Consulta: subjectFacets:"Microssatélites"
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Variabilidade fenotípica e genotípica em galinhas caipiras (Gallus gallus domesticus): resultados preliminares.
Provedor de dados: 14
Autores: CLEMENTINO, C. de S.; MARTINS, D. M.; BRITTO, F. B.; BARBOSA, F. J. V.; LIMA, P. S. da C.; DINIZ, F. M.
O presente trabalho teve como objetivo a avaliação preliminar da variabilidade fenotípica presente nessas aves e a seleção de marcadores moleculares, microssatélites ancorados (ISSR), para análise da variabilidade genética...
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Microssatélites; Variabilidade genética.; Galinha Caipira.
Ano: 2007
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/69583

Diversidade genética de Xylella fastidiosa em regiões produtoras de citros na Bahia
Provedor de dados: 86
Autores: Casais,Vinicius Oliveira; Patrocínio,Epaminondas do; Oliveira,Saulo Alves Santos de; Schnadelbach,Alessandra Selbach; Barbosa,Cristiane de Jesus; Barbosa,Luciana Veiga.
O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de marcadores SSR, a diversidade genética de Xylella fastidiosa no Estado da Bahia. Foram estudadas duas das principais regiões produtoras de citros no Estado, o Litoral Norte e o Recôncavo Sul. Para fins comparativos, utilizaram-se dez amostras provenientes do Estado de São Paulo. Foram empregados os seguintes iniciadores: ASSR20, OSSR9, OSSR17, CSSR4, CSSR12 e CSSR20, dos quais os quatro últimos permitiram identificar 22 loci polimórficos. As populações de X. fastidiosa presentes em citros no Estado da Bahia apresentam elevada diversidade genética, com base nos marcadores SSR, com pools gênicos distintos e agrupamento geográfico. No Litoral Norte, as populações do isolado apresentam maior diversidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Citrus sinensis; Bactéria fitopatogênica; CVC; Haplótipos; Microssatélites.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014000100005

Identificação de QTL associados à simbiose entre Bradyrhizobium japonicum, B. elkanii e soja
Provedor de dados: 86
Autores: Santos,Maria Aparecida dos; Nicolás,Marisa Fabiana; Hungria,Mariangela.
O objetivo deste trabalho foi identificar QTL (locos de caráter quantitativo), utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR), relacionados à fixação biológica de nitrogênio (FBN), em uma população F2:7 de cultivares de soja (Glycine max) com diferentes capacidades de FBN, Bossier (alta) e Embrapa 20 (média). Foram mapeados 16 marcadores, distribuídos em seis grupos de ligação, cobrindo uma região de 5% do genoma (151,6 cM). A análise de regressão identificou 12 associações significativas em quatro grupos de ligação (B1, C2, D1b e H): três para a massa da parte aérea seca, quatro para número de nódulos, duas para a massa de nódulos e três para a massa média de nódulos. Todos os QTL detectados foram de efeitos menores. Contudo, sete marcadores foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Fixação biológica do nitrogênio; Marcadores moleculares; Mapa genético; Microssatélites; Nodulação; SSR.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000100010

Seleção fenotípica e assistida por marcadores moleculares de famílias de feijoeiro-comum com alta produtividade
Provedor de dados: 86
Autores: Pereira,Helton Santos; Santos,João Bosco dos; Souza,Thaís Paula de; Lima,Igor Almeida.
O objetivo deste trabalho foi selecionar famílias de feijoeiro-comum, com alta produtividade de grãos, por meio de seleção fenotípica e de seleção assistida por marcadores moleculares (SAM). Foram avaliadas 394 famílias, de quatro populações, e seus seis genitores, no Município de Lavras, em dois experimentos: um na geração F3:4, na safra das águas de 2005/2006, em látice simples 20x20; e outro na geração F3:5, na safra da seca de 2006, em látice triplo 20x20. Foram estimados parâmetros genéticos e fenotípicos, e foi realizada a genotipagem das famílias, com marcadores microssatélites associados a QTL controladores da produção de grãos, previamente identificados. Também foram realizadas análises de associação por marcas simples, entre os marcadores e a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Locos de características quantitativas; Associação por marcas simples; Ganho genético; Herdabilidade; Microssatélites.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001100014

Caracterização genética e estrutura populacional de galinhas crioulas Canela-Preta
Provedor de dados: 86
Autores: Carvalho,Débora Araújo de; Bonafé,Cristina Moreira; Rodriguez-Rodriguez,Maria Del Pilar; Almeida,Marcos Jacob de Oliveira; Sarmento,Jose Lindenberg Rocha; Britto,Fabio Barros; Silva,Martinho de Almeida e.
Resumo O objetivo deste trabalho foi caracterizar geneticamente e avaliar a estrutura populacional de galinhas crioulas Canela-Preta de três plantéis pertencentes aos municípios de Teresina, Oeiras e Queimada Nova, no Estado do Piauí. Utilizaram-se 12 marcadores microssatélites e amostras de DNA de 118 galinhas. Após a extração do DNA, os marcadores microssatélites foram amplificados por meio da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Efetuaram-se análises estatísticas da estimativa de heterozigosidades observada e esperada, análise de variância molecular, análise de componentes principais, estatística F de Wright e análise de estrutura populacional com base em análise bayesiana. As análises de diferenciação genética (Amova) sugerem baixa...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Gallus gallus; Microssatélites; Polimorfismo; Variabilidade genética.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016001101899

Estrutura genética populacional de Copaifera langsdorffii Desf. (Leguminosae - Caesalpinioideae) em fragmentos florestais no Pontal do Paranapanema, SP, Brasil
Provedor de dados: 88
Autores: Martins,Karina; Santos,João Dagoberto dos; Gaiotto,Fernanda Amato; Moreno,Maria Andréia; Kageyama,Paulo Yoshio.
O Pontal do Paranapanema é a região mais recentemente desflorestada do Estado de São Paulo. Os efeitos da fragmentação florestal na estrutura genética de Copaifera langsdorffii Desf. foram avaliados por meio da genotipagem, com seis locos microssatélites, de pelo menos 30 indivíduos regenerantes e 30 adultos em três áreas do Pontal do Paranapanema. A amostragem compreendeu dois fragmentos localizados em assentamentos rurais, Tucano (800 ha) e Madre Cristina (300 ha); e uma população localizada em floresta contínua, no Parque Estadual do Morro do Diabo (35.000 ha). Níveis elevados de diversidade genética foram detectados tanto nos regenerantes como nos adultos. A diversidade gênica (He) variou de 0,718 a 0,835 e o número médio de alelos por loco (Â) variou...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diversidade genética; Floresta Atlântica; Fluxo gênico; Fragmentação florestal; Microssatélites.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042008000100007

Estratégias para o desenvolvimento de novas cultivares de mangueira para o semiárido brasileiro
Provedor de dados: 94
Autores: Santos,Carlos Antonio Fernandes; Lima Filho,José Moacir Pinheiro; Lima Neto,Francisco Pinheiro.
A mangueira é uma das principais fruteiras comerciais no Semiárido brasileiro, sendo que a cultivar Tommy Atkins ocupa 85% da área total cultivada com a cultura. O objetivo deste trabalho foi avaliar o emprego de estratégias para reduzir o período juvenil e as trabalhosas polinizações manuais em mangueira, de forma a acelerar o desenvolvimento de novas cultivares da espécie para o Semiárido brasileiro. Foram identificadas plantas isoladas das cultivares Haden e Espada dentro de plantios comerciais da cultivar Tommy Atkins, numa fazenda exportadora de manga, em Petrolina-PE. Mudas das progênies foram transplantadas com seis meses de idade para o campo. O manejo para a indução floral foi realizado com poda, controle da irrigação e aplicação de Paclobutrazol...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Mangifera indica; Microssatélites; Melhoramento; PBZ.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452010000200020

Caracterização agronômica e molecular de genótipos diplóides melhorados de bananeira
Provedor de dados: 94
Autores: Amorim,Edson Perito; Lessa,Lauro Saraiva; Ledo,Carlos Alberto da Silva; Amorim,Vanusia Batista de Oliveira; Reis,Ronaldo Viana dos; Santos-Serejo,Janay Almeida dos; Silva,Sebastião de Oliveira e.
Uma investigação sobre a diversidade genética entre 11 diplóides melhorados de bananeira, por meio de nove características agronômicas e 16 marcadores microssatélites, foi implementada na Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, Cruz das Almas (BA), Brasil. A distância generalizada de Mahalanobis indicou alto grau de divergência genética. Os genótipos foram agrupados em três grupos. As características altura de planta, número de pencas, número de frutos e diâmetro do pseudocaule contribuíram com grande parte da divergência genética observada. O número de alelos obtidos foi 120, com média de 7,51 alelos por primer. A similaridade genética média foi de 0,44, variando de 0,29 a 0,60. Novas combinações parentais podem ser identificadas com base na divergência...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Musa sp.; Divergência genética; Microssatélites; Híbridos; Mahalanobis.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452009000100022

Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos
Provedor de dados: 96
Autores: Pinto,Ana Paula Gomes; Lopes,Paulo Sávio; Lopes,Marcos Soares; Silva Filho,Miguel Inácio; Sousa,Katiene Régia Silva; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
Objetivou-se com este estudo mapear locos de características quantitativas (QTL) nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos (Sus scrofa) e associar seus efeitos em características de carcaça, cortes de carcaça, órgãos e vísceras, desempenho e qualidade de carne. Utilizaram-se amostras de DNA de animais pertencentes a uma população F2, oriunda do cruzamento entre machos da raça Piau e fêmeas Landrace õ Large White õ Pietrain. Um total de 13 locos microssatélites foi utilizado na construção dos mapas de ligação da população atual. As análises de associação foram feitas utilizando-se mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL. Identificaram-se associações significativas, em nível cromossômico, entre regiões do cromossomo 9 e as características peso...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Análise genômica; População F2; Produção de suínos; Microssatélites.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001000011

Validação de métodos laboratoriais aplicadas a análises com marcadores microssatélites
Provedor de dados: 124
Autores: Oliveira,Tiago Silva; Hoffmann,Lucia Vieira; Alves,Poliana Ferreira; Lucena,Valeska Silva; Silva Filho,João Luís da.
A troca de informação sobre biodiversidade e a utilização de recursos genéticos podem ser melhor realizadas se os laboratórios que geram as informações puderem demonstrar que seus resultados são confiáveis através de metodologias adequadas de validação. Para definir critérios que sirvam para demonstrar a confiabilidade de resultados em laboratórios onde são realizadas pesquisas com marcadores de DNA, foram analisados erros associados à quantificação de DNA em gel de agarose e à repetitividade e robustez da reação da polimerase em cadeia (PCR) utilizando primers baseados em marcadores microssatélites (SSR). O erro associado à quantificação de DNA foi menor quando 100 ng foram quantificadas, e aumentou para quantidades de DNA maiores, com a tendência de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Genética Vegetal; Microssatélites; Laboratórios biológicos/controle de qualidade.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902010000200016

Identificação de loci microssatélitescom potencial de amplificação na espécie de Peixe-Rei (Odontesthes humensis)
Provedor de dados: 45
Autores: Tavares,R.A.; Piedras,S.R.N.; Nunes,M.D.; Almeida,D.B.; Moreira,C.G.A.; Fernandes,J.M.; Freitas,S.F.; Moreira,H.L.M.; Pouey,J.L.O.F.; Dionello,N.J.L.
In this work, 25,806 potentially amplifiable microsatellite loci (PAL) were identified in pejerrey, (Odontesthes humensis), with 21% of dinucleotide, 22% trinucleotide, 37% tetranucleotide, 13% pentanucleotide and 7% hexanucleotide. Of the total loci, 167 were classified as "Best PAL", more likely to be variables in populations. The results show that with a small coverage of the genome it was possible to identify a large number of microsatellite loci.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Peixe-rei; Microssatélites; Marcadores moleculares; PAL.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000601941

Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno
Provedor de dados: 45
Autores: Pires,A.V.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F.; Guimarães,C.T.; Peixoto,J.O.
Uma população de suínos, composta de 550 animais F2, foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. O objetivo do trabalho foi mapear locos de características quantitativas (QTL) associados a cortes de carcaça. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites, distribuídos no cromossomo 6 de suínos. As características avaliadas foram: peso total do pernil, peso do pernil sem pele e sem capa de gordura, peso total da copa, peso da copa sem pele e sem capa de gordura, peso total da paleta, peso da paleta sem pele e sem capa de gordura, peso total do carré, peso do lombo, peso total do bacon, peso das costelas, peso total da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Suíno; QTL; Cruzamento divergente; Composição de carcaça; Microssatélites.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000300030

Elevada diversidade genética interpopulacional em Oryza glumaepatula Steud. (Poaceae) avaliada com microssatélites
Provedor de dados: 49
Autores: Silva,Cynthia Maria; Karasawa,Marines Marli Gniech; Vencovsky,Roland; Veasey,Elizabeth Ann.
Marcadores microssatélites foram usados para caracterizar a diversidade genética entre e dentro de sete populações naturais de Oryza glumaepaula. Seis dessas populações são originárias da bacia hidrográfica da Amazônia e uma do rio Paraguai no Pantanal Matogrossense. Utilizando sete locos de microssatélites, observou-se diversidade genética intrapopulacional média de 1,98 alelos por loco, 56,2% de locos polimórficos, Ho = 0,026 e He = 0,241. Elevada diferenciação interpopulacional foi observada pelo índice de fixação de Wright e pelo parâmetro de divergência de Slatkin (F ST = 0,715 e R ST = 0,595, respectivamente), bem como elevado nível de endogamia total (F IT = 0,963), em grande parte influenciada pelo sistema reprodutivo (F IS = 0,858). Verificou-se...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diversidade genética; Estrutura genética; Oryza glumaepatula; Microssatélites; Sistema reprodutivo; Populações.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1676-06032007000200019

Caracterização molecular de uma progênie de tangerineira 'Clementina Fina' e 'Montenegrina'
Provedor de dados: 65
Autores: Weiler,Roberto Luis; Brugnara,Eduardo Cesar; Schwarz,Sergio Francisco; Bastianel,Marinês; Machado,Marcos Antônio; Schifino-Wittmann,Maria Teresa.
Os citros apresentam uma taxonomia muito complexa, principalmente com relação ao número de espécies que constituem o gênero Citrus e os gêneros afins. Genótipos classificados como espécies podem ter sido originados por hibridação interespecífica e preservados por meio da embrionia nucelar. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar uma população de tangerineiras híbridas oriundas do cruzamento das tangerineiras 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.), genitor feminino, e 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.), genitor masculino, utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR). Com 12 pares de primers, foi possível diferenciar 93 acessos do estudo e agrupar a F1 em indivíduos mais próximos do genitor feminino e do genitor masculino....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Citrus; Marcadores moleculares; Microssatélites.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000700007

Seleção de famílias de feijoeiro baseada na produtividade, no tipo de grãos e informações de QTLs
Provedor de dados: 64
Autores: Torga,Paula Pereira; Santos,João Bosco dos; Pereira,Helton Santos; Ferreira,Daniel Furtado; Leite,Monik Evelin.
Objetivou-se neste trabalho, selecionar famílias de feijoeiro promissoras para a produtividade de grãos com tipo de grãos ideal utilizando informações fenotípicas e de marcadores moleculares ligados a QTLs. Foram utilizadas 100 famílias F3:7, avaliadas em três safras, com dois experimentos/safra, totalizando seis experimentos. A primeira safra foi a da seca/2007, na qual conduziu-se um experimento em Lavras-MG e o outro em Ijaci-MG. Nas safras de inverno/2007 e águas 2007/2008, foram conduzidos, em cada uma, um experimento em Lavras-MG e outro em Lambari-MG. Em todos eles foi utilizado o delineamento látice triplo 10x10, com parcelas de duas linhas de dois metros. As famílias foram avaliadas pela sua produtividade de grãos. Em apenas um dos experimentos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Linhagens; Seleção assistida por marcadores; Seleção fenotípica; Microssatélites.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100012