Consulta: creatorFacets:"Lopes,Paulo Sávio"
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Data/hora: 05/06/2024 05:42:31

Association between G316A growth hormone polymorphism and economic traits in pigs
Provedor de dados: 74
Autores: Faria,Danielle Assis de; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Pires,Aldrin Vieira; Paiva,Samuel Rezende; Sollero,Bruna Pena; Wenceslau,Amauri Arias.
The association between G316A growth hormone polymorphism and quantitative traits was investigated in an F2 population of pigs. Association analyses were performed using a statistical model that included genotype, sex, batch and sex by genotype interaction as fixed effects and sire as random effect. The polymorphism was associated with the number of right teats (p = 0.03), heart weight (p = 0.04), lung weight (p = 0.05), carcass length determined by the Brazilian carcass classification method (p = 0.04), picnic shoulder weight (p = 0.07), jowl weight (p = 0.01), pH 24 h after slaughtering (p = 0.03) and drip loss (p = 0.01). Interaction between genotype and sex was observed for six performance traits. The additive effect was significant (p &lt; 0.10) for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Candidate genes; Divergent cross; Molecular marker; Sex x genotype interaction; Swine.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000400010

Mapping of quantitative trait loci and confirmation of the FAT1 region on chromosome 4 in an F2 population of pigs
Provedor de dados: 74
Autores: Silva,Kleibe de Moraes; Paixão,Débora Martins; Silva,Priscila Vendramini; Solero,Bruna Pena; Pereira,Mario Sérgio; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
The objective was to map QTL on porcine chromosome 4 and to associate them with carcass and internal organ traits in an F2 population. The F1 population was produced by outbreed crossing, using two native Brazilian breed Piau boars and 18 commercial sows. A total of 617 F2 animals issued from 11 F1 boars and 54 F1 sows were typed for a total of five microsatellite markers. The data were analyzed by multiple regressions developed for the analysis of crosses between outbred lines, using the QTL Express software. Significant evidence for QTL was found for pig chromosome 4 regarding carcass and internal organ traits. All QTL were detected in the same region of the chromosome, designated FAT1.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Fatness; Pig production; Divergent crosses; Microsatellite markers; QTL mapping.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572008000300013

The influence of animals from embryo transfer on the genetic evaluation of growth in Simmental beef cattle by using multi-trait models
Provedor de dados: 74
Autores: Mota,Rodrigo Reis; Lopes,Paulo Sávio; Marques,Luiz Fernando Aarão; Silva,Luciano Pinheiro da; Resende,Marcos Deon Vilela de; Torres,Robledo de Almeida.
The weight records from Simmental beef cattle were used in a genetic evaluation of growth with or without the inclusion of animals obtained by embryo transfer. A multi-trait model in which embryo transfer individuals were excluded (MTM1) contained 29,510 records from 10,659 animals, while another model without exclusion of these animals (MTM2) contained 62,895 weight records from 23,160 animals. The weight records were adjusted for ages of 100, 205, 365, 450, 550 and 730 days. The (co)variance components and genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method. The (co)variance components were similar in both models, except for maternal permanent environment variance. Direct heritabilities (h²d) in MTM1 were 0.04, 0.11, 0.20, 0.27,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Body weight; (co)variance components; Heritability.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000100007

Genomic growth curves of an outbred pig population
Provedor de dados: 74
Autores: Silva,Fabyano Fonseca e; Resende,Marcos Deon V. de; Rocha,Gilson Silvério; Duarte,Darlene Ana S.; Lopes,Paulo Sávio; Brustolini,Otávio J.B.; Thus,Sander; Viana,José Marcelo S.; Guimarães,Simone E.F.
In the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bayesian LASSO; Nonlinear regression; SNP effects.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000400010

Genetic evaluation for persistency of lactation in Holstein cows using a random regression model
Provedor de dados: 74
Autores: Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva.
A model for analyzing test day records including both fixed and random coefficients was applied to the genetic evaluation of first lactation data for Holstein cows. Data comprising 87045 test-day milk yield records from calving between 1997 and 2001 from Holstein herds in 10 regions of the Brazilian state of Minas Gerais. Six persistency of lactation measures were evaluated using breeding values obtained by random regression analyses. The Wilmink function was used to model the additive genetic and permanent environmental effects. Residual variance was constant throughout lactation. Ranking for animals did not change among criteria for persistency measurements, but ranking changes were observed when the estimated breeding value (EBV) for persistency of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Genetic evaluation; Persistency of lactation; Rank correlation; Random regression models.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300009

Expression profile of genes associated with mastitis in dairy cattle
Provedor de dados: 74
Autores: Fonseca,Isabela; Silva,Priscila Vendramini; Lange,Carla Christine; Guimarães,Marta F.M.; Weller,Mayara Morena Del Cambre Amaral; Sousa,Katiene Régia Silva; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,José Domingos; Guimarães,Simone E.F.
In order to characterize the expression of genes associated with immune response mechanisms to mastitis, we quantified the relative expression of the IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, IFN-γ and TNF-α genes in milk cells of healthy cows and cows with clinical mastitis. Total RNA was extracted from milk cells of six Black and White Holstein (BW) cows and six Gyr cows, including three animals with and three without mastitis per breed. Gene expression was analyzed by real-time PCR. IL-10 gene expression was higher in the group of BW and Gyr cows with mastitis compared to animals free of infection from both breeds (p &lt; 0.05). It was also higher in BW Holstein animals with clinical mastitis (p &lt; 0.001), but it was not significant when Gyr cows with and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cytokine; Gene expression; Immune response; Real-time PCR.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000400018

Maternal effects on the genetic evaluation of Tabapuã beef cattle
Provedor de dados: 74
Autores: Campêlo,José Elivalto Guimarães; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Silva,Luiz Otávio Campos da; Euclydes,Ricardo Frederico; Araújo,Cláudio Vieira de; Pereira,Carmen Silva.
The aim of this investigation was to study the influence of maternal effects on the genetic evaluation of sire production in Tabapuã beef cattle. Single and multiple trait analyses were done with adjusted animal weights at 120, 240 and 420 days of age. Antagonism was observed between additive direct and maternal genetic effects, with the maternal effect being higher until weaning. The inclusion of maternal effects in the models removed part of the additive variance only in single trait analyses and resulted in smaller means and standard deviations for the sire breeding values. The use of maternal effect associated with single or multiple traits may affect sire ranking. The contradictory results of the single and multiple trait analyses for additive direct...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Additive direct effects; Beef cattle; Genetic parameters; Growth; Maternal effects.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000400009

Genetic diversity between herds of Alpine and Saanen dairy goats and the naturalized Brazilian Moxotó breed
Provedor de dados: 74
Autores: Araújo,Adriana Mello de; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Machado,Thea Mírian Medeiros; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva; Silva,Francisco Luiz Ribeiro da; Rodrigues,Marcelo Teixeira; Columbiano,Virgínia de Souza; Fonseca,Cleusa Graça da.
Brazilian naturalized goat breeds are adapted to the semiarid conditions prevalent in the Northeast region of the country (which has the largest Brazilian goat heard) and represent an as yet uninvestigated source of genetic diversity. Currently, imported goat breeds are crossed with Brazilian naturalized goat breeds, endangering the genetic potential of the naturalized breeds. We used 11 microsatellite markers to determine the genetic diversity among imported (non-naturalized) dairy Alpine and Saanen goats and naturalized Brazilian Moxotó goats. We genotyped 292 goats from three herds (one private, one from the University of Minas Gerais and the Moxotó conservation herd from Embrapa Caprinos) and found that the general heterozygosity was 0.6952 for Alpine,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Conservation; DNA microsatellite; Genetic distance; Genetic diversity; Goats.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000100014

Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in Holstein cows using a random regression model
Provedor de dados: 74
Autores: Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Pereira,Carmen Silva.
Test-day milk yield records of 11,023 first-parity Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield during different lactation periods. (Co)variance components were estimated using two random regression models, RRM1 and RRM2, and the restricted maximum likelihood method, compared by the likelihood ratio test. Additive genetic variances determined by RRM1 and additive genetic and permanent environmental variances estimated by RRM2 were described, using the Wilmink function. Residual variance was constant throughout lactation for the two models. The heritability estimates obtained by RRM1 (0.34 to 0.56) were higher than those obtained by RRM2 (0.15 to 0.31). Due to the high heritability estimates for milk yield throughout lactation and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Random regression models; REML method; Genetic parameters; Test-day milk yield; Holstein cows.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100013

Relationship between the Porcine Stress Syndrome gene and pork quality traits of F2 pigs resulting from divergent crosses
Provedor de dados: 74
Autores: Band,Guilherme de Oliveira; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Schierholt,Alex Sandro; Silva,Kleibe Moraes; Pires,Aldrin Vieira; Benevenuto Júnior,Augusto Aloísio; Gomide,Lúcio Alberto de Miranda.
The PSS genotypes of 596 F2 pigs produced by initial mating of Brazilian commercial sows and native boars were characterized by PCR-RFLP and the pork quality traits were evaluated. Among the 596 pigs studied, 493 (82.7%) were NN and 103 (17.3%) were Nn. There were no differences between NN and Nn pigs in the following pork qualities: pHu (5.71 ± 0.16 vs 5.70 ± 0.11), intramuscular fat (1.55 ± 0.64% vs 1.65 ± 0.67%), shear force (5552 ± 878 g/1.2 cm vs 5507 ± 826 g/1.2 cm), lightness (44.96 ± 2.05 vs 45.01 ± 1.92), redness (0.64 ± 0.60 vs 0.79 ± 0.55), yellowness (6.62 ± 0.56 vs 6.65 ± 0.48), hue (84.28 ± 5.53 vs 83.41 ± 4.85), or chroma (6.68 ± 0.52 vs 6.73 ± 0.52). However, pork from Nn pigs had a significantly (p &lt; 0.05) lower pH45 (6.41 ± 0.27 vs...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Meat quality; PCR-RFLP; Pork; PSE; PSS; Pig.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100015

Relationship between the Porcine Stress Syndrome gene and carcass and performance traits in F2 pigs resulting from divergent crosses
Provedor de dados: 74
Autores: Band,Guilherme de Oliveira; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Peixoto,Jane de Oliveira; Faria,Danielle Assis; Pires,Aldrin Vieira; Figueiredo,Frederico de Castro; Nascimento,Carlos Souza do; Gomide,Lúcio Alberto de Miranda.
The PSS genotypes of 596 F2 pigs produced by initial mating of Brazilian native boars commercial sows and were characterized by PCR-RFLP and their carcass and performance traits were evaluated. Among the 596 animals analyzed, 493 (82.72%) were characterized as NN and 103 (17.28%) as Nn. With respect to carcass traits, Nn animals presented higher (p &lt; 0.05) right half carcass weight, left half carcass weight, loin depth and loin eye area, and lower shoulder backfat thickness, backfat thickness between last and next to last but one lumbar vertebrae and backfat thickness after last rib at 6.5 cm from the midline compared to NN animals. Nn animals also showed (p &lt; 0.05) higher values for most of the cut yields, indicating higher cutting yields for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Carcass; Performance; PSS gene; PCR-RFLP; Pig.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100016

Genetic trends in the performance and reproductive traits of pigs
Provedor de dados: 74
Autores: Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva; Euclydes,Ricardo Frederico; Araújo,Cláudio Vieira de; Silva,Martinho de Almeida e.
The selection and evaluation of breeds and purebred lines to be used as the parental stock is an important step for the success of any animal breeding program. In this study, the feed:gain ratio, backfat thickness corrected for 100 kg, age to 100 kg, average daily gain, and age of sow at first farrowing were used to evaluate the genetic trends for direct and maternal additive genetic values in Large White pigs. The total number of piglets born or born alive and the litter weight at birth were used as indicators of the genetic trends for the direct additive values. The genetic trends were calculated by regression of the average predicted genetic values per year for each trait versus the offspring's year of birth (for performance traits) or versus the dam...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Average daily gain; Backfat thickness; Birth litter weight.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100017

Association of MYF5 gene allelic variants with production traits in pigs
Provedor de dados: 74
Autores: Carmo,Fausto Moreira da Silva; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Pires,Aldrin Vieira; Guimarães,Marta Fonseca Martins; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Schierholt,Alex Sandro; Silva,Kleibe de Moraes e; Gomide,Lúcio Alberto de Miranda.
We studied the phenotypic effects of polymorphisms at the MYF5 gene in a divergent F2 swine population and found that one polymorphism was due to an insertion and another to a deletion. The genotypes of 359 F2 animals were obtained and the Normal/Normal (NN) and Normal/Insertion (NI) genotypes analyzed to determine associations with phenotypic data for performance, carcass and meat quality traits. Significant differences were observed (p &lt; 0.05) between NN and NI animals for drip (NN = 3.14 ± 1.56; NI = 3.69 ± 2.78%), cooking (NN = 32.26 ± 2.41; NI = 33.21 ± 2.31%) and total loss (NN = 34.16 ± 2.63 and NI = 34.97 ± 2.08%). The Deletion marker was not statistically tested. The results indicate that the allelic variant Insertion is associated with a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Myogenesis; DNA sequencing; Pig production; PCR.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000300004

Use of regularized quantile regression to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits
Provedor de dados: 86
Autores: Santos,Patricia Mendes dos; Nascimento,Ana Carolina Campana; Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e; Azevedo,Camila Ferreira; Mota,Rodrigo Reis; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio.
Abstract: The objective of this work was to evaluate the use of regularized quantile regression (RQR) to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits, compared with the Bayesian lasso (Blasso) method. The genetic data of the traits carcass yield, bacon thickness, and backfat thickness from a F2 population composed of 345 individuals, generated by crossing animals from the Piau breed with those of a commercial breed, were used. RQR was evaluated considering different quantiles (τ = 0.05 to 0.95). The RQR model used to estimate the genetic merit showed accuracies higher than or equal to those obtained by Blasso, for all studies traits. There was an increase of 6.7 and 20.0% in accuracy when the quantiles 0.15 and 0.45 were considered in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Sus scrofa; Blasso; Shrinkage.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2018000901011

Análise bayesiana univariada e bivariada para a conversão alimentar de suínos da raça Piau
Provedor de dados: 86
Autores: Rossi,Robson Marcelo; Martins,Elias Nunes; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Fabyano Fonseca e.
O objetivo deste trabalho foi apresentar modelagens alternativas, uni e bivariadas, para avaliação da conversão alimentar (CA) de suínos da raça Piau, com uso de inferência bayesiana. Os efeitos de sexo e genótipo sobre a CA dos animais foram avaliados por meio de procedimentos de simulação de Monte Carlo via cadeias de Markov (MCMC) e de integração aproximada aninhada de Laplace (INLA). O modelo univariado foi avaliado com diferentes distribuições para o erro - normal (gaussiana), t de Student, gama, log-normal e skew-normal -, enquanto, para o modelo bivariado, considerou-se o erro normal. A distribuição skew-normal foi o modelo mais parcimonioso para inferir sobre a resposta direta (univariada) da CA aos efeitos de sexo e genótipo, os quais não foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise multivariada; Desempenho nutricional; INLA; MCMC; Síndrome do estresse suíno.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014001000754

Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória
Provedor de dados: 86
Autores: Pinheiro,Valeria Rosado; Silva,Fabyano Fonseca e; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Resende,Marcos Deon Vilela de; Lopes,Paulo Sávio; Cruz,Cosme Damião; Azevedo,Camila Ferreira.
O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância "identical‑by‑descent" associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Sus scrofa; Curvas de crescimento; Dados longitudinais; "identical‑by‑descent"; Locos de características quantitativas; Seleção assistida por marcadores.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000200009

Contemporary groups in the genetic evaluation of Nellore cattle using Bayesian inference
Provedor de dados: 86
Autores: Silva,Delvan Alves da; Silva,Fabyano Fonseca e; Ventura,Henrique Torres; Junqueira,Vinícius Silva; Silva,Alessandra Alves da; Mota,Rodrigo Reis; Lopes,Paulo Sávio.
Abstract: The objective of this work was to evaluate the criteria for the formation of contemporary groups (CGs) in the genetic evaluation of body weight at weaning in Nellore cattle. A total of 713,474 records from 3,066 herds located in Midwestern and Northern Brazil were used. Data were obtained from the genealogical registry of zebu breeds of the Brazilian association of zebu breeders. Data structures were defined based on the number of standard deviations (SDs) for outlier removal (±2.0, ±2.5, ±3.0, and ±3.5) and on the minimal number of animals per CG (3, 7, and 15). Genetic evaluation was performed with an animal model using Bayesian inference. Data structures with ±3.5 SDs and CG with at least 15 animals presented the highest additive genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Heritability; Outliers; Zebu.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017000800643

Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos
Provedor de dados: 86
Autores: Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Silva,Fabyano Fonseca e; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão via componentes independentes (ICR) na estimação de valores genéticos genômicos e dos efeitos de marcadores SNP para características de carcaça de uma população F2 de suínos (Piau x linhagem comercial). Os métodos foram avaliados por meio da concordância entre os valores genéticos preditos e os fenótipos corrigidos, observados por validação cruzada, e também foram comparados com outros métodos geralmente utilizados para os mesmos propósitos, tais como RR-BLUP, PCR e PLS. Os métodos ICR e PCR apresentam resultados similares, mas o método ICR apresenta maiores valores de acurácia.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Sus scrofa; BLUP; Marcadores SNP; Regressão aleatória; Redução dimensional.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000600007

Funções de covariância para produção de leite no dia do controle em bovinos Gir leiteiro
Provedor de dados: 86
Autores: Pereira,Rodrigo Junqueira; Lopes,Paulo Sávio; Verneque,Rui da Silva; Santana Júnior,Mário Luiz; Lagrotta,Marcos Rodrigues; Torres,Robledo de Almeida.
O objetivo deste trabalho foi estimar funções de covariância para a produção de leite no dia do controle (PLDC). Foram analisados 27 mil registros de PLDC de 3.362 primeiras lactações de vacas da raça Gir leiteira, paridas entre 1990 e 2007. As PLDC foram agrupadas em vinte classes quinzenais, analisadas por modelos de regressão aleatória, cujos efeitos aleatórios, genético-aditivo e de ambiente permanente foram modelados pelas funções de Wilmink (W) ou Ali &amp;amp; Schaeffer (AS). A modelagem da variância residual (VR) foi ajustada por meio de 1, 4, 6 ou 10 classes. As estimativas de herdabilidade para a PLDC variaram de 0,12 a 0,32, para a função AS, e de 0,09 a 0,33, para a função W, e foram maiores ao início da lactação. As correlações genéticas entre...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovinos de leite; Função paramétrica; Inferência bayesiana; Parâmetros genéticos.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010001100011

Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal
Provedor de dados: 86
Autores: Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BLUP; Seleção fenotípica; Simulação; Sistemas de acasalamento.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400010

Estudo da divergência genética entre quatro linhagens de matrizes de frangos de corte utilizando técnicas de análise multivariada
Provedor de dados: 96
Autores: Viana,Cristina Fontes Araújo; Silva,Martinho de Almeida e; Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Piassi,Marcelo.
O desempenho de duas linhagens de matrizes de frangos de corte, desenvolvidas pela Universidade Federal de Viçosa - UFV (M1 e F1), foi testado em relação a duas marcas comerciais (C1 e C2), usando métodos de análise multivariada para a avaliação da divergência genética. Foram avaliadas quatro características de importância econômica: idade à maturidade sexual (IMS), número de ovos (NO), peso médio do ovo (PO) e peso das matrizes (PM), em três períodos da vida produtiva das aves, inicial (25ª à 32ª semana de idade), médio (48ª a 56ª semana de idade) e total (25ª à 62ª semana de idade). O estudo da divergência genética entre as linhagens foi feito por meio da análise de variância multivariada, da análise de agrupamento, usando a distância generalizada de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise de agrupamento; Divergência genética; Frango de corte; Variável canônica.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000400018

Métodos de estimação de efeitos genéticos não-aditivos para características de peso e perímetro escrotal em bovinos de corte mestiços
Provedor de dados: 96
Autores: Bueno,Rachel Santos; Torres,Robledo de Almeida; Ferraz,José Bento Sterman; Lopes,Paulo Sávio; Eler,Joanir Pereira; Mourão,Gerson Barreto; Silva,Martinho de Almeida e; Mattos,Elisângela Chicaroni de.
Os objetivos neste trabalho foram investigar, em uma população de bovinos de corte mestiços a obtenção dos efeitos genéticos não-aditivos para as características peso aos 205 e 390 dias e perímetro escrotal e avaliar a consideração desses efeitos na predição dos valores genéticos dos reprodutores utilizando diferentes metodologias de estimação. No método 1, os dados foram pré-ajustados para os efeitos não-aditivos obtidos pelo método de mínimos quadrados em modelo que considerou os efeitos fixos genéticos aditivos diretos e maternos e os não-aditivos, das heterozigoses direta e materna total, e epistasia. No método 2, os efeitos não-aditivos foram considerados covariáveis no modelo genético. Valores genéticos para os dados ajustados e não-ajustados foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação multirracial; Heterozigose; Mestiços; Perdas por recombinação.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000500009

Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite de cabras da raça Alpina
Provedor de dados: 96
Autores: Breda,Fernanda Cristina; Albuquerque,Lucia Galvão; Yamaki,Marcos; Reis Filho,João Cruz; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira.
Foram utilizados 9.374 registros semanais de produção de leite de 302 primeiras lactações de cabras da raça Alpina. A produção de leite no dia do controle foi analisada por meio de um modelo animal, unicarater, de regressão aleatória, em que as funções de covariâncias para os componentes genéticos aditivos e de ambiente permanente foram modeladas por meio das funções de Wilmink, Ali e Schaeffer e por polinômios ortogonais, em uma escala de Legendre de ordens cúbica e quíntica. Assumiu-se, ainda, variância residual homogênea durante toda a lactação e heterogênea com três e quatro classes de variância residual. Os modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike (AIC), pelo critério de informação Bayesiano de Schwar (BIC), pela função de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Função de Ali e Schaeffer; Função de Wilmink; Polinômio ortogonal de Legendre; Regressão aleatória.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000200009

Avaliação sistêmica da introdução de tecnologias na pecuária de gado de corte do Pantanal por meio de modelos de análise envoltória de dados (DEA)
Provedor de dados: 96
Autores: Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Gomes,Eliane Gonçalves; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento.
Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar, por meio de diferentes modelos de Análise Envoltória de Dados (DEA), a eficiência da introdução e adaptação de tecnologias no sistema de produção de cria extensiva do Pantanal. Utilizaram-se dados econômicos registrados durante oito anos (1995 a 2002). Duas metodologias de escolha das variáveis foram utilizadas para a realização da análise DEA: a primeira é uma variante do método multicritério de seleção de variáveis, que combina os objetivos conflitantes de melhor ordenação das unidades de decisão e maior eficiência média, e a segunda inclui técnicas de estatística multivariada. Nos dois modelos resultantes (com seis inputs e um output; e com três inputs e um output, respectivamente), foram analisados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação de desempenho; Eficiência; Sistema de produção.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100025

Comparação de modelos de regressão aleatória para estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros
Provedor de dados: 96
Autores: Sarmento,José Lindenberg Rocha; Albuquerque,Lucia Galvão de; Torres,Robledo de Almeida; Rodrigues,Marcelo Teixeira; Lopes,Paulo Sávio; Reis Filho,João Cruz.
Objetivou-se avaliar a melhor modelagem para as variâncias genética aditiva, de ambiente permanente e residual da produção de leite no dia do controle (PLDC) de caprinos. Utilizaram-se modelos de regressão aleatória sobre polinômios ortogonais de Legendre com diferentes ordens de ajuste e variância residual heterogênea. Consideraram-se como efeitos fixos os efeitos de grupo de contemporâneos, a idade da cabra ao parto (co-variável) e a regressão fixa da PLDC sobre polinômios de Legendre, para modelar a trajetória média da população; e, como efeitos aleatórios, os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente. O modelo com quatro classes de variâncias residuais foi o que proporcionou melhor ajuste. Os valores do logaritmo da função de verossimilhança,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Componentes de variância; Dia do controle; Modelo animal; Polinômios de Legendre; Produção de leite.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001000011

Paternity in Brazilian goats through the use of DNA microsatellites
Provedor de dados: 96
Autores: Araújo,Adriana Mello de; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Pereira,Carmen Silva; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira; Machado,Théa Mírian Medeiros.
A total of 292 animals from three breeds (Alpine and Saanen dairy breeds, and the Brazilian naturalized breed Moxotó) were genotyped, comprising 276 paternity cases. Statistical analyses were carried out by using TFPGA and CERVUS programs. Heterozygosis ranged from 0.542 (ILSTS005) to 0.825 (INRA006), with an average of 0.717 for all loci. Polymorphic information content (PIC) was 0.676 and 0.542, and combined exclusion probabilities (EP) were 0.999591 and 0.988375 for known and unknown maternal genotypes, respectively. The microsatellite system reveals 10% of paternity misidentification in evaluated registers.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Brazil; Local breed; Paternity exclusion; Pedigree mismatching; Polymorphism.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000500010

Estimação de parâmetros genéticos em tamanho de leitegada de suínos utilizando análises de características múltiplas
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Junior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.
Registros de animais da raça Large White foram utilizados para estimar componentes de co-variâncias e parâmetros genéticos para a característica número de leitões nascidos como medida do tamanho de leitegada. Na obtenção dos componentes de co-variâncias e dos parâmetros genéticos, utilizou-se o método da Máxima Verossimilhança Restrita, com o algoritmo Livre de Derivadas, por meio do programa MTDFREML. O modelo misto continha o efeito fixo de grupo contemporâneo e os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual. Dados das primeiras quatro parições foram usados em duas análises: análises unicaracterísticas e análise multicaracterística separada em séries de análises bicaracterísticas, na qual cada parição foi tratada como característica diferente....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Características reprodutivas; Correlação genética; Herdabilidade; Número de leitões nascidos; REML.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100007

Association between insulin-like growth factor I (IGF-I) microsatellite polymorphisms and important economic traits in pigs
Provedor de dados: 96
Autores: Faria,Danielle Assis de; Peixoto,Jane de Oliveira; Lopes,Paulo Sávio; Paiva,Samuel Rezende; Silva,Priscila Vendramini; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
This study investigated the association between IGF-I microsatellite marker in an F2 population (N=459) generated by mating of native boars to Brazilian commercial sows with performance, carcass cut, and meat quality traits. Association analyses were carried out using a statistical model that included genotype, sex, and group as fixed effects and sire as random effect. The IGF-I genotypes were significantly associated with different quantitative traits and these results corroborate with previous QTL analyses obtained for this chromosome region in swine. Additive and dominance effects, as well as a genotype-sex interaction, were estimated and discussed in the text. According to the results obtained, this marker is suitable for QTL search in the genotyped...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Divergent cross; Microsatellite marker; Quantitative traits; Sex × genotype interaction; Swine.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000200007

Impact of embryo transfer phenotypic records on large-scale beef cattle genetic evaluations
Provedor de dados: 96
Autores: Junqueira,Vinícius Silva; Lopes,Paulo Sávio; Resende,Marcos Deon Vilela de; Silva,Fabyano Fonseca e; Lourenço,Daniela Andressa Lino; Yokoo,Marcos Jun Iti; Cardoso,Fernando Flores.
ABSTRACT We aimed to evaluate the impact of using embryo transfer (ET) information on weaning weight estimated breeding values (EBV) and its accuracy. Data from Hereford and Braford cattle, raised under extensive conditions in Southern Brazil, were used. A model that included ET information in addition to maternal (genetic and permanent environmental) effects as a function of foster dams was compared to a model without ET information. Accuracy of both bulls and calves increased due to inclusion of ET records in 0.04 and 0.12 points, respectively. In general, the inclusion of ET records provided a greater amount of phenotypic variance and most accurate EBV for sires and progeny. The results obtained in this study encourage the use of ET phenotypic records...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Accuracy; Assisted reproduction; Foster dam; Genetic groups.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982018000100405

Estimação de parâmetros genéticos em suínos usando Amostrador de Gibbs
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Junior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.
Um total de 38.865 registros de animais da raça Large White foi usado para estimar componentes de co-variância e parâmetros genéticos das características idade ao atingir 100 kg de peso vivo (IDA) e espessura de toucinho ajustada para 100 kg de peso vivo (ET), em análises bicaracterísticas. Para obtenção dos componentes de co-variância, foi utilizado o Amostrador de Gibbs por meio do programa MTGSAM. O modelo misto utilizado continha efeito fixo de grupo contemporâneo e os seguintes efeitos aleatórios: efeito genético aditivo direto, efeito genético aditivo materno, efeito comum de leitegada e efeito residual. As médias das estimativas de herdabilidade aditivas diretas foram 0,33 e 0,44 para IDA e ET, respectivamente. As médias das estimativas do efeito...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise bayesiana; Desempenho; Espessura de toucinho; Herdabilidade; Idade; Intervalo de alta densidade.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000700009

Population structure of Brazilian Gyr dairy cattle
Provedor de dados: 96
Autores: Reis Filho,João Cruz; Lopes,Paulo Sávio; Verneque,Rui da Silva; Torres,Robledo de Almeida; Teodoro,Roberto Luiz; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
The objective of the present study was to evaluate the genetic structure of Gyr cattle selected for milk production. Files of pedigree and production were composed of 27,610 animals. The ENDOG program was used for the calculation of individual inbreeding coefficient (F) and coefficient of average relatedness (AR), effective number of animals(Ne), effective number of founders (f e) and ancestors (f a), and generation interval (GI). Individual inbreeding coefficients and average relatedness in the population were 2.82% and 2.10%, respectively. It was observed a reduction in the effective number of animals, especially after publication of the results of the first progeny test. The estimated effective number of founders was 146 and 75 for the ancestrals. Out...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Effective size; Generation interval; Inbreeding; Progeny test.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001200012

Avaliação genética de caprinos da raça Alpina utilizando-se a produção de leite no dia do controle
Provedor de dados: 96
Autores: Sarmento,José Lindenberg Rocha; Reis Filho,João Cruz; Albuquerque,Lucia Galvão de; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira.
Com os objetivos de estimar os parâmetros genéticos e predizer os valores genéticos para produção de leite no dia do controle (PLDC) e para produção acumulada (PAC), utilizaram-se dados de 356 cabras da raça Alpina, com 825 lactações e 26.389 controles semanais efetuados entre os anos de 1997 e 2004. A PLDC foi analisada considerando-se o efeito fixo de grupo contemporâneo (ano-mês de controle), a idade da cabra ao parto, como covariável, e os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente. Para PAC, o modelo incluiu os mesmos efeitos aleatórios, o efeito fixo de grupo contemporâneo (ano-mês de parto) e as covariáveis idade da cabra ao parto e duração da lactação. Em geral, as herdabilidades estimadas foram de maiores magnitudes na primeira...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Caprinos leiteiros; Componentes de variância; Modelo animal; Parâmetros genéticos; Seleção.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000200015

Mapeamento de locos de características quantitativas nos cromossomos 5, 7 e 8 de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Sousa,Katiene Régia Silva; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Silva Filho,Miguel Inácio da; Lopes,Marcos Soares; Pinto,Ana Paula Gomes; Verardo,Lucas Lima; Braccini Neto,José; Lopes,Paulo Sávio.
Objetivou-se mapear QTL nos cromossomos 5, 7 e 8 e associá-los a características de carcaça, cortes de carcaça, qualidade de carne, desempenho e órgãos internos de suínos. Uma progênie F2 de 614 animais foi produzida do cruzamento de dois varrões da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). A população foi genotipada para 14 marcadores microssatélites cobrindo os cromossomos 5, 7 e 8. Em seguida, foi construído o mapa de ligação para cada cromossomo. As análises de associação foram feitas usando o mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL. Para características de carcaça e cortes de carcaça, foram mapeados 20 QTL nos três cromossomos, enquanto, para características de qualidade de carne,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Detecção de QTL; Marcadores microssatélites; Produção de suínos.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000100016

Mapeamento de locos de características quantitativas para desempenho no cromossomo 4 de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Silva,Kleibe de Moraes; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Nascimento,Carlos Souza do; Lopes,Marcos Soares; Amaral,Mayara Morena Del Cambre.
Uma população F2 de suínos obtida a partir do intercruzamento da geração F1, proveniente do acasalamento divergente de dois machos da raça naturalizada brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace × Large White × Piétrain) e genotipada para cinco marcadores tipo microssatélite foi utilizada com o objetivo de mapear locos de características quantitativas associados a características de desempenho no cromossomo 4. As características avaliadas foram: número de tetas, peso ao nascimento, peso aos 21, 42, 63, 77 e 105 dias de idade, peso ao abate, consumo de ração, conversão alimentar e ganho de peso médio diário dos 77 aos 105 dias de idade e idade ao abate. Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento com análises realizadas por meio do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cruzamento divergente; Marcadores microssatélite; Melhoramento animal.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000300011

Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos
Provedor de dados: 96
Autores: Silva,Marcos Vinicius G. Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Pereira,Carmen Silva; Machado,Marco Antônio; Arbex,Wagner.
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h² = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000100009

Estimação de parâmetros genéticos em características de desempenho de suínos das raças Large White, Landrace e Duroc
Provedor de dados: 96
Autores: Costa,André Ribeiro Corrêa da; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Pires,Aldrin Vieira.
Dados de suínos Large White (LW), Landrace (LD) e Duroc (DU) foram utilizados na estimação dos componentes de variância para peso ajustado aos 70 dias (PA70), ganho de peso diário (GPD) e espessura de toucinho (ET). Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo das estimativas das herdabilidades, do efeito comum de leitegada e das correlações genéticas, de leitegada e residual. As características apresentaram valores de herdabilidades de médio a alto, indicando a possibilidade de ganhos genéticos por meio de seleção. As correlações genéticas entre PA70 e GPD (LW = 0,46; LD = 0,08; e DU = -0,47) e entre PA70 e ET (LW = 0,48; LD = 0,31; e DU = 0,47) indicam...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Parâmetros genéticos; REML; Suíno.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000100009

Modeling the effect of age at calving × breed group of dam's interaction on weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves
Provedor de dados: 96
Autores: Toral,Fábio Luiz Buranelo; Torres Júnior,Roberto Augusto de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Luiz Otávio Campos da; Reis Filho,João Cruz.
The objective of this study was to evaluate alternatives for modeling the interaction between age of dam at calving (AOD) and the dam genetic group (DGG) on the weaning weight (W225) of Charolais-Zebu (Ch-Z) crossbred calves. Data from 56,965 crossbred calves were analyzed by the least square method. Regression coefficients for age of dam at calving were estimated nested into each class of the dam genetic group (CLA model); for age of dam at calving × dam Charolais percentage (age of dam at calving × FCh) and age of dam at calving × dam heterozygosity (age of dam at calving × FH) (FChFH model); for age of dam at calving × dam Charolais percentage (FCh model); for age of dam at calving × FH (FH model); or only for age of dam at calving (NINT model)....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Crossbreeding; Heterozygosis; Least square; Multiple-breed genetic evaluation.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000500015

Comparação de metodologias de predição de valores genéticos utilizando dados simulados
Provedor de dados: 96
Autores: Braccini Neto,José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José.
Foram simuladas, utilizando o programa GENESYS, sete populações com diferentes médias genéticas e estruturas de dados resultantes da substituição de 0, 10, 25, 50, 75, 90 e 100% de reprodutores, com o objetivo de comparar a metodologia de modelos mistos (MMM) com a metodologia GenSys, por meio de suas acurácias e variâncias do erro de predição (PEV), estimadas com base no modelo de reprodutor e no modelo animal. No modelo de reprodutor, à medida que se aumentava a intensidade de seleção, ocorriam diminuição na acurácia e aumento da PEV de ambas as metodologias, em razão da menor acurácia na estimação dos níveis do efeito fixo e da diminuição do número médio de progênies/reprodutor. A superioridade da MMM no modelo de reprodutor foi atribuída à maior...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: GenSys; Modelo animal; Modelo de reprodutor; Modelos mistos.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000700006

Modeling the effect of the age of dam at calving on the weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves
Provedor de dados: 96
Autores: Toral,Fábio Luiz Buranelo; Torres Júnior,Roberto Augusto de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Luiz Otávio Campos da; Reis Filho,João Cruz.
The objective of this study was to evaluate alternatives for modeling the age of dam at calving (AOD) effect on the weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves. Data from 56,965 calves were analyzed, using statistical models considering the fixed effects of the contemporary groups, sire and dam genetic groups, and AOD. The AOD effect was fitted to models using annual age classes, and ordinary quadratic to quintic-ordered polynomials (OP) or segmented polynomials (SP) with two, three, four, six and twelve evenly spaced intervals. In the case of segmented polynomials, general linear and quadratic effects and only one quadratic additional term from each knot were considered. The AOD effects were nested within sex of calf in all cases. According to the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Beef cattle; Environmental effects; Genetic evaluation; Least square.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000700011

Estimação de parâmetros genéticos de características reprodutivas em suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,André Ribeiro Corrêa da.
Com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos de características reprodutivas de suínos, foram utilizados dados de peso da leitegada ao nascimento (PLN), peso da leitegada ajustado para 21 dias (PL21), tamanho de leitegada ao nascimento (TLN), tamanho de leitegada ao desmame (TLD) e taxa de mortalidade (TM), de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White. Variâncias e covariâncias genéticas e fenotípicas foram estimadas pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), usando modelo que inclui os efeitos genéticos direto e materno e comum de leitegada. Estes componentes foram usados para calcular as herdabilidades direta (&lt;img src="http:/img/fbpe/rbz/v29n6/5698fr7.gif"&gt;), materna (&lt;img...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Efeito materno; Leitegada; Modelo animal; REML; Suíno.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600015

Uso de funções ortogonais para descrever a produção de leite no dia de controle por meio de modelos de regressão aleatória
Provedor de dados: 96
Autores: Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Claudio Napolis; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Simone Inoe; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Pereira,Carmen Silva; Cobuci,Jaime Araújo; Sarmento,José Lindenberg Rocha.
Registros de produção de leite de 68.523 controles leiteiros de 8.536 vacas da raça Holandesa, filhas de 537 reprodutores, distribuídas em 266 rebanhos, com parições nos anos de 1996 a 2001, foram utilizados na comparação de modelos de regressão aleatória, para estimação de componentes de variância. Os modelos de regressão aleatória diferiram entre si pelo grau do polinômio de Legendre utilizado para descrever a trajetória da curva de lactação dos animais. Os modelos incluíram os efeitos rebanho-mês-ano do controle, composição genética dos animais, freqüência de ordenhas diárias, regressão polinomial em cada classe de idade-estação de parto para descrever a parte fixa da lactação e regressão polinomial aleatória relacionadas aos efeitos genético direto e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Herdabilidade; Parâmetros genéticos.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400005

Tendências genéticas em características de desempenho de suínos das raças Large White, Landrace e Duroc
Provedor de dados: 96
Autores: Costa,André Ribeiro Corrêa da; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Regazzi,Adair José; Silva,Martinho de Almeida e; Pires,Aldrin Vieira.
Dados de suínos das raças Large White (LW), Landrace (LD) e Duroc (DU) foram usados para estimar as tendências genéticas para as características peso ajustado para 70 dias (PA70) em kg, ganho de peso diário (GPD), em g, e espessura de toucinho (ET), em cm. As estimativas de tendências genéticas foram obtidas por meio da regressão das médias dos valores genéticos das características, em função do ano de nascimento do animal. As estimativas de tendência genética para PA70 (LW = -0,22; LD = -0,24; DU = -0,57) foram negativas, em razão, possivelmente, da maior ênfase dada à seleção de GPD e ET e das correlações entre essas características. As estimativas de tendência genética para ganho de peso diário GPD (LW = 14,11; LD = 9,81; DU = 2,75) e espessura de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BLUP; Suíno; Tendência genética.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000200008

Exigência de fósforo disponível para frangos de corte machos e fêmeas de 1 a 21 dias de idade
Provedor de dados: 96
Autores: Runho,Richard Cesar; Gomes,Paulo Cezar; Rostagno,Horacio Santiago; Albino,Luiz Fernando Teixeira; Lopes,Paulo Sávio; Pozza,Paulo César.
Foram utilizados 960 pintos, metade machos e metade fêmeas, no período de 1 a 21 dias idade, com peso inicial médio de 42,5 e 42,1g, respectivamente. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, com seis tratamentos, dois sexos, quatro repetições por sexo e vinte aves por unidade experimental. Os tratamentos consistiram de uma dieta basal deficiente em fósforo (0,150%), suplementada com fósforo disponível, provenientes do fosfato bicálcico (0,0; 0,10; 0,20; 0,30; 0,40; e 0,50%). As variáveis avaliadas foram ganho de peso (GP), consumo de ração (CR), conversão alimentar (CA), resistência dos ossos à quebra (ROQ), cinzas (CO) e fósforo no osso (PO). As exigências em fósforo disponível foram estimadas por intermédio dos modelos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Exigência de fósforo disponível; Frangos; Fase inicial.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000100027

Behavior of genetic (co)variance components in populations simulated from non-additive genetic models of dominance and overdominance
Provedor de dados: 96
Autores: Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
The aim of this work was to investigate the short-term behavior of the genetic variability of quantitative traits simulated from models with additive and non-additive gene action in control and phenotypic selection populations. Both traits, one with low (h² = 0.10) and the other with high (h² = 0.60) heritability, were controlled by 600 biallelic loci. From a standard genome, it was obtained six genetic models which included the following: only the additive gene effects; complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci; and positive overdominance for 50% of the loci. In the models with dominance deviation, the additive allelic effects were also included for 100% of the loci. Genetic variability was quantified from generation to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Closed population; Computer simulation; Dominance deviation; Genetic variability; Intralocus interaction.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000900013

Interação reprodutor x rebanho na produção de leite da raça Holandesa no Brasil
Provedor de dados: 96
Autores: Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Cláudio Nápolis; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Registros de produção de leite de vacas da raça Holandesa foram utilizados na verificação da efetividade da inclusão da interação reprodutor x rebanho no modelo estatístico para estimação de componentes de variâncias, como uma forma de ajustamento para heterogeneidade de variância entre rebanhos. Com base no desvio-padrão fenotípico da produção de leite, ajustada a 305 dias de lactação e à idade adulta da vaca, os rebanhos foram estratificados em três classes: alto (&gt;1375 kg), médio (1165 a 1375 kg) e baixo (&lt;1165 kg) desvios-padrão fenotípicos. Componentes de variância em análise de características múltiplas, em que se considerou a produção de leite ajustada a 305 dias de lactação e à idade adulta em cada classe de desvio-padrão fenotípico como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Componentes de variância; Interação reprodutor x rebanho; Produção de leite.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000400012

Modelagem de efeitos genéticos e ambientais que influenciam o peso à desmama de bezerros mestiços Charolês-Zebu
Provedor de dados: 96
Autores: Toral,Fábio Luiz Buranelo; Torres Júnior,Roberto Augusto de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Luiz Otávio Campos da.
Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar alternativas para modelagem de efeitos genéticos e ambientais que influenciam o peso à desmama de bezerros mestiços Charolês-Zebu. Foram utilizados os dados de peso à desmama de 56.965 bezerros, com percentuais de alelos de origem da raça Charolesa variando entre 23% e 66%. Os modelos considerados diferiram quanto à inclusão de efeitos genéticos aditivos e não-aditivos médios, individuais e maternos, bem como quanto à maneira de modelar estes efeitos (regressão múltipla ou variável classificatória). Também foi avaliada a inclusão da interação entre o grupo genético do bezerro e seu grupo de contemporâneos, como um efeito aleatório não correlacionado. De acordo com os critérios de ajuste utilizados, a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética multirracial; Bovinos de corte; Cruzamento; Heterozigose; Modelo estatístico.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011001100014

Parâmetros genéticos de características reprodutivas de touros e vacas Gir leiteiro
Provedor de dados: 96
Autores: Santana Júnior,Mário Luiz; Lopes,Paulo Sávio; Verneque,Rui da Silva; Pereira,Rodrigo Junqueira; Lagrotta,Marcos Rodrigues; Peixoto,Maria Gabriela Campolina Diniz.
Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para a idade ao primeiro parto, perímetro escrotal e características do sêmen e avaliar a tendência genética da idade ao primeiro parto para animais da raça Gir Leiteira, foram analisadas medidas de 7.055 fêmeas e 97 machos de diversos rebanhos brasileiros. Os componentes de covariância foram estimados utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal, em análises unicaracterísticas. O modelo para características do sêmen incluiu os efeitos fixos central-ano-época de coleta de sêmen, idade à coleta como covariável, efeitos linear e quadrático. Para o perímetro escrotal, foram incluídos os efeitos fixos de ano do nascimento, classe de idade à medição do perímetro e central de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Correlação genética; Idade ao primeiro parto; Perímetro escrotal; Qualidade do sêmen; Tendência genética.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000800013

Genetic study of litter size and litter uniformity in Landrace pigs
Provedor de dados: 96
Autores: Camargo,Ederson Gomes; Marques,Daniele Botelho Diniz; Figueiredo,Elsio Antonio Pereira de; Silva,Fabyano Fonseca e; Lopes,Paulo Sávio.
ABSTRACT We aimed to estimate litter size and litter uniformity genetic parameters and genetic trends of Landrace pigs at birth and at three weeks by using multitrait analyses for 2,787 litters. The following litter traits were evaluated: number of piglets born alive (NBA), within-litter weight mean at birth (MBW), within-litter weight standard deviation at birth (SDB), within-litter weight coefficient of variation at birth (CVB), number of piglets at three weeks (NT), within-litter weight mean at three weeks (MT), within-litter weight standard deviation at three weeks (SDT), and within-litter weight coefficient of variation at three weeks (CVT). Heritability estimates for NBA, MBW, SDB, and CVB were 0.09±0.04, 0.31±0.08, 0.01±0.04, and 0.07±0.05,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coefficient of variation; Genetic parameters; Genetic trends; Piglet; Variation.
Ano: 2020
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982020000100402

Avaliação do crescimento de bovinos jovens da raça Tabapuã, por meio de análises de funções de covariâncias
Provedor de dados: 96
Autores: Sakaguti,Eduardo Shiguero; Silva,Martinho de Almeida e; Quaas,Richard Louis; Martins,Elias Nunes; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Luiz Otávio Campos da.
As estimativas de máxima verossimilhança restrita (REML), das variâncias e das covariâncias genéticas aditivas e residuais, do peso ao nascimento e dos pesos ajustados aos 120, 205, 240, 365, 420 e 550 dias de idade foram empregadas para determinar funções de covariâncias (CFs) do crescimento de 41.415 bovinos da raça Tabapuã, nascidos entre 1975 e 1997 e criados em regime de pastagem. A estimação das CFs mostrou-se bastante útil, pois, além de avaliar covariâncias entre qualquer par de idades, a análise das autofunções, associada aos autovalores das matrizes de coeficientes das CFs, revelou que as curvas de crescimento dos animais podem ser rapidamente alteradas pela seleção. Fatores como o estresse provocado pelo desmame, o ganho compensatório e a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Crescimento de bovinos; Funções de covariância; Parâmetros genéticos; Polinômios de Legendre.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000400011

Uso de modelos de regressão aleatória para descrever a variação genética da produção de leite na raça Holandesa
Provedor de dados: 96
Autores: Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Claudio Napolis; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Simone Inoe; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Pereira,Carmen Silva; Sarmento,José Lindenberg Rocha.
Registros de produção de leite de 68.523 controles leiteiros de 8.536 vacas da raça Holandesa, com parições nos anos de 1996 a 2001, foram utilizados na comparação entre modelos de regressão aleatória para estimação de componentes de variância. Os registros de controle leiteiro foram analisados como características múltiplas, considerando cada controle uma característica distinta. Os mesmos registros de controle leiteiro foram analisados como dados longitudinais, por meio de modelos de regressão aleatória, que diferiram entre si pela função utilizada para descrever a trajetória da curva de lactação dos animais. As funções utilizadas foram a exponencial de Wilmink, a função de Ali e Schaeffer e os polinômios de Legendre de segundo e quarto graus. A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; Regressão aleatória; Produção de leite.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400006

Efeito da interação reprodutor x rebanho sobre os valores genéticos de reprodutores para produção de leite e gordura na raça Pardo-Suíça
Provedor de dados: 96
Autores: Bueno,Rachel Santos; Torres,Robledo de Almeida; Rennó,Francisco Palma; Pereira,José Carlos; Araújo,Cláudio Vieira de; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico.
Registros de produção de leite e de gordura foram utilizados com o objetivo de verificar o efeito das interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano sobre os valores genéticos de reprodutores da raça Pardo-Suíça. Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, utilizando-se três modelos de características múltiplas, considerando-se como efeitos fixos grupo genético, estação de parto e classe de rebanho-ano e, como aleatórios, os efeitos de animal, de ambiente permanente, de interação reprodutor x rebanho ou reprodutor x rebanho-ano, quando considerada no modelo, e do erro. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado, para verificação da efetividade da inclusão dos efeitos de interação nos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovino de leite; Componentes de variância; Interação genótipo-ambiente.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000400009

Estudo da associação entre características de desempenho e de carcaça de suínos por meio de correlação canônica
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Torres,Robledo de Almeida.
Dados de 844 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados para avaliar a associação entre características de desempenho e carcaça por meio de correlação canônica. Foram consideradas no estudo, além das características de desempenho, o tamanho da leitegada ao nascimento, o número de tetos, o peso aos 77 dias de idade, o consumo de ração e a conversão alimentar dos 77 aos 105 dias e as seguintes características de carcaça: idade ao abate; peso da meia-carcaça direita; comprimento de carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça; maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar; profundidade de lombo; e pesos do coração, do baço, do rim, da meia-carcaça direita resfriada, do pernil, da copa, da paleta, do carré, das...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise multivariada; Carcaça; Correlação; Desempenho; Pares canônicos; Variáveis canônicas.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000700008

Avaliação genética de bovinos da raça holandesa usando a produção de leite no dia do controle
Provedor de dados: 96
Autores: Ferreira,William José; Teixeira,Nilson Milagres; Euclydes,Ricardo Frederico; Verneque,Rui da Silva; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Wenceslau,Amauri Arias; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Magalhães Júnior,Márcio Nery.
Utilizaram-se 153.963 controles mensais de produção de leite e 13.273 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa, com partos entre 1989 a 1998, com o objetivo de estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e de meio ambiente para produção de leite no dia do controle (PLDC) e produção até 305 dias de lactação (P305), bem como verificar a conveniência de se utilizar a PLDC em avaliações genéticas, em substituição à P305. Foram utilizados quatro modelos (modelo animal). Em dois, modelos 1 e 2, consideraram-se os controles mensais de produção, coletados ao longo da lactação, como medidas repetidas de um animal, diferenciados segundo o critério de formação de grupos de animais contemporâneos. No modelo 1 (PLDCM01), as produções dos animais foram agrupadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Controle mensal; Método REML; Modelo animal; Produção de leite; Raça Holandesa.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000200007

Semen cryopreservation of Piau swine breed submited to three freezing protocols
Provedor de dados: 96
Autores: Barros,Maurício Hoshino da Costa; Shiomi,Hugo Hideki; Amorim,Lincoln da Silva; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Siqueira,Jeanne Broch; Guimarães,José Domingos.
The objective of this study was to verify the effect of three protocols of cryopreservation on the sperm viability post-thawing of swine from the Piau breed (Sus scrofa), by means of evaluation assays in vitro and in vivo. Twenty-two ejaculates of 5 adult males of the Piau breed trough the gloved-hand method. In order to verify the sperm viability of the raw semen and post-thawing, the following traits were evaluated: sperm motility and vigor, hypoosmotic test, supra-vital color test and percentage of normal acrosomes. To freezing, the ejaculates were fractioned and submitted in: method 1, method of freezing recommended by Fürst et al. (2005), modified according to media extender; method 2, recommended by Fürst et al. (2005), modified according to the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Boars; Intra-uterine insemination; Spermatozoa.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000400012

Análises da persistência na lactação de vacas da raça Holandesa, usando produção no dia do controle e modelo de regressão aleatória
Provedor de dados: 96
Autores: Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Ameida; Pereira,Carmen Silva.
Foram utilizados 87.045 registros de produção de leite, na primeira lactação, de 11.023 vacas da raça Holandesa, obtidos nos anos de 1997 a 2001, em diferentes rebanhos distribuídos em dez núcleos do Estado de Minas Gerais. Foram avaliados seis tipos de mensuração da persistência na lactação utilizando-se os valores genéticos da produção de leite, obtidos por meio do modelo de regressão aleatória - MRA. Utilizou-se a função de Wilmink na descrição dos efeitos aleatórios e fixos, pelo MRA. As estimativas de herdabilidade e de correlação genética, para as várias mensurações da persistência na lactação, variaram em decorrência da definição da persistência. As estimativas de herdabilidade para persistência na lactação variaram de 0,11 a 0,27 e as estimativas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Correlação genética; Herdabilidade; Modelos de regressão aleatória; Persistência na lactação; Produção de leite no dia do controle; Raça Holandesa.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000300004

Avaliação de modelos para estimativa de componentes de (co)variância em características reprodutivas de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Regazzi,Adair José; Costa,André Ribeiro Corrêa da.
Foram analisados dados de características reprodutivas de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White, para avaliar a importância de inclusão dos efeitos genético materno e comum de leitegada em modelos animais. As características tamanho de leitegada ao nascimento, tamanho de leitegada ao desmame, peso de leitegada ao nascimento, peso de leitegada aos 21 dias de idade e taxa de mortalidade foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo-se um valor de verossimilhança para cada característica e raça. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para se verificar qual o modelo mais adequado na avaliação genética animal: o modelo 1, que continha o efeito genético direto; o modelo 2, que continha os efeitos genéticos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Efeito materno; Modelo animal; REML; Teste da razão de verossimilhança.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600013

Aspectos genéticos e ambientais da curva de lactação de vacas da raça Guzerá
Provedor de dados: 96
Autores: Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Martinho de Almeida e.
O conhecimento das relações genéticas entre os parâmetros da curva de lactação e a produção de leite é importante para a seleção de vacas e de touros. Os registros de produção de leite de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 reprodutores, foram usados para estimação dos parâmetros da curva de lactação em dois modelos matemáticos. As informações referentes às produções de leite foram obtidas usando-se a base de dados extraída do Arquivo Zootécnico Nacional, mantido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Gado de Leite). As análises foram efetuadas usando-se o sistema MTDFREML, sob modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto e, como covariável, a idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático. Como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Correlações genéticas; Curva de lactação; Método REML; Modelos matemáticos; Raça Guzerá.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500011

Estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros por meio de análise de regressão aleatória utilizando-se a Amostragem de Gibbs
Provedor de dados: 96
Autores: Assis,Giselle Mariano Lessa de; Albuquerque,Lucia Galvão de; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Carneiro Júnior,José Marques; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira.
Modelos de regressão aleatória foram utilizados neste estudo para estimar parâmetros genéticos da produção de leite no dia do controle (PLDC) em caprinos leiteiros da raça Alpina, por meio da metodologia Bayesiana. As estimativas geradas foram comparadas às obtidas com análise de regressão aleatória, utilizando-se o REML. As herdabilidades encontradas pela análise Bayesiana variaram de 0,18 a 0,37, enquanto, pelo REML, variaram de 0,09 a 0,32. As correlações genéticas entre dias de controle próximos se aproximaram da unidade, decrescendo gradualmente conforme a distância entre os dias de controle aumentou. Os resultados obtidos indicam que: a estrutura de covariâncias da PLDC em caprinos ao longo da lactação pode ser modelada adequadamente por meio da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise Bayesiana; Caprinocultura leiteira; Componentes de variância; Correlação genética.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000300011

Avaliação de características de carcaça de suínos utilizando-se a análise dos componentes principais
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Torres,Robledo de Almeida.
Dados de 367 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados na análise estatística, utilizando-se os componentes principais, para avaliação da possibilidade de redução da dimensionalidade do espaço multivariado em 33 características de carcaça. Dos 33 componentes principais, 17 apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), que sugere 17 variáveis para descarte e correlação linear simples significativa com as demais, ou seja, foram redundantes. Com base nos resultados, recomenda-se que as seguintes variáveis sejam mantidas em experimentos futuros: idade ao abate; peso da meia-carcaça direita; comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça; maior espessura de toucinho na região da copa, na linha...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise multivariada; Carcaça; Correlação; Descarte de variáveis.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000700007

Oscilação genética em populações submetidas a métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
Com o objetivo de avaliar o efeito da oscilação genética em populações sob seleção com diferentes tamanhos efetivos, foram simulados dados utilizando-se o programa GENESYS. A seleção foi praticada durante 20 gerações consecutivas, com base na seleção individual (SI) e nos valores genéticos preditos pelo BLUP Clássico (BLUP) e pelo BLUP Marcadores (BLUPM), com 30 repetições. A matriz de similaridade adotada no BLUP Marcadores foi obtida utilizando-se 100 marcadores moleculares do tipo microssatélite, por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclidiana média para dados quantitativos. Foram simuladas seis populações de seleção, correspondendo a dois tamanhos efetivos (18,18 e 66,66) e três sistemas de acasalamento dos reprodutores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção individual.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000100010

Estimativas de rendimentos de cortes comerciais e de tecidos de suínos em diferentes pesos de abate pela técnica de ultra-sonografia em tempo real
Provedor de dados: 96
Autores: Dutra Jr.,Wilson Moreira; Ferreira,Aloízio Soares; Urdapilleta Tarouco,Jaime; Euclydes,Ricardo Frederico; Donzele,Juarez Lopes; Lopes,Paulo Sávio; Cardoso,Leandro Lunardini.
Foram utilizadas 48 fêmeas suínas abatidas aos 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110 e 120 kg para determinar os rendimentos de cortes comerciais e de carne magra na carcaça, visando-se estimar área de olho de lombo (AOL) e espessura de toucinho (ET), utilizando-se a técnica de ultra-sonografia em tempo real. Foram tomadas medidas ultra-sônicas in vivo, para AOL e ET; nas carcaças quentes, utilizou-se equipamento óptico da marca Hennessy, a fim de estimar a ET e profundidade de músculo (PM). As equações para estimar a quantidade de músculo na carcaça obtiveram R² entre 0,97 e 0,99, com desvio-padrão residual entre 0,27 e 0,73. Os valores de R² para área de olho de lombo, por ultra-som e pela medida direta nas carcaças, foram de 0,97 e 0,98, respectivamente, com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Área de olho de lombo; Cortes cárneos; Equações simples e múltiplas; Espessura de toucinho; Rendimento de carne magra.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500017

Avaliação da introdução de tecnologias no sistema de produção de gado de corte no Pantanal: análise de eficiência
Provedor de dados: 96
Autores: Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Lopes,Paulo Sávio; Baptista,Antonio José M. dos Santos; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento.
Utilizando-se a metodologia de análise envoltória de dados (DEA), analisou-se, neste estudo, a eficiência de um sistema de produção no qual foram implantadas tecnologias ao longo de oito anos (1995-2002). Foram consideradas informações sobre dez categorias de gastos com insumos (inputs) e uma categoria de produto (output). Utilizou-se a técnica multivariada de componentes principais, com o objetivo de diminuir o número das variáveis de input. Os insumos sal mineral/vacinas/medicamentos, mão-de-obra/encargos sociais e investimentos apresentaram correlação significativa com os três primeiros componentes principais, que explicaram 91,6% da variância total. As eficiências verificadas nos anos de 1995, 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001 e 2002, respectivamente,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise envoltória de dados (DEA); Bovino de corte; Sistema de produção.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400040

Influência da informação a priori na avaliação genética animal utilizando dados simulados
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro Júnior,José Marques; Assis,Giselle Mariano Lessa de; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio.
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de verificar a influência da informação a priori nas avaliações genéticas dos animais. Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans, considerando-se uma única característica quantitativa, determinada por 800 locos, com dois alelos por loco, na qual a herdabilidade variou de 0,40 a 0,60. Foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas, que formaram a população-base. A partir da população-base, foram formados três tamanhos de populações: POP1 (100 animais), POP2 (300 animais) e POP3 (1.600 animais). Foram empregados três níveis de informação a priori: priors não-informativos (PNI), priors pouco informativos (PPI) e priors informativos (PI). Foram avaliadas também as conseqüências de se incluir nas análises...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise Bayesiana; Componentes de variância; Informação a priori; Parâmetros genéticos; Simulação.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000600014

Avaliação de características de qualidade da carne de suínos por meio de componentes principais
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Torres,Robledo de Almeida.
Dados de 326 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados para avaliar a redução da dimensionalidade do espaço multivariado por meio de componentes principais. Foram consideradas as seguintes características: pH aos 45 minutos e 24 horas post-mortem (pH45 e pHu, respectivamente), perda de peso por gotejamento (GOTEJ), perda de peso por cozimento (COZ), perda de peso total (PTOT), gordura intramuscular (GORINT), maciez objetiva (MACIEZ), luminosidade (L), índice de vermelho (a) e índice de amarelo (b). Quatro componentes principais, obtidos a partir da matriz de correlação, apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), o que sugere quatro variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes, em valor absoluto, a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise multivariada; Correlação; Descarte de variáveis; Suínos.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600009

Heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de búfalas no Brasil
Provedor de dados: 96
Autores: Moita,Antonia Kécya França; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Tonhati,Humberto; Freitas,Ary Ferreira de.
Registros de produção de leite de 754 búfalas da raça Murrah foram utilizados com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética. Os componentes de covariância foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita utilizando-se quatro modelos bicaracterísticos, considerando, como efeitos fixos, estação de parto e rebanho-ano de parto, e idade da vaca como covariável (efeito linear e quadrático). Os quatro modelos utilizados foram: modelo aditivo; modelo de repetibilidade; modelo aditivo com inclusão interação reprodutor x rebanho-ano; modelo de repetibilidade com inclusão da interação reprodutor x rebanho-ano. Os rebanhos foram classificados em duas classes de desvio-padrão fenotípico para produção de leite e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Palavras-chave: Estratificação dos dados; Melhoramento genético de búfalos.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000700007

Avaliação da introdução de tecnologias no sistema de produção de gado de corte no Pantanal
Provedor de dados: 96
Autores: Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento.
O desempenho produtivo de 1.075 matrizes e a estrutura etária do rebanho foram monitorados durante cinco anos (maio de 1994 a maio de 1999) em uma fazenda com sistema extensivo de cria de bovinos de corte na região do Pantanal. Nesse período, tecnologias foram introduzidas com o objetivo de modificar o sistema tradicional de produção da região e, conseqüentemente, melhorar o desempenho produtivo do rebanho de cria como um todo. As vacas foram numeradas e monitoradas durante a realização dos trabalhos de gado (TG), sendo classificadas como solteira ou parida e, conforme avaliação do desempenho reprodutivo ao longo dos trabalhos de gado, eram mantidas no rebanho ou descartadas. Os resultados foram modelados por meio de equações de estimação generalizadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação de rebanho; Sistema de produção extensiva; Equações de estimação generalizadas.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000800040

Mapeamento de locos de características quantitativas no cromossomo 6, associados às características de carcaça e de órgãos internos de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
Com o objetivo de mapear locos de características quantitativas (QTLs) associados às características de carcaça e de órgão internos, uma população composta de 550 animais F2 foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites distribuídos no cromossomo 6. As características avaliadas foram: comprimento de carcaça pelos métodos brasileiro e americano, peso e rendimento de carcaça, espessura de toucinho na região da copa, espessura de toucinho imediatamente após a última costela, espessura de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar, menor espessura de toucinho na região...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: QTL; Cruzamento divergente; Genética molecular; Melhoramento animal.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600012

Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e freqüentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro Júnior,José Marques; Assis,Giselle Mariano Lessa de; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Heterocedasticidade; Informação a priori; Melhoramento animal; Parâmetros genéticos; Simulação.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000700012

Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pinto,Ana Paula Gomes; Lopes,Paulo Sávio; Lopes,Marcos Soares; Silva Filho,Miguel Inácio; Sousa,Katiene Régia Silva; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
Objetivou-se com este estudo mapear locos de características quantitativas (QTL) nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos (Sus scrofa) e associar seus efeitos em características de carcaça, cortes de carcaça, órgãos e vísceras, desempenho e qualidade de carne. Utilizaram-se amostras de DNA de animais pertencentes a uma população F2, oriunda do cruzamento entre machos da raça Piau e fêmeas Landrace õ Large White õ Pietrain. Um total de 13 locos microssatélites foi utilizado na construção dos mapas de ligação da população atual. As análises de associação foram feitas utilizando-se mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL. Identificaram-se associações significativas, em nível cromossômico, entre regiões do cromossomo 9 e as características peso...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise genômica; População F2; Produção de suínos; Microssatélites.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001000011

Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 16, 17 e 18 de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Paixão,Débora Martins; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Silva Filho,Miguel Inácio da; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Mário Sérgio; Solero,Bruna Pena.
Objetivou-se com este trabalho realizar o mapeamento de Locos de características quantitativas (QTL) nos cromossomo 16, 17 e 18 de suínos e associar seus efeitos com características de desempenho. Utilizou-se uma população F2 proveniente do cruzamento de dois varrões da raça naturalizada brasileira Piau com 18 fêmeas de linhagem comercial (Landrace x Large White x Pietrain). A população foi genotipada para 11 marcadores microssatélites e o mapa de ligação específico dos marcadores para a população foi construído. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas quando analisado o conteúdo de informação polimórfica (PIC). Para identificação do QTL, utilizou-se o método de regressão por intervalo de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise genômica; População F2; Produção de suínos.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001000010

Efeito de tipos de acasalamentos e razões sexuais na seleção baseada no BLUP
Provedor de dados: 96
Autores: Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Ribeiro Júnior,José Ivo; Carneiro,Pedro Crescêncio Souza.
Diferentes tipos de acasalamentos foram avaliados, por meio de dados simulados, em populações submetidas à seleção com base no BLUP, durante 50 gerações. Considerou-se uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10 e a seguinte estrutura das populações de seleção: valores de razão sexual: 10, 20, 25 e 50; números de machos selecionados por geração: 10, 5, 4 e 2; tamanhos efetivos de população: 36,36; 19,05; 15,38; e 7,84, respectivamente. Em cada valor de razão sexual, as populações foram acasaladas segundo um dos tipos de acasalamentos: acasalamentos preferenciais de meios-irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Consangüinidade; Dados simulados; Seleção no longo prazo; Tamanhos efetivos de população.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000600003

Association between leptin gene single nucleotide polymorphisms and carcass traits in pigs
Provedor de dados: 96
Autores: Peixoto,Jane de Oliveira; Faria,Danielle Assis de; Silva,Priscila Vendramini; Fonseca,Isabela; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
It was investigated the association between leptin gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) T2411C and T3266G with carcass traits in F2 pigs obtained by crossing native Brazilian Piau with commercial sows composed of Landrace, Large White and Pietrain breeds. Association analyses were performed using a statistical model that included genotype, sex, and batch as fixed effects, sire and error as random effects. The T2411C SNP was associated with skinless and fatless boston shoulder weight (BSW), backfat thickness at last rib, 6.5 cm from the midline (P2), skinless and fatless picnic shoulder weight, and sirloin weight (SLW). The T3266G mutation was associated with slaughter age, bacon weight, BSW, midline backfat thickness between last and last but one...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Candidate gene; Pig genomics; Pig production.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000200008

Efeito da interação reprodutor x rebanho sobre as produções de leite e de gordura na raça Pardo-Suíça
Provedor de dados: 96
Autores: Sirol,Mirella Leme Franco Geraldini; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva; Araújo,Cláudio Vieira; Rennó,Francisco Palma.
Dados de 4.959 lactações de 2.414 vacas da raça Pardo-Suíça, filhas de 70 reprodutores, distribuídos em 51 rebanhos, foram utilizados para se estimar o componente de variância para a interação reprodutor x rebanho das produções de leite e de gordura e verificar o efeito desta interação sobre a avaliação genética dos reprodutores, por meio de modelos que diferiam na presença e ausência do termo de interação. As produções de leite e de gordura foram ajustadas para duas ordenhas diárias, 305 dias de lactação e idade adulta da vaca. O teste da razão de verossimilhança foi utilizado na verificação da efetividade da inclusão da interação no modelo. As médias das produções de leite e de gordura foram 6085,79 ± 1629,73 kg e 225,61 ± 60,44 kg, respectivamente. A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Acurácia; Avaliação genética; Bovinos leiteiros; Componentes de variância; Correlação genética; Interação genótipo x ambiente.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000500018

Erros na classificação de touros, vacas e touros jovens geneticamente superiores avaliados na presença de heterogeneidade
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Cunha,Elizângela Emidio.
Foram simuladas quatro estruturas de dados com diferentes padrões de heterogeneidade entre rebanhos e com diferentes graus de conexidade genética. As estruturas simuladas diferiam quanto aos parâmetros heterogêneos entre rebanhos: 1) heterogeneidade para todos os parâmetros; 2) médias genéticas homogêneas e demais parâmetros heterogêneos; 3) heterogeneidade para parâmetros fenotípicos; e 4) rebanhos sem heterogeneidade. Após a predição dos valores genéticos, calculou-se a porcentagem de animais comuns entre dois grupos de classificação para os animais geneticamente superiores: grupo 1 - classificação com base nos valores genéticos verdadeiros e grupo 2 - classificação com base nos valores genéticos preditos. Para dados com heterogeneidade para todos os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; Conexidade; Seleção; Simulação.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000700005

Heteroskedasticity for weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves
Provedor de dados: 96
Autores: Toral,Fábio Luiz Buranelo; Torres Júnior,Roberto Augusto de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Cardoso,Fernando Flores; Silva,Luiz Otávio Campos da.
The objective of the present study was to analyze models with genetic and/or residual heteroskedasticity for genetic evaluation of the weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves. Weaning weight data from 56,965 crossbred calves were analyzed using animal models with different combinations of genetic and residual heteroskedasticity and/or homoskedasticity. The inference on a posteriori distributions of genetic parameters were by the Monte Carlo method via Markov chains. The model with genetic and residual heteroskedasticity was the best fit on the data. Groups of animals with different genetic compositions, expressed as percentages of Charolais-Zebu breed alleles and individual and maternal heterozygosis, had different genetic variances. These...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Animal breeding; Bayesian inference; Canchim; Crossbreeding; Selection.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000500013

Efeito de erros de pedigree na seleção
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados com cinco níveis de erros de pedigree (0, 5, 10, 15 e 20%) e três herdabilidades (0,10; 0,30; e 0,60) foram usados para verificar o efeito de erros de pedigree na seleção por 10 gerações consecutivas. Os maiores valores fenotípicos e de eficiência sobre a seleção individual, em geral, foram obtidos com o BLUP sem erro, seguidos daqueles com 5, 10, 15 e 20% de erro. A superioridade média em ganho genético do BLUP por geração, nos vários níveis de erros, sobre a seleção individual, decresceu com o aumento da herdabilidade da caraterística. Na medida em que se elevaram os níveis de erros, o BLUP apresentou maior redução no ganho genético para as características com menores herdabilidades.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BLUP; Ganho genético; Seleção individual; Simulação.
Ano: 1999
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35981999000200008

Efeito da interação reprodutor x rebanho na acurácia da avaliação genética de reprodutores da raça Holandesa no Brasil
Provedor de dados: 96
Autores: Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Cláudio Nápolis; Pereira,Carmen Silva; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Registros de produção de leite referentes a 37.006 lactações provenientes de 18.540 vacas, filhas de 98 reprodutores e distribuídas em 455 rebanhos de vacas da raça Holandesa foram utilizados com o objetivo de verificar qual seria o efeito nas estimativas dos valores genéticos e na acurácia dessas estimativas, incluindo no modelo o termo de interação reprodutor x rebanho, em comparação com as estimativas de um modelo que não incluía o termo de interação reprodutor x rebanho. A produção de leite foi previamente ajustada para 305 dias de lactação e idade adulta da vaca. Os componentes de variância para produção de leite foram estimados pela máxima verossimilhança restrita, O teste da razão de verossimilhança foi utilizado na verificação da efetividade da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; Interação reprodutor x rebanho; Produção de leite.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000400013

Avaliação de modelos para estimação de componentes de (co)variância em características de desempenho e reprodutivas em suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Araújo,Cláudio Vieira de; Pereira,Carmen Silva; Silva,Martinho de Almeida e.
Foram analisados dados de características de desempenho e reprodutivas de suínos de uma linha em desenvolvimento da raça Large White, para verificar a importância da inclusão dos efeitos materno e comum de leitegada nos modelos de avaliação genética animal, utilizando quatro diferentes modelos: modelo 1 - efeito genético aditivo direto; modelo 2 - efeito genético aditivo direto e materno; modelo 3 - efeito genético aditivo direto e comum de leitegada; e modelo 4 - efeito genético aditivo direto e materno e comum de leitegada. As características foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo um valor de verossimilhança para cada característica. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para verificar qual o modelo mais...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Correlação amostral; Correlação de ordem; Efeito materno; Efeito comum de leitegada; Teste da razão de verossimilhança.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200011

Avaliação de métodos de estimação de componentes de variância utilizando dados simulados
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida.
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar análise comparativa entre os métodos de estimação de componentes de variância: método da máxima verossimilhança restrita (REML), método da máxima verossimilhança (ML) e método III de Henderson. Todos os três métodos foram utilizados com modelo reprodutor, e o método REML foi utilizado também com modelo animal. Objetivou-se verificar, principalmente, o efeito do desbalanceamento na estimação dos componentes de variância. Foi simulado um genoma, constituído de uma única característica quantitativa governada por 200 locos. O genoma foi utilizado na construção de três populações-base com herdabilidades de 0,60, 0,30 e 0,10, constituídas de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). A partir de cada...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Componentes de variância; Estimação/métodos; Melhoramento animal; Simulação.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200008

Uso da iteração nos dados para resolução de equações de modelo misto
Provedor de dados: 96
Autores: Lopes,Paulo Sávio.
Valores genéticos foram preditos usando-se a iteração nos dados em um modelo animal reduzido. O peso corporal, aos 35 dias de idade, de duas linhas de aves de corte foi medido em duas gerações, cujo arquivo de dados consistia de 1044 pais (população-base), 829 progênies-pais e 9039 progênies-não-pais. O número de iterações e o tempo de processamento, para obtenção das soluções das equações de modelo misto via iteração nos dados, foram avaliados por sete critérios de convergência (10¹ a 10-5 ). Seis iterações foram necessárias, com 9 s de tempo, e 158 iterações, com 5 min e 38 s, para se obterem as soluções para os critérios de convergência de 10¹ e 10-5, respectivamente. As correlações entre os valores genéticos preditos foram perfeitas (r=1,00), e não...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; Iteração nos dados; Modelos mistos.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000200017

Tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e materno em características reprodutivas de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Costa,André Ribeiro Corrêa da.
Foram utilizados dados de peso da leitegada ao nascimento (PLN), peso da leitegada aos 21 dias (PL21), tamanho de leitegada ao nascimento (TLN), tamanho de leitegada ao desmame (TLD) e taxa de mortalidade (TM), para avaliar a tendência genética atribuída aos efeitos genéticos aditivos diretos e maternos, em suínos Duroc, Landrace e Large White. As estimativas dos componentes de (co)variância foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML). As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e materno foram calculadas pela regressão das médias dos valores genéticos preditos das características, em relação ao ano de nascimento das porcas. As estimativas de tendências genéticas dos efeitos diretos mostraram que pouco ou praticamente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BLUP; Características reprodutivas; Suínos; Tendências genéticas.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600014

Exigência de fósforo disponível para frangos de corte machos e fêmeas de 22 a 42 e de 43 a 53 dias de idade
Provedor de dados: 96
Autores: Gomes,Paulo Cezar; Runho,Richard Cesar; D'Agostini,Priscila; Rostagno,Horacio Santiago; Albino,Luiz Fernando Teixeira; Lopes,Paulo Sávio.
Com o objetivo de se avaliar o requerimento nutricional de fósforo disponível para frangos de corte machos e fêmeas nas fases de crescimento e final, foram utilizados 864 e 720 frangos de corte, 50% de cada sexo, nos períodos de 22 a 42 e de 43 a 53 dias de idade, respectivamente. Seis níveis de fósforo disponível foram adicionados às rações basais deficientes em fósforo disponível. Os níveis de fósforo disponível adicionados foram 0,0; 0,09; 0,18; 0,27; 0,36 e 0,45%, para o período de 22 a 42 dias de idade, e 0,0; 0,07; 0,14; 0,21; 0,28 e 0,35%, para o período de 43 a 53 dias de idade. Ganho de peso, consumo de ração, conversão alimentar, teores de cinzas e fósforo nos ossos e resistência à quebra dos ossos foram avaliados nos períodos de 22 a 42 e de 43...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cinza nos ossos; Fósforo disponível; Frangos de corte; Resistência à quebra.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000700012

Razões entre componentes da variabilidade de características quantitativas simuladas com efeitos genéticos de dominância e sobredominância
Provedor de dados: 96
Autores: Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
Foram avaliadas as razões entre componentes da variabilidade de características quantitativas simuladas a partir de genoma incorporando efeitos genéticos não-aditivos em populações de acasalamento ao acaso e de seleção fenotípica a curto prazo. Estudaram-se uma característica de baixa (h² = 0,10) e outra de alta herdabilidade (h² = 0,60) influenciadas por 600 locos bialélicos. Cinco modelos de ação gênica foram simulados, dos quais quatro incluíram dominância completa e positiva para 25, 50, 75 e 100% dos locos (D25, D50, D75 e D100, respectivamente); e um modelo incluiu sobredominância positiva para 50% dos locos. Todos os modelos incluíram efeitos aditivos dos alelos para 100% dos locos. As principais razões quantificadas foram d² (variância de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Efeito genético não-aditivo; Seleção fenotípica; Simulação; Variação fenotípica.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009001000006

Estimation of variance components, genetic parameters and genetic trends for litter size of swines
Provedor de dados: 96
Autores: Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Júnior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.
Records of Large White breed animals were used to estimate variance components, genetic parameters and trends for the character total number of born piglets (TNBP) as measure of litter size. For obtaining variance components and genetic parameters, it was used the Restricted Maximum Likelihood Method using MTDFREML software. Two mixed models (additive and repeatability) were evaluated. The additive model contained fixed effect of the contemporary group and the following random effects: direct additive genetic and residual effect for the first parturition. Repeatability model had the same effects of the additive model plus parturition order fixed effect and non-correlated animal permanent environment random effect for the second, third and forth...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Genetic trend; Heritability; Number of piglets; REML; Repeatability model; Reproductive traits.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001000008

Modelos de regressão aleatória na avaliação da produção de leite em cabras da raça Saanen
Provedor de dados: 96
Autores: Menezes,Gilberto Romeiro de Oliveira; Torres,Robledo de Almeida; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Rodrigues,Marcelo Teixeira; Brito,Luiz Fernando; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Felipe Gomes da.
Foram utilizados 10.238 registros semanais de produção de leite no dia do controle leiteiro provenientes de 388 primeiras lactações de cabras da raça Saanen visando comparar diferentes modelos de regressão aleatória (MRA). Primeiramente, foram comparados cinco modelos, cujos termos exponenciais da função de Wilmink assumiram os seguintes valores -0,0350; -0,0500; -0,0565; -0,0680 e -0,1000 (W0350, W0500, W0565, W0680 e W1000, respectivamente), considerando-se homogeneidade de variância residual ao longo da lactação. No modelo W0500, o valor -0,0500 foi mantido, enquanto nos modelos W0350, W0565, W0680 e W1000 foram usados os valores -0,0350; -0,0565; -0,0680; e -0,1000, respectivamente, em substituição ao valor -0,0500, proposto no modelo original...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Função de Wilmink; Leite; Modelagem; Produção de leite no dia do controle; Variância residual.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000700018

Estimação de parâmetros genéticos de medidas de conformação, produção de leite e idade ao primeiro parto em vacas da raça Gir Leiteiro
Provedor de dados: 96
Autores: Wenceslau,Amauri Arias; Lopes,Paulo Sávio; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Euclydes,Ricardo Frederico; Ferreira,William José; Silva,Martinho de Almeida e.
RESUMO - Foram utilizados 573 registros zootécnicos de vacas primíparas da raça Gir Leiteiro para estimar os componentes de (co)variância das características de conformação, produção de leite em até 305 dias de lactação (PLEI) e idade ao primeiro parto (IPP) pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo dos coeficientes de herdabilidade e nas correlações genéticas, fenotípicas e residuais. As medidas de conformação, circunferência torácica (CTOR), altura na garupa (AG), comprimento corporal (CC), comprimento de tetas (CT), diâmetro de tetas (DT) e altura de úbere (AU) foram realizadas em vacas à primeira lactação, com idade média de 4,05 anos. As correlações genéticas e fenotípicas entre PLEI e IPP...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovino de leite; Correlação genética; Raça Gir; REML.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000100021

Inbreeding on productive and reproductive traits of dairy Gyr cattle
Provedor de dados: 96
Autores: Reis Filho,João Cruz; Verneque,Rui da Silva; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Raidan,Fernanda Santos Silva; Toral,Fabio Luiz Buranelo.
The objective of this study was to estimate genetic parameters and to evaluate the effects of inbreeding on productive and reproductive traits of dairy Gyr cattle. Single-trait animal models were used to estimate genetic parameters and solutions for inbreeding coefficients for milk (milk 305-d), fat (fat 305-d), protein (protein 305-d), lactose (lactose 305-d), and total solids (TS 305-d) yield up to 305 days of lactation, days in milk (DIM), age at first calving (AFC) and calving intervals (CI). The mean inbreeding coefficient was 2.82%. The models with linear and quadratic effects of inbreeding coefficients fitted the data better than the models without or with only linear effect of inbreeding coefficient for all traits. The increase in inbreeding...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Dairy cattle; Genetic parameter; Heritability; Inbreeding depression.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982015000500174

Efeito da seleção errônea de machos sobre ganhos genéticos, utilizando-se simulação
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Populações simuladas foram usadas para verificar o efeito de erros na seleção de machos sobre estimativas de ganhos genéticos, ao longo de dez gerações de seleção, usando o BLUP. Cinco níveis de erros na seleção de machos (0, 5, 10, 15 e 20%) e três herdabilidades (0,10; 0,30; e 0,60) foram trabalhados. Vinte machos e 200 fêmeas foram selecionados pelo BLUP. Após a seleção dos 20 machos em cada geração, 1, 2, 3 e 4 reprodutores foram substituídos por outros aleatoriamente. Os valores fenotípicos e a eficiência do BLUP com erro, em relação ao BLUP sem erro, foram reduzidos com o aumento no nível de erro. A redução dos ganhos genéticos, em função da inclusão deste tipo de erro, não apresentou, aparentemente, associação com a herdabilidade da característica.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BLUP; Ganho genético; Seleção; Simulação.
Ano: 1999
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35981999000200007

Efeito da conexidade de dados sobre o valor fenotípico médio e a variância genética aditiva
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados foram utilizados para verificar o efeito da conexidade sobre o valor fenotípico médio e a variância genética aditiva. O genoma simulado foi constituído de uma característica quantitativa governada por 500 locos. Simulou-se o efeito de rebanho (9 rebanhos) significativo a 5% de probabilidade pelo teste F. Foram simulados arranjos de dados com 0, 15, 30, 60, 90 e 100% de conexidade para herdabilidades 0,10; 0,30; e 0,60 e para diferentes tamanhos de progênie (9, 54 e 90 progênies/reprodutor). A cada geração foram selecionados nove machos e o número de fêmeas selecionadas variou de acordo com o número de progênies considerado em cada arranjo de dados. A seleção foi efetuada em dez gerações, sendo este processo repetido por 30 vezes. O uso de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção e simulação.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000200006

Efeito da conexidade de dados sobre a acurácia dos testes de progênie e performance
Provedor de dados: 96
Autores: Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados foram utilizados para verificar o efeito da conexidade sobre a acurácia dos testes de progênie e performance. O genoma simulado foi constituído de uma característica quantitativa governada por 500 locos. Simulou-se o efeito de rebanho (9 rebanhos) significativo a 5% de probabilidade pelo teste F. Foram simulados arranjos de dados com 0, 15, 30, 60, 90 e 100% de conexidade para herdabilidades 0,10; 0,30; e 0,60 e para diferentes tamanhos de progênie (9, 54 e 90 progênies/reprodutor). A cada geração foram selecionados nove machos e o número de fêmeas selecionadas variou de acordo com o número de progênies considerado em cada arranjo de dados. A seleção foi efetuada em dez gerações, sendo este processo repetido por 30 vezes. O uso de dados com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção e simulação.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000200007

Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Bayesiana e clássica sob diferentes cenários
Provedor de dados: 96
Autores: Assis,Giselle Mariano Lessa de; Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Modelo infinitesimal; Modelos mistos; REML; Simulação computacional; Viés da seleção.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600007

Evaluation of Bayesian models for analysis of crude protein requirement for pigs of Brazilian Piau breed
Provedor de dados: 63
Autores: Silva,Hugo Teixeira; Silva,Fabyano Fonseca e; Ferreira,Aloízio Soares; Veroneze,Renata; Lopes,Paulo Sávio.
ABSTRACT: We evaluated the inclusion of information on genetic relationship into the analysis of crude protein requirement in diets for pigs of Brazilian Piau breed, using Bayesian inference. The animals were assigned to treatments in a completely randomized design in factorial scheme 4 × 2 (crude protein levels × sex) with 12 repetitions per treatment. The evaluations were carried out in the initial, growing and finishing phases, and after slaughter. The traits evaluated were feed conversion (FC), backfat thickness (BF), daily weight gain (DWG), daily feed intake (DFI) and some carcass cuts. Three models were considered to evaluate the inclusion of information on genetic relationship into the analysis: Model I, a simple linear model; Model II, the same...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bayesian inference; Genetic relationship; Model selection; Performance.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162019001300208

Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves
Provedor de dados: 63
Autores: Silva,Fabyano Fonseca e; Zambrano,Maria Fernanda Betancur; Varona,Luis; Glória,Leonardo Siqueira; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa; Arbex,Wagner; Lázaro,Sirlene Fernandes; Resende,Marcos Deon Vilela de; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
ABSTRACT: Genome association analyses have been successful in identifying quantitative trait loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome association...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: SNP markers; Body weight; Longitudinal data.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162017000100001

Modelagem hierárquica Bayesiana na avaliação de curvas de crescimento de suínos genotipados para o gene halotano
Provedor de dados: 65
Autores: Macedo,Leandro Roberto de; Silva,Fabyano Fonseca e; Cirillo,Marcelo Ângelo; Nascimento,Moysés; Paixão,Débora Martins; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Santos,Jussara Aparecida dos; Azevedo,Camila Ferreira.
Para avaliar a influência do gene halotano sobre a curva de crescimento de suínos, bem como sua interação com o sexo do animal, foi proposta uma modelagem hierárquica Bayesiana. Nesta abordagem, os parâmetros dos modelos não-lineares de crescimento (Logístico, Gompertz e von Bertalanffy) foram estimados conjuntamente com os efeitos de sexo e genótipos do gene halotano. Foram utilizados 344 animais F2(Comercial x Piau) pesados ao nascer, aos 21, 42, 63, 77, 105 e 150 dias. O modelo Logístico foi aquele que apresentou melhor qualidade de ajuste por apresentar menor DIC (Deviance Information Criterion) que os demais. As amostras das distribuições marginais a posteriori para as diferenças entre as estimativas dos parâmetros do modelo Logístico indicaram que o...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Melhoramento; Modelos não-lineares; Síndrome do estresse suíno.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001001853

Multi-Trait analysis of growth traits: fitting reduced rank models using principal components for Simmental beef cattle
Provedor de dados: 65
Autores: Mota,Rodrigo Reis; Costa,Edson Vinícius; Lopes,Paulo Sávio; Nascimento,Moyses; Silva,Luciano Pinheiro da; Silva,Fabyano Fonseca e; Marques,Luiz Fernando Aarão.
ABSTRACT: The aim of this research was to evaluate the dimensional reduction of additive direct genetic covariance matrices in genetic evaluations of growth traits (range 100-730 days) in Simmental cattle using principal components, as well as to estimate (co)variance components and genetic parameters. Principal component analyses were conducted for five different models-one full and four reduced-rank models. Models were compared using Akaike information (AIC) and Bayesian information (BIC) criteria. Variance components and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood (REML). The AIC and BIC values were similar among models. This indicated that parsimonious models could be used in genetic evaluations in Simmental cattle. The first...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Computational demand; Genetic parameters; Heritability.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782016000901656

Estrutura populacional da raça Girolando
Provedor de dados: 65
Autores: Canaza-Cayo,Ali William; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da; Cobuci,Jaime Araújo; Torres,Robledo de Almeida; Martins,Marta Fonseca; Arbex,Wagner Antonio.
O objetivo neste estudo foi avaliar a estrutura genética da população de bovinos da raça Girolando no Brasil. Analisou-se o arquivo de pedigree de 26.969 animais, composto de 3.031 machos e 23.938 fêmeas. O nível de conteúdo de informação do pedigree na geração atual foi 61%, mostrando ser de qualidade moderada. O coeficiente de endogamia médio e o coeficiente de relação médio da população Girolando foram 0,11 e 0,13%, respectivamente. O tamanho efetivo da população, considerando a geração completa traçada, foi 188, acima do nível crítico. Do total de 9.457 ancestrais que contribuíram para a população de referência, 457 explicaram 50% da variabilidade genética da população. O número efetivo de fundadores foi 551 e o de ancestrais 393. O intervalo médio de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coeficiente de endogamia; Girolando; Tamanho efetivo populacional.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001102072

Quadrados mínimos parciais uni e multivariado aplicados na seleção genômica para características de carcaça em suínos
Provedor de dados: 65
Autores: Azevedo,Camila Ferreira; Silva,Fabyano Fonseca e; Rezende,Marcos Deon Vilela de; Peternelli,Luiz Alexandre; Guimarães,Simone Eliza Facione; Lopes,Paulo Sávio.
A principal contribuição da genética molecular é a utilização direta das informações de DNA no processo de identificação de indivíduos geneticamente superiores. Sob esse enfoque, idealizou-se a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection - GWS), a qual consiste na análise de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma. Devido a esse grande número de SNPs, geralmente maior que o número de indivíduos genotipados, e à alta colinearidade entre eles, métodos de redução de dimensionalidade são requeridos. Dentre estes, destaca-se o método de regressão via Quadrados Mínimos Parciais (Partial Least Squares - PLS), que além de solucionar tais problemas, permite uma abordagem multivariada, considerando múltiplos fenótipos....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Seleção genômica; Redução de dimensionalidade; Análise multivariada.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000900017

Modelagem da dinâmica de rebanho de bovino de corte por meio de cadeia de Markov
Provedor de dados: 65
Autores: Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Santos,Sandra Aparecida; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento.
A estrutura etária do rebanho e a estratégia de descarte de matrizes são pontos importantes na avaliação da eficiência do sistema de produção de gado de corte. Neste trabalho foi monitorado o rebanho de cria, cujas matrizes eram mantidas ou descartadas com base em critério técnico, conforme a avaliação do desempenho reprodutivo. Para tanto, foi utilizada a cadeia de Markov com o objetivo de simular a probabilidade de descarte por idade, ao longo da vida, e de calcular a expectativa de vida da matriz no rebanho. Após a introdução da estação de monta, a pressão de descarte foi maior, com aumento da probabilidade de descarte e da diminuição da probabilidade de permanência da matriz no rebanho nas idades mais avançadas. Com a introdução de tecnologias e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise de sistema de produção; Descarte de matrizes; Introdução de tecnologias.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000900046

The optimal number of partial least squares components in genomic selection for pork pH
Provedor de dados: 65
Autores: Silveira,Fernanda Gomes da; Duarte,Darlene Ana Souza; Chaves,Lucas Monteiro; Silva,Fabyano Fonseca e; Filho,Ivan Carvalho; Duarte,Marcio de Souza; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
ABSTRACT: The main application of genomic selection (GS) is the early identification of genetically superior animals for traits difficult-to-measure or lately evaluated, such as meat pH (measured after slaughter). Because the number of markers in GS is generally larger than the number of genotyped animals and these markers are highly correlated owing to linkage disequilibrium, statistical methods based on dimensionality reduction have been proposed. Among them, the partial least squares (PLS) technique stands out, because of its simplicity and high predictive accuracy. However, choosing the optimal number of components remains a relevant issue for PLS applications. Thus, we applied PLS (and principal component and traditional multiple regression)...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: SNP; Genomic prediction; Meat quality.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782017000100652