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VEGFR2 selective residue flexibility enriches AutoDock Vina docking results IPB - Escola Superior Agrária
Abreu, Rui M.V.; Froufe, Hugo J.C.; Queiroz, Maria João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R..
VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2) is a recognized anti-cancer protein target with already one known inhibitor, soranefib, in the market for therapeutic use.1 Protein-ligand docking tools can be used in order to find potential new VEGFR2 inhibitors. However, the quality of docking results can be affected by the simplification of treating protein structures as rigid entities. Selective residue flexibility is a recent option available on several molecular docking tools, including AutoDock Vina used in this work,2 where only selected residues are allowed to be flexible. This approach is promising as it attempts to provide a more realistic protein environment while preventing an escalation of the computer power need. In this study four...
Tipo: ConferenceObject
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10198/6035
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Virtual ligand screening studies between mushroom compounds and proteins involved in breast cancer IPB - Escola Superior Agrária
Froufe, Hugo J.C.; Abreu, Rui M.V.; Ferreira, Isabel C.F.R..
Tipo: ConferenceObject
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10198/3336
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