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Grapevine yellow speckle viroid 1 detected in symptomatic grapevines in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta; Fitossanidade; Vírus; Virose; UVA; Videira; Fungo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033162
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Guia de sanidade vegetal. Infoteca-e
EIRAS, M.; FAJARDO, T. V. M..
2016
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Cultura videira; Vitis sp; Sanidade vegetal.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1047157
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High-throughput sequencing applied for the identification of viruses infecting grapevines in Brazil and genetic variability analysis. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; SILVA, F. N.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
The application of high-throughput sequencing technologies (HTS) enables the recovery of many nucleotide sequence fragments from diseased plants and may help in pathogen identification. This study was designed to identify viruses infecting 15 grapevine (Vitis spp.) samples collected from experimental fields and vine collections and assess the genetic variability of the identified viruses. The virus-enriched dsRNAs were extracted from bark scrapings and sequenced using an Illumina platform. The paired-end reads were analyzed, assembled contigs were generated and identified as related to viruses. Contigs of 14 viruses have been identified, some of them covering large extensions of viral genomes or resulting in assembly of near-complete or complete genomes....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diagnosis; HTS; Next-generation sequencing; NGS; Vitis; Variability.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077833
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Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais. Repositório Alice
CATARINO, A. de M.; FAJARDO, T. V. M.; PIO-RIBEIRO, G.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
Os objetivos deste trabalho foram identificar as espécies virais presentes em vinhedos comerciais de duas regiões do Nordeste do Brasil e realizar a caracterização molecular parcial de isolados de três espécies virais. A diagnose foi realizada por meio de RT-PCR em tempo real para a detecção de Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Exceto para GFLV, os vírus avaliados estão amplamente disseminados nas áreas amostradas, frequentemente em altas incidências e em infecções múltiplas, de até 98% e 76,4%, na Zona da...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteína capsidial; Espécies virais; Variabilidade; Vitis; Videira; Uva; Levantamento; Coat protein.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1023196
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Levantamento e caracterização molecular de vírus e viroide em vinhedos no Município de São Roque, SP. Repositório Alice
MOURA, C. J. M. de; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
Cerca de 65 espécies virais infectam videiras no mundo, podendo causar significativos impactos econômicos. O objetivo deste trabalho foi determinar a incidência de vírus e viroide em 9 vinhedos do município de São Roque, SP e caracterizar molecularmente o gene da proteína capsidial (CP) de isolados locais.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vinhedo; Espécies virais; Viroide; Videira; Uva; Virus; Doença de planta.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1049029
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Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area. Repositório Alice
MOURA, C. J. M. de; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; SILVA, F. N. da; NICKEL, O..
ABSTRACT: The aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by realtime RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis; Diagnosis; Variabilitty; Incidence; Leafroll; Caracterização molecular; Videira; Vírus em videira; Cultivo de uva; Uva; DOença de planta.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078147
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Molecular characterization of Prunus necrotic ringspot virus isolated from rose in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; NASCIMENTO, M. B.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; PIO-RIBEIRO, G..
ABSTRACT There is no molecular characterization of Brazilian isolates of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), except for those infecting peach. In this research, the causal agent of rose mosaic was determined and the movement (MP) and coat (CP) protein genes of a PNRSV isolate from rose were molecularly characterized for the first time in Brazil. The nucleotide and deduced amino acid sequences of MP and CP complete genes were aligned and compared with other isolates. Molecular analysis of the MP and CP nucleotide sequences of a Brazilian PNRSV isolate from rose and others from this same host showed highest identities of 96.7% and 98.6%, respectively, and Rose-Br isolate was classified in PV32 group. Key words: diagnosis, sequencing, Ilarvirus, PNRSV,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diagnosis; Sequencing; Ilarvirus; PNRSV; ApMV; ArMV.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032952
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Obtenção de plantas de feijão-caupi resistentes ao Cowpea severe mosaic virus e ao Cowpea aphid-borne mosaic virus. Repositório Alice
BARROS, G. B.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; OLIVEIRA, C. R. R. de; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; VEIGA, C. F. de M.; BRIOSO, P. S. T.; EIRAS, M..
Dentre os vírus que infectam o feijão-caupi (Vigna unguiculata L. Walp.) destacam-se, respectivamente, pela severidade e ampla ocorrência o Cowpea severe mosaic virus (CPSMV) e o Cowpea aphidborne mosaic virus (CABMV). Portanto, objetivaram-se, no presente trabalho, obter e avaliar plantas de feijão-caupi com resistência ao CPSMV e ao CABMV, visando ao desenvolvimento de cultivares essencialmente derivadas e novas cultivares.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Comovirus; Potyvirus; Melhoramento genético.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/973897
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Produção de antissoro policlonal utilizando a proteína capsidial recombinante do Rupestris stem pitting-associated virus. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
O Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV) é o agente causal das caneluras do lenho da videira. Este trabalho teve como objetivo produzir antissoro policlonal a partir da proteína capsidial (CP) recombinante do RSPaV e avaliar a sua especificidade e sensibilidade. O gene da CP do RSPaV, com 780pb, foi previamente caracterizado. Esse gene foi subclonado no sítio de restrição EcoRI, no vetor de expressão pRSET-B e o plasmídeo recombinante foi utilizado para induzir a expressão da CP em Escherichia coli. A CP, ligada a uma cauda de seis histidinas, foi purificada por meio de cromatografia de afinidade em coluna de Ni-NTA a partir do extrato de proteínas totais extraídas de E. coli. A identidade da proteína purificada foi confirmada em SDS-PAGE e...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Detecção; RSPaV; Canelura do lenho; Sorologia; Limpeza clonal; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/872362
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Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of grape leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T, V, M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G..
bitstream/item/195701/1/PRODUCTION.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteína recombinante; Anti-soro; Policlonal; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/543073
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Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of Grapevine leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T.V.M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G..
The objective of this work was to produce and characterize specific antisera against Brazilian isolates of Grapevine leafroll-associated virus 2 (GLRaV-2) and Grapevine virus B (GVB), developed from expressed coat proteins (CPs) in Escherichia coli, and to test their possible use for the detection of these two viruses in diseased grapevines. The coat protein (CP) genes were RT-PCR-amplified, cloned and sequenced. The CP genes were subsequently subcloned, and the recombinant plasmids were used to transform E. coli cells and express the coat proteins. The recombinant coat proteins were purified, and their identities were confirmed by SDS-PAGE and Western blot and used for rabbit immunizations. Antisera raised against these proteins were able to recognize the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis; GLRaV-2; GVB; Indirect ELISA; Recombinant protein; Western blot; ELISA indireto; Proteína recombinante; Western blot.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122230
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Production of polyclonal antiserum using recombinant coat protein of Rupestris stem pitting-associated virus. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
bitstream/item/195344/1/Producao-de-antissoro-policlonal-utilizando-a-proteina-capsidial-recombinante.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Canelura do tronco; Anti-soro; Policlonal; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/865600
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Reação de genótipos de feijão-caupi revela resistência às coinfecções pelo Cucumber mosaic virus, Cowpea aphid-borne mosaic virus e Cowpea severe mosaic virus. Repositório Alice
OLIVEIRA, C. R. R. de; FREIRE FILHO, F. R.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; BARROS, G. B.; EIRAS, M.; RIBEIRO, V. Q.; LOPES, A. C. de A..
O rendimento do feijão-caupi pode ser afetado por diversos fatores, em especial as viroses. As principais espécies de vírus que infectam o feijão-caupi, no Brasil, são: Cucumber mosaic virus (CMV), Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Cowpea severe mosaic virus (CPSMV) e o Bean golden mosaic virus (BGMV). Este trabalho foi realizado em duas etapas e teve como objetivo avaliar a reação de genótipos de feijão-caupi quanto à resistência à infecção simples pelo CMV e mista nas combinações CMV+CABMV, CMV+CPSMV-I e MV+CABMV+CPSMV-I. Inicialmente, foram incluídos 57 genótipos, sendo três avaliações em gaiolas com tela antiafídeos sob infecção controlada, e uma em condição de campo sob infecção natural. Em seguida, foram selecionados 18 genótipos para serem...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Resistência a vírus; Efeito sinérgico.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/940785
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Reações inespecíficas na avaliação de fitoplasmas em videiras por nested-PCR. Repositório Alice
SANTOS, C. Z. dos; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
A videira (Vitis spp.) é acometida por doenças que afetam a produção, causando prejuízos econômicos, com destaque para o "amarelo da videira", induzido por fitoplasmas (Mollicutes), que ocorrem em diversas regiões vitícolas do mundo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fitlopasmas (molliculites); Videira; Amarelo da videira; Regiões vitícolas; Cigarrinhas (Cicadellidae); Limbo foliar; Bordos foliares; Nested-PCR; Vitis Vinifera.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096911
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Relação entre sintomas, infecção viral e genótipos de videiras. Repositório Alice
MOURA, C. J. M.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M..
No Brasil, são plantadas cultivares(cvs.) de Vitis vinifera(uva vinífera), videira mais sensível a viroses, e cvs. de Vitis labrusca e híbridas (uva comum), tolerantes a viroses. O objetivo deste trabalho foi relacionar a expressão de sintomas com infecção Viral e genótipos de videira.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Infecção Viral; Videira; Vírus; Vitis vinifera; Uva; Vitis labrusca.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071570
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Simultaneous detection of Brazilian isolates of grapevine viruses by TaqMan real-time RT-PCR. Repositório Alice
DUBIELA, C. R.; FAJARDO, T. V. M.; SOUTO, E. R.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; REVERS, L. F..
The aim of this work was to evaluate the efficiency of real-time RT-PCR for detection of different isolates of ten important virus species that infect grapevines in Brazil: Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1, -2, -3 and -5), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine fleck virus (GFkV) and Grapevine fanleaf virus (GFLV). The reactions consisted of individual (simplex) and simultaneous (duplex) virus detections. Thirty six grapevine accessions, regenerated after thermotherapy and tissue culture treatments, have been analysed. All the above-mentioned viruses were sensitively detected in simplex reactions in samples infected with different virus...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diagnóstico; Betaflexiviridae; Closteroviridae; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/960405
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Sintomas de viroses em plantas. Infoteca-e
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
Os vírus se multiplicam apenas dentro da célula hospedeira viva e não possuem metabolismo próprio. Após um processo de reconhecimento e interação em nível molecular, se a célula inoculada for suscetível ao vírus, ele se estabelecerá na célula hospedeira, se replicará, irá disseminar-se dentro da hospedeira e induzirá alterações bioquímicas e fisiológicas na hospedeira ao longo do processo infeccioso. Assim, os sintomas induzidos pelos vírus são, na essência, resultado do metabolismo celular alterado da hospedeira. O período transcorrido entre a entrada do vírus na hospedeira e a manifestação dos primeiros sintomas é denominado período de incubação.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Sintomas morfológicos; Amarelecimento; Bronzeamento; Branqueamento; Albinismo; Desvios de cor; Clorose; Clareamento de nervuras; Mosqueado; Mottling; Variegação nas pétalas; Estriado; Lesões locais cloróticas; MAncha anelar; Mancha anular; Line pattern; Padrão de linha; Mancha-café; Mosaico; Redução de crescimento; Subdesenvolvimento; Subcrescimento; Sintomas de deformações; Nanismo; Epinastia; Bolhas; Bolhosidades; Espessamento; Tumor; Canelura; Stem pitting; Tumor; Sintomas de necrose; Lesões locais necróticas; Cordão-de-sapato; Enação; Lamento; Enrugamento; Encrespamento; Necrose; Riscar; Viroses com infecções latentes; Sintomas citológicos; Infecção por vírus; Deficiências nutricionais; Toxinas produzidas por insetos; Toxinas produzidas por ácaros; Distúrbios de origem genética; Toxidez por herbicidas; Toxidez por inseticidas; Alta temperatura; Inoculação mecânica; Testes biológicos; Enxertia; União de tecidos; Vírus; Doença de planta.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1084312
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Variabilidade do gene da proteína capsidial de três importantes vírus que infectam videiras no Brasil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; RADAELLI, P.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; PIO-RIOBEIRO, G..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; RT-PCR; Capa protéica; GFLV; GLRaV-2; RSPaV; Detecção.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/543177
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Variability of the coat protein gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; DIANESE, E. C.; EIRAS, M.; CERQUEIRA, D. M.; LOPES, D. B.; FERREIRA, M. A. S. V.; MARTINS, C. R. F..
Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-l through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence offour GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastem Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NYl) and Chinese (Dawanhong N°2 and SUO) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-l through 4, showed deduced amino acid identities of98-l 00% (Pet-l through 3) and 95%...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Enrolamento da folha; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541980
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Variáveis agronômicas e variabilidade viral entre videiras sintomáticas e assintomáticas para viroses. Repositório Alice
NASCIMENTO, M. B.; BASSANIZ, B. G.; FAJARDO, T. V. M.; GROHS, D. S.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; PIO-RIBEIRO, G..
Os objetivos deste trabalho foram avaliar variáveis agronômicas em videiras com e sem sintomas de virose e caracterizar isolados virais destas plantas.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Videira; Niágara Rosada; Merlot; Virus; Uva; Doença de planta.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/994043
Registros recuperados: 40
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