Consulta: subjectFacets:"DNA"
Registros recuperados: 179
Data/hora: 17/06/2024 13:03:37

Factores involucrados en la respuesta del picudo del agave hacía el compuesto feromonal 2-metil-4-octanona y su manejo con agave fermentado e insecticidas sintéticos.
Provedor de dados: 32
Autores: Azuara Domínguez, Ausencio.
El  picudo del agave Scyphophorus acupunctatus produce una feromona de agregación que atrae ambos sexos. Sin embargo, la respuesta es baja debido a diferentes factores que interfieren, por lo que es necesario un mejor conocimiento de los factores participantes, así mismo, buscar nuevas alternativas de control. En la presente investigación se plantearon los siguientes objetivos: 1) Determinar la participación del sexo, edad y de la estructura genética en la respuesta electrofisiológica y de comportamiento de búsqueda de S. acupunctatus al compuesto principal de su feromona de agregación. 2) Evaluar la eficiencia de la planta de agave tequilero en estado fermentado en el trampeo del picudo e identificar los compuestos volátiles atractivos para este insecto....
Palavras-chave: Scyphophorus acupunctatus; Electroantenografía; Olfatómetro; ADN; Mitocondrial; Trampeo de adultos; Insecticidas sintéticos; Electroantennography; Olfactometer; Mitochondrial; DNA; Trapping; Synthetic insecticides; Entomología y Acarología; Doctorado.
Ano: 2013
URL: http://hdl.handle.net/10521/1901

Caracterización fenotípica y molecular de variedades de caña de azúcar cultivadas en el estado de Tabasco
Provedor de dados: 32
Autores: González Jiménez, Vianey.
Se llevó a cabo una caracterización morfológica de 12 variedades de caña de azúcar del estado de Tabasco mediante descriptores morfológicos, se identificó la filogenia por medio de secuenciamiento de la región ITS de DNA ribosómico y trnL-F cloroplástico, y se hizo una caracterización molecular usando la técnica AFLP. La descripción fenotípica se llevó a cabo considerando las características de entrenudo, hoja y yema. En la amplificación del DNA ribosómico se utilizaron los iniciadores ITS4 e ITS5. Para la amplificación del cloroplasto se utilizaron los iniciadores universales trnL-F. El procedimiento para la realización de los AFLPs se realizó siguiendo las recomendaciones descritas en el Kit AFLP®Analysis System I y AFLP® Starter Primer Kit. Entre las 12...
Tipo: Tesis
Palavras-chave: Caña de azúcar; AFLPs; DNA; Variabilidad; Maestría; Producción Agroaliemtaria en el Trópico; Sugarcane; Variability.
Ano: 2009
URL: http://hdl.handle.net/10521/1558

Senescencia foliar, componentes del rendimiento y degradación nuclear en dos variedades de papa (Solanum tuberosum L.) var. Lupita y Tollocan.
Provedor de dados: 32
Autores: Zárate Castrejón, José Luis.
La senescencia foliar es la última etapa del desarrollo de la hoja, se caracteriza por una serie de cambios fisiológicos, bioquímicos y estructurales. Las hojas pierden gradualmente clorofila, se desorganiza la maquinaria fotosintética y se reciclan los productos de degradación de las macromoléculas hacia otras partes en crecimiento (hojas jóvenes, flores, frutos) u órganos de almacenamiento como el tubérculo en Solanum tuberosum. Se conoce poco acerca de la relación entre la senescencia foliar y proceso del llenado del tubérculo. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la senescencia foliar en dos variedades de papa con diferente ciclo biológico y relacionarlo con el llenado del tubérculo. Se monitoreó el amarillamiento foliar en toda la planta a...
Palavras-chave: ADN; Cloroplastos; LSU; Rubisco; SDS-PAGE; Cloroplast; DNA; Maestría; Botánica.
Ano: 2010
URL: http://hdl.handle.net/10521/275

Diagnóstico de la presencia de roya naranja (Puccinia kuehnii (Krüger) Butler) en clones comerciales de caña de azúcar (Saccharum spp. Híbridos)  en el sureste de México.
Provedor de dados: 32
Autores: Pérez Hernández, Set.
La roya naranja (Puccinia kuehnii) es una enfermedad fungosa que afecta al cultivo de la caña de azúcar (Saccharum spp. Híbridos). La enfermedad afecta la capacidad fotosintética de la planta y reduce su crecimiento y desarrollo. El objetivo de la presente investigación fue determinar la presencia de la enfermedad de la roya naranja en clones comerciales de caña de azúcar en el sureste de México e identificar molecularmente el agente causal. En áreas de abastecimiento de los ingenios Santa Rosalía, Presidente Benito Juárez, Azuremex, Tabasco; Huixtla, Chiapas; La Joya, Campeche y San Rafael de Pucté, Quintana Roo, se colectaron hojas con síntomas y lesiones características de la roya naranja. Las hojas se cortaron en pequeñas porciones y se colocaron en...
Palavras-chave: Puccinia kuehnii; DNA; Saccharum spp.; Iniciadores; Agente causal; Primers; Causal agent; Producción Agroalimentaria en el Trópico; Maestría.
Ano: 2014
URL: http://hdl.handle.net/10521/2363

Bioinformática : Aplicaciones a la proteómica y genómica
Provedor de dados: 32
Autores: Riaño Pachón, Diego Mauricio; González Estrada, Elizabeth; Alexa, Adrian; Ramírez, Fidel; Vischi Winck, Flavia; Gómez Merino, Fernando, Coord.; Silva Rojas, Hilda Victoria, Coord.; Pérez Rodríguez, Paulino, Coord.
En esta publicación intitulada “Bioinformática: aplicaciones a la genómica y proteómica” se detallan algunos de los avances más sobresalientes de los temas de genómica y proteómica, derivados de un curso internacional sobre el tema, organizado por el Colegio de Postgraduados. Estos avances incluyen aspectos de las dos ciencias ómicas, incluyendo genómica y biología estructural, código R, análisis comparativo y evolución, agrupamiento y minería de datos en R, redes de interacciones entre proteínas y proteómica bioinformática. BIOINFORMATICS : APPLICATIONS TO GENOMICS AND PROTEOMICS. ABSTRACT : In this publication entitled "Bioinformatics: applications to genomics and proteomics" are some of the most salient issues of genomics and proteomics, derived from an...
Tipo: Libro
Palavras-chave: Bioinformática; Proteómica; Genómica; ADN; Proteínas; Modelación; Simulación; Análisis de genómas; Biología estructural; Código R; Análisis comparativo; Minería de datos; Computación aplicada; Bioinformatics; Proteomics; DNA; Proteins; Models; Genomics; Simulation; R Code; Data mining; Computing; Genome analysis.
Ano: 2010
URL: http://hdl.handle.net/10521/313

Piloting a Non-Invasive Genetic Sampling Method for Evaluating Population-Level Benefits of Wildlife Crossing Structures
Provedor de dados: 7
Autores: Clevenger, Anthony P; Western Transportation Institute, Montana State University; apclevenger@gmail.com; Sawaya, Michael A; Department of Ecology, Montana State University; mikesawaya@hotmail.com.
Intuitively, wildlife crossing structures should enhance the viability of wildlife populations. Previous research has demonstrated that a broad range of species will use crossing structures, however, questions remain as to whether these measures actually provide benefits to populations. To assess this, studies will need to determine the number of individuals using crossings, their sex, and their genetic relationships. Obtaining empirical data demonstrating population-level benefits for some species can be problematic and challenging at best. Molecular techniques now make it possible to identify species, individuals, their sex, and their genetic relatedness from hair samples collected through non-invasive genetic sampling (NGS). We describe efforts to pilot...
Tipo: Peer-Reviewed Reports
Palavras-chave: Banff National Park; DNA; Genetics; Non-invasive; Road ecology; Ursus americanus; Ursus arctos; Wildlife crossing structure.
Ano: 2010

Perspectives on the application of biotechnology to assist the genetic enhancement of plantain and banana (Musa spp.)
Provedor de dados: 69
Autores: Crouch,Jonathan H.; Vuylsteke,Dirk; Ortiz,Rodomiro.
Bananas and plantains (Musa spp.) are the most important tropical fruit crops. They form an integral component of the farming systems in the humid agroecological zones of the tropics. A broad array of applied cell and molecular techniques are increasingly being used worldwide to facilitate and enhance the handling and improvement of plantain and banana germplasm. Tissue culture is used for germplasm exchange, conservation and rapid multiplication, while in vitro seed germination (based on embryo culture or rescue) plays a critical role in generating hybrid plants. DNA marker systems have been developed in Musa to assist germplasm management, selection within the breeding pool or gene introgression from wild species, and for disease diagnosis. Likewise,...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Banana; Improvement; Micropropagation; DNA; Markers; Plantain.
Ano: 1998
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34581998000100002

DNA demethylation during Chrysanthemum floral transition following short-day treatment
Provedor de dados: 69
Autores: Li,Zhongai; Li,Jie; Yanhua,Liu; Wang,Zicheng.
Background: Analytical techniques such as methylation-sensitive amplification polymorphism and high-performance liquid chromatography were used to detect variation in DNA methylation of mature Chrysanthemum leaves during the floral transition induced by short-day (SD) treatment. Results: For both early- and late-flowering cultivars, the time from the date of planting to the appearance of the capitulum bud and early blooming were significantly shorter than those of the control. The capitulum development of the early-flowering cultivar was significantly accelerated compared to the control, unlike the late-flowering cultivar. The DNA methylation percentage of leaves was significantly altered during flower development. For the early-flowering cultivar, DNA...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Chrysanthemum; DNA; Methylation; Floral transition; Short day.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582016000300009

Enhancing DNA electrotransformation efficiency in Escherichia coli DH10B electrocompetent cells
Provedor de dados: 69
Autores: Wu,Ning; Matand,Kanyand; Kebede,Bizuayehu; Acquaah,George; Williams,Sonya.
Electrotransformation also known as electroporation is the most reliable and efficient tool for plasmid DNA uptake. Electrotransformation efficiency is function of many factors which include (1) number of cell washes prior to electroporation, (2) electroporation cell number, (3) electroporation DNA amount, and (4) cell growth phase. Those factors have limitedly been concomitantly investigated in E. coli DH10B strain. This study is aimed to explore above key factors to define the optimal conditions for high electrotransformation efficiency. The results showed that electrotransformation efficiency of E. coli DH10B was enhanced to 1.5 x 10(9) cfu/µg by washing cells three times with 15 ml of 10% glycerol. This washed off extra salts from cell suspension and...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Cell competency; DNA; E. coli DH10B; Electroporation.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582010000500021

Molecular identification of Mazama species (Cervidae: Artiodactyla) from natural history collections
Provedor de dados: 74
Autores: Mantellatto,Aline Meira Bonfim; González,Susana; Duarte,José Maurício Barbanti.
Abstract Natural history museum collections constitute an invaluable patrimony of biological diversity for analysing the taxa distribution and evolution. However, it is very common to discover taxonomic misidentification in museum collections based on incorrect data. The aim of this research was to identify brocket deer species (Mazama genus) using molecular markers. We collected 199 samples, performed DNA extraction and species identification using a specific mitochondrial marker based on a fragment of cytochrome b (Cytb) for Neotropical deer. We achieved the amplification and sequencing of 77 specimens and verified that 26% of the skulls were wrongly identified. Moreover, in the museum collections 57% of the specimens were only identified as Mazama sp,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cytochrome b; Deer; DNA; Mammal; Morphological taxonomy.
Ano: 2020
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572020000400201

Genetic characterization of Aberdeen Angus cattle using molecular markers
Provedor de dados: 74
Autores: Vasconcellos,Luciana Pimentel de Mello Klocker; Tambasco-Talhari,Daniella; Pereira,Andréa Pozzi; Coutinho,Luiz Lehmann; Regitano,Luciana Correia de Almeida.
Aberdeen Angus beef cattle from the Brazilian herd were studied genetically using restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the kappa-casein - HinfI (CSN3 - HinfI), beta-lactoglobulin - HaeIII (LGB - HaeIII) and growth hormone AluI (GH- AluI) genes, as well as four microsatellites (TEXAN15, CSFM50, BM1224 and BM7160). The RFLP genotypes were determined using the polymerase chain reaction (PCR) followed by digestion with restriction endonucleases and electrophoresis in agarose gels. With the exception of the microsatellite BM7160, which was analyzed in an automatic sequencer, the PCR products were genotyped by silver staining. The allele and genotype frequencies, heterozygosities and gene diversity were estimated. The values for these parameters of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Aberdeen Angus; Bovine; DNA; Characterization; RFLP; Microsatellite.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000200005

Genetic characterization of the population of São Luís, MA, Brazil
Provedor de dados: 74
Autores: Ferreira,Francileide Lisboa; Leal-Mesquita,Emygdia Rosa; Santos,Sidney Emanuel Batista dos; Ribeiro-dos-Santos,Ândrea Kely Campos.
Five loci (vWA1, F13A1, D12S67, Apo-B and D1S80) were investigated by polyacrylamide gel electrophoresis followed by silver staining in a sample of 177 individuals from the population of São Luís, State of Maranhão, Brazil. A total of 70 different alleles were identified. A statistically significant deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium was observed in a single locus (F13A1, p = 0.0075). The average heterozygosity (H) was estimated at 77.7%, the mean number of alleles per locus as 14. The PD (capacity of genotype differentiation at each locus) ranged from 88.9% (vWA1) to 96.7% (F13A1). The combined PE (power of exclusion) of these five loci was 99.8%. In terms of racial admixture (42% European, 39% Indian, and 19% African Black ancestry), São Luís...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Amazon region; DNA; Polymorphisms; VNTRs; STRs; Interethnic admixture.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100004

A simple protocol for the extraction and sequence analysis of DNA from study skin of museum collections
Provedor de dados: 74
Autores: Moraes-Barros,Nadia de; Morgante,João Stenghel.
Museum collections have been widely used as sources of biological samples for molecular biology studies and there are several methodologies and techniques to obtain and analyze DNA from tissues archived in museums, but most of these protocols have been developed for a specific tissue or are commercial kits. We present a simple protocol for extracting and amplifying DNA segments from sloth museum specimens. With this simple protocol we analyzed DNA fragments from 64% of 64 skin samples from three-toed sloths (Bradypus variegatus and Bradypus tridactylus) archived in three different museums: 43 samples from the University of São Paulo Museum of Zoology (Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, MUZUSP) São Paulo, São Paulo, Brazil; 18 samples from the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bradypus; DNA; Dried skins; Museum specimens.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000600024

Hidden Markov models applied to a subsequence of the Xylella fastidiosa genome
Provedor de dados: 74
Autores: Silva,Cibele Q. da.
Dependencies in DNA sequences are frequently modeled using Markov models. However, Markov chains cannot account for heterogeneity that may be present in different regions of the same DNA sequence. Hidden Markov models are more realistic than Markov models since they allow for the identification of heterogeneous regions of a DNA sequence. In this study we present an application of hidden Markov models to a subsequence of the Xylella fastidiosa DNA data. We found that a three-state model provides a good description for the data considered.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Xylella fastidiosa; Hidden Markov models.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000400018

Non-invasive genetic sampling for molecular sexing and microsatellite genotyping of hyacinth macaw (Anodorhynchus hyacinthinus)
Provedor de dados: 74
Autores: Presti,Flavia T.; Meyer,Janaína; Antas,Paulo T.Z.; Guedes,Neiva M.R.; Miyaki,Cristina Y.
Molted feather sampling is a useful tool for genetic analyses of endangered species, but it is often very laborious due to the low quality and quantity of the DNA obtained. In the present study we show the parts of feathers that resulted in better yield of DNA. In descending order these were: blood clot outside the umbilicus, umbilicus (without blood clot), tip, inner membrane, and small calamus. Compared to DNA extracted from blood samples, DNA extracted from feathers produced microsatellite alleles of poorer quality and had to be processed immediately after extraction. As expected due to the level of DNA degradation, molecular sexing protocols that result in shorter PCR products were more efficient.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Molted feathers; Blood sample; DNA; PCR product; Parrot.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000100019

Microsatellite polymorphism in wheat from Brazilian cultivars; inter- and intra-varietal studies
Provedor de dados: 74
Autores: Lima,Vitor Lopes de Abreu; Seki,Homiko Abreu; Rumjanek,Franklin David.
Eleven samples of wheat (Triticum aestivum) from different Brazilian cultivars and six American varieties were compared for polymorphism, using primers for nine different STR loci. STR analysis of DNA from single grains of the Brazilian varieties showed that for most loci there was very little intra-cultivar polymorphism. The polymorphic variation observed for Brazilian cultivars was similar to that seen in the American varieties. For the Brazilian cultivars PCR analysis could be performed on only one half of a grain. The American samples required more seeds for analysis. The nucleotide sequences of five amplified microsatellites selected at random from the Brazilian samples were also determined and compared to those of the Chinese Spring variety. Although...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Wheat; Brazilian; Cultivars; DNA; STR; Polymorphism.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000300021

DNA sampling from eggshells and microsatellite genotyping in rare tropical birds: Case study on Brazilian Merganser
Provedor de dados: 74
Autores: Maia,Thais Augusta; Vilaça,Sibelle Torres; Silva,Luciana Resende da; Santos,Fabricio Rodrigues; Dantas,Gisele Pires de Mendonça.
Abstract This study shows that sampling maternal DNA from hatched and abandoned eggshells is a viable noninvasive strategy for studying the genetics of rare or endangered tropical birds, as exemplified here by the Brazilian Merganser (Mergus octosetaceus). Eighteen microsatellites were isolated from enriched libraries and nine heterologous loci from related species were tested. Seven loci were amplified successfully, with five of them being polymorphic. These loci exhibited amplicons ranging from 110 to 254 bp for 132 samples, with 60 from eggshells and 72 from blood or muscle samples. The number of alleles for M. octosetaceus ranged from one to six (mean = 3.71), which is low compared to M. merganser (1-15 alleles), a ‘least concern’ species. Genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Noninvasive samples; Genetic diversity; Endangered birds; Mergus.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000500808

Intraspecific genetic diversity of Drechslera tritici-repentis as detected by random amplified polymorphic DNA analysis
Provedor de dados: 74
Autores: Santos,Ana Maria Pujol Vieira dos; Matsumura,Aida T. Santos; Van Der Sand,Sueli Teresinha.
The phytopathogenic fungus Drechslera tritici-repentis causes tan spot, an important disease of wheat in the southern Brazilian state of Rio Grande do Sul. Twelve D. tritici-repentis isolates were obtained from wheat seeds from different locations in the state. Their colony morphology on potato dextrose agar and polymorphisms in genomic DNA by the random amplified polymorphic DNA (RAPD) method were investigated. For the RAPD method, 23 primers were tested of which nine were selected for use in the study of D. tritici-repentis polymorphisms. The degree of similarity between isolates was calculated using a simple matching coefficient and dendrograms constructed by the unweighted pair-group method with arithmetical averages (UPGMA). The morphological and RAPD...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Drechslera tritici-repentis; RAPD; DNA; Polymorphism; Genetic diversity.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572002000200020

Biomolecular computers with multiple restriction enzymes
Provedor de dados: 74
Autores: Sakowski,Sebastian; Krasinski,Tadeusz; Waldmajer,Jacek; Sarnik,Joanna; Blasiak,Janusz; Poplawski,Tomasz.
Abstract The development of conventional, silicon-based computers has several limitations, including some related to the Heisenberg uncertainty principle and the von Neumann “bottleneck”. Biomolecular computers based on DNA and proteins are largely free of these disadvantages and, along with quantum computers, are reasonable alternatives to their conventional counterparts in some applications. The idea of a DNA computer proposed by Ehud Shapiro’s group at the Weizmann Institute of Science was developed using one restriction enzyme as hardware and DNA fragments (the transition molecules) as software and input/output signals. This computer represented a two-state two-symbol finite automaton that was subsequently extended by using two restriction enzymes. In...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bioinformatics; DNA; DNA computer; Restriction enzymes.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000500860

Microsatellites in Portuguese autochthonous horse breeds: usefulness for parentage testing
Provedor de dados: 74
Autores: Luís,C.; Cothran,E.Gus; Oom,M.M.
The use of DNA technology for parentage testing is increasing every day. Most laboratories have improved their exclusion probabilities (PE) by the addition of DNA microsatellite loci to standard blood-typing results. The efficacy of each locus depends on the number of alleles detected and their frequencies in the breeds tested. Here we analyzed the usefulness of six microsatellites for routine parentage testing in three Portuguese autochthonous horse breeds: Lusitano, Sorraia and Garrano. The DNA loci analyzed - ASB2, HMS3, HMS7, HTG4, HTG10, and VHL20 - were chosen based upon the polymorphism detected in other breeds with Iberian horse influence. The estimated probability of exclusion of wrongly named parents (PE) was high, with values ranging from 88.5%...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Microsatellites; DNA; Portuguese horse breeds; Parentage testing.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572002000200003

Assessment of genetic mutation frequency induced by oxidative stress in Trypanosoma cruzi
Provedor de dados: 74
Autores: Torres-Silva,Carolina Furtado; Repolês,Bruno Marçal; Ornelas,Hugo Oliveira; Macedo,Andréa Mara; Franco,Glória Regina; Junho Pena,Sérgio Danilo; Tahara,Erich Birelli; Machado,Carlos Renato.
Abstract Trypanosoma cruzi is the etiological agent of Chagas disease, a public health challenge due to its morbidity and mortality rates, which affects around 6-7 million people worldwide. Symptoms, response to chemotherapy, and the course of Chagas disease are greatly influenced by T. cruzi‘s intra-specific variability. Thus, DNA mutations in this parasite possibly play a key role in the wide range of clinical manifestations and in drug sensitivity. Indeed, the environmental conditions of oxidative stress faced by T. cruzi during its life cycle can generate genetic mutations. However, the lack of an established experimental design to assess mutation rates in T. cruzi precludes the study of conditions and mechanisms that potentially produce genomic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: T. cruzi; DNA; Mutation frequency; H2O2.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572018000300466

Similaridade genética de populações naturais de pimenta-de-macaco por análise RAPD
Provedor de dados: 75
Autores: Gaia,José Maria D.; Mota,Milton Guilherme da C.; Conceição,Carmen Célia C. da; Costa,Maria Rosa; Maia,José Guilherme S.
A espécie conhecida como pimenta-de-macaco (Piper aduncum L.) possui grande potencial para exploração econômica em função da comprovada utilidade do seu óleo essencial na agricultura e saúde humana. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética de populações naturais dessa planta. Um total de dezoito acessos da planta, provenientes de quatro procedências da Amazônia Brasileira, foi examinado por meio de locos de DNA, gerados por análise RAPD (polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). O estudo evidenciou a existência de real diversidade entre as populações examinadas, sendo provável que dentro das localidades investigadas, os padrões da diversidade genética acompanhem os padrões de distribuição geográfica.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Piper aduncum L.; Óleo; Diversidade genética; DNA; Germoplasma; Domesticação.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362004000400004

Биохимические эффекты полихлорированных бифенилов на организм черноморского моллюска Mytilus galloprovincialis Lam.
Provedor de dados: 13
Autores: Солдатов, А. А.; Бочко, О. Ю.; Головина, И. В.; Щербань, С. А.; Вялова, О. Ю.
Исследован характер распределения полихлорированных бифенилов (ПХБ) в тканях Mytilus galloprovincials Lam. в условиях хронического токсикологического эксперимента с применением ароклора 1254. У животных из естественных популяций (контрольная группа) данные химические соединения аккумулируются преимущественно в гепатопанкреасе и ноге. При содержании моллюсков в воде с концентрацией ароклора 1254 - 110 нг л-1 (экспозиция 21 день) существенный прирост уровня ПХБ отмечен в жабрах и ноге на 57 и 160 % (р&lt;0.05) соответственно. На этом фоне в данных тканевых структурах отмечали развитие гипоксии гистоток-сического типа. Индекс МДГ/ЛДГ вырос в 2.2 - 2.6 раза (р&lt;0.001). Одновременно происходило угнетение скорости процессов регенерации в жабрах. Индекс РНК/ДНК...
Tipo: Journal Contribution
Palavras-chave: Полихлорированные бифенилы; Mytilus galloprovincials; Малатдегидрогеназа; Лактатдегид-рогеназа; РНК; ДНК; Каротиноиды; Polychlorinated biphenyls; Mytilus galloprovincials Lam.; Malate dehydrogenase; Lactate dehydrogenase; RNA; DNA; Carotinoids.
Ano: 2005
URL: http://repository.ibss.org.ua/dspace/handle/99011/236

Comparação de métodos de extração do DNA e avaliação de reações da polimerase em cadeia (PCR) para o diagnóstico de Trypanosoma (Dutonella) vivax.
Provedor de dados: 14
Autores: MADRUGA, C. R.; ARAÚJO, F. R. de; LIMA JÚNIOR, M. S. da C.; MELO, E. S. de P.
A introdução de Trypanosoma vivax na América Latina ocorreu por meio de gado zebu importado do Senegal para Guiana Francesa e Antilhas, e no Brasil, o primeiro registro desse hemoprotozoário foi feito no Estado do Pará (SHAW; LAISON, 1972). Até recentemente, a distribuição de T. vivax estava restrita à região Norte do país. Entretanto, em 1995, Silva et al. (1995) diagnosticaram esse hemoparasito em um rebanho bovino do Pantanal do Estado de Mato Grosso, município de Poconé. Posteriormente, a tripanossomíase por essa espécie de Trypanosoma foi diagnosticada em Mato Grosso do Sul, no Pantanal do município de Miranda e da Nhecolândia (PAIVA et al., 2000; DÁVILA et al., 2003). Neste trabalho, foram avaliadas PCRs anteriormente descritas por Masake et al....
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)
Palavras-chave: PCR.; Bovino; DNA; Diagnostico; Epidemiologia; Sanidade Animal; Trypanosoma Vivax.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/326896

Determinação da pureza varietal de sementes da cultivar de soja BRS Raimunda utilizando marcadores moleculares.
Provedor de dados: 14
Autores: MOREIRA, C. T.; BROGIN, R. L.; SOUZA, P. I. M. de; FARIAS NETO, A. L. de; ABUD, S.; TEIXEIRA, R. N.
bitstream/CPAC-2009/26810/1/p2005_18.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: DNA; Glycine Max; Marcador Molecular; Marcador Genético; Melhoramento Genético Vegetal; Soja.; Genetic markers; Plant breeding; Soybeans.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/569437

Protocolo de extração de DNA e genotipagem de SSRs em larga escala para uso no melhoramento do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.).
Provedor de dados: 14
Autores: VALDISSER, P. A. M. R.; MOTA, A. P. S.; BUENO, L. G.; MENEZES, I. P. P. de; COELHO, G. R. C.; MAGALHÃES, F. O. da C.; VIANELLO, R. P.
O objetivo deste comunicado é o de ajustar e estabelecer procedimentos laboratoriais de extração de DNA e genotipagem molecular em larga escala favorecendo a implementação de uma rotina eficiente de seleção assistida por marcadores pelo programa de melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Protocolo de extração; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Extração; DNA; Marcador molecular.
Ano: 2013
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/957563

Aplicação e evolução dos métodos moleculares para o estudo da biodiversidade do rizóbio.
Provedor de dados: 14
Autores: STRALIOTTO, R.; RUMJANEK, N. G.
A extensão da biodiversidade microbiana. A diversidade do rizóbio. Aplicações da biologia molecular nos estudos de diversidade e taxonomia do rizóbio. Métodos fenotípicos clássicos. Ánalise numerica de dados fenotípicos. Ánalise de isoenzimas. Pirólise. Métodos sorológicos. SDS_PAGE. Métodos genotípicos. Determinação da relação de bases do DNA (RFLP). Homologia do DNA&gt; Polimorfismo nos fragmentos de restrição do DNA (RFLP). Estudos baseados no DNA ribossomal. A reação de polimeras em cadeia. Técnicas de fingerprinting do DNA baseadas em PCR
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Ácido Nucléico; Biologia Molecular; Biodiversidade; DNA; Fenótipo; Genótipo; Isoenzima; Rhizobium; Taxonomia.
Ano: 1999
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/624276

Estudo da origem e da ancestrabilidade paterna e materna de bovinos pantaneiros.
Provedor de dados: 14
Autores: SERENO, J. R. B.; ISSA, E. C.; JORGE, W.; CARMO, A. O. do.
bitstream/CPAC-2009/27872/1/p2006_80.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bovinae.; Bovino; DNA; Gado; Genética Animal.; Pantanal; Brazil; Genetics.; Cattle.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/556435

Genômica e proteômica.
Provedor de dados: 14
Autores: TEIXEIRA, K. R. dos S.; SIMÕES ARAÚJO, J. L.
Introdução a genômica; O sequenciamento de DNA; Sequenciamento automático de DNA; Estratégias para sequenciamento completo de genômas; Sequenciamento hierárquico; Sequenciamento por fragmentos aleatórios (Shotgun); Pirossequenciamento: nova alternativa para o sequenciamento rápido de genômas; Introdução a proteômica; Análise do perfil de proteínas expressas através de eletroforese bidimensional (2D-GE); Espectrometria de massa e sua aplicabilidade na proteômica; Equipamentos de espectrometria de massa e sua aplicação.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Proteôma.; Ácido Nucléico; Cromossoma; DNA; Genoma.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/629229

TOMATE cereja: consumidor indica a melhor variedade: programa 24: Centro-Oeste/Sudeste.
Provedor de dados: 14
O tomate cereja é mais conhecido pelo formato pequeno e pela coloração vermelha e uniforme que lembra uma cereja. No entanto, há uma grande variedade de cores, formatos e texturas que também são apreciadas pelo sabor e pela versatilidade para ornamentação de pratos. A boa receptividade do produto levou pesquisadores da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ) e da Embrapa Agroindústria de Alimentos (Rio de Janeiro/RJ) a pesquisar os melhores acessos para cultivo orgânico e quais os mais aceitos pelo consumidor. Os resultados serão apresentados no Prosa Rural, o programa de rádio da Embrapa. O Departamento de Fitotecnia da UFRRJ pesquisou mais de 40 acessos de tomate cereja submetidos a diferentes tratamentos em sistemas orgânicos. De acordo com...
Tipo: Prosa Rural (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Cultivo orgânico; Licopeno; Radical livre; ENAS 1031; ENAS 1029; Tomate cereja; Tomate; Consumidor; Antioxidante; DNA.
Ano: 2008
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1015963

Modulação da expressão gênica em plantas via tecnologia CRISPR/dCas9.
Provedor de dados: 14
Autores: MORGANTE, C. V.; ARRAES, F. B. M.; PINTO, C. E. M.; MELO, B. P. de; GROSSI-DE-SA, M. F.
Este capítulo aborda a tecnologia CRISPR pelo uso da variante dead Cas9 (CRISPR/ dCas9), com ênfase no seu uso para a modulação da expressão gênica em plantas. São apresentadas e discutidas as principais estratégias atualmente utilizadas, para as quais foi proposto um roteiro, considerando os principais aspectos para um bom desenho experimental.
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: CRISPR; Genoma da planta; Expressão gênica.; Biotecnologia; DNA; Genoma; Genética.; Biotechnology; Plant genetics.
Ano: 2020
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1126520

Construção e validação de membranas de macroarranjo de DNA para o estudo da interação planta-nematóide.
Provedor de dados: 14
Autores: ANDRADE, R. V. de; MEHTA, A.; GUIMARÃES, P. M.; SILVA, F. R. da; GROSSI DE SÁ, M. F.; SARAIVA, M. A. de P.; FRAGOSO, R.; BRASILEIRO, A. C. M.
bitstream/CPAC-2009/30194/1/bp204.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Amendoim silvestre; Arachis stenosperma; Feijão-caupi; Membranas de macroarranjo.; Algodão; Biotecnologia; DNA; Gossypium Hirsutum; Meloidogyne Incognita; Nematóide; Vigna Unguiculata.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/571792

TOMATE cereja: consumidor indica a melhor variedade: programa 33: Sul.
Provedor de dados: 14
O tomate cereja é mais conhecido pelo formato pequeno e pela coloração vermelha e uniforme que lembra uma cereja. No entanto, há uma grande variedade de cores, formatos e texturas que também são apreciadas pelo sabor e pela versatilidade para ornamentação de pratos. A boa receptividade do produto levou pesquisadores da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ) e da Embrapa Agroindústria de Alimentos (Rio de Janeiro/RJ) a pesquisar os melhores acessos para cultivo orgânico e quais os mais aceitos pelo consumidor. Os resultados serão apresentados no Prosa Rural, o programa de rádio da Embrapa. O Departamento de Fitotecnia da UFRRJ pesquisou mais de 40 acessos de tomate cereja submetidos a diferentes tratamentos em sistemas orgânicos. De acordo com...
Tipo: Prosa Rural (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Cultivo orgânico; Licopeno; Radical livre; ENAS 1029; ENAS 1031; Tomate cereja; Tomate; Consumidor; Antioxidante; DNA.
Ano: 2008
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1016248

Manual de extração de DNA.
Provedor de dados: 14
Autores: COSTA, M. R.; MOURA, E. F.
bitstream/item/63491/1/Oriental-Doc89.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: DNA; Extração; Genética Vegetal; Marcador Genético.
Ano: 2001
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/403421

Metodologia para operacionalizar a extracao de DNA de especies nativas do cerrado visando a analises moleculares.
Provedor de dados: 14
Autores: FALEIRO, F. G.; FALEIRO, A. S. G.; CORDEIRO, M. C. R.; KARIA, C. T.
bitstream/CPAC-2009/24559/1/comtec_92.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Biotecnologia; Biologia Molecular; Cerrado; Engenharia Genética; DNA; Marcador Genético; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal.; Biotechnology; Genetic engineering; Genetic markers; Plant breeding.; Molecular biology.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/559088

Reciclagem de agarose usada em laboratório de biologia molecular.
Provedor de dados: 14
Autores: CHOER, E.; REINIGER, L.; ANTHONISEN, D.; CUNHA, L.
bitstream/item/31564/1/Comunicado71.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Angarose.; Eletroforese; DNA; Reciclagem.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/744372

Revisões em micorriza I: Técnicas moleculares aplicadas ao estudo dos fungos micorrízicos arbusculares.
Provedor de dados: 14
Autores: SALLES, J. F.; SOUZA, F. A. de.
Caracterização de esporos de FMA. Extração DNA a partir de amostras de FMA. Técnicas moleculares empregadas no estudo de FMA. Detecção e identificação de FMA. Filogenia. Protocolos. Extração de DNA a partir de esporos de FMA. A partir de um esporo (LIoyd-Macglip et al., 1996). De 10 a 20 esporos. A partir de 50 esporos (LIoyd-Macglip et al., 1996). partir de micélio (longato e bonfante, 1997. Extração de DNA bde raízes colonizadas por FMA ( Abbas et al., 1996)
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Ácido Nucléico; DNA; Extração; Micorriza Vesicular Arbuscular.
Ano: 1998
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/624286

Protocolo de extração de DNA genômico para os principais fungos fitopatogênicos do arroz.
Provedor de dados: 14
Autores: DUARTE, L. T.; CÔRTES, M. V. de C. B.; FILIPPI, M. C. C. de; SILVA-LOBO, V. L.
Para obter êxito no uso das técnicas de biologia molecular é fundamental a obtenção de DNA genômico de boa qualidade, livre de impurezas e com a maior integridade possível. O objetivo do trabalho foi estabelecer e padronizar protocolo para a extração de DNA genômico dos patógenos de arroz de maior importância no Brasil, Bipolaris oryzae, Microdochium oryzae, Rhizoctonia solani, Sarocladium oryzae e Magnaporthe oryzae (anamorfo: Pyricularia oryzae), a partir do método de extração de DNA de plantas descrito por Dellaporta et al. (1983). Os 14 isolados fúngicos provenientes da Coleção de Microrganismos Multifuncionais e Fitopatógenos da Embrapa Arroz e Feijão foram cultivados em meio líquido caldo batata dextrose e em meio sólido ágar batata dextrose a 25 ºC,...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Arroz; Extração; DNA; Fungo; Micélio.
Ano: 2019
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1112790

Identificação varietal e genotipagem de macieiras utilizando testes de DNA.
Provedor de dados: 14
Autores: REVERS, L. F.; MACHADO, C. A. E.; MARANGON, M. A.; BUFFON, V.
bitstream/item/107372/1/Comunicado-Tecnico-148.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Simple Sequence Repeat; Microssatélite; Macieira; Maçã; Variedade; DNA; Marcador molecular.
Ano: 2013
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/993539

Determinação do teor de metilxantinas e análise da variabilidade genética de seis variedades populares de erva-mate.
Provedor de dados: 14
Autores: LAGOS, J. B.; MAZZA, M. C. M.; NAKASHIMA, T.; MEDRADO, M. J. S.; AMARAL, F. M. R.
Os objetivos deste estudo foram determinar os conteúdos de metilxantinas e cafeína em folhas maduras de seis “variedades” populares de erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil. Aquifoliaceae) e avaliar a distância genética entre estas diferentes “variedades” por meio de marcadores RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA). A concentração de metilxantinas foi determinada por espectrofotometria UV e a de cafeína por cromatografia gasosa. Foram estudadas seis “variedades” de erva-mate: nativa, folha grande, folha brilhosa, talo-roxo e folha cobre (consideradas variedades botânicas Ilex paraguariensis var. paraguariensis) e a “variedade” peluda (considerada variedade botânica Ilex paraguariensis var. vestita). A “variedade” folha cobre apresentou o maior conteúdo...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Metilxantina; Erva mate; Variabilidade genética; Marcador RAPD.; Espécie nativa; Genética; Mate; Cafeína; DNA; Ilex Paraguariensis.
Ano: 2001
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/301883

Transformação de plantas.
Provedor de dados: 14
Autores: ANDRADE, S. R. M. de.
ABSTRACT: During centuries mankind plants to obtain cultivars with superior characteristics. However, conventional methods of plant breeding present limitations. The development of transformation methods created possibilities of great progresses in plant breeding because it offers the opportunity to introduce exogenous genes into superior cultivars to obtain new varieties. Genetic transformation is the targed organism using non sexual methods. Transgenic plants can be defined as those the present genes different from the original genoma obtained by techniques of genetic engineering. The transformation stages consist of the identification isolation, cloning and introduction of gene into the cells. There are several transformation methods, and the choice...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Transformação genética; Biolística; Eletroporação; Bactéria; Biotecnologia; DNA; Gene; Melhoramento Genético Vegetal; Planta Transgênica.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/562707

Identificação de Brucella spp. em bovinos com lesões sugestivas de brucelose.
Provedor de dados: 14
Autores: ROSINHA, G. M. S.; SANTOS, L. R. dos; ELISEI, I.; SANCHES, C. C.; BERTOLACCI, M. A. B. C.; MANTOVANI, C.; ELISEI, C.; SOARES, C. O.
A prevalência de focos da brucelose bovina em propriedades pecuárias no Brasil varia de 0,32% a 41,5%. O Estado de Mato Grosso do Sul tem 41,5% de suas fazendas com pelo menos um animal reagente à prova sorológica. Estes índices por si só são muito expressivos e impactam nos diferentes segmentos das cadeias produtivas da pecuária de corte e de leite, além de implicar em barreira comercial à exportação da carne bovina. Assim, há necessidade de um teste rápido post-mortem, de altas sensibilidade e especificidade que possa ser usado como ferramenta de diagnóstico em sistemas de vigilância sanitária, frente à brucelose bovina. Diante disto, 20 bovinos de diferentes frigoríficos do Estado de Mato Grosso do Sul, que apresentavam lesões sugestivas para brucelose...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Brucelose; Brucella Abortus; Diagnostico; DNA; Pecuária.
Ano: 2019
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1118276

Biossegurança: Legislação e o papel das comissões nacional (CTNBIO) e local(CIBIO).
Provedor de dados: 14
Autores: TEIXEIRA, K. R. dos S.; BALDANI, J. I.
A Lei de biossegurança. Instruçções normativas -in. Infrações, crimes e penas da lei de biosseguraança. O papel da comissão técnica nacional de biossegurança (CTNBIO). O papel da comissão interna de biossegurança (CIBIO) e responsabilidades do técnico principal responsável (TPR).Comissão local: CIBIO- Embrapa Agrobiologia.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Ácido Nucléico; DNA; Vírus.
Ano: 1998
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/624302

MANEJO de lagartas resistentes: programa 34: Nordeste/Vale do Jequitinhonha.
Provedor de dados: 14
O Prosa Rural desta semana vai abordar o problema da resistência de lagartas à Soja-BT, aquela soja que expressa a proteína-inseticida em seu DNA, como forma de controle de algumas espécies de lagartas que atacam essa cultura. Apesar da área com resistência ainda ser pequena no Brasil, a Embrapa faz um alerta para que os produtores atentem para o manejo adequado dessas pragas, para evitar que o problema atinja mais áreas em pouco espaço de tempo.
Tipo: Gravações de som
Palavras-chave: DNA; Lagarta; Manejo; Praga de Planta; Produtor; Soja.
Ano: 2022
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1148436

MANEJO de lagartas resistentes: programa 34: Norte.
Provedor de dados: 14
O Prosa Rural desta semana vai abordar o problema da resistência de lagartas à Soja-BT, aquela soja que expressa a proteína-inseticida em seu DNA, como forma de controle de algumas espécies de lagartas que atacam essa cultura. Apesar da área com resistência ainda ser pequena no Brasil, a Embrapa faz um alerta para que os produtores atentem para o manejo adequado dessas pragas, para evitar que o problema atinja mais áreas em pouco espaço de tempo.
Tipo: Gravações de som
Palavras-chave: DNA; Lagarta; Manejo; Praga de Planta; Produtor; Soja.
Ano: 2022
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1148438

Operacionalizacao da extracao de DNA de especies nativas do cerrado visando analises moleculares.
Provedor de dados: 14
Autores: FALEIRO, F. G.; FALEIRO, A. S. G.; CORDEIRO, M. C. R.; KARIA, C. T.
bitstream/CPAC-2009/24957/1/p2004_10.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Planta nativa; Indigenous organisms.; Biotecnologia; Biologia Molecular; Cerrado; DNA; Marcador Genético; Marcador Molecular.; Biotechnology; Genetic markers; Molecular biology.
Ano: 2004
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/567935

Extração de DNA de folhas de pinhão-manso ( Jatropha curcas L.).
Provedor de dados: 14
Autores: SILVA, H. L. da; ANTUNES, J. E. L.; ARAÚJO, E. C. E.; DINIZ, F. M.; SOUZA, V. A. B. de; LIMA, P. S. da C.
Este trabalho teve como objetivo avaliar a extração de DNA por meio de um kit comercial "Puregene DNA Isolation" a partir de folhas cujas colorações definiam o estádio de crescimento no final do período de repouso vegetativo do pinhão-manso. Os resultados obtidos a partir dos métodos de quantificação indicaram que as folhas mais jovens, com coloração vermelho-vinho e verde-claro são as mais indicadas para a realização das extrações, quanto aos parâmetros da qualidade e de concentração do DNA, possibilitando a realização de coleta de tecidos para extrações mesmo no período de repouso da planta.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Biologia Molecular; DNA; Tecido Vegetal.
Ano: 2008
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/70642

Caracterização genética de bovinos por meio de estudos de cromossomo Y e do DNA mitocondrial.
Provedor de dados: 14
Autores: JORGE, W.; ISSA, E. C.; SERENO, F. T. P. de S.; SERENO, J. R. B.
ABSTRACT: Domestic cattle breeds are classified in two subspecies: Bos taurus taurus, which have an european origin and Bos taurus indicus, the zebuines, originated in India. The main phenotypic difference between them is the presence of the hump, observed in the zebuines and absent in taurines. In addition, the sexual Y chromosome has been considered as a marker for these subspecies. Animals that have a submetacentric or metacêntrico Y chromosome are considered as Bos taurus taurus and those with acrocentric Y chromosome are typically zebuine animals (Bos taurus indicus). On the other hand it is known that the Y-chromosome possesses genes related to spermatogenesis and consequently to reproductive fitness. The objective of this review was the Y-chromosome...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bovinae.; Bovino; Bos Taurus; Citogenética Animal; DNA; Melhoramento Genético Animal; Raça.; Animal breeding.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/570270

XXI Ciência para a vida: alimentos do futuro: cientistas desvendam DNA para compreender a função de genes e construir as bases de uma nova geração de plantas e animais.
Provedor de dados: 14
Entrevista especial 40anos; Genômica; Cenários; ciência Globalizada; Plantas e mais CO2; Clonagem.
Tipo: Outras publicações técnicas (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Biorrefinaria; DNA; Pesquisa agrícola; Melhoramento vegetal; Melhoramento animal.
Ano: 2013
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/994897

Eletroforese de ácidos nucléicos.
Provedor de dados: 14
Autores: GOUVEIA, J. J. de S.; REGITANO, L. C. de A.
bitstream/item/224366/1/7.-ELETROFORESE-DE-ACIDOS-NUCLEICOS.pdf
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: ÁCIDOS NUCLÉICOS; Eletroforese; DNA.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1132871

Síntese de DNA complementar (cDNA).
Provedor de dados: 14
Autores: IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.
bitstream/item/224365/1/9.-SINTESE-DE-DNA-COMPLEMENTAR-cDNA.pdf
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Síntese complementar; DNA.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/45684

As expansoes do milho - Zea mays, L. - para a América do Sul, baseado no resgate e estudo de DNA anciao de amostras arqueológicas.
Provedor de dados: 14
Autores: FREITAS, F. de O.
bitstream/CENARGEN/23671/1/bp032.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Amostra arqueologica; America do Sul.; DNA; Genética; Milho; Zea Mays.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/184682

Construção e validação de membranas de macroarranjo de DNA para o estudo da interação planta-nematóide.
Provedor de dados: 14
Autores: ANDRADE, R. V. de; MEHTA, A.; GUIMARÃES, P. M.; SILVA, F. R. da; GROSSI DE SÁ, M. F.; SARAIVA, M. A. de P.; FRAGOSO, R.; BRASILEIRO, A. C. M.
bitstream/CENARGEN/29528/1/bp204.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Amendoim silvestre; Arachis stenosperma; Feijão-caupi; Membranas de macroarranjo.; Algodão; Biotecnologia; DNA; Gossypium Hirsutum; Meloidogyne Incognita; Nematóide; Vigna Unguiculata.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/189412

MANEJO de lagartas resistentes: programa 34: Sul.
Provedor de dados: 14
O Prosa Rural desta semana vai abordar o problema da resistência de lagartas à Soja-BT, aquela soja que expressa a proteína-inseticida em seu DNA, como forma de controle de algumas espécies de lagartas que atacam essa cultura. Apesar da área com resistência ainda ser pequena no Brasil, a Embrapa faz um alerta para que os produtores atentem para o manejo adequado dessas pragas, para evitar que o problema atinja mais áreas em pouco espaço de tempo.
Tipo: Gravações de som
Palavras-chave: DNA; Lagarta; Manejo; Praga de Planta; Produtor; Soja.
Ano: 2022
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1148440

Caracterização e divergência genética entre genótipos de batata através de marcadores RAPD.
Provedor de dados: 14
Autores: COLLARES, E. A. V.; CHOER, E.; PEREIRA, A. da S.
bitstream/item/32402/1/documento-99.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Melhoramento genético; Potato.; Batata; DNA; Eletroforese; Marcador Molecular; Solanum Tuberosum.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/744139

CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos.
Provedor de dados: 14
Autores: SIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F.
Variações no número de cópias de regiões específicas do DNA, ou simplesmente CNVs (Copy Number Variations), constituem um tipo de marcador molecular que é encontrado com frequência nos genomas de mamíferos e plantas. Em humanos, o impacto das CNVs sobre os fenótipos já foi relatado em características adaptativas, mortalidade embrionária e em algumas doenças complexas como autismo, esquizofrenia, doença de Chron, artrite reumatoide, diabetes tipo I e obesidade. Comparada aos SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), as CNVs envolvem um número maior de sequências genômicas, apresentando, potencialmente, um impacto mais pronunciado na expressão gênica, em função de alterações na estrutura e na dosagem gênica. Assim, acredita-se que esse marcador também exerça um...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bovino; DNA; Fenótipo; Gene; Genética Animal; Marcador Molecular; Variação Genética; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2019
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1118279

Extração de DNA genômico de Brachiaria e Panicum maximum.
Provedor de dados: 14
Autores: BONATO, A. L. V.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; LEGUIZAMON, G. O. de C.
bitstream/CNPGC/10572/1/COT79.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Molecular markers; Processing.; Brachiaria; DNA; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Panicum Maximum; Processamento.; Plant breeding.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/319897

Extração de DNA e obtenção de marcadores moleculares para diferentes espécies de interesse para o cerrado.
Provedor de dados: 14
Autores: BELLON, G.; FALEIRO, F. G.; BARROS, A. M.; KARIA, C. T.; ANDRADE, R. P.; CORDEIRO, M. C. R.; PINTO, A. C.; JUNQUEIRA, N. T. V.; PEREIRA, A. V.; PEREIRA, E. B. C.; FERNANDES, F. D.; FERREIRA, M. E.
bitstream/CPAC-2009/26863/1/p2005_54.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Planta nativa; Indigenous organisms.; Biotecnologia; Biologia Molecular; Cerrado; DNA; Marcador Genético; Marcador Molecular.; Genetic markers; Biotechnology; Molecular biology.
Ano: 2006
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/553057

Otimização do protocolo de extração de DNA para espécies do gênero Piper nativas da Amazônia.
Provedor de dados: 14
Autores: RODRIGUES, S. de M.; MENEZES, I. C. de; VIEIRA, E. F. T.
bitstream/item/204948/1/ComTec-318.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Extração de DNA; Piperaceae; Extração; DNA; Piper.
Ano: 2019
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1114580

Engenharia genética: conceitos básicos, ferramentas e aplicações.
Provedor de dados: 14
Autores: CORDEIRO, M. C. R.
ABSTRACT: Basic concepts and methodologies concerning genetic engineering are presented in this review and is directed to people or professionales not familiarized to it. Moreover, it can be a document to clarity what is genetic engineering, the importance of its contributions to modern agriculture, medicine or livestock research and to support discussions on genetic research ethics. Covers information on structure of nucleic acids, types, functions and main processes such us DNA duplication, transcription and traduction. Important methodologies are covered about DNA/RNA extraction, electrophoresis, PCR, nucleic acid libraries production, cloning, sequencing, gene characterization in connection to main historical events of genetic engineering. It...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Ácido Nucléico; Biologia Molecular; Biotecnologia; Clonagem; DNA; Engenharia Genética; Gene; Marcador Genético; RNA; Organismo Transgênico.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/568132

Método de TÚNEL: uma ferramenta alternativa para avaliar a integridade do DNA de espermatozóides bovinos.
Provedor de dados: 14
Autores: MARTINS, C. F.; DODE, M. N.; BÁO, S. N.; RUMPF, R.
ABSTRACT: The success of the assisted reproductive techniques (ART) in both humans and domestic animals depends of the semen quality. Since there is no test that alone can predict sperm fertility, as more sperm parameters are analyzed during evaluation, more acurated will the result. The evaluation of the DNA integrity during the exam of bovine fresh and frozen sperm is of fundamental importance to avoid embryonic losses. The terminal deoxynucleotidyl transferase mediated dUTP nick end labeling assay (TUNEL) has been an efficient method to detect sperm DNA fragmentation, avoiding problems of embryonic development and decrease of the animal reproductive efficiency. This work presents and describes with the TUNEL technique (principles, advantages and...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bovinae.; Bovino; DNA; Espermatozóide; Genética Animal; Reprodução Animal.; Genetics; Reproduction; Spermatozoa.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/571981

Biotecnologia do pau-rosa.
Provedor de dados: 14
Autores: MORAES, L. A. C.; ÂNGELO, P. C. da S.; SAMPAIO, P. de T.; SANTOS, R. P.; QUISEN, R. C.; CARVALHO, R. de S.; LOPES, C. de O.
Pau-Rosa. Tecnologia do DNA. Cultura de tecidos.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Biotecnologia; Cultura de Tecido; DNA; Pau Rosa.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/672774

Extração de DNA genômico de Stylosanthes spp.
Provedor de dados: 14
Autores: BONATO, A. L. V.; VERZIGNASSI, J. R.; RESENDE, R. M. S.; FERNANDES, C. D.; LEGUIZAMON, G. O. de C.
Protocolo. Considerações sobre os procedimentos.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Molecular markers; Processing.; DNA; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Processamento.; Stylosanthes; Plant breeding.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/318167

Analise dos processsos de quebra, sintese e reparo do DNA durante a profase meiotica em Lilium spp.
Provedor de dados: 14
Autores: ALVES, R. M.; NASCIMENTO FILHO, F. J. do.
Celulas meioticas de lirio, microsporocitos, tem sido amplamente utilizadas para estudos bioquimicos combinados. O sincronismo natural das celulas meioticas, a duracao arelativamente longa da profase (2 a 5 dias) e a habilidade das celulas desenvolverem-se in vitro possibilitou analisar cada intervalo da sintese de DNA, separadamente.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Lillium; Brasil; Sao Paulo; Piracicaba; Species; Plants; Nucleotide sequence; DNA; Espécie; Meiose; Planta.
Ano: 1984
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/670465

Bulks de DNA na caracterização de germoplasma vegetal.
Provedor de dados: 14
Autores: BRESOLIN, A. P. S.; CASTRO, C. M.; OLIVEIRA, A. C. de.
bitstream/item/33972/1/documento-218.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Amostragem; DNA; Genética Vegetal; Marcador Molecular.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/745031

Isolamento e amplificação de DNA de amostras de solo como ferramenta para avaliar a diversidade das populações de bactérias em solos agrícolas.
Provedor de dados: 14
Autores: SANTOS, S. T. dos: DIREITO, I. C. N: TEIXEIRA, K. R. S. dos.
Aspectos físicos e químicos do solo e seu potencial de interação com os ácidos nucléicos. Extração do DNA do solo. Métodos indiretos de extração de DNA. Métodos diretos de extração de DNA. Aplicação da PCR na microbiologia ambiental. Fatores que interferem com aplicação da técnica de PCR em amostras ambientais. Parâmetros da reação que requerem otimização. Variações da técnica de PCR. Considerações finais sobre a aplicação destas técnicas na Ecologia Microbiana.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Bactéria; DNA; Solo.
Ano: 2002
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/597346

Otimização de protocolo para extração do DNA de endosperma de sementes de Araucaria angustifolia.
Provedor de dados: 14
Autores: KESTRING, D. R.; SEOANE, C. E. S.
bitstream/item/25642/1/177-10.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Protocolo.; Araucária; DNA; Extração.
Ano: 2010
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/873343

MANEJO de lagartas resistentes: programa 34: Centro-Oeste/Sudeste.
Provedor de dados: 14
O Prosa Rural desta semana vai abordar o problema da resistência de lagartas à Soja-BT, aquela soja que expressa a proteína-inseticida em seu DNA, como forma de controle de algumas espécies de lagartas que atacam essa cultura. Apesar da área com resistência ainda ser pequena no Brasil, a Embrapa faz um alerta para que os produtores atentem para o manejo adequado dessas pragas, para evitar que o problema atinja mais áreas em pouco espaço de tempo.
Tipo: Gravações de som
Palavras-chave: DNA; Lagarta; Manejo; Praga de Planta; Produtor; Soja.
Ano: 2022
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1148435

Detection of oyster herpesvirus DNA and proteins in asymptomatic Crassostrea gigas adults
Provedor de dados: 5
Autores: Arzul, Isabelle; Renault, Tristan; Thebault, Anne; Gerard, Andre.
Since 1972, several herpes-like virus infections have been reported among different bivalve species around the world. Most of these reports involved larvae or juveniles presenting high mortalities. Two case reports of herpes-like viruses concerned adult oysters, Crassostrea virginica in USA and Ostrea angasi in Australia. Molecular techniques including PCR and in situ hybridization (ISH) have been recently developed to detect the oyster herpesvirus genome. In the present study, 30 Pacific oyster, Crassostrea gigas, adults have been analyzed using three different techniques: PCR, ISH and immunochemistry, in order to detect herpesviruses in asymptomatic individuals. PCR and ISH allowed detection of oyster herpesvirus DNA in 93.3 and 86.6%, respectively, of...
Tipo: Text
Palavras-chave: Protein; DNA; Healthy carrier; Adult oyster; Crassostrea gigas; Herpesvirus.
Ano: 2002
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2002/publication-697.pdf

Development of genomic probes for detection of hepatitis A virus and enteroviruses in shellfish
Provedor de dados: 5
Autores: Apaire, M; Leguyader, F; Besse, B; Billaudel, S.
The development of molecular biology techniques has modified research procedures for certain viruses, particularly hepatitis A virus (HAV) and enteroviruses. Accordingly, we designed cDNA and RNA genomic probes to detect viruses in shellfish in the environment. Better sensitivity was noted with RNA than cDNA probes: only 17/83 shellfish samples were positive with HAV and enterovirus DNA probes, where as 42/83 were positive with HAV and enterovirus RNA probes.
Tipo: Text
Palavras-chave: Mollusca; Enterovirus; Hepatitis A virus; Picornaviridae; RNA probes; DNA probes; Seafood; Biology; Sensors; DNA; RNA; Viruses; Detection; Marine molluscs; Shellfish.
Ano: 1992
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/acte-1613.pdf

A rare and unusual new bittiine genus with two new species from the South Pacific (Cerithiidae, Gastropoda)
Provedor de dados: 5
Autores: Strong, Ellen E.; Bouchet, Philippe.
A new genus, Limatium gen, n., and two new species, L. pagodula sp, n, and L. aureum sp, n. are described, found on outer slopes of barrier reefs and fringing reefs in the South Pacific. They are rare for cerithiids, which typically occur in large populations. The two new species arc represented by 108 specimens sampled over a period of 30 years, only 16 of which were collected alive. Three subadults from the Philippines and Vanuatu likely represent a third species. In addition to their rarity, Limatium species arc atypical for cerithiids in their smooth, polished, honey to golden brown shells with distinctive white fascioles extending suture to suture. The radula presents a unique morphology that does not readily suggest an affinity to any of the...
Tipo: Text
Palavras-chave: Bittiinae; New genus; New species; Marine; DNA.
Ano: 2018
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00494/60615/64101.pdf

Autophagy plays an important role in protecting Pacific oysters from OsHV-1 and Vibrio aestuarianus infections
Provedor de dados: 5
Autores: Moreau, Pierrick; Moreau, Kevin; Segarra, Amelie; Tourbiez, Delphine; Travers, Marie-agnes; Rubinsztein, David C.; Renault, Tristan.
Recent mass mortality outbreaks around the world in Pacific oysters, Crassostrea gigas, have seriously affected the aquaculture economy. Although the causes for these mortality outbreaks appear complex, infectious agents are involved. Two pathogens are associated with mass mortality outbreaks, the virus ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) and the bacterium Vibrio aestuarianus. Here we describe the interactions between these 2 pathogens and autophagy, a conserved intracellular pathway playing a key role in innate immunity. We show for the first time that autophagy pathway is present and functional in Pacific oysters and plays an important role to protect animals from infections. This study contributes to better understand the innate immune system of Pacific...
Tipo: Text
Palavras-chave: Autophagy; Crassostrea gigas; OsHV-1; Pacific oyster; Vibrio aestuarianus; ATG; Autophagy-related; Atg8-PE; Atg8-phosphatidylethenolamine; DNA; Deoxyribonucleic acid; Hpi; Hours postinfection; LC3-II; Cleaved; Lipidated and autophagosome-associated form of LC3; MAP1LC3A; B (LC3A; B); Microtubule-associated proteins 1 light chain 3 alpha.
Ano: 2015
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00269/37989/36072.pdf

DNA hybridization mechanism in an interfacial environment: What hides beneath first order k (s(-1)) kinetic constant?
Provedor de dados: 5
Autores: Lazerges, M.; Perrot, H.; Rabehagasoa, N.; Compere, Chantal; Dreanno, Catherine; Mucio Pedroso, M.; Faria, R. C.; Bueno, P. R.
The scientific question addressed in this work is: what hides beneath first order kinetic constant k (s(-1)) measured for hybridization of a DNA target on a biosensor surface. Kinetics hybridization curves were established with a 27 MHz quartz microbalance (9 MHz, third harmonic) biosensor, constituted of a 20-base probe monolayer deposited on a gold covered quartz surface. Kinetics analysis, by a known two-step adsorption-hybridization mechanism, is well appropriate to fit properly hybridization kinetics curves, for complementary 20-base to 40-base targets over two concentration decades. It was found that the K-1 (M-1) adsorption constant, relevant to the first step, concerns an equilibrium between non hybridized targets and hybridized pre-complex and...
Tipo: Text
Palavras-chave: Biosensors; DNA; Hybridization kinetics; Quartz crystal microbalance.
Ano: 2012
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00101/21195/19415.pdf

Oligonucleotide quartz crystal microbalance sensor for the microalgae Alexandrium minutum (Dinophyceae)
Provedor de dados: 5
Autores: Lazerges, M; Perrot, H; Antoine, Elisabeth; Defontaine, Audrey; Compere, Chantal.
We report the immobilization on a gold surface of a 20-base DNA probe labeled with disulfide group and on the selective hybridization with the complementary 20-base DNA strand. The oligonucleotide probe is the complementary strand of a partial sequence of the gene encoding for a large ribosomal RNA sub-unit which is a coding sequence of Alexandrium minutum DNA, a microalgae that produces neurotoxins responsible for paralytic shellfish poisoning on European and Asian coasts. The kinetics of DNA probe immobilization and hybridization were monitored in situ by using a 27 MHz quartz crystal microbalance under controlled hydrodynamic conditions. The frequency of the setup is stable to within a few hertz, corresponding to the nanogram, scale, for 3 h and makes...
Tipo: Text
Palavras-chave: DNA; Alexandrium minutum; Microbalance.
Ano: 2006
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1354.pdf

Thiol- and Biotin-Labeled Probes for Oligonucleotide Quartz Crystal Microbalance Biosensors of Microalga Alexandrium Minutum
Provedor de dados: 5
Autores: Lazerges, Mathieu; Perrot, Hubert; Rabehagasoa, Niriniony; Compere, Chantal.
Two quartz crystal microbalance oligonucleotide biosensors of a toxic microalga gene sequence (Alexandrium Minutum) have been designed. Grafting on a gold surface of 20-base thiol- or biotin-labeled probe, and selective hybridization with the complementary 20-base target, have been monitored in situ with a 27 MHz quartz crystal microbalance under controlled hydrodynamic conditions. The frequency of the set up is stable to within a few hertz, corresponding to the nanogram scale, for three hour experiments. DNA recognition by the two biosensors is efficient and selective. Hybridization kinetic curves indicate that the biosensor designed with the thiol-labeled probe is more sensitive, and that the biosensor designed with the biotin-labeled probe has a shorter...
Tipo: Text
Palavras-chave: Alexandrium Minutum; Avidin; Biosensor; Biotin; DNA; Quartz crystal miocrobalance; Self-assembled monolayer; Thiol.
Ano: 2012
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21810/19385.pdf

Identification of skipjack tuna juveniles based on DNA control region sequences and potential spawning area around reunion island
Provedor de dados: 5
Autores: Nikolic, Natacha; Jerome, Marc; Fonteneau, Alain; Evano, Hugues; Verrez-bagnis, Veronique.
In this study, we confirmed that DNA control region can be used to identify potential spawning area from pelagic juveniles species. We used the mitochondrial DNA control region to identify tuna juveniles predated by common dolphinfish and sampled in surface waters around Reunion Island. These were skipjack juveniles at an early stage (small length and young age). The biological results confirmed the species identification based on DNA analysis. Catch data by longline reveal a higher number of skipjack from October to December around Reunion Island corresponding to the period of our skipjack juvenile sampling
Tipo: Text
Palavras-chave: Skipjack tuna; Reunion island; DNA; Age; Juvenile.
Ano: 2016
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00299/40993/42657.pdf

Antimicrobial histones and DNA traps in invertebrate immunity: evidences in Crassostrea gigas.
Provedor de dados: 5
Autores: Poirier, Aurore C.; Schmitt, Paulina; Rosa, Rafael D.; Vanhove, Audrey S.; Kieffer-jaquinod, Sylvie; Rubio, Tristan P.; Charriere, Guillaume M.; Destoumieux-garzon, Delphine.
Although antimicrobial histones have been isolated from multiple metazoan species, their role in host defense has long remained unanswered. We found here that the hemocytes of the oyster Crassostrea gigas release antimicrobial H1-like and H5-like histones in response to tissue damage and infection. These antimicrobial histones were shown to be associated with extracellular DNA networks released by hemocytes, the circulating immune cells of invertebrates, in response to immune challenge. The hemocyte-released DNA was found to surround and entangle vibrios. This defense mechanism is reminiscent of the neutrophil extracellular traps (ETs) recently described in vertebrates. Importantly, oyster ETs were evidenced in vivo in hemocyte-infiltrated interstitial...
Tipo: Text
Palavras-chave: Antimicrobial Peptide (AMP); DNA; Innate Immunity; Invertebrate; Reactive Oxygen Species (ROS); NET; Mollusk.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00217/32866/31784.pdf

In situ QCM DNA-biosensor probe modification
Provedor de dados: 5
Autores: Lazerges M, M; Perrot, H; Zeghib N, N; Antoine, Elisabeth; Compere, Chantal.
We report on a probe modification of a quartz crystal microbalance (QCM) DNA-biosensor that permits to reversibly change the DNA sequence detected. A QCM DNA-biosensor was designed by immobilization of a 20-base DNA-disulfide probe on the gold-covered quartz surface of a 27 MHz microbalance (9 MHz, third overtone). After immobilization on the gold covered quartz surface, this probe was modified by hybridization with a 45-base DNA that includes the complementary 20-base sequence, a 5-base spacer and a non-complementary 20-base sequence. The non-complementary sequence constitutes a new probe, different from the DNA-disulfide probe, that permits the detection of a new DNA target. As this 45 bases DNA is changeable by dehybridization, successive different DNA...
Tipo: Text
Palavras-chave: QCM; DNA; Biosensor.
Ano: 2006
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1985.pdf

Recherche d'AND d'herpèsvirus infectant les bivalves dans des échantillons d'eau de claires ostréicoles
Provedor de dados: 5
Autores: Solliec, Gaëlle; Vigneron, Valérie; Montanie, Hélène; Renault, Tristan.
Viral particles, associated with high mortality rates, have been reported among larvae and juveniles in different marine bivalve specie and characterized as member of the Hespesviridae family. Most studies focused on the detection of such viral infections among economically important species. However, the persistence of bivalve herpes viruses in marine environment is poorly documented. This topic appears as an important research domain in order to clarify the natural infection cycle of the herpesvirus of marine bivalves.
Tipo: Text
Palavras-chave: Herpesviridae; Oyster; PCR; DNA; Herpesvirus; Huître; PCR; ADN.
Ano: 2003
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2856.pdf

Morphoquantitative Analysis of the Intraepithelial Neoplasic Uterine Cells by Computer Image System
Provedor de dados: 77
Autores: Lima,Jacqueline Silva Brito; Bittencourt,Alexandre Motta; Lima,Carlos Eduardo de Queiroz; Mota,Diógenes Luis da; Romaguera,Ana Maria de Ataíde; da Silva,Luiz Lúcio Soares.
The purpose of the present research was to detect the DNA variations by Feulgen stained chromatin and the packing degree of the cervical chromatin in the clinical cases of human uterine carcinomas. Scanning microphotometry was carried out on slides prepared from block Feulgen-stained. Accurate control procedures were performed using normal human cell nuclei. The cervical cells was morphometric studied using the Image Lab System for citologic classification. The overall diagnostic accuracy for neoplasia type I (CIN I) and type II (CIN II), demonstrated by stain interpetration values of a sensitive detection of DNA neuroploidy and a significant difference between the two groups in scanning static cytophotometry.
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Cervix; DNA; Cervical Cancer; Morphometry.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-95022008000100016

Current perspectives on the evolution of birds
Provedor de dados: 16
Autores: Ericson, P.G.P.
The paper summarizes the current understanding of the evolution and diversification of birds. New insights into this field have mainly come from two fundamentally different, but complementary sources of information: the many newly discovered Mesozoic bird fossils and the wealth of genetic analyses of living birds at various taxonomic levels. The birds have evolved from theropod dinosaurs from which they can be defined by but a few morphological characters. The early evolutionary history of the group is characterized by the extinctions of many major clades by the end of the Cretaceous, and by several periods of rapid radiations and speciation. Recent years have seen a growing consensus about the higher- level relationships among living birds, at least as...
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Aves; Phylogeny; Systematics; Fossils; DNA; Genetics; Biogeography; 42.83.
Ano: 2008
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/280479

Bird specimens - an invaluable resource for genetical studies and conservation
Provedor de dados: 16
Autores: Gamauf, A.
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Aves; Specimens; DNA; 42.83.
Ano: 2005
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/210820

Evolution and biogeography of suboscine birds analysed by DNA sequence data – a research program at the Swedish Museum of Natural History
Provedor de dados: 16
Autores: Ericson, P.G.P.
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Suboscine birds; Evolution; Biogeography; DNA; 42.83.
Ano: 2005
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/210821

Lock, stock and two different barrels: comparing the genetic composition of morphotypes of the Indo-Pacific sponge Xestospongia testudinaria
Provedor de dados: 16
Autores: Swierts, T.; Peijnenburg, K.T.C.A.; Leeuw, C. de; Cleary, D.F.R.; Hörnlein, C.; Setiawan, E.; Wörheide, G.; Erpenbeck, D.; Voogd, N.J. de.
The giant barrel sponge Xestospongia testudinaria is an ecologically important species that is widely distributed across the Indo-Pacific. Little is known, however, about the precise biogeographic distribution and the amount of morphological and genetic variation in this species. Here we provide the first detailed, fine-scaled (&lt;200 km2) study of the morphological and genetic composition of X. testudinaria around Lembeh Island, Indonesia. Two mitochondrial (CO1 and ATP6 genes) and one nuclear (ATP synthase β intron) DNA markers were used to assess genetic variation. We identified four distinct morphotypes of X. testudinaria around Lembeh Island. These morphotypes were genetically differentiated with both mitochondrial and nuclear markers. Our results...
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Xestospongia testudinaria; Indo-Pacific; DNA; Genetic composition; Sponge; 42.72.
Ano: 2013
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/470573

Review of the Palaearctic (and Oriental) Allurus (Braconidae, Euphorinae) based on material from Sweden
Provedor de dados: 16
Autores: Stigenberg, J.; Achterberg, K. van.
Background  The tribe Centistini includes three genera, Allurus, Centistes and Centistoides (Stigenberg et al. 2015). They are solitary endoparasitoids of adults and final instar larvae of beetles from the family Curculionidae (Jackson 1920, Aeschlimann 1980, Tobias 1986)  New information  In this paper we present a key, molecular data (standard DNA barcode, CO1) and images of the two species of Allurus occurring in the Western Palaearctic. A third Oriental species described from China (Taiwan) is also included in the key. Allurus is a Holarctic genus with three known species (A. choui, A. lituratus, A. muricatus). Our sequence data confirms that A. muricatus and A. lituratus are two distinct and separate species and this paper points out good and easy...
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Braconidae; Euphorinae; Allurus; Parasitic wasp; DNA.
Ano: 2016
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/624483

Phylogeny of Old World Perninae (Accipitridae) based on mitochondrial DNA sequences
Provedor de dados: 16
Autores: Garnauf, A.; Haring, E.
Tipo: Article / Letter to the editor
Palavras-chave: Old World Perninae; Phylogeny; DNA; 42.83.
Ano: 2005
URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/210822

Caracterização molecular de populações de Euseius citrifolius Denmark &amp;amp; Muma e Euseius concordis (Chant) (Acari: Phytoseiidae) utilizando o seqüenciamento das regiões ITS1 e ITS2
Provedor de dados: 82
Autores: Noronha,Aloyséia C.S.; Mota,Adilson; Moraes,Gilberto J.; Coutinho,Luiz L.
A identificação dos ácaros geralmente é feita com base nas características morfológicas. Entretanto, as evidências morfológicas nem sempre são suficientes para a distinção de espécies muito próximas, levando o taxonomista a considerar aspectos ecológicos, biológicos e, mais recentemente, as características moleculares. A caracterização molecular de populações de Euseius citrifolius Denmark &amp;amp; Muma e E. concordis (Chant) foi realizada com o seqüenciamento da região dos espaçadores internos transcritos ITS1 e ITS2 utilizando-se os primers P1 (5'-AGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAG-3)' e P2 (5'-ATATGCTTAAATTCAGGGGG-3'), localizados nas regiões 18S e 28S do DNA ribossomal, respectivamente. Foram caracterizadas as seguintes populações: E. citrifolius: Arroio do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Palavras-chave: Controle biológico; DNA; Fitoseídeo; Predador.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2003000400009

Molecular key to seven Brazilian species of Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae) using sequences of the ITS2 region and restriction analysis
Provedor de dados: 82
Autores: CIOCIOLA JR,AMÉRICO I.; ZUCCHI,ROBERTO A.; STOUTHAMER,RICHARD.
Using the ITS2 sequences of the ribosomal DNA together with some restriction enzymes, a simple and precise molecular key to some Brazilian species of Trichogramma was created. This key is very easy to make and quick results can be obtained on the identification of this minute parasitoid (0.25 mm). The methodology presented is easily implemented and can be used to detect possible contaminations under laboratory rearings.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Insecta; DNA; Enzymes; Biological control.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2001000200008

The complete mitochondrial genome of Corydoras nattereri (Callichthyidae: Corydoradinae)
Provedor de dados: 83
Autores: Moreira,Daniel A.; Buckup,Paulo A.; Britto,Marcelo R.; Magalhães,Maithê G. P.; Andrade,Paula C. C. de; Furtado,Carolina; Parente,Thiago E.
ABSTRACT The complete mitogenome of Corydoras nattereri , a species of mailed catfishes from southeastern Brazil, was reconstructed using next-generation sequencing techniques. The mitogenome was assembled using mitochondrial transcripts from the liver transcriptomes of three individuals, and produced a circular DNA sequence of 16,557 nucleotides encoding 22 tRNA genes, two rRNA genes, 13 protein-coding genes and two noncoding control regions (D-loop, OrigL). Phylogeographic analysis of closely related sequences of Cytochrome Oxydase C subunit I (COI) demonstrates high diversity among morphologically similar populations of C. nattereri . Corydoras nattereri is nested within a complex of populations currently assigned to C. paleatus and C. ehrhardti ....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Barcode; DNA; Mitogenome; Molecular diversity; MtRNA.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252016000100218

Multiloci analyses suggest synonymy among Rhomboplites, Ocyurus and Lutjanus and reveal the phylogenetic position of Lutjanus alexandrei (Lutjanidae: Perciformes)
Provedor de dados: 83
Autores: Veneza,Ivana; Silva,Raimundo da; Silva,Danillo da; Gomes,Grazielle; Sampaio,Iracilda; Schneider,Horacio.
ABSTRACT Lutjanidae comprises 21 genera and 135 species widespread throughout Atlantic, Indian and Pacific oceans. Nonetheless, the phylogenetic relationships of Lutjaninae remain uncertain. Furthermore, phylogenetic hypotheses for Lutjanus alexandrei, an endemic species from northeastern Brazilian coast, in Lutjanidae are absent so far. Therefore, we carried out multiloci analyses, combining both mitochondrial and nuclear DNA sequences in Lutjaninae species from Western Atlantic focusing on the controversial relationships among Lutjanus, Rhomboplites, and Ocyurus. Besides, we determined the phylogenetic position and dated the origin of L. alexandrei. The phylogenetics trees based on the 4.4 kb for 11 species corroborated the synonym among Lutjanus and the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Lutjaninae; Phylogeny Molecular; Systematics; Taxonomy.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252019000100211

Toxoplasma gondii: DNA vaccination with genes encoding antigens MIC2, M2AP, AMA1 and BAG1 and evaluation of their immunogenic potential
Provedor de dados: 19
Autores: Dautu, George; Munyaka, Biscah; Carmen, Gabriella; Zhang, Guohong; Omata, Yoshitaka; Xuan, Xuenan; Igarashi, Makoto.
A combination of antigenic regions of microneme proteins have been previously reported as being protective against chronic toxoplasmosis. In this work, we evaluated immune responses induced by immunizing BALB/c and C57BL/6 mice intradermally with plasmid DNA encoding the protein sequences of Toxoplasma gondii AMA1, MIC2, M2AP and BAG1. Mice immunized with the AMA1 gene developed high levels of serum IgG2a and c antibodies as well as cellular immune responses associated with IFN-γ synthesis suggesting a modulated Th1 type of response. Immunization with the AMA1 gene resulted in a partial but significant protection against the acute phase of toxoplasmosis compared to MIC2, M2AP and BAG1 genes. Therefore, the AMA1 gene appears to generate a strong specific...
Palavras-chave: Toxoplasma gondii; DNA; Deoxyribonucleic acid; DNA immunization; MIC2; Microneme protein-2; M2AP; MIC2 associated protein; AMA1; Apical membrane antigen-1; BAG1; Bradyzoite antigen-1; IgG; Immunoglobulin G.
Ano: 2007
URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/1031

Estimates of DNA strand breakage in bottlenose dolphin (Tursiops truncatus)
Provedor de dados: 20
Autores: Blanco, M.; Cruz, D.; Carro, S.; López, R.; Díaz, A.; Sánchez, L.; Santiago, L.; Guevara, C.; Sánchez, L.; Cuetara, E.B.; López, N.
The analysis of DNA damage by mean of Comet or single cell gel electrophoresis (SCGE) assay has been commonly used to assess genotoxic impact in aquatic animals being able to detect exposure to low concentrations of contaminants in a wide range of species. The aims of this work were 1) to evaluate the usefulness of the Comet to detect DNA strand breakage in dolphin leukocytes, 2) to use the DNA diffusion assay to determine the amount of DNA strand breakage associated with apoptosis or necrosis, and 3) to determine the proportion of DNA strand breakage that was unrelated to apoptosis and necrosis. Significant intra-individual variation was observed in all of the estimates of DNA damage. DNA strand breakage was overestimated because a considerable amount...
Tipo: Journal Contribution
Palavras-chave: DNA; Species.
Ano: 2009
URL: http://hdl.handle.net/1834/3354

Estructura genética de las poblaciones de Stegastes  partitus (Perciformes: Pomacentridae) en cinco  localidades del archipiélago cubano y Bocas del Toro,  Panamá.
Provedor de dados: 20
Autores: Castellanos Gell, J.
La mayoría de los peces de arrecifes poseen un estadio larval pelágico durante el cual pueden ser  transportados largas distancias.  La inferencia  de estos patrones de conectividad  a partir de  estudios genético-poblacionales, ha cobrado gran auge debido a su utilidad en el diseño de áreas  marinas protegidas. Este trabajo se propone analizar la influencia de las posibles barreras físicas,  la biología de la especie y sus potenciales de dispersión, en la estructura genética de Stegastes  partitus y brindar elementos al esclarecimiento de esta problemática en el archipiélago cubano. Se  colectaron individuos de cinco localidades del archipiélago cubano: Los Canarreos y La Bajada, en  la región Suroccidental; y por el Norte: Cayo Coco, Los Colorados, y...
Tipo: Theses and Dissertations
Palavras-chave: Population genetics; Marine structures; DNA; Genetic selection.
Ano: 2008
URL: http://hdl.handle.net/1834/5513

Etude de la structure génétique des populations de la tortue marine Caretta caretta dans les eaux tunisiennes.
Provedor de dados: 20
Autores: Chaieb, O.
La tortue marine, la caouanne (Caretta caretta), est une espèce en danger d’extinction. Elle est caractérisée par un cycle biologique complexe se basant sur une série de transitions écologiques et géographiques nécessitant des migrations sur de longues distances. En Tunisie, plusieurs études ont été réalisées sur les activités de nidification et les interactions avec les activités de pêche, mais, aucune n’a porté sur l’étude génétique de cette espèce. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à l’analyse génétique de la population nidifiante en Tunisie et des populations des tortues se développant dans les zones néritiques tunisiennes.  La population nidifiante a été appréhendée par l’analyse des nouveau-nés échantillonnés durant une période de sept ans...
Tipo: Theses and Dissertations
Palavras-chave: Allozymes; DNA; Genetic diversity; Neritic province.
Ano: 2013
URL: http://hdl.handle.net/1834/5923

Caracterización genética de la colonia reproductiva de la tortuga marina Golfina -Lepidochelys olivacea- en el Parque Nacional Natural Gorgona (Pacífico colombiano) a partir de secuencias de ADN mitocondrial
Provedor de dados: 20
Autores: Rondón-González, F.; Amorocho, D.; Camacho_Mosquera, L.; Mejía-Ladino, L.M.; Palacio-Mejía, J.D.
Con el fin de caracterizar genéticamente la colonia anidante de Lepidochelys olivacea en playa Palmeras-Parque Nacional Natural Gorgona (PNNG) y contribuir a la implementación de estrategias de conservación para la especie, se secuenció un fragmento de la región + (D-loop) del ADN mitocondrial en 29 individuos, a partir del cual se estimó la diversidad genética y se infirieron las posibles relaciones filogenéticas al comparar la misma secuencia con datos publicados en el GenBank. El análisis de las secuencias reveló la presencia de dos haplotipos N (96.55%) y E (3.45%), de acuerdo con las secuencias registradas para esa especie. La diversidad genética y nucleotídica de la colonia estudiada es h=0.069 y π=0.023%, respectivamente.
Tipo: Journal Contribution
Palavras-chave: DNA; Conservation.
Ano: 2008
URL: http://hdl.handle.net/1834/3503

Estudio de las concentraciones de los ácidos nucleicos (RNA, DNA)en músculo blanco e hígado de la lisa (Mugil brasiliensis)a lo largo de sus períodos de reposo y maduración gonadal
Provedor de dados: 20
Autores: Duhalde, G.B.; Introzzi, A.E.
The concentration of nucleic acids (RNA and DNA)was reviewed, as well as the RNA/DNA coefficient, in white muscle and liver of Mugil brasiliensis adult females caught at the Mar Chiquita Coastal Laggon (37°30'S, 57°20'W)between September and March. Countrary to what observations in other species (Lepomis macrochirus and Clarias batrachus)have shown, i.e., a decrease in muscle RNA/DNA during gonadal maturation, Mugil brasiliensis would seem to maintain a proteic balance in equilibrium during the said period. No significant correlation was found between IGS and the RNA, DNA and RNA/DNA muscular variables.
Tipo: Journal Contribution
Palavras-chave: Sexual maturity; Nucleic acids; DNA; Nucleic acids; Sexual maturity.
Ano: 1986
URL: http://hdl.handle.net/1834/2035

Arachis hoehnei, the probable B genome donor of Arachis hypogaea based on crossability, cytogenetical and molecular studies
Provedor de dados: 30
Autores: Mallikarjuna, N.
Palavras-chave: Genomes; Hybrids; Polyploidy; Cytogenetics; DNA; Groundnuts; Mosses; Genetic polymorphism; Polymorphism; Genetic improvement.
Ano: 2006
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3177

Genes are gems:reporting agri-biotechnology
Provedor de dados: 30
Autores: R.L.
Palavras-chave: Biotechnology; Transgenics; Genes; DNA; Mycotoxins; Chickpeas; Transgenic plants; Genetic markers; Genetic engineering; Genomes.
Ano: 2006
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4146

Stability analysis of chickpea large genomic DNA inserts in Agrobacterium
Provedor de dados: 30
Autores: Rajesh, P.N.
Palavras-chave: Cloning; Genomes; Plasmids; DNA; Chickpeas; Genetic transformation; Chromosomes; Antibiotics; Bacteria; Genes.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3293

Sequence of ITS-2 Amplified from Pearl Millet Downy Mildew Samples
Provedor de dados: 30
Autores: Viswanathan, A.
Palavras-chave: DNA; PCR; Genetic techniques; Sampling; Ribosomes; Fungi; Genetic variation; Genes; Millets; Cloning.
Ano: 2005
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3262

Progress in interspecific hybridization between Cicer arietinum and wild species C. bijugum
Provedor de dados: 30
Autores: Mallikarjuna, N.,( Nalini Mallikarjuna ).
Palavras-chave: Chickpeas; Hybrids; Cytokinins; Self pollination; Cross pollination; Crossing over; Hybridization; Interspecific hybridization; Heterocyclic compounds; DNA.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3343

Isolation and characterization of novel microsatellite markers and their application for diversity assessment in cultivated groundnut (Arachis hypogaea)
Provedor de dados: 30
Autores: Luu M Cuc.
Palavras-chave: Genomes; Genetic structures; Polymorphism; Alleles; DNA; Genotypes; PCR; Cloning; Locus; Groundnuts.
Ano: 2008
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3317

Alternative cytoplasmic male sterility systems in sorghum and their utilization
Provedor de dados: 30
Autores: A.A. ( A. Ashok Kumar ).
Palavras-chave: Cytoplasm; Genes; Sorghum; Hybrids; Heterosis; Transcription; DNA; Genetic structures; Segregation; Genomes.
Ano: 2008
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3149

Development of new simple sequence repeat markers for pearl millet
Provedor de dados: 30
Autores: Yadav, O.P.
Palavras-chave: Locus; DNA; Genetic structures; PCR; Millets; Polymorphism; Genomes; Biotechnology; Breeds (animals); Melting.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3309

Genetic structure, diversity, and allelic richness in composite collection and reference set in chickpea (Cicer arietinum L.)
Provedor de dados: 30
Autores: Upadhyaya, H.D.
Palavras-chave: Alleles; Chickpeas; Locus; Genomes; Polymorphism; Genes; Genetic structures; DNA; PCR; Peas.
Ano: 2008
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3334

Groundnut bacterial wilt: past, present, and future
Provedor de dados: 30
Autores: V.K.
Palavras-chave: Bacteria; Groundnuts; Pathogens; PCR; DNA; Enzymes; Genotypes; Oil crops; Mutants.
Ano: 1994
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4181

New molecular marker technologies for pearl millet improvement
Provedor de dados: 30
Autores: Gale, M.D.
Palavras-chave: Millets; Genomes; Genes; DNA; Genetic polymorphism; Genetic structures; Genetic markers; Locus; Genetic maps; Chromosomes.
Ano: 2005
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3219

Molecular genetic relationships among Arachis diogoi and A. chiquitana accessions
Provedor de dados: 30
Autores: Mallikarjuna, N.,( Nalini Mallikarjuna ).
Palavras-chave: DNA; Polymorphism; RAPD; Genotypes; Locus; Genetic structures; Groundnuts; Hybrids; Nitrogen; Mass media.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3294

Diagnosis of key nematode pests of chickpea and pigeonpea and their management
Provedor de dados: 30
Autores: S.B.
Palavras-chave: Pigeonpeas; Chickpeas; DNA; Parasites; Genes; Grain legumes; Biological interaction; Nematicides; Yield losses.
Ano: 1997
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4196

Development of cost-effective SNP assays for chickpea genome analysis and breeding
Provedor de dados: 30
Autores: Varshney, R.K.,( Rajeev K. Varshney ).
Palavras-chave: Genomes; Polymorphism; Genotypes; Enzymes; Nucleotides; Chickpeas; DNA; Bioinformatics; Genetic structures; Genes.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3282

An effective method for cloning of partial MADS-box genes related to flower development in groundnut
Provedor de dados: 30
Autores: Yuan, M.
Palavras-chave: Genes; PCR; DNA; Cloning; Transcription factors; Genomes; Transcription; Genetic structures; Nucleotides; Molecular cloning.
Ano: 2005
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3213

International Sorghum and Millets Newsletter
Provedor de dados: 30
Autores: J.A.
Palavras-chave: Millets; Sorghum; Grain; Hybrids; Genotypes; Cytoplasm; Germplasm; DNA; Breeds (animals); Genes.
Ano: 1998
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4667

Extending the repertoire of microsatellite markers for genetic linkage mapping and germplasm screening in chickpea
Provedor de dados: 30
Autores: Varshney, R.K.,( Rajeev K. Varshney ).
Palavras-chave: Genetic structures; Chickpeas; Genomes; Cloning; Chromosome mapping; Plasmids; Polymorphism; DNA; Genotypes; Genetic markers.
Ano: 2007
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3338

Use of 2n pollen in generating interspecific derivatives of groundnut
Provedor de dados: 30
Autores: Mallikarjuna, N.
Palavras-chave: Genomes; Polyploidy; Nucleus; Hybrids; Chromosome number; Chromosomes; Mosses; Meiosis; Cytogenetics; DNA.
Ano: 2006
URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3176

The nuclear rDNA region of &lt;i&gt;Gyrodactylus arcuatus&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. branchicus&lt;/i&gt; (Monogenea: Gyrodactylidae)
Provedor de dados: 27
Autores: Zietara, M.S.; Arndt, A.; Geets, A.; Hellemans, B.; Volckaert, F.A.M.J.
The primary structure of the ribosomal DNA internal transcribed spacers (ITS-1 and ITS-2) and 5.8S rRNA gene were used to characterize and identify 2 monogenean species of &lt;i&gt;Gyrodactylus&lt;/i&gt; living externally on the threespine stickleback (&lt;i&gt;Gasterosteus aculeatus&lt;/i&gt;). The ITS region was amplified by PCR from freshwater, brackish, and marine isolates of &lt;i&gt;Gyrodactylus arcuatus&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. branchicus&lt;/i&gt;, and the ends of the coding regions were identified by comparative alignment. No intraspecific and very low interspecific variation were observed in the 5.8S rRNA gene; high inter- and low intraspecific variation were revealed in the ITS-1 and ITS-2 regions. The morphological species identification was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Molecular structure; Nucleotide sequence; Taxonomy; Gasterosteus aculeatus.
Ano: 2000
URL: http://www.vliz.be/nl/open-marien-archief?module=ref&refid=8482

Mapeamento de QTLs para reação ao oídio e mancha-angular do feijoeiro-comum em diferentes locais
Provedor de dados: 86
Autores: Melo,Leonardo Cunha; Santos,João Bosco dos; Ferreira,Daniel Furtado.
Os objetivos deste trabalho foram mapear, em diferentes locais, marcadores RAPD ligados a QTLs (Quantitative Trait Loci) de reação do feijoeiro-comum ao oídio e à mancha-angular, avaliar a interação de QTLs por locais e comparar os métodos de mapeamento e regressão múltipla no processo de detecção de QTLs. Foram avaliadas 196 linhagens recombinantes, oriundas do cruzamento entre as cultivares Carioca e Flor de Mayo, em duas épocas de cultivo: época da seca, para mancha-angular, e inverno para oídio, nos anos de 1996, 1997 e 1998, em dois locais de Minas Gerais. Foram conduzidos sete experimentos de avaliação fenotípica utilizando o delineamento experimental em látice quadrado simples. Os resultados mostraram que a interação QTLs por locais foi...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Marcadores genéticos; DNA; Variação genética; Doenças das plantas.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2002000800009

Variabilidade genética entre populações de Pistia stratiotes
Provedor de dados: 87
Autores: Cardoso,L.R.; Martins,D.; Mori,E.S.; Terra,M.A.
O manejo de plantas daninhas em ambientes aquáticos requer cuidado diferencial e específico, a fim de evitar a contaminação ou alteração nas funções dos corpos hídricos e otimização do custo-benefício das operações. O estudo das características genéticas de populações de plantas daninhas aquáticas fornece informações que podem auxiliar no seu controle e manejo. A alface-d'água é uma planta aquática flutuante livre amplamente distribuída em todo o Brasil, mas é em ambientes aquáticos eutrofizados que essa e outras espécies de rápido desenvolvimento causam problemas sociais e econômicos, devido à grande massa vegetal produzida. Este estudo caracterizou geneticamente populações de alface-d'água coletadas em 15 reservatórios de hidrelétricas (Barra Bonita-BAB,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Alface-d'água; DNA; RAPD; Planta daninha; Planta aquática.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582005000200003

Caracterização genética de acessos de egéria (Egeria spp.) coletados no estado de São Paulo utilizando RAPD
Provedor de dados: 87
Autores: Martins,D.; Cardoso,L.R.; Mori,E.S.; Tanaka,R.H.
Este trabalho constituiu-se na análise da variabilidade genética de acessos de egéria (Egeria spp.) coletados em sete reservatórios de geração de energia do Estado de São Paulo. Foi utilizada a técnica de RAPD (DNA polimórfico amplificado ao acaso), na qual seis primers (X03, Y09, Y11, Z11, Z12 e W06) permitiram a análise de 23 locos polimórficos na espécie Egeria densa. Os materiais dos reservatórios de Nova Avanhandava e Promissão foram os mais semelhantes geneticamente, visto que se localizam em seqüência no rio Tietê. Os reservatórios de Salto Grande e Promissão apresentaram plantas com o maior índice de distância genética (0,1792). Para a espécie Egeria najas foram analisados 52 locos polimórficos, resultantes da amplificação de nove primers (X01,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Planta aquática; DNA; Dispersão; Egeria densa; Egeria najas.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582003000400001

Variabilidade genética de acessos de aguapé coletados no Estado de São Paulo
Provedor de dados: 87
Autores: Cardoso,L.R.; Martins,D.; Kuramae,E.E.; Tanaka,R.H.; Mori,E.S.
No presente trabalho foram coletados acessos de Eichhornia crassipes (aguapé) nos reservatórios das hidrelétricas de Barra Bonita, Bariri, Três Irmãos, Ilha Solteira, Salto Grande, Promissão, Ibitinga, Nova Avanhandava, Mogi-Guaçu, Euclides da Cunha, Jaguari, Jurumirim, Jupiá, Paraibuna e Porto Primavera, do Estado de São Paulo. Estes acessos foram submetidos a um estudo de variabilidade genética por meio de RAPD. Os "primers" utilizados foram OP X02, OP X07, OP X11 e OP P10 (TTCCGCCACC, GAGCGAGGCT, GGAGCCTCAG, TCCCGCCTAG, respectivamente). Dentre os acessos coletados e analisados, 21 apresentaram índice de identidade genética acima de 0,90. O dendrograma gerado com dados entre populações revelou forte coerência com a distribuição geográfica dos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Planta aquática; DNA; Dispersão; Eichhornia crassipes.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582002000400001

Laboratory Protocols CIMMYT Applied Molecular Genetics Laboratory
Provedor de dados: 31
Autores: Warburton,   Marilyn.
Third Edition
Tipo: Report
Palavras-chave: Chemiluminescence immunoassays; DNA; DNA hybridization; Molecular markers; PCR; RFLPs; Research and Development/Tech Change/Emerging Technologies; F30.
Ano: 2005
URL: http://purl.umn.edu/56184

Inter-relações genéticas entre espécies do gênero Spondias com base em marcadores AFLP
Provedor de dados: 94
Autores: Santos,Carlos Antônio Fernandes; Oliveira,Viseldo Ribeiro de.
O objetivo deste trabalho foi construir um fenograma de trinta indivíduos de seis espécies de Spondias, amostradas em três diferentes locais, baseado em 120 marcadores AFLP das combinações de primers EcoR1/Mse1 para esclarecer as inter-relações entre as espécies, subsidiar a exploração das espécies como porta-enxerto e fornecer informações genômicas dessas espécies. O fenograma UPGMA do coeficiente de Jaccard apresentou boa definição, com valor co-fenético de 0,925 e localização externa de dois "outgroups" das espécies Mangifera indica e Schinopsis brasiliensis da família Anacardeaceae. Todos os indivíduos de S. cytherea, S. tuberosa e S. purpurea foram agrupados dentro de cada espécie, independentemente do local de amostragem, enquanto quatro dos seis...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Spondias tuberosa; Fenograma; Marcadores moleculares; DNA; AFLP; Genética.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000300028

EXTRAÇÃO DE DNA GENÔMICO DE Passiflora spp. PARA ANÁLISES PCR-RAPD
Provedor de dados: 94
Autores: MOLINARI,HUGO BRUNO; CROCHEMORE,MARIA LÚCIA.
A identificação e caracterização da diversidade genética de plantas por meio de técnicas moleculares envolvem a avaliação de vários indivíduos, necessitando-se, portanto, de métodos rápidos e precisos de extração do DNA. O co-isolamento de polissacarídeos, fenóis e compostos secundários é o principal problema encontrado no isolamento e purificação de DNA vegetal. Folhas das diversas espécies de Passiflora possuem níveis variados desses compostos que podem comprometer este procedimento. O presente estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a qualidade e quantidade de DNA de folhas de variedades de Passiflora spp., utilizando-se de três métodos de extração. Os três métodos forneceram DNA em qualidade e quantidade suficientes para a realização da técnica...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Palavras-chave: Passiflora spp.; DNA; Extração.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452001000200051

Genetic variations among passion fruit species using rapd markers
Provedor de dados: 94
Autores: Aukar,Ana Paula de Andrade; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Oliveira,João Carlos.
It has been evaluated the genetic variability through the use of RAPD molecular markers on the following passionflower species: Passiflora amethystina, P. caerulea, P. cincinnata, P. coccinea, P. serrato digitata, P. foetida, P. maliformis, P. alata, P. giberti, P. laurifolia, P. macrocarpa, P. nitida, P. setacea, P. suberosa, P. ligularis, P. capsularis, P. edulis Sims and its botanical variety P. edulis Sims f. flavicarpa Deg. In this research work, the analyses of the random amplified polymorphic DNA products (RAPD) were employed to estimate the genetic diversity and the taxonomic linkage within the species above. The total of 21 primers were used in this study which generated 270 different polymorphic products. It was possible to detect that the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Genetic diversity; Passion fruit; Random Amplified Polymorphic DNA.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452002000300044

Genetic and chemical characterization of avocado commercial cultivars avocado of Risaralda Colombia
Provedor de dados: 94
Autores: Álvarez,Gloria Edith Guerrero; Gutiérrez,Ana María López; Valencia,Katalina Ángel; Mossos,Paula Sandoval; Rozo,Diana Lucía Suárez; Hurtado,Nathalia Cardona.
Abstract  This research aimed at performing the molecular characterization of commercial Papelillo avocado (Persea americana cv Lorena) cultivars from the municipality of Marsella (Risaralda, Colombia), as well as the physicochemical analysis and antioxidant activity assessment of the pulp and seed. An evaluation of 50 individuals among commercial varieties and possible patterns was performed using 17 microsatellite markers. Proximate analysis of the pulp was performed, and the fatty acid profile of oils, the antioxidant activity by the DPPH and FRAP methods, and the total phenolic content were evaluated. From the cluster analysis, Dice index, and Principal Coordinates Analysis, it became evident that all the individuals showed a tendency to group by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Antioxidants; DNA; Fatty acids; Microsatellites; Persea americana Mill.; Total phenols.
Ano: 2020
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452020000500902

Genetic diversity of four cattle breeds using microsatellite markers
Provedor de dados: 96
Autores: Machado,Marco Antonio; Schuster,Ivan; Martinez,Mário Luiz; Campos,Ana Lúcia.
Four cattle breeds (Gyr, Nellore, Guzerat and Holstein) were analyzed by amplification of genomic DNA using microsatellite loci to evaluate the genetic diversity within and among them. DNA samples of 18 animals from each breed were collected to access the genetic content of them. Allele frequencies were calculated and used to generate a Nei's genetic distance matrix what was used to build a dendrogram following UPGMA clustering. As expected, Holstein breed was the most distinct from the other breeds: 1.15 in relation to Gyr, 1.12 in relation to Nellore and 0.94 in relation to Guzerat. The closest genetic distance was 0.25 between Guzerat and Nellore. A total of 64 alleles in all four breeds were detected using nine microsatellite primers. Each breed showed...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovine; DNA; Genetic diversity; Marker; Microsatellite.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000100012

Microbiota ileal de frangos de corte submetidos a diferentes dietas
Provedor de dados: 96
Autores: Santos,Ione Iolanda dos; Corção,Gertrudes; Kessler,Alexandre de Mello; Laranjeira,Vani dos Santos; Lima,Marla Sonaira.
Este estudo foi conduzido para analisar as alterações do perfil microbiano da digesta ileal de frangos de corte alimentados com dietas contendo diferentes níveis de energia e aditivos. Foram preparadas duas dietas: uma à base de milho e farelo de soja com nível de energia padrão e outra de baixa energia com milho e os farelos de soja e trigo. Para cada nível de energia, foram ou não acrescentados o probiótico Enterococcus faecium; as enzimas xilanase, amilase mais β-glucanase; e a combinação do probiótico com as enzimas, resultando em 8 tratamentos. As aves foram distribuídas em delineamento inteiramente ao acaso com arranjo fatorial 2 × 4 e cada tratamento teve 5 repetições de 12 aves. Aos 19 dias, uma ave de cada repetição foi abatida e o conteúdo ileal...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DGGE; DNA; Enzimas; Probiótico; Trigo.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000300025

Genetic improvement of beef cattle through opportunities in genomics
Provedor de dados: 96
Autores: Miller,Stephen.
Genomics will improve the efficiency of beef cattle genetic improvement programs through the incorporation of genomic predictions into traditional genetic evaluations. The global dairy cattle breeding industry has been changed considerably in the last year through the implementation of genomic selection. Now proven to work in dairy cattle breeding, the challenge remains for the beef industry to successfully implement this technology. The primary challenge in beef cattle is the required resource population that relates genomic profile to phenotypic performance, which is quite large and its establishment will require collaboration or a significant investment by any one enterprise. Another challenge in beef cattle is the requirement for genomic predictions to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Breeding strategies; DNA; Genomic selection; Phenotype; Recording; Single nucleotide polymorphisms.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001300027

Caracterização molecular de animais da raça Nelore utilizando microssatélites e genes candidatos
Provedor de dados: 96
Autores: Tambasco,Daniella Debenedetti; Alencar,Maurício Mello de; Coutinho,Luiz Lehmann; Tambasco,Antonio Junqueira; Tambasco,Marina Debenedetti; Regitano,Luciana Correia de Almeida.
No presente trabalho, 180 fêmeas da raça Nelore, provenientes de oito rebanhos, foram analisadas quanto aos marcadores microssatélites TEXAN15, BM1224 e CSFM50 e aos polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) nos locos k-caseína, beta-lactoglobulina e hormônio de crescimento (GH). Com exceção de GH, todos os marcadores foram polimórficos na amostra estudada. Os valores de heterozigosidade, diversidade gênica, conteúdo de informação polimórfica (PIC) e probabilidade de exclusão de paternidade (PE) foram estimados. Os maiores valores de PIC (0,685) e PE (0,521) foram obtidos para o marcador BM1224.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovino; DNA; Marcador; Microssatélite; Nelore; RFLP.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000400014

Effects of cottonseed meal supplemented with lysine and enzyme (Hydroenzyme XP) on egg quality and performance of laying hens
Provedor de dados: 96
Autores: Saki,Ali Asghar; Pournia,Khashayar; Tabatabaie,Mohamad Mehdi; Zamani,Pouya; Haghighat,Mojtaba; Salary,Jalal.
This study was conducted to evaluate the effect of cottonseed meal supplemented with lysine and enzyme on laying hens performance and egg quality. Eighty Hy-Line W-36 white Leghorns were allotted for 12 weeks in a 2 × 2 factorial experiment in a completely randomized design, including four treatments and five replications with four birds in each. Treatments included: basal diet + 1% lysine + 0% enzyme; basal diet + 1% lysine + 0.025% enzyme; basal diet + 2% lysine + 0% enzyme; and basal diet + 2% lysine + 0.025% enzyme. Protein content in the magnum tissue was not significantly affected by different levels of lysine and enzyme, although magnum Protein:RNA ratio increased with 2% of lysine as compared with 1%. Moreover, jejunum DNA's concentration was not...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cottonseed meal; DNA; Performance; Protein synthesis; RNA.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012001000013

Sexagesimal scale for mapping human genome
Provedor de dados: 97
Autores: CRUZ-COKE,RICARDO.
In a previous work I designed a diagram of the human genome based on a circular ideogram of the haploid set of chromosomes, using a low resolution scale of Megabase units. The purpose of this work is to draft a new scale to measure the physical map of the human genome at the highest resolution level. The entire length of the haploid genome of males is deployed in a circumference, marked with a sexagesimal scale with 360 degrees and 1296000 arc seconds. The radio of this circunference displays a semilogaritmic metric scale from 1 m up to the nanometer level. The base pair level of DNA sequences, 10-9 of this circunsference, is measured in milliarsec unit (mas), equivalent to a thousand of arcsecond. The "mas" unit, correspond to 1.27 nanometers (nm) or...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Human genome; DNA; Chromosomes; Genetic map.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-078X2001000000014

Correlação entre alterações de cromatina espermática de touro identificadas por azul de toluidina e scsa
Provedor de dados: 195
Autores: da Fonseca, Ludmila Angélica; Oliveira Rocha, Lays; Beletti, Marcelo Emílio.
Reprodutores que possuem espermograma normal podem se comportarcomo subférteis ou passarem por períodos de subfertilidade. As alterações na descompactação da cromatina dos espermatozoides em bovinos são possíveis explicações encontradas para tais comportamentos. O presente trabalho foi delineado para correlacionar dois métodos para avaliação da descompactação da cromatina: análise computacional de esfregaços de sêmen corados com azul de toluidina e o SCSA (Sperm Chromatin Structure Assay). Quatorze amostras de sêmen de bovinos subférteis foram avaliadas com os dois métodos. Nos esfregaços de sêmen corados com AT foram avaliadas a descompactação e heterogeneidade da cromatina. Com o SCSA avaliou-se a proporção decabeças de espermatozoides coradas em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Azul de toluidina; Alaranjado de acridina; Espermatozoide; Cromatina; DNA.
Ano: 2014
URL: http://www.revistamvez-crmvsp.com.br/index.php/recmvz/article/view/23742

Há correlação entre os testes realizados in vitro e a fertilidade in vivo obtida em um programa de inseminação de ovinos com sêmen congelado?
Provedor de dados: 195
Autores: Bittencourt, Rodrigo Freitas; Chalhoub, Marcus; Loiola, Marcus Vinícius Galvão; Rodrigues, Alexandra Soares; Ferraz, Priscila Assis; Ribeiro Filho, Antônio de Lisboa.
Uma das grandes dificuldades na andrologia e identificar testes que possibilitem estimar a fertilidade do reprodutor ou de determinada amostra de sêmen congelada, devido a baixa ou ausência de correlação entre as avaliações in vitro e a fertilidade in vivo. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de correlações positivas entre os diferentes testes de avaliação espermática realizados in vitro e a sua fertilidade in vivo. Para tanto, 44 amostras de sêmen foram descongeladas e submetidas as avaliações espermáticas in vitro. As características de cinética espermática avaliadas (IVOS 12, Hamiton Thorn Biosciences, Beverly, MA, EUA) foram: motilidade total (MT, %), motilidade progressiva (MP, %), espermatozoides rápidos (RAP, %), velocidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ovinos; Sêmen; Criopreservação; DNA; Teste do cometa.
Ano: 2015
URL: http://www.revistamvez-crmvsp.com.br/index.php/recmvz/article/view/24974

A simple method for DNA isolation from Xanthomonas spp.
Provedor de dados: 63
Autores: Gomes,Luiz Humberto; Duarte,Keila Maria Roncato; Andrino,Felipe Gabriel; Tavares,Flavio Cesar Almeida.
A simple DNA isolation method was developed with routine chemicals that yields high quality and integrity preparations when compared to some of the most well known protocols. The method described does not require the use of lysing enzymes, water bath and the DNA was obtained within 40 minutes The amount of nucleic acid extracted (measured in terms of absorbancy at 260 nm) from strains of Xanthomonas spp., Pseudomonas spp. and Erwinia spp. was two to five times higher than that of the most commonly used method.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Palavras-chave: DNA; Xanthomonas; RAPD.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162000000300028

Control of algal growth on greenhouse surfaces using commercial algaecides
Provedor de dados: 63
Autores: Berthold,David Erwin; Elazar,Ariel; Lefler,Forrest; Marble,Christopher; Laughinghouse IV,Haywood Dail.
ABSTRACT Greenhouses and nurseries provide ideal environments for facilitating the formation of nuisance algal mats. Algal growth poses safety concerns to horticulturists and stimulates the propagation of unwanted plant pests and pathogens. To date, few strategies and data are available to effectively manage algal problems. The effectiveness of five algaecides was tested on two varying surfaces of greenhouses in situ to elucidate the efficacy of chemical methods of removing algae. Moreover, Nostoc commune (Vaucher ex Bornet &amp; Flahault) was treated on ceramic tiles in vitro , as it is a common alga in greenhouses and nurseries. We found that each algaecide had different effects, depending on the chemical applied, the surface to which the chemical was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Nostoc commune; DNA; Cyanobacteria; Herbicides; Management.
Ano: 2021
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162021000101601

ผลของการเสริม Ethidium bromide หรือ CuSO4 ในปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) ต่อการเพิ่มความแม่นยำในการคัดเพศตัวอ่อนโคเนื้อ
Provedor de dados: 106
Autores: Saruttiwong Boonkong; Chainarong Navanukraw; Tossapol Moonmanee; Jiratti Thammasiri; Vilaivan Khanthusaeng; Aree Kraisoon.
The study was conducted to determine effect of EB or CS supplements in LAMP reaction on greater accuracy of sexing cattle embryos. Bovine ovaries were collected from the slaughterhouse, oocytes were aspirated from follicles then were evaluated morphology. Oocytes were cultured in TCM-199 at 38.5 ºC 24 h. For in vitro fertilization (IVF), oocytes were co-incubated with spermatozoa at 38.5 ºC 24 h. Fertilization rate was evaluated and then the embryos were in vitro cultured until morula stage. Then, embryo samples were frozen and stored at -196 ºC. Frozen embryos (n=35) were randomly extracted for total cellular DNA and amplified by PCR method. DNA samples were stored at -20 ºC. Sexing was determined by modification of LAMP method with either 1mM EB or 1M CS...
Tipo: PhysicalObject
Palavras-chave: Cattle; Bovine; Oocyte; LAMP reaction; Loop-mediated isothermal amplificatio; Ethidium bromide; EB; CuSO4; CS; DNA; Sexing embryo; In vitro fertilization; IVF; โคเนื้อ; โอโอไซต์; ลักษณะทางสัณฐานวิทยา; การคัดเพศตัวอ่อน; เทคนิคการคัดเพศ; ดีเอ็นเอ; ความแม่นยำ.
Ano: 2013
URL: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/handle/001/5813

เทคนิคการสกัด DNA จากใบข้าวโพดสดให้มีคุณภาพดี
Provedor de dados: 106
Autores: Chaba Jampatong; Chatpong Balla; Usa Choorak; Gunyavee Saipun.
12 ill., 3 tables
Palavras-chave: Corn; Maize; DNA; Extraction; ข้าวโพด; ดีเอ็นเอ; การสกัด; ใบ.
Ano: 2004
URL: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/handle/001/4211

การประเมินความแปรปรวนของเอ็มบริโอเจนิคแคลลัสปาล์มน้ำมัน ที่เพาะเลี้ยงบนอาหารแข็งและในอาหารเหลวโดยเทคนิค RAPD และ SSR
Provedor de dados: 106
Autores: Anchalee Arthipatjaporn; Sompong Te-chato.
Effects of types of medium on somaclonal variation of the embryogenic callus of oil palm wereinvestigated. The calli were cultured either on solidified or in liquidified MS medium supplemented with dicamba at different concentrations and subcultured at monthly intervals for 3 months. The results showed that the maximum growth of the callus at 0.333 gram fresh weight (gFW) and 1.191 gFW were obtained from the solidified and liquidified medium containing 0.1 mg/l dicamba, respectively. Verification of somaclonal variation in embryogenic callus raised on both types of culture media was detected by RAPD and SSR techniques. The RAPD technique revealed that 6 primers namely OPA-03, OPAB-01, OPAB-09, OPAB-14, OPR-11 and OPT-06 gave clear DNA patterns with...
Tipo: Collection
Palavras-chave: Oil Palm; SSR techniques; Plant genetics; DNA; RAPD techniques; ปาล์มน้ำมัน; เอ็มบริโอเจนิคแคลลัส; การเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืช; พันธุกรรมพืช; เครื่องหมายโมเลกุล; อาหารแข็ง; อาหารเหลว; ความแปรปรวนทางพันธุกรรม.
Ano: 2012
URL: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/handle/001/5277

Marcadores RAPD na análise da diversidade genética de isolados de Acremonium strictum
Provedor de dados: 102
Autores: Teixeira,Hudson; Vieira,Maria das Graças G. C.; Machado,José C.
Os fungos Acremonium strictum e Fusarium verticillioides normalmente apresentam algumas similaridades morfológicas, o que dificulta sua diferenciação em sementes de milho (Zea mays), particularmente quando ocorrem simultaneamente. Técnicas moleculares de análise do DNA têm possibilitado o desenvolvimento de métodos rápidos, sensíveis eespecíficos no diagnóstico de fitopatógenos, em complemento à análise morfológica. Este trabalho objetivou caracterizar e dimensionar a diversidade genética de dez isolados de A. strictum obtidos de sementes de milho, provenientes de diferentes regiões produtoras brasileiras, por meio da análise do DNA genômico (RAPD). Objetivou-se ainda, diferenciar os isolados de A. strictum de F. verticillioides por meio da técnica citada....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Variabilidade; Fungo fitopatogênico; Cephalosporium acremonium; Semente; Milho.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000600009

Ralstonia solanacearum em viveiros clonais de eucalipto no Brasil
Provedor de dados: 102
Autores: Alfenas,Acelino C.; Mafia,Reginaldo G.; Sartório,Robert C.; Binoti,Daniel H.B.; Silva,Ricardo R.; Lau,Douglas; Vanetti,Cláudia A.
A incidência da murcha bacteriana, causada por Ralstonia solanacearum, em viveiros clonais de eucalipto, no período de abril a setembro de 2005, resultou no descarte de cerca de 553.991 minicepas, 6.837.691 propágulos na fase de enraizamento e 11.266.819 mudas, nos Estados da Bahia, do Espírito Santo, do Maranhão, de Minas Gerais e do Pará, totalizando um prejuízo estimado em, no mínimo, seis milhões de reais (US$ 2,7 milhões). Em minijardim clonal, a doença caracteriza-se por necrose foliar, escurecimento anelar ou completo do lenho, murcha e morte de minicepas. Os sintomas na parte aérea são similares à morte gradual de minicepas submetidas a podas drásticas ou com sistema radicular malformado. Na fase de enraizamento, miniestacas infectadas podem...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Murcha bacteriana; Murcha vascular; Eucalyptus spp.; Propagação clonal; PCR/RFLP; DNA.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000400005

Genetic divergence among and within Colletotrichum lindemuthianum races assessed by RAPD
Provedor de dados: 102
Autores: Talamini,Viviane; Souza,Elaine A.; Pozza,Edson A.; Silva,Gilvan F.; Ishikawa,Francine H.; Camargo Júnior,Osnil A.
Genetic divergence within and among races of Colletotrichum lindemuthianum was determined using RAPD markers. In addition to the different races of the fungus three isolates of the sexual stage of Colletotrichum lindemuthianum (Glomerella cingulata f.sp. phaseoli) were included in this study. The band patterns generated using 11 primers produced 133 polymorphic bands. The polymorphic bands were used to determine genetic divergence among and within the pathogen races. The isolates analyzed were divided into six groups with 0.75 relative similarity. Group VI, formed by three isolates of the sexual phase of Colletotrichum lindemuthianum, was the most divergent. Races previously determined using differential cultivars did not correlate with the results...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Common bean; DNA; Molecular characterization; Variability.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000600002

LA DUALIDAD ANÁLOGO DIGITAL DE LA INFORMACIÓN SE EJEMPLIFICA EN EL ESTUDIO DE LAS MÓLECULAS DE RNA
Provedor de dados: 37
Autores: ANDRADE,EUGENIO.
Las investigaciones sobre las moléculas de RNA, han contribuido a precisar y formalizar la noción física de información considerada tanto en su aspecto analógico como digital. El dogma central de la biología molecular, restringe la noción de información al aspecto digital de la misma, y por tanto al copiado fiel de una cadena de símbolos en los procesos de replicación (DNA-DNA) y transcripción (DNA-RNA), e igualmente en la traducción a proteínas mediante el código genético. Esta visión genera la paradoja sobre qué surgió primero si DNA o proteínas, la cual se resuelve en parte recurriendo a la hipótesis según la cual existió un mundo prebiótico RNA, anterior a las proteínas codificadas genéticamente y al DNA. Esta hipótesis tiene soporte empírico sólido...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: RNA; DNA; Proteínas; Información digital; Información analógica; Dogma central; Mundo RNA.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2011000300002

Comparação de protocolos para extração do DNA de Lernaea sp. (Copepoda: Cyclopoida) - DOI: 10.4025/actascianimsci.v25i2.1973
Provedor de dados: 2
Autores: Valentim, Marivone; UFP; Vargas, Lauro; UEM; Moreira, Héden Marques; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM.
Neste estudo, 30 amostras de fêmeas adultas de Lernaea sp. foram obtidas de peixes naturalmente infestados, em 2 pisciculturas na região norte do estado do Paraná, Brasil. Testaram-se 2 protocolos de extração do DNA para os tecidos do parasito. Os resultados obtidos revelaram o protocolo, utilizando o “Kit Puregene DNA Isolation” (GENTRA) para tecidos sólidos, como adequado para extração do DNA genômico de Lernaea. O método, utilizando protocolo CTAB, descrito por Black IV et al. (1996), modificado para a extração do DNA de Lernaea sp., foi tido como não-adequado, pois não houve extração do DNA.
Palavras-chave: 5.04.00.00-2 Zootecnia Crustacea; Lernaea; DNA; Protocolos de extração 5.04.00.00-2 Zootecnia.
Ano: 2003
URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/1973

Campomanesia adamantium (Cambess.) O. Berg seed desiccation: influence on vigor and nucleic acids
Provedor de dados: 42
Autores: DRESCH,DAIANE M.; MASETTO,TATHIANA E.; SCALON,SILVANA P.Q.
The aim of this study was to evaluate the sensitivity of Campomanesia adamantium seeds to desiccation by drying in activated silica gel (fast) and under laboratory conditions (slow). To assess the sensitivity of the seeds to desiccation, we used drying with silica gel and drying under laboratory conditions (25 °C), in order to obtain seeds with moisture content of 45, 35, 30, 25, 20, 15, 10 and 5%. The physiological potential of the seeds after desiccation was evaluated by measuring primary root protrusion, percentage of normal seedlings, germination seed index, seedling length, total seedling dry mass, electrical conductivity and DNA and RNA integrities. The C. adamantium seeds were sensitive to desiccation and to a reduction in moisture content to 21.1%...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cerrado; DNA; Drying; RNA; Viability.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652015000502217

Engineering biodiversity as a model for the species conservation
Provedor de dados: 42
Autores: RECH,ELIBIO L.
Abstract: Early humans have domesticated plant and animal species based on ancient empirical concepts (Darwin 1868, 1876). In 1886, Mendel established a new paradigm of hereditary laws (Mendel 1866, 1870, 1950) based on genotypic and phenotypic traits of cross-compatible species, establishing a complex breeding technology that is currently utilized for the development of most food and livestock-derived products. Recently, studies on deciphering the double-helical structure (Watson and Crick 1953a, b) and how to restrict DNA (Arber 2012) have established the foundation of recombinant DNA technology. A new era is paving the way for genetic manipulation of important traits among all the kingdom’s organisms, allowing for the development of innovative and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Biodiversity; Species conservation; DNA; Genetic engineering.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652019000600617

Molecular research and the control of Chagas disease vectors
Provedor de dados: 42
Autores: Abad-Franch,Fernando; Monteiro,Fernando A.
Chagas disease control initiatives are yielding promising results. Molecular research has helped successful programs by identifying and characterizing introduced vector populations and by defining intervention targets accurately. However, researchers and health officials are facing new challenges throughout Latin America. Native vectors persistently reinfest insecticide-treated households, and sylvatic triatomines maintain disease transmission in humid forest regions (including Amazonia) without colonizing human dwellings. In these scenarios, fine-scale vector studies are essential to define epidemiological risk patterns and clarify the involvement of little-known triatomine taxa in disease transmission. These eco-epidemiological investigations, as well as...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Molecular systematics; DNA; Allozymes; Triatominae; Chagas disease.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652005000300007

Molecular survey of Anaplasma platys and Ehrlichia canis in dogs from Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil
Provedor de dados: 42
Autores: SOARES,RODRIGO; RAMOS,CARLOS ALBERTO; PEDROSO,THATIANNA; BABO-TERRA,VERÔNICA; CLEVELAND,HERBERT; ARAÚJO,FLÁBIO DE.
ABSTRACT This study investigated the frequency of infection by Anaplasma platys and Ehrlichia canis in dogs submitted to animal health centers in Campo Grande, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. E. canis and A. platys showed infection frequencies of 55.75% and 16.96%, respectively. The identity of the two species was confirmed by DNA sequencing.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Epidemiology; NPCR; DNA; Midwestern Brazil.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652017000100301

Padronização de uma PCR para a autenticação do Salmo salar em pratos da culinária japonesa
Provedor de dados: 45
Autores: Gonçalves,E.P.M.; Barros,M.C.S.; Pessôa,M.C.; Cardilli,D.J.; Roos,T.B.; Moraes,C.M.
RESUMO O objetivo deste trabalho foi padronizar uma PCR para a detecção do Salmo salar, a qual possa ser usada na autenticação do salmão utilizado em pratos da culinária japonesa e do pescado comercializado in natura. Para isso, dois lotes de sushi foram produzidos experimentalmente. Além disso, foram visitados 38 estabelecimentos que comercializam comida japonesa e 10 peixarias na região metropolitana de Belém, visando à coleta do sushi, do temaki e do pescado pertencente à espécie Salmo salar. Os dados demonstraram que a técnica foi eficiente para a autenticação de Salmo salar, visto que a espécie foi detectada tanto nas amostras de sushis preparados experimentalmente quanto nas alíquotas de pescados isolados, utilizados para a preparação do sushi. Em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Sushi; Pescado; Temaki; Identificação; DNA.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352019000200640

Comparação entre métodos de estocagem de DNA extraído de amostras de sangue, sêmen e pêlos e entre técnicas de extração
Provedor de dados: 45
Autores: Coelho,E.G.A.; Oliveira,D.A.A.; Teixeira,C.S; Sampaio,I.B.M.; Rodrigues,S.G.; Alves,C.
DNA samples of six bovines obtained from three tissues (blood, semen and hair) were extracted using two different techniques. After the extraction procedures the samples were divided in six fractions. Three were stored at -20° C and three at 4° C. Every three months one sample of each tissue/extraction procedure was analyzed in spectrophotometer, to determine the quantity of the DNA and the extract was amplified using the primer RM 29. No differences in the DNA quantity or in the level of protein contamination among the three periods of analyses were observed. All the DNA extracted by quick extraction technique showed good amplification patterns during the nine months, meaning that this technique can be used in laboratory routine instead of the permanent...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: DNA; Métodos de extração; Amplificação.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352004000100017

Microssatélites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 e RM88 em testes de verificação de parentesco para bovinos da raça Gir
Provedor de dados: 45
Autores: Rodrigues,S.G.; Oliveira,D.A.A.; Teixeira,C.S.; Oliveira,P.F.; Coelho,E.G.A.; Alves,C.; Velloso,A.P.S.; Pereira,J.C.C.
Foram utilizados 46 animais da raça Gir, registrados na Associação Brasileira de Criadores de Zebu, provenientes de cinco fazendas situadas no Estado de Minas Gerais, com o objetivo de avaliar a eficiência dos microssatélites BM2113, ILSTS005, ILSTS008, ETH131 e RM88 em testes de verificação de parentesco. Os locos BM2113, ILSTS005, ETH131 e RM88 mostraram-se eficientes, apresentando valores de PE2 (probabilidade de exclusão quando os dois progenitores são genotipados) entre 0,62 e 0,69 e PIC2 (conteúdo de informação polimórfica quando os dois progenitores são genotipados) entre 0,78 e 0,83. O mesmo não ocorreu para o loco ILSTS008, o qual apresentou baixos valores de PE2 (0,24) e PIC2 (0,41).
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovino; Microssatélite; DNA.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000300015

Freqüência do gene Miostatina (GDF-8) em rebanhos brasileiros da raça Marchigiana
Provedor de dados: 45
Autores: Teixeira,C.S.; Oliveira,D.A.A.
Identificou-se e determinou-se a freqüência do gene miostatina (GDF-8) normal e mutante em rebanhos Marchigiana, em 377 bovinos da raça Marchigiana, criados nos estados de São Paulo e Paraná. Identificaram-se 37,9% de animais normais, 55,2% de portadores e 6,9% homozigotos afetados para musculatura dupla. Estes resultados indicam que os criadores têm interesse na característica musculatura dupla, promovendo, ainda que aleatoriamente, selecão a favor da mutação.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovino; Marchigiana; DNA; Miostatina; Musculatura dupla; PCR.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352007000300036

Detection of mutations within exons 4 to 8 of the p53 tumor suppressor gene in canine mammary glands
Provedor de dados: 45
Autores: Souza,D.M.B.; Barros,M.G.O.; Silva,J.S.C.; Silva,M.B.; Coleto,Z.F.; Jimenez,G.C.; Adrião,M.; Wischral,A.
Fifteen female canines with mammary tumors and 6 normal females were used to study mutations in exons 4 to 8 of the p53 gene. DNA samples from the tumors, respective adjacent normal mammary tissue and mammary glands from healthy animals were sequenced and analyzed for the presence of mutations. Mutations were found in 71.8% of the samples and the most frequent were missense mutations. The most attacked exons in the mammary tumor were 5, 7 and 8, with 23.4, 31.6 and 23.4% mutations, respectively. Canine mammary tumors are related to mutations in gene p53 and mutations mostly occur in the region of the protein that is linked to the DNA in the cell nucleus, which can change the functionality of the cell and propitiate tumor growth. Despite being...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bitch; DNA; Mamma; Molecular biology; Neoplasm; PCR.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352012000200013

Bovine alphaherpesvirus 1 and 5 in semen from bulls presenting genital lesions under field conditions in Brazil
Provedor de dados: 45
Autores: Henzel,A.; Salla,P.F.; Mascitti,A.K.; Demoliner,M.; Solyman,M.C.; Lunge,V.R.; Spilki,F.R.
ABSTRACT Bovine alphaherpesviruses 1 and 5 (BoHV-1/5) are main pathogens of respiratory, reproductive and neurological diseases in cattle. The aim of this study was to investigate the frequency of neutralizing antibodies against BoHV-1/5 in serum samples and to detect viral DNA in semen of bulls from beef cattle farms located in RS. A total of 372 serum and semen sample from bulls were collected in eighteen farms. Serum samples were submitted to virus neutralization (VN) assay, while semen samples were used to detect BoHV-1 and BoHV-5 DNA by PCR. VN results showed that BoHV-1/5 antibodies were detected in bulls of 66.7% (12/18) of the farms, 295 (79.5%) BoHV positive bulls, 287 for BoHV-1 and 234 for BoHV-; at 43 vaccinated bulls 72.1% (31/43) showing...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: BoHV-1 and 5; Co-infection; DNA; Semen.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352019000100197

Randon amplified polymorphic DNA in the analysis of isolates of Haemonchus (Nematoda-Trichostrongylidae) originated from bovines from different regions
Provedor de dados: 45
Autores: Guimarães,M.P.; Gomes,M.A.; Caldeira,M.C.
Utilizou-se a técnica de DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD) para a análise de 14 amostras de Haemonchus, um tricostrongilídeo parasito do abomaso de bovinos, originárias de diferentes regiões do estado de Minas Gerais. Os perfis foram obtidos utilizando-se cinco iniciadores diferentes. Não houve correlação entre polimorfismo observado com a origem do animal ou com a espécie de Haemonchus estudada.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cattle; RAPD; Haemonchus; DNA.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352006000100019

Sexagem em tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) por meio do teste da reação em cadeia da polimerase
Provedor de dados: 45
Autores: Bento,H.J.; Rosa,J.M.A.; Morgado,T.O.; Granjeiro,M.D.B.; Bianchini,M.A.; Iglesias,G.A.; Dutra,V.; Nakazato,L.; Paz,R.C.R.
RESUMO Em tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) não há dimorfismo sexual, tornando-se necessária a diferenciação entre machos e fêmeas, em especial naqueles indivíduos com finalidade reprodutiva. Entre as diversas técnicas empregadas para a caracterização sexual, a reação em cadeia da polimerase (PCR) é utilizada em mamíferos para identificar uma sequência genética especifica do cromossomo Y (SRY), sendo considerado um meio moderno e eficaz de determinação sexual. O objetivo deste trabalho é padronizar um protocolo para determinação sexual de tamanduá-bandeira por meio da técnica de PCR, utilizando material genético extraído do bulbo capilar desses animais. Mediante esse protocolo, foi possível determinar o sexo de sete animais testados, sendo...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Pilosa; Reprodução; Conservação; Determinação sexual; DNA.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352019000200538

Teste de DNA para verificação de parentesco em cães: avaliação do método não automatizado com o auxílio do primer CMR S
Provedor de dados: 45
Autores: Oliveira,P.F.; Oliveira,D.A.A.; Teixeira,C.S.; Velloso,A.P.S.; Coelho,E.G.A.; Rodrigues,S.G.; Alves,C.
To evaluate the precision of the DNA tests using the non-automatized technique for individual identification and parentage tests, 105 Rottweiler dogs were studied using the primer CMR S. The sample was composed of 39 animals belonging to 11 complete families and their progenies, and 66 non related individuals until the second generation, derived from kennels located in the states of Minas Gerais and São Paulo. The CMR S primer was used for the Polimerase Chain Reaction (PCR). The results showed the inefficiency of the technique, even when analyzed through the automated gel analysis system. Also showed the impossibility of its commercial use due to the fact of does not permit the storage of data for subsequent use.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Cão; DNA; Teste de verificação de parentesco.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000500018

Plant or fungal sequences? An alternative optimized PCR protocol to avoid ITS (nrDNA) misamplification
Provedor de dados: 52
Autores: Miranda,Vitor Fernandes Oliveira de; Martins,Vanderlei Geraldo; Furlan,Antonio; Bacci Jr.,Maurício.
The nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2) from leaves of Drosera (Droseraceae) were amplified using "universal" primers. The analysis of the products demonstrated most samples were a molecular mixture as a result of unsuccessful and non-specific amplifications. Among the obtained sequences, two were from Basidiomycota fungi. Homologous sequences of Basidiomycota were obtained from GenBank database and added to a data set with sequences from Drosera leaves. Parsimony analysis demonstrated that one sequence was amplified from an Ustilaginomycetes fungus, and another from a Heterobasidiomycetes. Possibly these fungi were associated to leaves of Drosera, and not because of samples contamination. In order to provide optimization and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Polymerase; DNA; Drosera; Fungi; Phylogeny.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000100018

Alterations in Biomarkers Associated with Sterility in Pectinophora gossypiella (Saunders) Induced by Gamma Irradiation
Provedor de dados: 52
Autores: Ali,Hanaa Mahmoud; Moustafa,Hemat Zakaria; Sayed,Rehab Mahmoud.
ABSTRACT Nowadays, radiation technology is widely used to produce changes in Biosystems. The goal of this work is to determine the variation induced male Pectinophora gossypiella in gamma-irradiated as pupae using 50Gy and 150Gy. Comparing elements composition and DNA (using RAPD-PCR) between substerile 50Gy and the sterile dose 150Gy in P. gossypiella showed variation between them. Potassium (K) was the most abundant elements in unirradiated and irradiated males followed by magnesium (Mg). The percentage of heavy metals as copper, zinc, and cadmium concurrent with K was directly proportional to the radiation dose. While the percentage of Mg, Phosphorous and calcium decreased as the radiation dose increased. The results also revealed that some extra bands...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Pectinophora gossypiella; Gamma rays; RAPD-PCR; Elements; DNA.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132018000100401

Alterations in Biomarkers Associated with Sterility in Pectinophora gossypiella (Saunders) Induced by Gamma Irradiation
Provedor de dados: 52
Autores: Ali,Hanaa Mahmoud; Moustafa,Hemat Zakaria; Sayed,Rehab Mahmoud.
ABSTRACT Nowadays, radiation technology is widely used to produce changes in Biosystems. The goal of this work is to determine the variation induced male Pectinophora gossypiella in gamma-irradiated as pupae using 50Gy and 150Gy. Comparing elements composition and DNA (using RAPD-PCR) between substerile 50Gy and the sterile dose 150Gy in P. gossypiella showed variation between them. Potassium (K) was the most abundant elements in unirradiated and irradiated males followed by magnesium (Mg). The percentage of heavy metals as copper, zinc, and cadmium concurrent with K was directly proportional to the radiation dose. While the percentage of Mg, Phosphorous and calcium decreased as the radiation dose increased. The results also revealed that some extra bands...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Pectinophora gossypiella; Gamma rays; RAPD-PCR; Elements; DNA.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132017000100436

Influence of an extract of Juglans regia on the growth of Escherichia coli, on the electrophoretic profile of plasmid DNA and on the radiolabeling of blood constituents
Provedor de dados: 52
Autores: Santos-Filho,Sebastião David; Diniz,Claudia Leite; Carmo,Fernanda Santos do; Fonseca,Adenilson de Souza da; Bernardo-Filho,Mario.
The aim of this work was to study the influence of a walnut (Juglans regia) extract on the growth of Escherichia coli (E. coli) AB1157, on the plasmid DNA topology and on the labeling of blood constituents with technetium-99m (99mTc). An E. coli AB1157 culture, in stationary phase, was incubated with walnut and the growth of the culture was evaluated by optical density at 600 nm for 7 hours. Plasmid DNA samples were incubated with SnCl2 in presence or absence of walnut for 40 minutes, 0.8% agarose gel electrophoresis was performed, the gel was stained and the plasmid topological forms were visualized. Blood samples from Wistar rats were incubated with walnut extract and an assay of labeling of blood constituents with technetium-99m (99mTc) was performed....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Escherichia coli; DNA; Electrophoresis; Stannous chloride; Technetium-99m; Juglans regia.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132008000700026

A simplified DNA extraction method for PCR analysis of Camarotella spp.
Provedor de dados: 52
Autores: Vitória,Nadja Santos; Bezerra,José Luiz; Gramacho,Karina Peres.
This work aimed to optimize an efficient and simple protocol for DNA extraction of Camarotella species, an obligate plant pathogen that cause verrucosis or "lixa" on coconut tree and other palms, facilitating the molecular studies of these biotrophic microorganisms. The method proposed enabled a fast, reproducible and reliable DNA extraction from Camarotella species.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Camarotella torrendiella; C. acrocomiae; Verrucosis on coconut; DNA; PCR.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000200001

Evaluation of nine microsatellite loci and misidentification paternity frequency in a population of Gyr breed bovines
Provedor de dados: 62
Autores: Curi,Rogério Abdallah; Lopes,Catalina Romero.
Paternity misidentification is harmful due to the reduction in annual genetic earnings of the population and because it endangers an efficient genetic improvement program. The objectives of the present study was to evaluate nine microsatellites in Paternity Testing and to investigate misidentification paternity frequency in families of Gyr breed bovines population. In the present experiment blood samples from forty Gir breed families ( bull / cow / calf ), registered pure breed in the Zebu Breeders Brazilian Association (ABCZ) were used. The most part of the microsatellites used in this work were recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG). The genomic DNA extraction was performed from whole blood samples. The microsatellites...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Microsatellites; Paternity; Bovine; Gyr.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-95962002000300004

DNA-lipid systems: A physical chemistry study
Provedor de dados: 56
Autores: Dias,R.; Antunes,F.; Miguel,M.; Lindman,S.; Lindman,B.
It is well known that the interaction of polyelectrolytes with oppositely charged surfactants leads to an associative phase separation; however, the phase behavior of DNA and oppositely charged surfactants is more strongly associative than observed in other systems. A precipitate is formed with very low amounts of surfactant and DNA. DNA compaction is a general phenomenon in the presence of multivalent ions and positively charged surfaces; because of the high charge density there are strong attractive ion correlation effects. Techniques like phase diagram determinations, fluorescence microscopy, and ellipsometry were used to study these systems. The interaction between DNA and catanionic mixtures (i.e., mixtures of cationic and anionic surfactants) was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Cationic surfactants; Catanionic mixtures; Chitosan; Phase behavior; Polyelectrolyte-oppositely charged surfactant systems.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2002000500002

Low-level red laser therapy alters effects of ultraviolet C radiation on Escherichia coli cells
Provedor de dados: 56
Autores: Canuto,K.S.; Sergio,L.P.S.; Guimarães,O.R.; Geller,M.; Paoli,F.; Fonseca,A.S.
Low-level lasers are used at low power densities and doses according to clinical protocols supplied with laser devices or based on professional practice. Although use of these lasers is increasing in many countries, the molecular mechanisms involved in effects of low-level lasers, mainly on DNA, are controversial. In this study, we evaluated the effects of low-level red lasers on survival, filamentation, and morphology of Escherichia colicells that were exposed to ultraviolet C (UVC) radiation. Exponential and stationary wild-type and uvrA-deficient E. coli cells were exposed to a low-level red laser and in sequence to UVC radiation. Bacterial survival was evaluated to determine the laser protection factor (ratio between the number of viable cells after...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Escherichia coli; Laser; Ultraviolet radiation.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2015001000012

DNA extraction and quantification from touch and scrape preparations obtained from autopsy liver cells
Provedor de dados: 56
Autores: Ribeiro,C.N.M.; Peres,L.C.; Pina-Neto,J.M.
The objective of the present study was to develop a simplified low cost method for the collection and fixation of pediatric autopsy cells and to determine the quantitative and qualitative adequacy of extracted DNA. Touch and scrape preparations of pediatric liver cells were obtained from 15 cadavers at autopsy and fixed in 95% ethanol or 3:1 methanol:acetic acid. Material prepared by each fixation procedure was submitted to DNA extraction with the Wizard® genomic DNA purification kit for DNA quantification and five of the preparations were amplified by multiplex PCR (azoospermia factor genes). The amount of DNA extracted varied from 20 to 8,640 µg, with significant differences between fixation methods. Scrape preparation fixed in 95% ethanol provided...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Autopsy; Congenital anomalies; DNA; Touch preparative; Scrape preparative; Polymerase chain reaction.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2004000500002

Nucleotide excision repair pathway assessment in DNA exposed to low-intensity red and infrared lasers
Provedor de dados: 56
Autores: Fonseca,A.S.; Campos,V.M.A.; Magalhães,L.A.G.; Paoli,F.
Low-intensity lasers are used for prevention and management of oral mucositis induced by anticancer therapy, but the effectiveness of treatment depends on the genetic characteristics of affected cells. This study evaluated the survival and induction of filamentation of Escherichia coli cells deficient in the nucleotide excision repair pathway, and the action of T4endonuclease V on plasmid DNA exposed to low-intensity red and near-infrared laser light. Cultures of wild-type (strain AB1157) E. coli and strain AB1886 (deficient in uvrA protein) were exposed to red (660 nm) and infrared (808 nm) lasers at various fluences, powers and emission modes to study bacterial survival and filamentation. Also, plasmid DNA was exposed to laser light to study DNA lesions...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Enzyme; Escherichia coli; Filamentation; Laser.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2015001000011

The fallacy of racial pharmacogenomics
Provedor de dados: 56
Autores: Pena,S.D.J.
Personalized pharmacogenomics aims to use individual genotypes to direct medical treatment. Unfortunately, the loci relevant for the pharmacokinetics and especially the pharmacodynamics of most drugs are still unknown. Moreover, we still do not understand the role that individual genotypes play in modulating the pathogenesis, the clinical course and the susceptibility to drugs of human diseases which, although appearing homogeneous on the surface, may vary from patient to patient. To try to deal with this situation, it has been proposed to use interpopulational variability as a reference for drug development and prescription, leading to the development of "race-targeted drugs". Given the present limitations of genomic knowledge and of the tools needed to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: DNA; Genetic polymorphisms; Human genomic variability; Race; Pharmacogenomics.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2011000400001

Low-intensity red and infrared laser effects at high fluences on Escherichia coli cultures
Provedor de dados: 56
Autores: Barboza,L.L.; Campos,V.M.A.; Magalhães,L.A.G.; Paoli,F.; Fonseca,A.S.
Semiconductor laser devices are readily available and practical radiation sources providing wavelength tenability and high monochromaticity. Low-intensity red and near-infrared lasers are considered safe for use in clinical applications. However, adverse effects can occur via free radical generation, and the biological effects of these lasers from unusually high fluences or high doses have not yet been evaluated. Here, we evaluated the survival, filamentation induction and morphology of Escherichia coli cells deficient in repair of oxidative DNA lesions when exposed to low-intensity red and infrared lasers at unusually high fluences. Cultures of wild-type (AB1157), endonuclease III-deficient (JW1625-1), and endonuclease IV-deficient (JW2146-1) E. coli, in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Escherichia coli; Filamentation; Laser.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2015001000013

A procedure to evaluate the efficiency of surface sterilization methods in culture-independent fungal endophyte studies
Provedor de dados: 58
Autores: Burgdorf,R.J.; Laing,M.D.; Morris,C.D.; Jamal-Ally,S.F.
Extraneous DNA interferes with PCR studies of endophytic fungi. A procedure was developed with which to evaluate the removal of extraneous DNA. Wheat (Triticum aestivum) leaves were sprayed with Saccharomyces cerevisiae and then subjected to physical and chemical surface treatments. The fungal ITS1 products were amplified from whole tissue DNA extractions. ANOVA was performed on the DNA bands representing S. cerevisiae on the agarose gel. Band profile comparisons using permutational multivariate ANOVA (PERMANOVA) and non-metric multidimensional scaling (NMDS) were performed on DGGE gel data, and band numbers were compared between treatments. Leaf surfaces were viewed under variable pressure scanning electron microscopy (VPSEM). Yeast band analysis of the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Endophyte; Fungi; DNA; Surface sterilization.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000300030

Comparison of DNA-extraction methods and Selective Enrichment broths on the detection of Salmonella Typhimurium in swine feces by polymerase chain reaction (PCR)
Provedor de dados: 58
Autores: Freschi,Carla Roberta; Carvalho,Luiz Fernando de Oliveira e Silva; Oliveira,Celso José Bruno de.
The aim of this study was to compare different DNA-extraction methods and selective enrichment broths for their effectiveness to detect Salmonella Typhimurium in artificially inoculated swine feces samples (100 CFU/g) by polymerase chain reaction. After enrichment in Rappaport-Vassiliadis, selenite cystine or Müller-Kauffmann tetrathionate, aliquots were used for DNA extraction by three different methods: boiling-centrifugation, phenol-chloroform and salting-out. Aliquots of extracted DNA were then used as template in PCR. The selective enrichment broths had no effect on the efficiency of PCR when boiling-centrifugation and salting-out were used. On the other hand, phenol-chloroform was superior (P&lt;0.05) when combined to Rappaport-Vassiliadis....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diagnosis; DNA; Feces; PCR; Salmonella Typhimurium.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822005000400011

A comparison of silver staining protocols for detecting DNA in polyester-backed polyacrylamide gel
Provedor de dados: 58
Autores: Qiu,Shanlian; Chen,Jichen; Lin,Si; Lin,Xinjian.
Eight silver-staining protocols were applied to detect DNA in polyester-backed gels to select the optimal. Results showed important differences in staining quality and that four methods were well-suited for TGGE gels due to high sensitivity and low background, including the Bassam et al. methods, the manufacturer method and our improved method.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Backed gel; DNA; Silver staining.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200029

Evolution of potential biomarkers of acute muscle injury after physical exercise
Provedor de dados: 60
Autores: Chielle,Eduardo Ottobelle; Granella,Lucilene Wildner; Maziero,Jorlana Stacke; Vidigal,Tiago Mateus Andrade; Mallmann,Bárbara Lidiane Kummer; Karal,Jaison.
Skeletal muscle injury is a frequent event and diagnosis using the classical blood markers sometimes produces unsatisfactory results. Therefore, objective of the study was to detect new biomarkers in plasma, saliva and urine in response to acute muscle damage induced by physical exercise. A cross-sectional study was conducted with 27 American football players. Before the physical exercises (T0), 60 minutes (T1) and 24 hours (T2) after physical exercise, was determined the clinical, biochemical and molecular parameters, including ADA, TBARS, leukocytes, lymphocytes and comet assay. The serum ADA was significantly higher in T1 and T2, in the urine there was a significant increase in T1, in the saliva there was no significant differences. There was an...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Biomarkers/serum; Biomarkers/saliva; Biomarkers/urine; Exercise; Athletes; Athletic injuries; Adenosine deaminase/analysis; DNA.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-82502019000100549

Variabilidade genética em um ensaio de progênies de erva- mate (Ilex paraguariensis St.Hil.)
Provedor de dados: 65
Autores: Vidor,Mario Angelo; Ruiz,César Pérez; Moreno,Santiago Vázquez; Floss,Paulo Alfonso.
A Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina S.A) possui uma das maiores coleções brasileiras de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.). A partir de ensaios agronômicos preliminares, apresentaram destaque as procedências Barão de Cotegipe e Água Doce. O objetivo deste trabalho foi o de caracterizar geneticamente a variabilidade existente nos germoplasmas oriundos destas procedências. A técnica utilizada foi a de marcadores moleculares para amplificar o DNA, do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Os resultados indicaram não ser possível diferenciar geneticamente as procedências entre si. Em função da distância genética, foi formado um grupo com quatro materiais ou germoplasmas e outro com os demais. Os diferentes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ilex paraguariensis; Variabilidade genética; Marcadores moleculares; DNA; RAPD; PCR.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782002000400006

Brazilian ground beef authentication by multiplex polymerase chain reaction
Provedor de dados: 65
Autores: Oliveira,Andrey Carlos do Sacramento de; Pedroso,Silvia Cristina da Silva; Cardilli,Diogo José; Leite,Fábio Pereira Leivas; Ferreira,Gabrielle Virgínia Lopes; Silva,Andréia Silva da; Roos,Talita Bandeira; Moraes,Carina Martins de; Sousa,Roberta Sales; Monteiro,Roseli do Socorro Dias.
ABSTRACT: The aim of the present study was to assess the efficacy ofmultiplex PCR in detecting the adulterationof commercially available ground beefvia addition and/orsubstitution ofground buffalo meat. Experimentally adulterated ground beefsamples were prepared in triplicate, and dilutions of DNA from Bos taurus and Bubalusbubalis were prepared to determine the detection limit of the method. Concurrently, 91 ground meatsamples sold as “ground beef” were collected from differentstores in northern Brazil andanalyzed bymultiplex PCR. Buffalo DNA was detected in 17.5% of the collected ground meat samples.Our results showed that multiplex PCR is an efficient method for detectingthe incorporation of groundbuffalo meatatpercentages ranging from 10 to 100% and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Species identification; Bos taurus; Bubalusbubalis; DNA; Adulteration.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000200652

Marcadores moleculares em estudos de caracterização de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.): o sabor
Provedor de dados: 65
Autores: Vidor,Mario Angelo; Ruiz,César Pérez; Moreno,Santiago Vázquez; Floss,Paulo Alfonso.
A Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina S.A) possui uma das maiores coleções brasileiras de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.). A partir de ensaios agronômicos preliminares, apresentaram destaque as procedências Barão de Cotegipe e Água Doce. Dentre essas, verificaram-se diferentes sabores (mais amargo e menos amargo), aparentemente, em função do tipo de folha (CL - curta e larga; LE - longa e estreita). O objetivo deste trabalho foi o de tentar associar os padrões obtidos mediante marcadores moleculares, com as procedências ou acessos e características fenotípicas desejáveis - altura de planta, diâmetro de copa, densidade folhar, sobrevivência das plantas e comportamento de rebrota -, dentro do caráter sabor em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ilex paraguariensis; Marcadores moleculares; Variabilidade genética; PCR; RAPD; DNA; Biotecnologia.
Ano: 2002
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782002000300008

Diagnostic methods for identification of root-knot nematodes species from Brazil
Provedor de dados: 65
Autores: Cunha,Tiago Garcia da; Visôtto,Liliane Evangelista; Lopes,Everaldo Antônio; Oliveira,Claúdio Marcelo Gonçalves; God,Pedro Ivo Vieira Good.
ABSTRACT: The accurate identification of root-knot nematode (RKN) species (Meloidogyne spp.) is essential for implementing management strategies. Methods based on the morphology of adults, isozymes phenotypes and DNA analysis can be used for the diagnosis of RKN. Traditionally, RKN species are identified by the analysis of the perineal patterns and esterase phenotypes. For both procedures, mature females are required. Over the last few decades, accurate and rapid molecular techniques have been validated for RKN diagnosis, including eggs, juveniles and adults as DNA sources. Here, we emphasized the methods used for diagnosis of RKN, including emerging molecular techniques, focusing on the major species reported in Brazil.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA; Esterase; Meloidogyne; Molecular biology; Morphological pattern.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000200153

MÉTODOS DE EXTRAÇÃO DE DNA PARA A DETECÇÃO DE Salmonella EM OVOS DE GALINHAS, COM E SEM CASCA, ATRAVÉS DA REAÇÃO EM CADEIA PELA POLIMERASE
Provedor de dados: 65
Autores: Flôres,Maristela Lovato; Nascimento,Vladimir Pinheiro do; Kader,Ivonyr Irene Troglio Abdel; Santos,Luciana Ruschel dos; Pontes,Alexandre Pontes; Salle,Carlos Tadeu Pippi; Lopes,Rui Fernando Felix.
O diagnóstico microbiológico de Salmonella sp em amostras de alimentos é demorado, com cinco diferentes etapas, levando cerca de 120 horas até o resultado final. A utilização da técnica da Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) pode diminuir esse período, porém sofre influência de substâncias presentes na amostra que afetam a reação. O objetivo deste trabalho foi comparar dois métodos de extração de DNA, a extração por tratamento térmico e a pelo fenol-clorofórmio, em amostras de 100 ovos de galinhas domésticas artificialmente contaminados com uma cepa de Salmonella enterica sorovar typhimurium em fase estacionária. O material obtido com as extrações foi submetido à PCR, utilizando-se um par de iniciadores que amplificam um fragmento de 284pb do gene InvA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Salmonella; Ovos; Extração; DNA; PCR.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782001000200020

Identification of Pm24, Pm35 and Pm37 in thirteen Egyptian bread wheat cultivars using SSR markers
Provedor de dados: 64
Autores: Emara,Hassan Mahmoud; Omar,Ayman Feisal; El-Shamy,Moustafa Mahmoud; Mohamed,Mona Elsaid.
ABSTRACT Powdery mildew of wheat (Triticum spp.) caused by Blumeria graminis f.sp. tritici (DC) E.O. Speer Em. Marchal is one of the most important bread wheat diseases in Egypt. All the Egyptian common bread wheat cultivars are susceptible to that disease at seedling and adult stages. Breeding of resistant cultivars is the most economical and environmentally safe method to eliminate the disease and reduce crop losses. Combinations of two or more effective resistance genes may lead to better, more durable resistance to that disease. Eight Pm genes i.e. Pm2, Pm6, Pm12, Pm16, Pm24, Pm35, Pm36 and Pm37 out of 21 powdery mildew monogenic wheat lines (Pm) were resistant to 42 individual isolates of powdery mildew collected from different governorates in the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Powdery mildew; Genetic control; DNA; Molecular markers.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542016000300279

Molecular characterization of elephantgrass accessions through RAPD markers
Provedor de dados: 64
Autores: Passos,Leônidas Paixão; Machado,Marco Antonio; Vidigal,Maria Coletta; Campos,Ana Lúcia.
Elephantgrass pastures are limited by yield variations and reductions in forage quality and availability, thus making the search for genotypes with reduced seasonality a major concern. In order to verify the extent of genetic variability among contrasting cultivars, ten elephantgrass accessions were analyzed through DNA amplification by RAPD technique. A total of 160 DNA bands were generated with the use of 44 random primers and 23% of these bands were monomorphic for all accessions. Gel-obtained binary data (1 for presence and 0 for absence) were used for generating a genetic distance matrix, which was utilized in a UPGMA grouping analysis. Elephantgrass cultivars Cameroon and Vruckwona were the accessions mostly divergent from the others, with an average...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Molecular markers; Elephantgrass; RAPD; DNA.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542005000300009

Alterações de cromatina em espermatozóides de ovinos e caprinos avaliadas por azul de toluidina e alaranjado de acridina
Provedor de dados: 64
Autores: Kamimura,Cristina de Figueiredo; Jacomini,José Octávio; Beletti,Marcelo Emílio.
Reprodutores com espermograma normal podem se comportar como subférteis ou passarem por períodos de subfertilidade. As alterações na cromatina dos espermatozóides são possíveis explicações encontradas para tais comportamentos. Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de testar a eficiência de azul de toluidina (AT) e do alaranjado de acridina (AA) na identificação de alterações na compactação de cromatina em espermatozóides de ovinos e caprinos, além de avaliar a correlação entre essas alterações e as de morfologia espermática. Para tal, foram avaliadas amostras de sêmen de 15 ovinos e de 15 caprinos, com dez repetições para cada método por animal. Calcularam-se a média, o desvio padrão (DP) e o coeficiente de variação (CV) para cada técnica e animal....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Azul de toluidina; Alaranjado de acridina; Espermatozóide; Cromatina; DNA.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100027