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Identificação de SNPs em parte do gene de um fator de diferenciação celular localizado no BTA14. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Um fator de diferenciação celular localizado no BTA14 foi relacionado com adipogênese. O objetivo desse trabalho foi identificar SNPs no gene desse fator para subseqüente associação com espessura de gordura subcutânea em bovinos da raça Canchim. O valor genético (VG) de 113 touros foi calculado. Seis touros com maior VG e seis touros com menor VG foram escolhidos para identificação de SNPs. Todos os touros foram genotipados para todos os SNPs identificados e então foi aplicado um teste exato de Fisher. 76 SNPs foram identificados. O teste de Fisher revelou um valor de P= 0.0167 para um SNP localizado no íntron 13. Esse SNP pode ser um bom candidato para associação com deposição de gordura na população estudada.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene canditado; Espessura de gordura; Raça; Canchim; Gado de corte.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/83291
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Identificação de SNPs no gene DDEF1 bovino. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
A raça Canchim foi criada objetivando a produção de carne de melhor qualidade nas condições brasileiras e, tem sido muito utilizada em cruzamentos. Padrões específicos de algumas características da carcaça como, por exemplo, de espessura de gordura, contribuem para a manutenção da qualidade da carne. A raça Canchim produz carcaças com espessura de gordura inferior ao desejável pelo mercado, necessitando assim de estudos que visem auxiliar o melhoramento dessa característica. Os marcadores moleculares surgem nesse contexto como uma possibilidade de auxiliar o melhoramento tradicional. O BTA14 possui relatos de QTLs para espessura de gordura, motivando o estudo de genes candidatos a influenciar a deposição de gordura nessa região do genoma dos bovinos. Um...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; Gene DDEF1; Raça Canchim; Espessura de gordura; Marcador molecular.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48709
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Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; OLIVEIRA, H. N.; YAMAGISHI, M. E. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
O valor comercial da carcaça bovina é determinado por alguns fatores, dentre eles destaca-se a quantidade de gordura de cobertura. Um dos objetivos do melhoramento na raça Canchim é melhorar tal característica na raça, pois esta não possui espessura de gordura desejável pelo mercado. No genoma existem muitas regiões relacionadas à deposição de gordura e, por esse motivo, estudos em larga escala, como os que utilizam chips de milhares de SNPs vêm sendo cada vez mais realizados. O objetivo desse trabalho foi verificar a existência de SNPs em animais Canchim, associados à espessura de gordura subcutânea, utilizando um chip de alta densidade de SNPs, utilizando a estratégia de amostragem dos extremos para a característica. Um mil, cento e setenta e um animais...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento animal; Região genômica; SNPS.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/660912
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Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. G.; GROSSI, D. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Canchim is a synthetic beef cattle developed in Brazil which have good growth potential and tropical adaptation but suboptimal fat deposition. There are genomic regions associated with fat deposition already described, among them the centromeric region of BTA14. The scope of this work was to identify genomic regions associated with backfat thickness in Canchim (5/8 Charolais + 3/8 zebu) and MA (offspring of Charolais bulls and 1/2 Canchim + 1/2 Zebu cows) populations and to validate the association of haplotypes of the BTA14 with backfat thickness in this population. Thirty animals with extreme phenotypes were genotyped with the 54 K SNP chip, revealing 100 signifi cant SNPs contained in chromosomes 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 14, 15, 17, 18,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Identification of genomic; Beef cattle.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/862995
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Investigação de regiões cromossômicas candidatas para associação com a deposição de gordura em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
MEIRELLES, S. L.; VENERONI, G. B.; NUNES, H. de O.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Este trabalho teve o objetivo de investigar a associação entre os marcadores BMS490, ETH10 do cromossomo 5; INRA133, ILSTS090 do cromossomo 6 e RM222, BMS2142 do cromossomo 19 de bovinos e a característica espessura de gordura subcutânea (EGS) na raça Canchim. Foi estudada uma amostra de 392 animais, composto por dois grupos genéticos: Canchim (5/8 Charolês + 3/8 Zebu) e MA, criados em regime de pasto na Embrapa Pecuária Sudeste, em São Carlos -SP, e na Fazenda Ipameri, em Jussara -GO. O DNA foi extraído de amostras de sangue pelo método de precipitação das proteínas com sal como descrito por Regitano (2001). Os microssatélites foram amplificados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e analisados no equipamento ABI 3100 Avant (Applied Biosystems). As...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Espessura de gordura; Marcador molecular; Quantitative trait loci.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47485
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Marcadores moleculares e suas aplicações no melhoramento animal Repositório Alice
REGITANO, L. C. de A.; VENERONI, G. B..
Marcadores genéticos têm sido elementos fundamentais nos estudos de segregação de caracteres hereditários, na análise do comportamento de genes em populações e na reconstrução da história evolutiva de populações, entre outras aplicações. Desde a descoberta do DNA, a genética molecular experimentou extraordinário avanço, que passou pelo desenvolvimento de métodos de análise da estrutura e da função do material genético, e de equipamentos com capacidade para análise automatizada de grande quantidade de amostras, até o desenvolvimento de métodos estatísticos e de ferramentas de informática, resultando na ciência conhecida como genômica.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador genético; Melhoramento animal.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/257210
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Prospecting candidate SNPs for backfat in Canchim beef cattle. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Canchim is a composite cattle breed developed in Brazil for beef production. One of the breeding objectives is to increase fat deposition. QTLs for fat thickness and/or marbling have been reported on BTA4 and BTA14. The IGFBP3 and DDEF1 genes, mapped to BTA4 and BTA14, respectively, affect adipogenesis. We looked for SNPs in the IGFBP3 and DDEF1 genes that could be associated with backfat thickness in Canchim beef cattle. For SNP identification, sires with the highest accuracy were ranked according to expected breeding value for fat thickness; the 12 extremes (six sires with the highest and six with the lowest expected breeding value for the trait) were chosen. Six regions of the IGFBP3 and 14 regions of the DDEF1 were sequenced using the Sanger method....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fat deposition; Candidate genes; SNP identification.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/864190
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Reação em cadeia da polimerase (pcr). Repositório Alice
SANTIAGO, A. C.; VENERONI, G. B.; REGITANO, L. C. de A..
2007
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Polimerase; PCR; Cadeia.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48097
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Seleção de genes constitutivos para estudos de expressão gênica em Iinfonodo de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (B.) microplus. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A..
Um dos principais fatores em estudos de expressão gênica é a nonnalização dos dados por meio do uso de genes constitutivos. Esse é um método simples e amplamente utilizado, pois possibilita o controle de variação na quantidade inicial de material, na qualidade do RNA, na variação intrínseca do equipamento utilizado e nas diferenças na sintese de cDNA, permitindo avaliar se a variação encontrada está relacionada aos tratamentos estabelecidos ou a artefatos. O objetivo deste trabalho foi selecionar um gene constitutivo estável para análise de expressão gênica em linfonodos de bovinos resistentes e sensíveis ao carrapato Rhipicephalus (B.) microplus. Foram escolhidas cinco amostras de animais resistentes e cinco de animais sensíveis. Seis
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção de genes; Linfonodo; Bovinos; Carrapatos.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/575833
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SNP do gene da tireoglobulina não afeta a espessura de gordura em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIANGO, A. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
A raça Canchim é uma raça composta que vem crescendo no mercado de gado de corte. Apesar da elevada capacidade de produção de carne a raça possui pouca gordura de cobertura, justificando pesquisas com o objetivo de aumentar a deposição de gordura nessa raça. Essas pesquisas incluem a procura por marcadores moleculares que podem auxiliar a identificação de animais com maior potencial genético para a característica. Em várias populações bovinas, inclusive na população em estudo, a região centromérica do cromossomo 14 (BTA14) foi associada com deposição de gordura. O gene da tireoglobulina está localizado à 4,46 Mb nesse cromossomo e relatos descrevem a influência de um polimorfismo na seqüência 5´ líder desse gene sobre o marmoreio e a espessura de gordura....
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Canchim; Espessura de gordura; Marcador molecular; Tireoglobulina.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47006
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Teste de associação de um SNP do gene IGFBP3 com espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; MELLO, S. S.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
A raça Canchim tem possui pouca gordura de cobertura o que limita o valor da carcaça produzida. O cromossomo 4 já foi associado com deposição de gordura em bovinos. O gene IGFBP3 foi relacionado ao metabolismo de gorduras e encontra-se no cromomosso 4. Este trabalho objetivou identificar polimorfismos no gene IGFBP3, investigar associação desses SNPs com espessura de gordura, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de bovinos da raça Canchim. Um total de 647 animais, compreendendo machos e fêmeas, nascidos de 2003 a 2006, criados em regime de pastagem em oito fazendas localizadas nos estados de SP e GO, foi avaliado para espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de idade. Para a identificação dos SNPS foram calculados os...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; Gado de corte; Raça canchim.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/660900
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Teste de associação do hormônio liberador de corticotrofina (CRH) com espessura de gordura em bovinos da raça Canchim Repositório Alice
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; MELLO, S. S.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Raça canchim; Espessura de gordura; Hormônio; Corticotrofina.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/576969
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Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. de S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A..
A variabilidade genética para resistência de bovinos ao carrapato tem sido verificada em diversos grupos genéticos. A compreensão dos mecanismos envolvidos nessa variação pode auxiliar a identificação de genes ou marcadores para essa característica. O objetivo desse trabalho foi verificar quais vias regulatórias podem estar envolvidas na resistência e suscetibilidade de bovinos submetidos à infestação artificial com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Para isso, amostras de pele (PE) e linfonodo (LN) de animais previamente classificados em resistentes (PER e LNR) e sensíveis (PES e LNS) foram coletadas no nono dia após a infestação artificial com carrapato. Foi realizado o isolamento e purificação em coluna de sílica do RNA total e,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Carrapato; Boophilus microplus; Resistência; Susceptibilidade.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/660899
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