Consulta: creatorFacets:"SANTOS, E. H. dos"
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Data/hora: 12/06/2024 15:43:29

Projeções de superfície 3D no plano para análise de interfaces proteicas através do Sting.
Provedor de dados: 14
Autores: GONÇALVES, M; N.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.
Análise, de forma visual, de como algumas grandezas físico-químico estão presentes na interface proteica. A proteína é mostrada em 3 dimensões(3D). Cada região da cadeia proteic é colorida com uma cor diferente, representando a variaçao de características físico-químicas na cadeia
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Superfície 3D; Interface proteicas através do Sting.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3012

Gene+: uma solução computacional distribuída para gerenciar ensaios de genotipagem e marcadores moleculares.
Provedor de dados: 14
Autores: GERMANO, E.; SILVA, H. de O.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.
Um ensaio de genotipagem é constituído de um conjunto de informações de amostras e marcadores moleculares para realização de experimentos destinados ao melhoramento genético. O desafio de gerenciar os dados dos ensaios em uma base de dados estruturada e permitir a exploração deles a partir de uma interface acessível via serviços web, é o principal objetivo do Gene+. Um modelo arquitetural foi elaborado e uma implementação está sendo realizada. Nessa implementação é utilizado um Application Programming Interface (API) Gateway com a finalidade de compor os serviços web e integrá-los com outros sistemas da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). Como forma de validar o modelo proposto, foi desenvolvido uma aplicação web usando o Google Web...
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Aplicação web; Sistema computacional; Gestão de dados; Dados genotípicos; Dados fenotípicos; API Gateway.
Ano: 2017
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1080976

Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes.
Provedor de dados: 14
Autores: BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCÃO, P. R. K.
bitstream/CNPTIA/11660/1/bp17.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bioinformática; Geometria computacional; Triangulação de Delaunay; Teoria Alpha Shapes; Estrutura de proteína.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1327

Protocolo para cifra de uso único via função NOT controlada.
Provedor de dados: 14
Autores: MINTO NETO, J. G.; SANTOS, E. H. dos; CASTRO, A. de.
Resumo ? Criptografia é uma técnica de proteção da informação que consiste em codificar o conteúdo de uma mensagem por meio da utilização de algoritmos matemáticos a fim de criar padrões de segurança de armazenamento de dados e de gestão de tráfego entre dispositivos automatizados. Neste trabalho, é apresentado um protocolo de criptografia simétrica baseada em cifra de uso único One-Time Pad, (OTP) associada ao modo de operação Electronic Code Book (ECB). O protocolo consiste em um algoritmo que divide a mensagem original em blocos, e cada bloco é criptografado separadamente combinando caractere por caractere da mensagem original a uma chave criptográfica aleatória que é utilizada apenas uma vez para garantir que o sistema seja imperscrutável. A chave...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Criptografia; Criptografia simétrica; Protocolo de criptografia simétrica; Porta CNOT; Cryptography.
Ano: 2018
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1090389

Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.
Provedor de dados: 14
Autores: OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCÃO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.
Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bioinformática; Classificação de proteínas; Mineração de dados.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/2836

Estrutura básica do MicroArray Gene Expression Markup Language - MAGE-ML.
Provedor de dados: 14
Autores: SANTOS, E. H. dos.
Um dos objetivos da Rede Genômica Animal é a identificação de genes que contribuam para o melhoramento de características de interesse econômico em animais de produção. Uma das ferramentas para prospecção e análise desses genes é o Microarranjo de DNA, uma técnica que permite avaliar a expressão gênica em condições específicas. Apesar de seu uso amplamente difundido na comunidade científica, os procedimentos e as informações de experimentos nem sempre são padronizados, a despeito dos esforços na criação de uma linguagem padrão como o MAGE-ML. Este documento visa apresentar o padrão MAGE-ML para aqueles que ainda não se utilizam desse recurso e gostariam de aprender um pouco a respeito.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Microarranjo de DNA; MAGE-ML; Expressão gênica; Microarray technology; Gene expression.
Ano: 2010
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883658

CodeCharge: gerador de códigos para aplicações Web.
Provedor de dados: 14
Autores: SANTOS, E. H. dos.
Características do CodeCharge.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: CodeCharge; Gerador de códigos; Web.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/2156

Análise automática de Outorga de recursos hídricos para irrigação.
Provedor de dados: 14
Autores: SANTOS, E. H. dos; PEREIRA, A. S.; ASSAD, E. D.; EVANGELISTA, S. R. M.
Este trabalho apresenta este módulo, cujo objetivo é auxiliar a ANA na tomada de decisões de forma prática por meio da Web e reduzir o tempo para análise de outorga para irrigação.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: ANA; Agência Nacional de Águas; Tomada de decisões; Outorga de recursos hídricos.; Irrigação.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8833

Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD.
Provedor de dados: 14
Autores: YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.
bitstream/CNPTIA/10852/1/comtec67.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Pockets; Superfície protéica; Java Protein Dossier; JPD.
Ano: 2005
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/9102

Guia prático para aplicação do método da diagnose da composição nutricional (CND): exemplo de uso na cultura da cana-de-açúcar.
Provedor de dados: 14
Autores: TRASPADINI, E. I. F.; PRADO, R. M.; VAZ, G. J.; SILVA, F. C. da; MANCINI, A. L.; SILVA, G. P. da; SANTOS, E. H. dos; WADT, P. G. S.
Interpretação do estado nutricional. O cálculo do método CND. Média geométrica. Relação multivariada. Norma CND. Índice CND. Potencial de Resposta da planta a Adubação (PRA). Guia para cálculo e interpretação do estado nutricional da planta. Organização dos dados. Média da produtividade e classe produtiva. Cálculo do componente R. Média geométrica. Relação multivariada dos nutrientes. Relação multivariada dos nutrientes. Norma CND. Interpretação do Estado Nutricional. Exemplo de Interpretação do Estado Nutricional.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Nutrição Vegetal; Cana de Açúcar; Disease diagnosis; Plant nutrition; Sugarcane.
Ano: 2018
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1103108

Encapsulando um sistema gerenciador de ensaios de genotipagem e de marcadores moleculares em containers Docker.
Provedor de dados: 14
Autores: GERMANO, E.; NARCISO, M. G.; SANTOS, E. H. dos.
Resumo. O crescente número de componentes de software a serem integrados e testados durante o processo de implantação de um sistema exige pleno controle de alocação dos recursos computacionais. A solução utilizada durante o desenvolvimento do GeneMaisLab, "Sistema gerenciador de dados de genotipagem", consiste no uso de serviços da plataforma Docker e do sistema de distribuição de carga HAProxy para o escalonamento dos serviços web. O Docker é uma ferramenta projetada para facilitar a criação, a implementação e a execução de aplicativos usando containers. Esses permitem que um desenvolvedor empacote um aplicativo com todas as partes que precisa, como bibliotecas e outras dependências, e envie tudo como um único pacote de software. A solução utilizada no...
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Plataforma Docker; GeneMaisLab; HAProxy.
Ano: 2018
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101381

Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer.
Provedor de dados: 14
Autores: NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.
O software Sting é um software voltado para a Bioinformática e, d eforma geral, faz análise de estrutura de proteínas e mostra de forma especializada qualquer proteína cuja estrutura está em arquivos .pdf, que contém dados sobre proteínas, podendo ser acessados em Research Collaboratory for Structural Bionformatics.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Co-evolução; Aminoácidos; Marcelo Gonçalves Narciso.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3005

Processo de migração de dados meteorológicos para o banco de dados do sistema Agritempo.
Provedor de dados: 14
Autores: ROMANI, L. A. S.; SANTOS, E. H. dos; MONTAGNER, A. J.
Análise dos dados das estações meteorológicas. Dados da CEMIG. Dados do INMET. Processo de migração. Formato padrão proposto. Migração de dados: conversor e migrador.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Dados meteorológicos; Migração de dados; Agritempo; Sistema de Monitoramento Agrometeorológico.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8629

Utilizando o Rsync para atualizar os bancos de dados do Sting Millennium Suite.
Provedor de dados: 14
Autores: VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos.
Entendendo o Rsync. Usando o Rsync em modo servidor. Usando o Rsync com protocolo Shell de conexão remota.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Rsync; Bases de dados.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/166

Informatização do monitoramento agrometeorológico - Sistema Agritempo 1.0.
Provedor de dados: 14
Autores: TERNES, S.; SANTOS, E. H. dos; ASSAD, E. D.; ROMANI, L. A. S.; EVANGELISTA, S. R. M.; MONTAGNER, A. J.
Protótipo. Modelos de dados. Perfis de usuários. Ações do perfil instituição. Acesso a dados - estação. Acesso a dados - meteorológicos. Visualização de mapas. Geração de boletins - resumindo 1. Geração de boletins - balanço hídrico. Pesquisa e gráficos. Alteração de senha. Upload de arquivos.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Agritempo; Sistema de monitoramento agrometeorológico.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8631

VPRO - um identificador de padrões de seqüências.
Provedor de dados: 14
Autores: SANTOS, E. H. dos; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.
bitstream/CNPTIA/11542/1/ct81.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Programa VPRO.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/4362

Modelo de rastreamento bovino via Smart Contracts com tecnologia Blockchain.
Provedor de dados: 14
Autores: YANO, I. H.; SANTOS, E. H. dos; CASTRO, A. de; BERGIER, I.; SANTOS, P. M.; OLIVEIRA, S. R. de M.; ABREU, U. G. P. de.
Blockchain. Exemplo de rastreamento bovino com Smart Contract. Simulação de rastreamento bovino utilizando Smart Contract. Conclusão.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Blockchain; Cadeia de blocos; Contratos Inteligentes; Rastreamento bovino; Big data; Inteligência artificial; Smart Contract; Artificial intelligence.
Ano: 2018
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101384

Arcabouço para desenvolvimento de simuladores de sistemas dinâmicos contínuos e hierárquicos.
Provedor de dados: 14
Autores: MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G.; SANTOS, E. H. dos; DIAS, F. R. T.; SANTOS, J. W. dos; ABREU, L. L. B. de; TININI, L. V. S.
Resumo. Um arcabouço (framework) orientado a objetos para o desenvolvimento de simuladores de sistemas dinâmicos contínuos com suporte à hierarquia é descrito. O arcabouço surgiu da necessidade de uma ferramenta para facilitar e padronizar o desenvolvimento de modelos de simulação baseados em processo em projetos de pesquisa na Embrapa. Um dos requisitos do desenvolvimento foi modularidade e simplicidade de código para facilitar o desenvolvimento de modelos por equipes multidisciplinares de pesquisa e implementação por grupos de estagiários/bolsistas com alta rotatividade. Também provê desempenho superior a ferramentas de modelagem típicas, que geralmente tem código interpretado. Modelos componentes, geralmente desenvolvidos por equipes de especialistas em...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Software de simulação; Modelagem matemática.; Simulação.
Ano: 2013
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/981039

Rotâmeros raros no Java Protein Dossier.
Provedor de dados: 14
Autores: YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.
O objetivo do STING é oferecer uma plataforma para análise e visualização de estruturas proteicas.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Java Protein Dossier.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3002