Consulta: creatorFacets:"GIACHETTO, P. F."
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Data/hora: 06/06/2024 08:27:36

Planos de gestão de dados acionáveis por máquina alinhados aos princípios FAIR para o Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa.
Provedor de dados: 14
Autores: SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; TORRES, T. Z.; FALCAO, P. R. K.; NHANI JUNIOR, A.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R. da; CINTRA, L. C.; OSAWA, C. C.; SILVA, A. R. da; BARBOSA, L. A. F.
Esta publicação traz uma contribuição efetiva para comunidade de dados ômicos da Embrapa ao apresentar modelos de planos de gestão de dados acionáveis por máquina, alinhados aos princípios FAIR, desenvolvidos pelo Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa.
Tipo: Livros
Palavras-chave: Gestão de dados de pesquisa; Dados FAIR; Bioinformática; Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa; Plano de gestão de dados; Plano de gestão de dados acionável por máquina; PGDam.
Ano: 2022
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1149101

Identificação de polimorfismos no gene da leptina bovina.
Provedor de dados: 14
Autores: SALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F.
O objetivo desse trabalho foi identificar a existência de polimorfismos de conformação de cadeia simples (SSCP) e de tamanho de fragmentos de restrição (RFLP) em regiões do gene da leptina amplificadas por reação em cadeia da polimerase (PCR) de bovinos de corte pertencentes a três grupos genéticos terminados em confinamento.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Leptina bovina.; Polimorfismo.
Ano: 2008
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/709701

Termos técnicos úteis na catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa: uma compilação de definições.
Provedor de dados: 14
Autores: SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; OSAWA, C. C.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; TORRES, T. Z.; SILVA, A. R. da.
Este trabalho de compilação de termos é fruto de esforços conjuntos realizados no escopo da Ação Gerencial Local (AGL), intitulada "Implantar a gestão de dados de pesquisa na Embrapa Informática Agropecuária", alinhada ao Programa de Governança de Dados de Pesquisa. Desses esforços participaram ativamente membros da equipe do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa (LMB) e do Grupo de Pesquisa em Computação Científica, Engenharia da Informação e Automação (GCIA), da Embrapa Agricultura Digital. Trata-se de um documento de natureza terminológica indispensável à ampliação e à popularização do vocabulário técnico associado à Biblioteconomia aplicada a dados, em especial, na catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da...
Tipo: Livros
Palavras-chave: Representação descritiva; Representação temática; Catalogação; Datasets; Catalogação de datasets ômicos; Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa.
Ano: 2021
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1138340

A tecnologia de microarranjos na identificação de genes de interesse na bovinocultura.
Provedor de dados: 14
Autores: GIACHETTO, P. F.
Como ferramenta de análise da expressão gênica, a tecnologia dos microarranjos de DNA permite a investigação de milhares de transcritos de um tecido, de maneira simultânea. Essa metodologia tem revolucionado diversas áreas do conhecimento, por meio do aumento substancial da capacidade analítica dos processos moleculares. Hoje, dentro da ciência animal, a disponibilidade desse método de investigação tem permitido aos pesquisadores identificar variações na expressão de determinados genes que possam ocorrer como respostas biológicas devido à condição experimental (idade, raça, estado fisiológico). Sob um aspecto prático, essa tecnologia tem seu papel na identificação de genes envolvidos na determinação de características fenotípicas de interesse econômico, os...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Tecnologia de microarranjos de DNA; Expressão gênica.; Bovinocultura.; Microarray technology; Gene expression; Cattle.
Ano: 2010
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/885253

Termos de Biologia e áreas afins úteis na catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa: uma compilação de definições.
Provedor de dados: 14
Autores: SOUZA, M. I. F.; GIACHETTO, P. F.; OSAWA, C. C.; VISOLI, M. C.; FALCAO, P. R. K.; TORRES, T. Z.; SILVA, A. R. da.
Este trabalho de compilação de termos é fruto de esforços conjuntos realizados no escopo da Ação Gerencial Local (AGL), intitulada "Implantar a gestão de dados de pesquisa na Embrapa Agricultura Digital", alinhada ao Programa de Governança de Dados de Pesquisa. Desses esforços participaram os membros da equipe do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa (LMB) e do Grupo de Pesquisa em Computação Científica, Engenharia da Informação e Automação (GCIA), da Embrapa Agricultura Digital. Trata-se de um documento de natureza terminológica indispensável à ampliação e à popularização do vocabulário técnico associado à Biologia, Bioquímica, Biologia Molecular e Bioinformática, especialmente voltado para catalogação de datasets ômicos no Repositório de...
Tipo: Livros
Palavras-chave: Representação descritiva; Representação temática; Catalogação; Datasets ômicos; Termos técnicos; Biologia.
Ano: 2021
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1138350

Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Provedor de dados: 14
Autores: HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F.
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de componentes principais - PCA.; Análise Estatística.
Ano: 2010
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/885652

Um modelo computacional para estudar a influência dos anticorpos na manutenção da memória imunológica.
Provedor de dados: 14
Autores: CASTRO, A. de; FRONZA, C. F.; GIACHETTO, P. F.; ALVES, D.
Este artigo apresenta um modelo computacional para estudar a evolução temporal do repertório clonal, incluindo populações de anticorpos. O modelo proposto também foi utilizado para estudar o comportamento da memória imunológica quando populações antigênicas são inoculadas aleatoriamente para simular um processo de mutação viral. Os resultados das simulações realizadas sugerem que um decréscimo na produção de anticorpos favorece a manutenção global da memória imunológica. O modelo aqui exposto permite representar a geração, manutenção e regulação da memória imunológica de uma forma mais completa, através de uma rede de memória, que combina as características da teoria de seleção clonal de F. M. Burnet e a hipótese de rede de N. K. Jerne, considerando...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Modelo computacional; Memória imunológica; Mutação antigênica; Antigenic mutation; Immune memory.; Computational model; Imunologia.
Ano: 2009
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/662776

CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos.
Provedor de dados: 14
Autores: SIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F.
Variações no número de cópias de regiões específicas do DNA, ou simplesmente CNVs (Copy Number Variations), constituem um tipo de marcador molecular que é encontrado com frequência nos genomas de mamíferos e plantas. Em humanos, o impacto das CNVs sobre os fenótipos já foi relatado em características adaptativas, mortalidade embrionária e em algumas doenças complexas como autismo, esquizofrenia, doença de Chron, artrite reumatoide, diabetes tipo I e obesidade. Comparada aos SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), as CNVs envolvem um número maior de sequências genômicas, apresentando, potencialmente, um impacto mais pronunciado na expressão gênica, em função de alterações na estrutura e na dosagem gênica. Assim, acredita-se que esse marcador também exerça um...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bovino; DNA; Fenótipo; Gene; Genética Animal; Marcador Molecular; Variação Genética; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2019
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1118279

Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Provedor de dados: 14
Autores: HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F.
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de componentes principais - PCA.; Análise Estatística.; Gene expression; Algorithms; Statistical analysis; Principal component analysis.
Ano: 2010
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883623