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Nuclear DNA content and separation of Nicotiana sylvestris vegetative and generative nuclei at various stages of male gametogenesis IRD
De Paepe, R.; Koulou, A.; Pham, Jean-Louis; Brown, S.C..
Tipo: Text Palavras-chave: GAMETOGENESE; ANDROGENESE; POLLEN; NOYAU CELLULAIRE; ADN; EMBRYOGENESE; DIPLOIDE; CYTOG ENETIQUE; METHODE D'ANALYSE; EXTRACTION; CYTOPHOTOMETRIE; CYTOMETRIE DE FLUX; MICROPHOTOMETRIE; FLUOROMETRIE.
Ano: 1990 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010024387
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Nuclear DNA content in the subgenus Coffea (Rubiaceae) : inter and intra-specific variation in African species IRD
Cros, Joëlle; Combes, Marie-Christine; Chabrillange, Nathalie; Duperray, C.; Monnot des Angles, A.; Hamon, Serge.
La cytométrie en flux a été utilisée pour estimer la quantité d'ADN nucléaire chez 13 espèces de #Coffea$ (Rubiacea) originaires d'Afrique. Douze espèces diploïdes (#2n$=22) et l'espèce tétraploïde #C. arabica$ (#2n$=44) ont été analysées. Pour 77 génotypes, des populations de noyaux isolés ont été colorées par l'iodure de propidium (IP ; non spécifique des bases). Pour trente neuf génotypes, le 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI; AT spécifique) a été également utilisé. Les quantités 2C d'ADN nucléaire, estimées avec l'IP, oscillent entre 0,95 et 1,78 pg. Trois groupes correspondant à des quantités croissantes d'ADN ont été mis en évidence. Les trois espèces #C. sessiliflora, C. racemosa$ et #C. pseudozanguebariae$ se classent dans le groupe des plus...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; ADN; NOYAU; VARIABILITE; EVOLUTION; CYTOMETRIE EN FLUX; GENOME; VARIATION INTERSPECIFIQUE; VARIATION INTRASPECIFIQUE.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41767
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Nucleotide polymorphisms and an improved PCR-based mtDNA diagnostic for parthenogenetic root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) IRD
Stanton, J.; Hugall, A.; Moritz, C..
L'analyse de séquences de 2212 paires de bases provenant de six ADN mitochondriaux haplotypes très voisins de #Meloidogyne$ (Hugall et al., 1994) a permis de mettre en évidence douze sites nucléotidiens polymorphiques et une délétion. En dépit de cette faible diversité, il existe assez de sites différents d'enzymes de restriction parmi ces séquences pour fournir des tests de diagnostic. En utilisant un choix de ces sites, il a été mis au point un test diagnostique multiplex fondé sur l'amplification en chaîne par polymérase (PCR), test amplifiant simultanément deux étroites régions du génome mitochondrial, et digérant ensuite le produit par HinfI ou MnlI. Ce test diagnostique permet d'identifier les haplotypes - même en mélange - présents chez #M....
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; ADN; POLYMORPHISME GENETIQUE; DIAGNOSE; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE.
Ano: 1997 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010011563
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Origen y microdiferenciación de la población del Archipiélago de Chiloé RChHN
GARCÍA,FEDERICO; MORAGA,MAURICIO; VERA,SOLEDAD; HENRÍQUEZ,HUGO; LLOP,ELENA; OCAMPO,CARLOS; ASPILLAGA,EUGENIO; ROTHHAMMER,FRANCISCO.
Las etnias originarias del archipiélago de Chiloé presentan características culturales que plantean preguntas acerca de su origen como entidad genética independiente y distinta del grupo continental. Al respecto, hemos caracterizado las frecuencias de los cuatro haplogrupos amerindios fundadores del ADN mitocondrial en cuatro poblaciones del archipiélago. El componente aborigen materno de estas poblaciones fue superior al 90 %. El análisis de distancias genéticas sugiere una segregación norte-sur en donde las poblaciones septentrionales aparecen más relacionadas con la etnia continental Huilliche. Aún cuando el análisis de diferenciación interpoblacional y de componentes principales muestran una singularidad en el grupo insular, ésta puede ser interpretada...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Chiloé; Diversidad étnica; Diversidad genética humana; ADN.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-078X2004000300012
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Pathogenomics of Listeria spp. Inra
Hain, T.; Chatterjee, S. S.; Ghai, R.; Kuenne, C. T.; Billion, A.; Steinweg, C.; Domann, E.; Kärst, U.; Jänsch, L.; Wehland, J.; Eisenreich, W.; Bacher, A.; Joseph, B.; Schär, J.; Kreft, J.; Klumpp, J.; Loessner, M. J.; Dorscht, J.; Neuhaus, K.; Fuchs, T. M.; Scherer, S.; Doumith, M.; Jacquet, C.; Martin, P.; Cossart, P.; Rusniock, C.; Glaser, P.; Buchrieser, C.; Goebel, W.; Chakraborty, T..
This review provides an overview of recent progress in the exploration of genomic, transcriptomic, and proteomic data in Listeria spp. to understand genome evolution and diversity, as well as physiological aspects of metabolism utilized by the bacteria when growing in diverse and varied environments.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: LISTERIA; BACTERIE; GENOME; ADN; GENOMIQUE; TRANSCRIPTOMIQUE; PROTEOMIQUE; METABOLISME; IMPACT DE L'ENVIRONNEMENT; DIVERSITE; EXPRESSION DES GENES; BACTERIE PATHOGENE; PATHOGENICITE; VARIABILITE LISTERIA; GENOMIC; TRANSCRIPTOMIC; PROTEOMIC; BACTERIOPHAGE; METABOLISM.
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20097b41fd4e&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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PATRONES GENÉTICOS DE LOS CULTIVARES DE VIDES DE VINIFICACIÓN MÁS COMÚNMENTE USADOS EN CHILE BASADOS EN MARCADORES DE MICROSATÉLITES Agricultura Técnica
Narváez H.,Claudio; Castro P.,M. Herminia; Valenzuela B.,Jorge; Hinrichsen R.,Patricio.
La industria chilena del vino se ha modificado substancialmente en las últimas décadas, predominando la plantación de los denominados "cultivares finos" sobre los tradicionales, como la cepa País. Por otra parte, la globalización de los mercados ha resaltado la necesidad de certificar la identidad genética y pureza de los cultivares, que hasta hace poco tiempo se realizó exclusivamente mediante ampelografía. El análisis directo del ADN ha permitido el desarrollo de nuevas y poderosas herramientas analíticas, como las secuencias de mini- y microsatélites, actualmente usadas como marcadores moleculares para diferentes fines. En este trabajo se presenta la caracterización genética de los cultivares de vides de vinificación más comúnmente usados en Chile. Para...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Variedades de uva vinífera; ADN; Polimorfismo.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072001000300001
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PCR-RFLP and sequencing analysis of ribosomal DNA of Bursaphelenchus nematodes related to pine wilt disease IRD
Iwahori, H.; Tsuda, K.; Kanzaki, N.; Izui, K.; Futai, K..
La réaction en chaîne des polymérases/polymorphisme des fragments de restriction (PCR-RFLP) a été utilisée pour séparer des isolats du nématode #Bursaphelenchus$. Les isolats de #B. xylophilus$ examinés provenaient du Japon, des USA, de Chine et du Canada, et ceux de #B. mucronatus$ du Japon, de Chine et de la France. L'ADN ribosomal contenant le gène 5.8S, les segments de transciption interne 1 et 2, et les segments partiels des gènes 18S et 28S ont été amplifiés par PCR. La digestion des produits amplifiés provenant de chaque isolat à l'aide de douze endonucléases de restriction et l'examen des données en RFLP qui en découlent révèlent, par une analyse en grappe, une séparation significative entre #B. xylophilus$ et #B. mucronatus$. Parmi les isolats de...
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; ANALYSE GENETIQUE; ADN; TECHNIQUE PCR; TECHNIQUE RFLP; GENETIQUE DE POPULATION; TAXONOMIE.
Ano: 1998 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010017647
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Phyllody of faba bean in the Sudan. II. - Detection of the disease by light microscopy: fluorescence, bright field, interference contrast and observation of MLOs by transmission electron microscopy Inra
Dafalla, G.A.; Cousin, M.T..
Plusieurs techniques de microscopie photonique en fluorescence et en lumière normale ainsi que de microscopie électronique ont été utilisées pour détecter les MLO à l’intérieur des tubes criblés de la féverole atteinte de phyllodie. Un fluorochrome spécifique de l’ADN, Bisbenzimid H 33258 ou réactif de Hoechst, a donné des résultats satisfaisants quel que soit le mode de préparation du matériel végétal : tissu frais coupé au cryostat, tissu fixé et inclus dans la paraffine ou dans l’historésine. Les coupes préparées à partir de matériel frais ont permis l’indexage rapide de l’infection alors que l’inclusion dans la paraffine et surtout dans l’historésine a l’avantage de faciliter la caractérisation des structures anatomiques des tissus. L’historésine...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PHYLLODIE; MICROSCOPIE PHOTONIQUE; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE; TRANSMISSION; CONTRASTE INTERFERENTIEL; FLUORESCENCE; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE A TRANSMISSION; ADN; PARAFFINE; HISTORESINE; COUPE; COLORATION; TECHNIQUE ANALYTIQUE.
Ano: 1988 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009274ee1bc&uri=/notices/prodinra1/2009/09/
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Population genetics of genes with chromosomal inversions in the Anopheles gambiae complex IRD
Dickerman, A.W.; Fontenille, Didier; Hawley, W.A.; Kidwell, M.G..
Tipo: Text Palavras-chave: PALUDISME; SPECIATION; CHIMIOTAXONOMIE; GENIE GENETIQUE; DISTANCE GENETIQUE; ADN; CHROMOSOME; POLYMORPHISME GENETIQUE; MOUSTIQUE; HEMATOZOAIRE.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010018050
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Programme Herpèsvirus. Synthèse des travaux réalisés au Laboratoire IFREMER de La Tremblade - Mars 1996 - Février 1997 ArchiMer
Renault, Tristan; Le Deuff, Rose-marie; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Haffner, Philippe.
Ce rapport représente la synthèse des travaux réalisés de mars 1996 à février 1997 au laboratoire de Génétique, Aquaculture et Pathologie de la station IFREMER de La Tremblade, dans le cadre de l'étude du virus de type herpès observé chez les huîtres et de la mise au point de méthodes de diagnostic. La majorité des travaux rapportés ici de façon complète, a déjà fait l'objet de comptes rendus intermédiaires.
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Herpèsvirus; Herpesviridae; Huître creuse; Crassostrea gigas; Huître plate; Ostrea edulis; Virus; Détection; ¨Protocole; ADN; PCR.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00165/27663/25838.pdf
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Protocolos De Laboratorio - Laboratorio De Genética Molecular Aplicada Del CIMMYT AgEcon
Tercera Edicion
Tipo: Report Palavras-chave: Inmunoensayos de quimioluminiscencia; ADN; Hibridación del ADN; Marcadores moleculares; PCR; RAPD; RFLP; Research and Development/Tech Change/Emerging Technologies; F30.
Ano: 2006 URL: http://purl.umn.edu/56183
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Purification et étude structurale du virus du Coléoptère Oryctes rhinoceros L. IRD
Monsarrat, Pierre; Veyrunes, J.C.; Meynadier, G.; Croizier, G.; Vago, C..
Tipo: Text Palavras-chave: ENTOMOLOGIE APPLIQUEE; INSECTE NUISIBLE; LUTTE BIOLOGIQUE; VIRUS; PURIFICATION; METHODOLOGIE; ULTRASTRUCTURE; ADN; ETUDE EXPERIMENTALE; COCOTIER; ORYCTES RHINOCEROS.
Ano: 1973 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:06474
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Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis : a tool for rapid characterization of Fusarium oxysporum f. sp. albedinis isolates ? IRD
Fernandez, Diana; Tantaoui, A..
Tipo: Text Palavras-chave: CHAMPIGNON PARASITE; PATHOLOGIE VEGETALE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; ADN; ANALYSE; IDENTIFICATION; RAPD.RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA; PALMIER DATTIER; DIVERSITE GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41228
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Recherche d'AND d'herpèsvirus infectant les bivalves dans des échantillons d'eau de claires ostréicoles ArchiMer
Solliec, Gaëlle; Vigneron, Valérie; Montanie, Hélène; Renault, Tristan.
Viral particles, associated with high mortality rates, have been reported among larvae and juveniles in different marine bivalve specie and characterized as member of the Hespesviridae family. Most studies focused on the detection of such viral infections among economically important species. However, the persistence of bivalve herpes viruses in marine environment is poorly documented. This topic appears as an important research domain in order to clarify the natural infection cycle of the herpesvirus of marine bivalves.
Tipo: Text Palavras-chave: Herpesviridae; Oyster; PCR; DNA; Herpesvirus; Huître; PCR; ADN.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2856.pdf
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Reevaluating the classification of Halobacteroides and Haloanaerobacter species based on sequence comparisons of the 16S ribosomal RNA gene IRD
Patel, B.K.C.; Andrews, K.T.; Ollivier, Bernard; Mah, R.A.; Garcia, Jean-Louis.
The 16S rRNA gene (rDNA) sequence analysis of four halophilic anaerobes : #Halobacteroides halobius$, #H. lacunaris$, #Haloanaerobacter (Hb.) chitinovorans$ and #H. acetoethylicus$ confirmed that they were all members of the family #Haloanaerobiaceae$. #H. lacunaris$ and #H. halobius$ were found to be more closely related to each other and were distantly related to #Sporohalobacter lortetti$ and the members of the genera #Haloanaerobium$ and #Halothermothrix$. These data are in agreement with their assignment to the genus #Halobacteroides$. Further analysis indicated that #Hb. chitinovorans$ was closely affiliated to members of the genus #Halobacteroides$, and therefore we propose to transfer it to the genus #Halobacteroides$ as #H. chitinovorans$ comb....
Tipo: Text Palavras-chave: FERMENTATION; BACTERIOLOGIE; BACTERIE; ADN; TAXONOMIE.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010006015
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Reliable flow cytometric estimation of nuclear DNA content in coffee trees IRD
Barre, Philippe; Noirot, Michel; Louarn, Jacques; Duperray, C.; Hamon, Serge.
La cytométrie en flux a permis d'obtenir des mesures précises de la taille des génomes de deux taxons (#C. liberica dewevrei$ et #C. pseudozanguebariae$). L'iodure de propidium (IP) et le #Petunia hybrida$ ont été utilisés, respectivement, comme fluorochrome et standard interne. La linéarité de la relation entre la quantité d'ADN et le signal fluorescent digitalisé a été vérifiée. Cinq résultats majeurs ressortent : des conditions expérimentales optimales ont été définies pour l'estimation de la position des pics (moyenne et mode), le temps de coloration (au moins deux minutes), le voltage du photomultiplicateur (557 V) et de la concentration en IP (330 microg/ml) ; les effets du voltage et de la concentration en IP ont été paramétrés ; deux biais dus aux...
Tipo: Text Palavras-chave: BOTANIQUE; GENETIQUE; GENOTYPE; NOYAU CELLULAIRE; ADN; CYTOGENETIQUE; ANALYSE STATISTIQUE; CYTOTAXONOMIE.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010006011
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Replication of the densovirus of Casphalia extranea (Lepidoptera Limacodidae) on an established cell line IRD
Fédière, Gilles; Léry, Xavier; Quiot, J.M.; Monsarrat, Pierre.
Les larves du Lépidoptère #Casphalia extranea$ ravagent périodiquement les plantations de palmier à huile et de cocotier en Côte d'Ivoire. Le principal agent pathogène capable de réguler les populations de ce ravageur est un densovirus (#Parvoviridae$). En dehors de son hôte, ce virus se multiplie dans la lignée cellulaire SPC BM40 de #Bombyx mori$. Le taux de multiplication du virus en culture in vitro est de 10 au bout de 15 jours. C'est la première fois qu'un densovirus se reproduit en lignée cellulaire. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: ENTOMOLOGIE APPLIQUEE; PLANTE CULTIVEE; INSECTE NUISIBLE; LARVE; DYNAMIQUE DE POPULATION; VIRUS ENTOMOPATHOGENE; REPRODUCTION; ADN; CULTURE IN VITRO; PALMIER A HUILE; COCOTIER; DENSOVIRUS; LIGNEE CELLULAIRE; TRANSFECTION.
Ano: 1990 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:31797
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Restriction endonuclease analysis and diagnosis of the granulosis virus isolated from Spodoptera littoralis Boisd. in West Africa and multiplied in Egypt IRD
Abol Ela, S.; Fédière, Gilles; Nour El Din, A.; Khamiss, O.; Salah, M..
Tipo: Text Palavras-chave: VIRUS ENTOMOPATHOGENE; INSECTE NUISIBLE; VIROSE; ETUDE COMPARATIVE; ADN; DIAGNOSTIC EPIDEMIOLOGIQUE; ENDONUCLEASE; ELECTROPHORESE SUR GEL; AGAROSE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41348
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Restriction map of the Casphalia extranea densovirus genome IRD
Fédière, Gilles; Herder, S.; Kouassi, K.N.; Léry, Xavier; Dauthuille, Dominique; Bergoin, M..
Tipo: Text Palavras-chave: INSECTE; VIRUS; ADN; ANALYSE; CARTE; GENOME; DENSOVIRUS.
Ano: 1991 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:36384
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Rodents of the sunrise : mitochondrial DNA phylogenies of Polynesian Rattus exulans and the settlement of Polynesia IRD
Matisoo-Smith, E.; Allen, J.S.; Roberts, R.M.; Irwin, G.J.; Lambert, D.M..
Cet article présente une approche biologique originale du peuplement et de la mobilité humaine en Polynésie à travers l'étude d'un animal qui fut transporté à travers le Pacifique par les anciens polynésiens. Nous sommes convaincus que l'étude de la variation génétique du rat polynésien (#Rattus exulans$) permet de dresser un modèle phylogénétique du peuplement initiale et de la mobilité ultérieure. Les phylogènes ADN de 92 séquences mitochondriales de #Rattus exulans$ originaires de Polynésie orientale sont présentés. Les résultats de l'étude indiquent que toutes les populatoins orientales de #Rattus exulans$ sont originaires du sud des îles Cook et des îles de la Société, que #Rattus exulans$ à Hawaï a deux origines et que #Rattus exulans$ a des origines...
Tipo: Text Palavras-chave: HISTOIRE DU PEUPLEMENT; COLONISATION; MOBILITE SPATIALE; RAT; VARIATION; GENETIQUE; ADN; MITOCHONDRIE; PHYLOGENIE.
Ano: 1999 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010020751
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