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Expression of rice genes homologous of Arabidopsis genes previously related to drought tolerance. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. .J.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
The identification and validation of candidate genes related to traits of interest is a time consuming and expensive process and the homology among genes from different species can facilitate the identification of genes of the target species from the genomic information of a model species. This study aimed to quantify the expression of homologous rice genes previously related to drought tolerance in Arabidopsis. Five genes (CPK6, PLDa, GluR2, CesA8, and EIN2) were identified in rice by the homology of the amino acid sequence between rice and Arabidopsis. The genotypes Douradão (drought tolerant) and Primavera (drought susceptible) were subjected to a water deficit experiment, and subsequently evaluated for gene expression by qPCR for the five homologous...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gene homology; Arroz; Oryza sativa; Acido abscisico; Rendimento; Rice; Abscisic acid; Quantitative polymerase chain reaction; Yields; Arabidopsis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1054691
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Superexpressão do gene PLDα1 para aumento da tolerância à deficiência hídrica da cultivar de arroz αBRSMG Curinga. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; MENDONÇA, J. A.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Este trabalho objetivou a obtenção de plantas de arroz geneticamente modificadas (GM) mais tolerantes ao deficit hídrico. O gene PLDα1, expresso constitutivamente, está diretamente relacionado a respostas de plantas à deficiência hídrica por meio do seu produto enzimático, o ácido fosfatídico. Esse gene foi clonado em vetor binário p7i2x-Ubi e inserido, via Agrobacterium, no genoma da cultivar de arroz BRSMG Curinga, moderadamente tolerante à deficiência hídrica.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084750
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De Arabidopsis a Oryza: identificação de genes ortólogos, transformação e obtenção de plantas de arroz mais tolerantes à seca. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; MENDONÇA, J. A.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Com o objetivo de verificar a expressão dos genes ortólogos PLDα1 e CPK5 em arroz, previamente relacionados com a tolerância à seca em Arabidopsis, o presente estudo, em uma primeira etapa, analisou em um experimento de tolerância à seca dois genótipos contrastantes de arroz, Douradão, tolerante à seca, e Primavera, susceptível.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arabidopsis; Arroz; Oryza sativa; Resistência a seca; Gene.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039506
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Plantas de arroz geneticamente modificadas com genes homólogos relacionados à tolerância à seca em Arabidopsis. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Este estudo teve como objetivo selecionar dois genes homólogos de arroz, previamente relacionados à tolerância à seca em Arabidopsis, que apresentaram expressão diferencial entre genótipos tolerante e suscetível à seca e, a partir deles, obter plantas geneticamente modificadas mais tolerantes a essa condição.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Planta transgência; Resistência a seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066112
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Identificação e validação de genes de referência para análise de RT-qPCR em arroz. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo desse estudo foi identificar e validar genes de referência para análise de RTqPCR em arroz.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/989145
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Avaliação da tolerância à seca de plantas T2 da cultivar de arroz BRSMG Curinga geneticamente modificadas. Repositório Alice
ALVES, L. L.; MENDONCA, J. A.; VIANELLO, R. P.; ABREU, F. R. M.; BRONDANI, C..
Esse trabalho, que ainda está na fase de condução do experimento em casa de vegetação, objetiva avaliar a expressão gênica relacionada à tolerância à seca em arroz geneticamente modificado submetido a tratamento de restrição hídrica.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Tolerância à seca; Melhoramento vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039448
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Estudo da expressão e validação de genes candidatos induzidos em condições de deficiência hídrica em feijão (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
ARAÚJO, R. B. de; LANNA, A. C.; COELHO, G. R. C.; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste trabalho foi conduzir o experimento de deficiência hídrica em 25 genótipos de feijão, incluindo variedades tradicionais e linhagens/cultivares em ambiente controlado de casa de vegetação, selecionar e avaliar os perfis de expressão de genes candidatos previamente identificados como associados à tolerância à deficiência hídrica e altas temperaturas.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066114
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Validação de genes candidatos para tolerância à seca via qPCR em um amplo grupo de genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica. Repositório Alice
ARAÚJO, R. B. de; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
Tem como objetivo avaliar o perfil de expressão de dezenas de genes previamente identificados como responsivos em condições de seca em genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência à seca; Deficiência hídrica; Gene; Genótipo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039457
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Genome prediction accuracy of common bean via Bayesian models. Repositório Alice
BARILI, L. D.; VALE, N. M. do; SILVA, F. R. e; CARNEIRO, J. E. de S.; OLIVEIRA, H. R. de; VIANELLO, R. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; NASCIMENTO, M..
We aimed to apply genomic information based on SNP (single nucleotide polymorphism) markers for the genetic evaluation of the traits ?stay-green? (SG), plant architecture (PA), grain aspect (GA) and grain yield (GY) in common bean through Bayesian models. These models were compared in terms of prediction accuracy and ability for heritability estimation for each one of the mentioned traits. A total of 80 cultivars were genotyped for 377 SNP markers, whose effects were estimated by five different Bayesian models: Bayes A (BA), B (BB), C (BC), LASSO (BL) e Ridge regression (BRR). Although, prediction accuracies calculated by means of cross-validation have been similar within each trait, the BB model stood out for the trait SG, whereas the BRR was indicated...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Validação cruzada; Cross-validation; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Marcador Molecular; Beans; Genetic markers; Marker-assisted selection.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095835
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Linkage and mapping of quantitative trait loci associated with angular leaf spot and powdery mildew resistance in common beans. Repositório Alice
BASSI, D.; BRIÑEZ, B.; ROSA, J. S.; OBLESSUC, P. R.; ALMEIDA, C. P. de; NUCCI, S. M.; SILVA, L. C. D. da; CHIORATO, A. F.; VIANELLO, R. P.; CAMARGO, L. E. A.; BLAIR, M. W.; BENCHIMOL-REIS, L. L..
Angular leaf spot (ALS) and powdery mildew (PWM) are two important fungi diseases causing significant yield losses in common beans. In this study, a new genetic linkage map was constructed using single sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphisms (SNPs), in a segregating population derived from the AND 277 x SEA 5 cross, with 105 recombinant inbred lines. Phenotypic evaluations were performed in the greenhouse to identify quantitative trait loci (QTLs) associated with resistance by means of the composite interval mapping analysis. Four QTLs were identified for ALS resistance. The QTL ALS11AS, linked on the SNP BAR 5054, mapped on chromosome Pv11, showed the greatest effect (R2 = 26.5%) on ALS phenotypic variance. ForPWMresistance, two QTLs...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pseudocercospora griseola; Quantitative inheritance; Feijão; Phaseolus vulgaris; Mancha foliar; Erysiphe polygoni; Microsatellite repeats; Single nucleotide polymorphism; Leaf spot.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076287
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Identificação de regiões genômicas associadas a zinco e ferro em feijoeiro comum. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; PEREIRA, H. S.; VIANELLO, R. P.; BASSINELLO, P. Z.; MATSUSHIGE, I..
desenvolvimento de cultivares de feijoeiro comum com altos teores de ferro pode ser uma alternativa à redução da baixa ingestão deste mineral em países em desenvolvimento. O objetivo deste trabalho foi avaliar o conteúdo de ferro e zinco em uma população biparental, assim como o polimorfismo molecular entre os parentais. O teor de ferro variou expressivamente entre as 194 progênies e os parentais IAC Una e G6492 exibiram diferenças significativas no teor deste micronutriente. O parentais IAC Una e G6492 apresentaram 20% de polimorfismo quando avaliados através de um conjunto de 768 SNP.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biofortificação; Feijão; Phaseolus vulgaris; Ferro; Zinco; Microelemento; Marcador molecular.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027434
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Mapping QTLs for drought tolerance in a SEA 5 x AND 277 common bean cross with SSRs and SNP markers. Repositório Alice
BRIÑEZ, B.; PERSEGUINI, J. M. K. C.; ROSA, J. S.; BASSI, D.; GONÇALVES, J. G. R.; ALMEIDA, C.; PAULINO, J. F. de C.; BLAIR, M. W.; CHIORATTO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; BENCHIMOL-REIS, L. L..
The common bean is characterized by high sensitivity to drought and low productivity. Breeding for drought resistance in this species involves genes of different genetic groups. In this work, we used a SEA 5 x AND 277 cross to map quantitative trait loci associated with drought tolerance in order to assess the factors that determine the magnitude of drought response in common beans. A total of 438 polymorphic markers were used to genotype the F8 mapping population. Phenotyping was done in two greenhouses, one used to simulate drought and the other to simulate irrigated conditions. Fourteen traits associated with drought tolerance were measured to identify the quantitative trait loci (QTLs). The map was constructed with 331 markers that covered all 11...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: QTL mapping; Interpopulation gene-pool; Feijão; Marcador molecular; Deficiência hídrica; Plant-water relations; Genetic markers; Abiotic stress; Quantitative trait loci.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078353
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/938894
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923298
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923169
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/922956
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Discrimination of common bean cultivars using multiplexed microsatellite markers. Repositório Alice
CARDOSO, P. C. B.; BRONDANI, C.; MENEZES, I. P. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; DEL PELOSO, M. J.; VIANELLO, R. P..
Analysis of DNA polymorphisms allows for the genetic identification and precise discrimination of species with a narrow genetic base such as common bean. The primary objectives of the present study were to molecularly characterize commercial common bean varieties developed at various research institutions using microsatellite markers and to determine the degree of genetic diversity among the bean varieties analyzed. Fifty cultivars representing 12 grain classes and 64 genitors, i.e., accessions used to develop these cultivars, were characterized. Based on an analysis of 24 simple sequence repeats, the estimates for the average number of alleles and genetic diversity were 8.29 and 0.646, respectively. The combined probability of identity was estimated at...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Feijão; Phaseolus vulgaris; DNA; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085520
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Molecular characterization of high performance inbred lines of Brazilian common beans. Repositório Alice
CARDOSO, P. C. B.; VEIGA, M. M.; MENEZES, I. P. P. de; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
The identification of germplasm genetic variability in breeding programs of the common bean (Phaseolus vulgaris) is essential for determining the potential of each combination of parent plants to obtain superior genotypes. The present study aimed to estimated the extent of genetic diversity in 172 lineages and cultivars of the common bean by integrating five tests of value for cultivation and use (VCU) that were conducted over the last eight years by the breeding program of Embrapa Arroz e Feijão in Brazil. Nine multilocus genotyping systems composed of 36 fluorescent microsatellite markers distributed across 11 different chromosomes of the common bean were used, of which 24 were polymorphic in all trials. One hundred and eighty-seven alleles were...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético; Variação genética; Inbred lines; Genetic lines.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953582
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SNP discovery in genomic regions flanking the common bean anthracnose resistance locus Co-4. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; COELHO, G. R. C.; SOUZA, T. L. P. O.; VIANELLO, R. P..
The main goal of this work was to characterize the genetic variability of genomic regions flanking the anthracnose resistance locus Co-4 aiming to develop SNP markers for specific identification of the different alleles presented by this locus, mainly of the Co-42.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Antracnose; Colletrotrichum lindemuthianum; Fungo; Marcador molecular.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1025174
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Re-sequenciamento genômico da cultivar de feijoeiro comum Pérola (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; LEVINDO, G. G.; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo é realizar através dos dados de re-sequenciamento da cultivar Pérola as análises de montagem, anotação e identificação de variações nucleotídicas através do alinhamento com os genomas de referência das variedades BAT93 e G19833 de feijoeiro comum.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequenciamento genômico; Feijão; Phaseolus vulgaris; Genoma.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/989137
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