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Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. Repositório Alice
ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caprino; Estrutura populacional; Genética de populações; Microssatélites; Raça naturalizada; Teste de paternidade; Microsatellite.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/534250
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Perfil eletrolítico e peso corporal em suínos submetidos a dietas com diferentes teores de fósforo. Repositório Alice
DANTAS, W. de M. F.; RIBEIRO FILHO, J. D.; GUIMARÃES, J. D.; FARIAS, S. K.; GUIMARÃES, S. E. F.; SARAIVA, A.; OLIVEIRA, T. T. de.
Resumo ? O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de dietas, com diferentes teores de fósforo, no perfil eletrolítico sanguíneo e no ganho de peso corporal em suínos. Foram utilizados 60 suínos híbridos comerciais, machos castrados, com peso corporal médio inicial de 61,07±0,86 kg, com aproximadamente 110 dias de idade. Os animais foram distribuídos em blocos ao acaso, com 5 tratamentos e 12 repetições cada um. Os tratamentos foram constituídos de dietas com 0,135, 0,200, 0,265, 0,330 e 0,395% de fósforo disponível. No início e no final do período experimental, foi determinado o peso corporal e foram coletadas amostras de sangue, sem jejum dos animais, para a mensuração de sódio, potássio, cloreto, magnésio total, fósforo e cálcio ionizado....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioquímica clínica; Desempenho; Exigência nutricional; Leitões.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/877939
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Comparison of dimensionality reduction methods to predict genomic breeding values for carcass traits in pigs. Repositório Alice
AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; GLÓRIA, L. S..
A significant contribution of molecular genetics is the direct use of DNA information to identify genetically superior individuals. With this approach, genome-wide selection (GWS) can be used for this purpose. GWS consists of analyzing a large number of single nucleotide polymorphism markers widely distributed in the genome; however, because the number of markers is much larger than the number of genotyped individuals, and such markers are highly correlated, special statistical methods are widely required. Among these methods, independent component regression, principal component regression, partial least squares, and partial principal components stand out. Thus, the aim of this study was to propose an application of the methods of dimensionality reduction...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Quadrados mínimos parciais; Componente de regressão independente; Componente principal de regressão; Componente principal parcial; Partial least squares; Independent component regression; Principal component regression; Partial principal component.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030362
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Aplicação de marcadores moleculares na conservação e melhoramento de um rebanho da raça Santa Inês. Repositório Alice
PAIVA, S. R.; PAIVA, D. A. de F.; SILVÉRIO, V. C.; McMANUS, C.; OLIVEIRA, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA, M. S.; EGITO, A. A. do; AZEVEDO, H. C. A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; CASTRO, S. R.; MARIANTE, A. da S..
0 objetivo deste trabalho foi caracterizar a distribuiçao da variabilidade genetica dentro de um Nucleo de Conservaçao da raça Santa Ines a partir do usa de marcadores moleculares. Foram utilizados 17 locos em 191 individuos do rebanho de Santa Ines da Embrapa Tabuleiros Costeiros, Sergipe. Os resultados obtidos mostraram que existe variabilidade genetica significativa existente dentro do nucleo com valores de Heterezigosidade media observada de 0,702 e de conteudo de informaçao polimorfica (PIC) de 0,704. Outras analises intrapopulacionais mostraram que 29% dos locos analisados nao estao em Equilfbrio de Hardy-Weinberg (p<0,01) e apresentaram excesso de homozigotos (p<0,05). A partir do fndice de proporçao de alelos compartilhados entre todos os...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ovino; Melhoramento genético animal; Biologia molecular; Marcador molecular; Variabilidade genética; Microssatélite; Conservação.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/531812
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Iberian origin of Brazilian local pig breeds based on Cytochrome b (MT-CYB) sequence. Repositório Alice
SOUZA, C. A.; PAIVA, S. R.; PEREIRA, R. W.; GUIMARÃES, S. E. F.; DUTRA JUNIOR, W. M.; MURATA, L. S.; MARIANTE, A. da S..
bitstream/item/178629/1/SP-19910-ID-32667.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Conservation genetics; Livestock evolution; MtDNA; Sus scrofa; Genetic resources.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/783701
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Genetic variability among brazilian sheep using microsatellites. Repositório Alice
PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; SILVÉRIO, V. C.; MCMANUS, C.; EGITO, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; CASTRO, S. R.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; MARIANTE, A. S..
bitstream/item/178496/1/ID-25664.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Recursos genéticos animais; Genética da conservação; Microssatélites; Ovino; Ovis Aries.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186171
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Descrição de cinco loci de microsatélite em uma população de caprinos da raça Alpina e sua utilização em testes de confirmação de paternidade em casos onde o genótipo materno é ou não informado. Repositório Alice
ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; COLUMBIANO, V. S.; TEIXEIRA, M. R.; LOPES, P. S..
2003
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caprino Raça Alpina; Melhoramento animal; Poliformismo genético; DNA; Teste de paternidade; Microsatélite loci.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/531263
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Regularized quantile regression for SNP marker estimation of pig growth curves. Repositório Alice
BARROSO, L. M. A.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F.; SERÃO, N. V. L.; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F..
Background: Genomic growth curves are generally defined only in terms of population mean; an alternative approach that has not yet been exploited in genomic analyses of growth curves is the Quantile Regression (QR). This methodology allows for the estimation of marker effects at different levels of the variable of interest. We aimed to propose and evaluate a regularized quantile regression for SNP marker effect estimation of pig growth curves, as well as to identify the chromosome regions of the most relevant markers and to estimate the genetic individual weight trajectory over time (genomic growth curve) under different quantiles (levels). Results: The regularized quantile regression (RQR) enabled the discovery, at different levels of interest...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome association; Pig; Regularized quantile regression; QTL; Melhoramento genético animal; Porco; Suíno; Growth curves; Swine.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084057
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Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. Repositório Alice
SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C..
Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; SNP; Dados longitudinais; LASSO bayesiano; Longitudinal data; Bayesian LASSO.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974473
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Association between insulin-like growth factor I (IGF-I) microsatellite polymorphisms and important economic traits in pigs. Repositório Alice
FARIA, D. de A.; PEIXOTO, J. de O.; LOPES, P. S.; PAIVA, S. R.; SILVA, P. V.; GUIMARÃES, S. E. F..
bitstream/item/178619/1/SP-19911-ID-32668.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Divergent cross; Microsatellite marker; Cruzamentos divergentes; Marcadores microssatélites; Suíno; Quantitative traits; Swine.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/852898
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Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. Repositório Alice
PINHEIRO, V. R.; SILVA, F. F. e; GUIMARÃES, S. E. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F..
O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical&#8209;by&#8209;descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sus scrofa; Curva de crescimento; Dados longitudinais; Identical-by-descent; Locos de característica quantitativas; Seleção assistida por marcadores.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/966562
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Perfil de ácidos graxos na carne de cordeiros de quatro genótipos. Repositório Alice
LOBO, A. M. B. O.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOBO, R. N. B.; BOMFIM, M. A. D.; FACO, O.; FERNANDES JÚNIOR, G. A..
Trinta e quatro cordeiros contemporâneos de quatro grupos genéticos, desmamados com idade média de 84 dias, foram utilizados neste estudo para avaliar o perfil de ácidos graxos no músculo Longissimus dorsi. A idade e o peso médio dos cordeiros ao abate foram 200,18 ± 7,54 dias e 20,62 ± 3,46 kg, respectivamente. As diferenças genéticas entre os grupos estudados foram responsáveis pelas diferenças em seus perfis de ácidos graxos. A raça Morada Nova (MO) apresentou os maiores valores de CLA, ácidos graxos poliinsaturados e P:S. Cordeiros MO e ½ Dorper x ½ MO (F1) apresentaram carne com maior proporção de ácidos graxos essenciais (EFA). O índice aterogênico e atividade relativa da enzima dessaturase foram semelhantes nos cordeiros F1, MO e Santa Inês. A raça...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: CLA; Índice aterogênico; Ovino; Qualidade da carne; Lipídio; Hair sheep; Meat quality; Lipids; Atherogenic index.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/916581
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Genetic diversity in naturalized and commercial pig breeds in Brazil. Repositório Alice
SOLLERO, B. P.; PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; BERTRANI, G. R.; MAMANI, E.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; CASTRO, S. T. R.; GERMANO, J. L.; MARIANTE, A. S..
bitstream/item/178307/1/ID-27565-1-f-.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Raça naturalizada; Raça comercial; Diversidade genética; Brasil; Suíno.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188057
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Diversidade genética em uma população da raça naturalizada Moxotó no Brasil. Repositório Alice
ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, T. M. M.; SILVA, F. L. R. da; FONSECA, C. G. da; LOPES, P. S.; MENDONÇA, P. T.; COLUMBIANO, V. S..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caprino; Distância euclidiana; Diversidade genética; Marcador genético; Recurso genético.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/534248
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Frequência alélica do gene da aromatase (Cyp19) em ovinos Santa Inês. Repositório Alice
LOBO, A. M. B. O.; GUIMARÃES, S. E. F.; LÔBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; LOPES, M. S..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ovino; Raça Santa Inês; Melhoramento genético animal; Reprodução animal; Cyp19; Crescimento; Aromatase; Hormônio de crescimento; Característica reprodutiva; Polimorfismo genetico.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/530867
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Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves. Repositório Alice
SILVA, F. F. e; ZAMBRANO, M. F. B.; VARONA, L.; GLÓRIA, L. S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; LÁZARO, S. F. L.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F..
Genome association analyses have been successful in identifying quantitative trait loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome association analysis...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: SNP markers; Body weight; Longitudinal data.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1069719
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Association between G316A growth hormone polymorphism and economic traits in pigs. Repositório Alice
FARIA, D. A. de; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S.; PIRES, A. V.; PAIVA, S. R.; SOLLERO, B. P.; WENCESLAU, A. A..
bitstream/item/178037/1/ID-27620-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genes candidatos; Divergent cross; Interação sexo genotipo; Marcador Molecular; Suíno.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187925
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Uso de LOCI microssatélites na conservação dos recursos genéticos de Ovis aries no Brasil. Repositório Alice
SILVÉRIO, V. C.; PAIVA, S. R.; FARIA, D. A.; PAIXÃO, D. M.; SOLLERO, B. P.; MCMANUS, C.; EGITO, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; CASTRO, S. R.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; MARIANTE, A. S..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/185887
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Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos. Repositório Alice
AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão via componentes independentes (ICR) na estimação de valores genéticos genômicos e dos efeitos de marcadores SNP para características de carcaça de uma população F2 de suínos (Piau x linhagem comercial). Os métodos foram avaliados por meio da concordância entre os valores genéticos preditos e os fenótipos corrigidos, observados por validação cruzada, e também foram comparados com outros métodos geralmente utilizados para os mesmos propósitos, tais como RR-BLUP, PCR e PLS. Os métodos ICR e PCR apresentam resultados similares, mas o método ICR apresenta maiores valores de acurácia.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Metódo de melhoramento; Melhoramento animal; Suíno.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/969295
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Expression profile of genes associated with mastitis in dairy cattle. Repositório Alice
FONSECA, I.; SILVA, P. V.; LANGE, C. C.; GUIMARAES, M. F. M.; WELLER, M. M. D. C. A.; SOUSA, K. R. S.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, J. D.; GUIMARÃES, S. E. F..
2009
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cytokine; Gene expression; Immune response; Real-time PCR.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/697368
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