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Expression of drought tolerance genes in tropical upland rice cultivars (Oryza sativa). Repositório Alice
SILVEIRA, R. D.; ABREU, F. R. M.; MAMIDI, S.; McCLEAN, P. E.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; CARNEIRO, N. P.; BRONDANI, C..
Gene expression related to drought response in the leaf tissues of two Brazilian upland cultivars, the drought-tolerant Douradão and the drought-sensitive Primavera, was analyzed. RNA-seq identified 27,618 transcripts in the Douradão cultivar, with 24,090 (87.2%) homologous to the rice database, and 27,221 transcripts in the Primavera cultivar, with 23,663 (86.9%) homologous to the rice database. Gene-expression analysis between control and water-deficient treatments revealed 493 and 1154 differentially expressed genes in Douradão and Primavera cultivars, respectively. Genes exclusively expressed under drought were identified for Douradão, including two genes of particular interest coding for the protein peroxidase precursor, which is involved in three...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Gene; Resistência a seca; Variedade.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035196
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Validação de genes candidatos para tolerância à seca via qPCR em um amplo grupo de genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica. Repositório Alice
ARAÚJO, R. B. de; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
Tem como objetivo avaliar o perfil de expressão de dezenas de genes previamente identificados como responsivos em condições de seca em genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência à seca; Deficiência hídrica; Gene; Genótipo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039457
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Marcadores STS ligados ao alelo Co-42 de resistência à antracnose em feijoeiro. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; WENDLAND, A.; MELO, L. C.; VIANELLO, R. P.; PEREIRA, H. S.; SOUZA, T. L. P. O. de..
o objetivo desse estudo foi validar marcadores STS ligados ao alelo Co-42, mediante análises de cosegregação. Inicialmente, foram avaliadas 261 plantas F2 e 197 progênies F2:3 resultantes do cruzamento entre BRS Cometa e SEL 1308 (Co-42). Foram avaliadas cerca de 16 plantas de cada progênie F2:3. Todas as plantas foram inoculadas com a raça 73 de C. lindemuthianum, sete dias após o plantio.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Antracnose.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039410
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Identificação de loci relacionados à produtividade sob deficit hídrico utilizando uma abordagem GBS - GWAS. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via GBS, o polimorfismo de marcadores SNPs em 175 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob deficit hídrico, identificando regiões genômicas que podem estar relacionadas a esse caráter.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Deficiência hídrica; Arroz; Oryza sativa; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039439
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Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P..
Esse estudo teve como objetivo desenvolver e sequenciar bibliotecas de cDNA a partir de diferentes tecidos e genótipos de feijão e analisar em resposta aos tratamentos específicos os níveis diferenciais de expressão gênica. Foram avaliados os genótipos fenotipicamente divergentes BAT477, caracterizado como tolerante à seca, e Pérola, como suscetível.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039617
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SNP discovery in genomic regions flanking the common bean anthracnose resistance locus Co-4. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; COELHO, G. R. C.; SOUZA, T. L. P. O.; VIANELLO, R. P..
The main goal of this work was to characterize the genetic variability of genomic regions flanking the anthracnose resistance locus Co-4 aiming to develop SNP markers for specific identification of the different alleles presented by this locus, mainly of the Co-42.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Antracnose; Colletrotrichum lindemuthianum; Fungo; Marcador molecular.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1025174
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Expressão de genes homólogos de Arabidopsis em arroz relacionados ao aumento do potencial produtivo. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. A. V. de; ABREU, F. R. M.; PEREIRA, W. J.; SILVEIRA, R. D. D.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho foi quantificar a expressão de genes de arroz homólogos de Arabidopsis previamente relacionados ao aumento do potencial produtivo (RUBIRICE, RUBICORN, AVP1, DA1 e TOR) por meio da análise de PCR quantitativo (qPCR). Os genótipos estudados nesse estudo foram BRSMG Curinga, Primavera e Douradão, os quais foram avaliados em um ensaio em casa de vegetação, cultivados sob dois níveis de fertilidade do solo (alta e baixa), em esquema fatorial, no delineamento inteiramente casualizado e com duas repetições.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arabidopsis; Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039417
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Mapa genético para o feijoeiro-comum usando marcadores SNP e a população de RILs Rudá X AND 277. Repositório Alice
SILVA, L. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; CRUZ, C. D.; CARNEIRO, J. E. de S.; CARNEIRO, P. C. S.; FONSECA, C. E. L. da; GONÇALVES, B. F. de S.; BARROS, E. G.; PASTOR-CORRALES, M. A.; SONG, Q.; GREGAN, P. B.; VIANELLO, R. P.; SOUZA, T. L. P. O. de..
Mapas genéticos são úteis ao melhoramento genético, pois permitem visualizar a detecção da associação entre marcadores moleculares do DNA e genes de interesse e, consequentemente, a seleção assistida de locos associados a características qualitativas e quantitativas. Uma grande diversidade de mapas já foi desenvolvida para a cultura do feijoeiro a partir de diferentes tipos de populações e utilizando variadas classes de marcadores moleculares. Entretanto, as populações atuais são de tamanho reduzido, o que compromete a acurácia das estimativas de recombinação entre locos. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi construir um mapa de ligação genética robusto e saturado a partir de 376 RILs de feijão-comum (Phaseolus vulgaris) derivadas do cruzamento...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022498
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Marker-assisted selection integrated to the embrapa common bean breeding program. Repositório Alice
RODRIGUES, L. A.; COELHO, G. R. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; SOUZA, T. L. P. O..
The establishment of a specific Marker-Assisted Selection Facility at the Embrapa Rice and Beans Biotechnology Laboratory, in 2014, has better supported the routine analysis with molecular markers demanded by the Embrapa Common Bean Breeding Program. In addition, it has also supported other Embrapa plant breeding programs, such as rice and cotton.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1047586
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Avaliação da produtividade de arroz de terras altas relacionada com tolerância à deficiência hídrica em condições controladas. Repositório Alice
SANTOS, F. F. dos; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste estudo foi avaliar acessos de arroz de terras altas submetidos ao estresse de deficiência hídrica em casa de vegetação para identificar os genótipos com maior estabilidade de produção.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Resistência a seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066113
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Análise fenotípica para produtividade em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
GARCIA, A. L. B.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho é identificar genes relacionados à produtividade, através da análise de RILs (linhas puras recombinantes) genotipadas por marcadores SNPs.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066201
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Avaliação de acessos da CONFE sob sistema irrigado por aspersão (Phaseolus vulgaris L.) em ambiente de campo. Repositório Alice
SARTORI, D. E. L.; MENDONÇA, J. A.; SOUZA, R. O.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; GUIMARÃES, C. M.; MELO, L. C.; RAMALHO, I..
O objetivo deste estudo foi caracterizar quanto a tolerância à alta temperatura, os acessos de feijão-comum que integram a coleção nuclear de feijão da Embrapa, em experimento de campo
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Irrigação; Banco de germoplasma.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066131
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Análise de QTL para produtividade baseada em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
SILVA, D. R. A.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; CORDEIRO, A. C. C.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve por objetivo identificar genes associados à produtividade por meio da genotipagem por sequenciamento e uma posterior análise de QTL.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: QTL; Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066155
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Expressão relativa de genes homólogos de Arabidopsis em arroz relacionados ao aumento da produtividade. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. A. V. de; ABREU, F. R. M.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo deste estudo foi quantificar a expressão de genes homólogos de arroz (RUBISCO, AVP1, DA1 e TOR), relacionados ao aumento de produtividade em Arabidopsis, por meio da análise de RT-qPCR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arabidopsis; Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066191
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Genome-wide association studies of anthracnose and angular leaf spot resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
PERSEGUINI, J. M. K. C.; OBLESSUC, P. R.; ROSA, J. R. B. F.; GOMES, K. A.; CHIORATO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; GARCIA, A. A. F.; VIANELLO, R. P.; BENCHIMOL-REIS, L. L..
The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Mancha foliar; Antracnose; Colletotrichum lindemuthianum; Genoma.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076304
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Estudo da expressão e validação de genes candidatos induzidos em condições de deficiência hídrica em feijão (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
ARAÚJO, R. B. de; LANNA, A. C.; COELHO, G. R. C.; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste trabalho foi conduzir o experimento de deficiência hídrica em 25 genótipos de feijão, incluindo variedades tradicionais e linhagens/cultivares em ambiente controlado de casa de vegetação, selecionar e avaliar os perfis de expressão de genes candidatos previamente identificados como associados à tolerância à deficiência hídrica e altas temperaturas.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066114
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Physiological characterization of common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes, water-stress induced with contrasting response towards drought. Repositório Alice
LANNA, A. C.; MITSUZONO, S. T.; TERRA, T. G. R.; VIANELLO, R. P.; CARVALHO, M. A. de F..
Among the three annual common bean seasons in Brazil, two of them are subject to drought. The objective of this study was to identify physiological traits in common bean under water restriction. The common beans genotypes, BAT 477 (tolerant to water-stress) and Perola (sensitive to water-stress), were grown under greenhouse conditions under two different watering regimes: irrigated (control treatment) and non-irrigated (stress treatment). The water deficit treatment consisted of suspension of irrigation to the plants at 10 days after emergence (DAE) (at the V2 physiological stage) for 30 days, followed by the irrigation?s re-establishment at 40 DAE (at the R6-R7 physiological stage) up to the phase of physiological maturity of the grains for assessment of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Tropical conditions; Physiological mechanisms; Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistencia a seca; Deficiência hídrica; Características agronômicas; Plant-water relations; Agronomic traits.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037693
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Plantas de arroz geneticamente modificadas com genes homólogos relacionados à tolerância à seca em Arabidopsis. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Este estudo teve como objetivo selecionar dois genes homólogos de arroz, previamente relacionados à tolerância à seca em Arabidopsis, que apresentaram expressão diferencial entre genótipos tolerante e suscetível à seca e, a partir deles, obter plantas geneticamente modificadas mais tolerantes a essa condição.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Planta transgência; Resistência a seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066112
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Análise preliminar de dados de sequenciamento por captura (Capture-seq na identificação de marcadores SNPs associados a tolerância à seca em arroz. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi analisar um conjunto de dados de sequenciamento de captura de 300 genótipos de arroz de terras altas para 2.500 unigenes previamente identificados como relacionados a tolerância à seca na espécie.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular; Resistência à seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066152
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Expression of rice genes homologous of Arabidopsis genes previously related to drought tolerance. Repositório Alice
ABREU, F. R. M.; DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. .J.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
The identification and validation of candidate genes related to traits of interest is a time consuming and expensive process and the homology among genes from different species can facilitate the identification of genes of the target species from the genomic information of a model species. This study aimed to quantify the expression of homologous rice genes previously related to drought tolerance in Arabidopsis. Five genes (CPK6, PLDa, GluR2, CesA8, and EIN2) were identified in rice by the homology of the amino acid sequence between rice and Arabidopsis. The genotypes Douradão (drought tolerant) and Primavera (drought susceptible) were subjected to a water deficit experiment, and subsequently evaluated for gene expression by qPCR for the five homologous...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gene homology; Arroz; Oryza sativa; Acido abscisico; Rendimento; Rice; Abscisic acid; Quantitative polymerase chain reaction; Yields; Arabidopsis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1054691
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