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Interações e epistáticas entre QTLs afetando o peso aos dois anos em bovinos mestiços leiteiro. Repositório Alice
SALEM, M. M. I.; MOURÃO, G. B.; MACHADO, M. A.; GASPARIN, G.; AZEVEDO, A. L. S.; VERNEQUE, R. da S.; REGITANO, L. C. de A..
O objetivo deste estudo foi detectar QTLs e epistasia afetando o peso de dois anos na população de mestiços de gado leiteiro. Dois QTLs sugestivos foram encontrados nos cromossomos BTA 2 e BTA 3 no modelo inclui o efeito aditivo e dominância, e três QTLs sugestivos foram detectados nos BTA 6, BTA 10 e BTA 12 no modelo inclui apenas efeito aditivo. Um QTL significativo foi detectado em BTA 22 no modelo inclui o efeito aditivo e dominância. Identificaram dez pares de genes epistáticos.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Características de crescimento; Epistasia; Gado de leiteiro; QTL.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/859732
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Introdução à análise de marcadores moleculares. Repositório Alice
REGITANO, L. C. de A..
Polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição; Técnica PCR; Microssatélites; Polimorfismo de um nucleotídeo (SNPs).
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo; Nucleotídeos; Marcadores Genéticos.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46005
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Investigação de marcadores para resistência ao carrapato em bovinos da raça Nelore e seus cruzamentos. Repositório Alice
REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; ESPERÂNDIO, M. C.; ANDRÉO, R.; MELETI, L.; GASPARIN, G.; MIYATA, M.; BARIONI JUNIOR, W.; SILVA, A. M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bovino; Microplus microplus; Marcador molecular; Resistência genética.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47227
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Investigação de regiões cromossômicas candidatas para associação com a deposição de gordura em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
MEIRELLES, S. L.; VENERONI, G. B.; NUNES, H. de O.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Este trabalho teve o objetivo de investigar a associação entre os marcadores BMS490, ETH10 do cromossomo 5; INRA133, ILSTS090 do cromossomo 6 e RM222, BMS2142 do cromossomo 19 de bovinos e a característica espessura de gordura subcutânea (EGS) na raça Canchim. Foi estudada uma amostra de 392 animais, composto por dois grupos genéticos: Canchim (5/8 Charolês + 3/8 Zebu) e MA, criados em regime de pasto na Embrapa Pecuária Sudeste, em São Carlos -SP, e na Fazenda Ipameri, em Jussara -GO. O DNA foi extraído de amostras de sangue pelo método de precipitação das proteínas com sal como descrito por Regitano (2001). Os microssatélites foram amplificados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e analisados no equipamento ABI 3100 Avant (Applied Biosystems). As...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Espessura de gordura; Marcador molecular; Quantitative trait loci.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47485
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Investigação do polimorfismo K232A do gene DGAT1 em raças de Bos indicus e seus cruzamentos. Infoteca-e
PAPPAS, M. de C. R.; LOURENCO, I. T.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MACHADO, M. A.; CAMPOS, A. L.; MARTINEZ, M. L.; GRATTAPAGLIA, D..
2004
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Cruzamento; Polimorfismo.
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47258
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Investigação do polimorfismo K232a do gene DGAT1 em raças de Bos indicus e seus cruzamentos. Infoteca-e
PAPPAS, M. C. R.; LOURENÇO, I. T.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MACHADO, M. A.; CAMPOS, A. L.; MARTINEZ, M. L.; GRATTAPAGLIA, D..
2004
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/186337
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Iron content affects lipogenic gene expression in the muscle of nelore beef cattle. Repositório Alice
DINIZ, W. J. da S.; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Iron (Fe) is an essential mineral for metabolism and plays a central role in a range of biochemical processes. Therefore, this study aimed to identify differentially expressed (DE) genes and metabolic pathways in Longissimus dorsi (LD) muscle from cattle with divergent iron content, as well as to investigate the likely role of these DE genes in biological processes underlying beef quality parameters. Samples for RNA extraction for sequencing and iron, copper, manganese, and zinc determination were collected from LD muscles at slaughter. Eight Nelore steers, with extreme genomic estimated breeding values for iron content (Fe-GEBV), were selected from a reference population of 373 animals. From the 49 annotated DE genes (FDR<0.05) found between the two...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fisiologia esquelético muscular; Metabolismo lipídico; Gado Nelore; Ferro; Nellore.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1055127
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Label-free MSE proteomic analysis of the bovine skeletal muscle: new approach for meat tenderness evaluation. Repositório Alice
POLETI, M. D.; SIMAS, R. C.; CESAR, A. S. M.; ANDRADE, S. C. S.; SOUZA, G. H. M. F.; CAMERON, L. C.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Espectrometria de massa; Proteona; Gado de corte; Beef cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057369
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LDHB gene has allele-specific expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M..
Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cattle; Residual feed intake; Differential expression; MicroRNA.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075647
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Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Genome wide association studies; Desequilíbrio de ligação; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003463
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Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Beef cattle; Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único; Beef cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism; Gado de corte.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006604
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Liofilização como método de conservação de RNA. Repositório Alice
SOUZA, J. R. T. de; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Liofilização; RNA.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47753
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Liver DNA methylation profile in Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. N. de; REGITANO, L. C. de A.; KOLTES, J. E.; NICIURA, S. C. M..
The production cost of cattle is high, especially the fraction related to animal nutrition. The increase in feed efficiency may provide increased efficiency in beef production, minimizing feed expenditures, methane gas emission and nitrogen excretion.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feed efficiency; RRBS; Differential methylation; Beef production; Gado de Corte; Bovino; Gene expression regulation; Animal nutrition.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110134
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Mapa de ligação de cromossomo 7 (BTA7) de bovinos mestiços provenientes de cruzamento Holandês x GIR. Repositório Alice
GASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; BARBOSA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; REGITANO, L. C. de A..
2005
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cromossomo; Bovino mestiço; Holandês x GIR.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47318
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Mapa de ligação do cromossomo 23 de bovinos mestiços (Holandês x Gir). Repositório Alice
TUNIN, K.; BARON, E. E.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
2003
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: CROMOSSOMO; BOVINO; MESTIÇO.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46689
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Mapa de ligação do cromossomo 5 (BTA5) de bovinos mestiços provenientes de cruzamento Holandês x Gir. Repositório Alice
GASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; REGITANO, L. C. de A..
2004
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cromossomo; Bovino; Mestiço.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46892
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Mapas de ligação de três cromossomos bovinos (5, 7 e 14) utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
GASPARIN, G.; MIYATA, M.; REGITANO, L. C. de A..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapas de ligação; Bovino; Marcadores; Microssatélites.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47716
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Mapeamento de QTL para resistência a carrapatos no cromossomo 23 de bovinos (BTA23). Repositório Alice
TUNIN, K. P.; PACKER, I. U.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; MARTINEZ, M. L..
Uma população experimental F2 de bovinos, originada do cruzamento das raças Gir x Holandês, foi genotipada para o cromossomo 23 (BTA23) utilizando cinco marcadores microssatélites distribuídos ao longo dos cromossomos, com um espaçamento médio de 25 cM entre eles. Os marcadores utilizados foram BM1258, BM1818, BM1905, BB705 e CSSM24, com os quais foi construído um mapa de ligação para o BTA23. Dessa população F2, 263 animais foram submetidos a infestação artificial pelo carrapato Boophilus microplus. Vinte e um dias após a infestação, foi contado o número de carrapatos (larvas engurgitadas) presentes em cada animal. Dois modelos estatísticos foram desenvolvidos com o auxílio do programa SAS para análise da variância e para fins de mapeamento de QTL, o...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento de QTL; Boophilus microplus; Bovinos; Transformação.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48104
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Mapeamento de QTLs de características fisiológicas relacionadas a estresse térmico em bovinos leiteiros cruzados. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; RIBEIRO, A. R. B.; PIRES, M. de F. A.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; BELO, V. de A.; GASPARIN, G.; CERVINI, M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento de QTLS; Gado de corte; Adaptação; Cruzamento; Gado leiteiro.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/576961
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Mapeamento de QTLS para peso ao nascimento no cromossomo 14 de bovinos Repositório Alice
MYTATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Produção de leite; Raças Holandesas; Marcador molécula.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47156
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