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Detection of three Allexivirus species infecting garlic in Brazil. Repositório Alice
MELO FILHO, P. de A.; NAGATA, T.; DUSI, A.N.; BUSO, J.A.; TORRES, A.C.; EIRAS, M.; RESENDE, R. de O..
Garlic viruses often occur in mixed infections under field conditions. In this study, garlic samples collected in three geographical areas of Brazil were tested by Dot-ELISA for the detection of allexiviruses using monoclonal specific antibodies to detect Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C (GarV-C) and a polyclonal antiserum able to detect the three virus species mentioned plus Garlic virus D (GarV-D). The detected viruses were biologically isolated by successive passages through Chenopodium quinoa. Reverse Transcriptase Polimerase Chain Reaction (RT-PCR) was performed using primers designed from specific regions of the coat protein genes of Japanese allexiviruses available in the Genetic Bank of National Center of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Allium sativum; Virus detection; Coat protein; Dot-ELISA; RT-PCR; Detecção de vírus; Proteínas capsidiais.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/112506
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Citrus exocortis viroid and Hop stunt viroid doubly infecting grapevines in Brazil. Repositório Alice
EIRAS, M.; TARGON, M. L. P. N.; FAJARDO, T. V. M.; FLORES, R.; KITAJIMA, E. W..
Viroids, non-protein-coding small (246-40 I nt) eircular single-stranded RNAs with autonornous replication, are currently classified into two farnilics. Within the farnily Pospiviroidae, Citrus exocortis viroid (CEVd) belongs to lhe genus Pospiviroid while Hop stunt viroid (HSVd) is the single rnembcr of the genus Hostuviroid. These pathogens are distributcd worldwide and infect a large nurnbcr of hosts. In Brazil, isolates of CEVd and HSVd have been detected in both citrus and grapevine. To characterize and study the genetic variability of thcse viroids, total RNA frorn leaves of grapevine Vitis vinifera 'Cabemet Sauvignon' and V Iabrusca 'Niagara Rosada' frorn Bento Gonçalves, RS, was used as a tcmplate for RTPCR amplification with specific primers for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: CEVd; HSVd; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura; Hostuviroid; Pospiviroid; Pospiviroidae.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541733
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Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Rupestris stem ptting-associated virus. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O..
bitstream/item/194609/1/DETECCAO-E-CARACTERIZACAO.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rupestris stem pitting-associated virus; Caracterização molecular; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/542404
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Variability of the coat protein gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; DIANESE, E. C.; EIRAS, M.; CERQUEIRA, D. M.; LOPES, D. B.; FERREIRA, M. A. S. V.; MARTINS, C. R. F..
Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-l through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence offour GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastem Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NYl) and Chinese (Dawanhong N°2 and SUO) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-l through 4, showed deduced amino acid identities of98-l 00% (Pet-l through 3) and 95%...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Enrolamento da folha; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541980
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Caracterização molecular parcial do gene da proteína capsidial do Grapevine fanleaf virus. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O..
bitstream/item/194604/1/CARACTERIZACAO-MOLECULAR-PARCIAL.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização molecular; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura; Grapevine fanleaf virus.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/542406
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Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of Grapevine leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T.V.M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G..
The objective of this work was to produce and characterize specific antisera against Brazilian isolates of Grapevine leafroll-associated virus 2 (GLRaV-2) and Grapevine virus B (GVB), developed from expressed coat proteins (CPs) in Escherichia coli, and to test their possible use for the detection of these two viruses in diseased grapevines. The coat protein (CP) genes were RT-PCR-amplified, cloned and sequenced. The CP genes were subsequently subcloned, and the recombinant plasmids were used to transform E. coli cells and express the coat proteins. The recombinant coat proteins were purified, and their identities were confirmed by SDS-PAGE and Western blot and used for rabbit immunizations. Antisera raised against these proteins were able to recognize the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis; GLRaV-2; GVB; Indirect ELISA; Recombinant protein; Western blot; ELISA indireto; Proteína recombinante; Western blot.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122230
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Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of grape leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T, V, M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G..
bitstream/item/195701/1/PRODUCTION.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteína recombinante; Anti-soro; Policlonal; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/543073
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Variabilidade do gene da proteína capsidial de três importantes vírus que infectam videiras no Brasil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; RADAELLI, P.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; PIO-RIOBEIRO, G..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; RT-PCR; Capa protéica; GFLV; GLRaV-2; RSPaV; Detecção.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/543177
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Caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Prune dwarf virus. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; POPPE, J. K.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
bitstream/item/194881/1/Caracterizacao-molecular-do-gene-da-proteina-capsidial-do-Prune-dwarf-virus..pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vírus do nanismo; Protéina capsidial; Identificação genética; Ameixa; Doença de Planta; Fruticultura; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/544101
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Produção de antissoro policlonal utilizando a proteína capsidial recombinante do Rupestris stem pitting-associated virus. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
O Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV) é o agente causal das caneluras do lenho da videira. Este trabalho teve como objetivo produzir antissoro policlonal a partir da proteína capsidial (CP) recombinante do RSPaV e avaliar a sua especificidade e sensibilidade. O gene da CP do RSPaV, com 780pb, foi previamente caracterizado. Esse gene foi subclonado no sítio de restrição EcoRI, no vetor de expressão pRSET-B e o plasmídeo recombinante foi utilizado para induzir a expressão da CP em Escherichia coli. A CP, ligada a uma cauda de seis histidinas, foi purificada por meio de cromatografia de afinidade em coluna de Ni-NTA a partir do extrato de proteínas totais extraídas de E. coli. A identidade da proteína purificada foi confirmada em SDS-PAGE e...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Detecção; RSPaV; Canelura do lenho; Sorologia; Limpeza clonal; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/872362
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Detecção e identificação molecular de vírus associados a videiras sintomáticas e assintomáticas. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
A propagação vegetativa da videira favorece infecções virais múltiplas, com expressão diferencial de sintomas em função da combinação da cultivar ou espécie da hospedeira com a espécie viral. Os objetivos deste trabalho foram detectar e identificar as espécies virais presentes em duas espécies/cultivares de videira: uma sintomática e outra assintomática. DsRNA de ambas as amostras foi submetido à RT-PCR com 17 pares de oligonucleotídeos específicos para a detecção de Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine fanleaf virus (GFLV), Arabis mosaic virus (ArMV), Grapevine chrome mosaic virus (GCMV), Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV), Grapevine leafroll-associated virus 1 a 4...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Identificação; Diagnose; RSPaV; GLRaV-2; GLRaV-3; Variabilidade; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/871826
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Production of polyclonal antiserum using recombinant coat protein of Rupestris stem pitting-associated virus. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
bitstream/item/195344/1/Producao-de-antissoro-policlonal-utilizando-a-proteina-capsidial-recombinante.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Canelura do tronco; Anti-soro; Policlonal; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/865600
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Grapevine fleck virus: detecção via RT-PCR em tempo real e caracterização molecular do gene da proteína capsidial. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; DUBIELA, C. R.; EIRAS, M.; SOUTO, E. R.; NICKEL, O..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Detecção de vírus; Mancha das nervuras; Caracterização molecular; Proteína capsidial; Gene; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; Genética.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/898419
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Detecção por RT-PCR em Tempo Real e caracterização molecular do Grapevine virus D e Grapevine leafroll-associated virus 5 em videira. Repositório Alice
DUBIELA, C. R.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; REVERS, L. F.; SOUTO, E. R. de; NICKEL, O..
O objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência destes dois vírus em videiras por meio de RT-PCR em Tempo Real, além de caracterizar molecularmente três dos isolados obtidos.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; Genética; Complexo do lenho rugoso; Enrolamento da folha da videira; Grapevine leafroll-associated virus 5; Grapevine virus D.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908445
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Detecção e caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de ilarvírus e ampelovírus que infectam fruteiras temperadas. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; NICKEL, O.; EIRAS, M..
Dentre os principais patógenos que incidem em fruteiras temperadas, destacam-se o Prune dwarf virus (PDV), o Apple mosaic virus (ApMV) e o Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1). Neste trabalho foram realizadas a detecção e a caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de isolados destas três espécies virais. RNAs totais foram extraídos de amostras de folhas de pessegueiros, macieiras e videiras e, nas reações de RT-PCR, foram utilizados oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os cDNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Foram verificadas altas identidades entre as sequências de nucleotídeos dos genes da proteína capsidial dos isolados brasileiros de PDV, ApMV e GLRaV-1 e isolados de outros países, independente...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Proteína capsidial de ilarvírus; Proteína capsidial de ampelovírus; PDV; ApMV; GLRaV-1; Fruticultura; Uva; Maçã; Pêssego; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874030
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Reação de genótipos de feijão-caupi revela resistência às coinfecções pelo Cucumber mosaic virus, Cowpea aphid-borne mosaic virus e Cowpea severe mosaic virus. Repositório Alice
OLIVEIRA, C. R. R. de; FREIRE FILHO, F. R.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; BARROS, G. B.; EIRAS, M.; RIBEIRO, V. Q.; LOPES, A. C. de A..
O rendimento do feijão-caupi pode ser afetado por diversos fatores, em especial as viroses. As principais espécies de vírus que infectam o feijão-caupi, no Brasil, são: Cucumber mosaic virus (CMV), Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Cowpea severe mosaic virus (CPSMV) e o Bean golden mosaic virus (BGMV). Este trabalho foi realizado em duas etapas e teve como objetivo avaliar a reação de genótipos de feijão-caupi quanto à resistência à infecção simples pelo CMV e mista nas combinações CMV+CABMV, CMV+CPSMV-I e MV+CABMV+CPSMV-I. Inicialmente, foram incluídos 57 genótipos, sendo três avaliações em gaiolas com tela antiafídeos sob infecção controlada, e uma em condição de campo sob infecção natural. Em seguida, foram selecionados 18 genótipos para serem...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Resistência a vírus; Efeito sinérgico.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/940785
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Detection and partial molecular characterization of Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 and -6 infecting grapevines in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; DUBIELA, C. R.; SOUTO, E. R..
2012
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Diagnóstico; Sequenciamento genético; Maculavirus; Vitivirus; Ampelovirus; Detecção; Caracterização; Brasil; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941752
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Simultaneous detection of Brazilian isolates of grapevine viruses by TaqMan real-time RT-PCR. Repositório Alice
DUBIELA, C. R.; FAJARDO, T. V. M.; SOUTO, E. R.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; REVERS, L. F..
The aim of this work was to evaluate the efficiency of real-time RT-PCR for detection of different isolates of ten important virus species that infect grapevines in Brazil: Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1, -2, -3 and -5), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine fleck virus (GFkV) and Grapevine fanleaf virus (GFLV). The reactions consisted of individual (simplex) and simultaneous (duplex) virus detections. Thirty six grapevine accessions, regenerated after thermotherapy and tissue culture treatments, have been analysed. All the above-mentioned viruses were sensitively detected in simplex reactions in samples infected with different virus...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diagnóstico; Betaflexiviridae; Closteroviridae; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/960405
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Detection and partial molecular characterization of isolates of Grapevine leafroll-associated virus 4 and Grapevine rupestris vein feathering virus. Repositório Alice
CATARINO, A. D. M.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; RIBEIRO, G. P..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização molecular parcial de isolados; Grapevine leafroll-associated virus 4; Grapevine rupestris vein feathering virus; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979484
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Obtenção de plantas de feijão-caupi resistentes ao Cowpea severe mosaic virus e ao Cowpea aphid-borne mosaic virus. Repositório Alice
BARROS, G. B.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; OLIVEIRA, C. R. R. de; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; VEIGA, C. F. de M.; BRIOSO, P. S. T.; EIRAS, M..
Dentre os vírus que infectam o feijão-caupi (Vigna unguiculata L. Walp.) destacam-se, respectivamente, pela severidade e ampla ocorrência o Cowpea severe mosaic virus (CPSMV) e o Cowpea aphidborne mosaic virus (CABMV). Portanto, objetivaram-se, no presente trabalho, obter e avaliar plantas de feijão-caupi com resistência ao CPSMV e ao CABMV, visando ao desenvolvimento de cultivares essencialmente derivadas e novas cultivares.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Comovirus; Potyvirus; Melhoramento genético.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/973897
Registros recuperados: 40
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