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Transcriptome profiling of wild Arachis from water-limited environments uncovers drought tolerance candidate genes. Repositório Alice
BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ARAUJO, A. C. G.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; SILVA, A. K.; MARTINS, A. C. Q.; VINSON, C. C.; SANTOS, C. M. R.; BONFIM, O.; TOGAWA, R. C.; SARAIVA, M. A. P.; BERTIOLI, D. J.; GUIMARAES, P. M..
Peanut (Arachis hypogaeaL.) is an important le-gume cultivated mostly in drought-prone areas where its pro-ductivity can be limited by water scarcity. The development of more drought-tolerant varieties is, therefore, a priority for pea-nut breeding programs worldwide. In contrast to cultivated peanut, wild relatives have a broader genetic diversity and constitute a rich source of resistance/tolerance alleles to biotic and abiotic stresses. The present study takes advantage of this diversity to identify drought-responsive genes by analyzing the expression profile of two wild species, Arachis duranensis and Arachis magna (AA and BB genomes, respectively), in response to progressive water deficit in soil. Data analysi from leaves and roots of A. duranensis...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Amendoim; Resistência a seca; Gene tolerante; Cultura resistente a seca; Biologia molecular; SSHlibraries; 454 Sequencing; Differential gene expression; Dry-down; Peanut wild relatives; QRT-PCR.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035448
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Genetic linkage mapping applied to the generation of tools for breeding purposes and genetic dissection of grapevine agronomical traits at Embrapa Uva e Vinho. Repositório Alice
BUFFON, V.; IRALA, P. B.; COSTENARO-DA-SILVA, D.; LAMPE, V. S.; PORTO, D. D.; MACHADO, C. A. E.; CZERMAINSKI, A. B. C.; GARRIDO, L. da R.; OLIVEIRA, P. R. D. de; WELTER, L. J.; CAMARGO, U. A.; REVERS, L. F..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Dissecação; Mapeamento; Ferramenta; Viticultura; Uva; Biologia molecular; Melhoramento genético; Reprodução; Tecnologia.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/978985
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Manual de utilização de marcadores moleculares para análise de diversidade genética. Infoteca-e
BUSO, G. S. C.; YAMAGUISHI, A. T.; AZEVEDO, V. C. R.; LEÃO, D. A.; FERREIRA, M. A.; MORETZSOHN, M. de C.; AMARAL, Z. P. de S.; MAZZUCATO, A..
2009
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biologia molecular; Marcador molecular.
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007719
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Characterization of Tomato yellow spot virus, a novel tomato-infecting begomovirus in Brazil Repositório Alice
CALEGARIO, R.F.; FERREIRA, S. de S.; ANDRADE, E.C. de; ZERBINI, F.M..
The objective of this work was the biological and molecular characterization of a begomovirus detected in São Joaquim de Bicas, Minas Gerais, Brazil, named TGV-[Bi2], by determining its host range, complete nucleotide sequence and phylogenetic relationships with other begomoviruses. Biological characterization consisted of a host range study using either sap inoculation or particle bombardment as inoculation methods. The yellow spot virus can infect plants in Solanaceae and Amaranthaceae, including economically importat crops as sweet pepper, and weeds as Datura stramonium and Nicotiana silvestris. For the molecular characterization, the full-length genome (DNA-A and DNA-B) was amplified, cloned and completely sequenced. Sequence comparisons and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Lycopersicon esculentum; Bemisia tabaci; ToYSV; Molecular biology; Whitefly; Biologia molecular; Geminivírus; Mosca-branca.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122814
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Novas perspectivas para adaptação de culturas ao cerrado. Repositório Alice
CANCADO, G.M.A.; CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; PURCINO, A. A. C.; GUIMARAES, C. T.; ALVES, V. M. C.; PARENTONI, S. N.; SOUZA, I. R. P. de; PAIVA, E..
2001
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cerrado; Biologia molecular; Aluminio; Savanna; Molecular biology; Aluminum.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/485188
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Assessment of phenotypic indexes for aluminum tolerance in maize using nutrient solution. Repositório Alice
CANCADO. G.M.A.; MARTINS, P.R.; PARENTONI, S. N.; OLIVEIRA, A.B.; LOPES, M.A..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Aluminio; Tolerancia; Cerrado; Biologia molecular; RFLP; Aluminium; Tolerance; Savanna; Soil; Molecular biology.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/483530
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Evaluation of the effectiveness of killer toxins produced by some strains of yeasts against other strains killer. Repositório Alice
CANOSSA, S.; AGUSTINI, B. C.; SILVA, G. A. da.
To make the wine, you do not need killer strains used for the purpose of dominance. It is only necessary that the yeasts are neutral. The aim of this study was to evaluate the effectiveness of killer toxins produced by some strains to produce a lethal effect on other strains killer. The experiments were conducted using the medium must Lorena M80: 20 with methylene blue. The killer test strains used were: 7M, 12M, 24M, 25M and 30M isolated from grape berries derived from the cultivar Merlot municipality of Pinto Bandeira (RS, Brazil). These strains were tested against other strains isolated killer Pinto Bandeira, they being the 3CF lineage derived from the cultivar Cabernet Franc, and the 24A strain isolated from cultivar Ancelota,; and also against strains...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Saccharomyces cerevisiae; Levedura; Viticultura; Vinho; Fermento; Fermentação; Linhagem; Biologia molecular; Genética; Viticulture; Grapes; Genetics; Molecular biology; Yeasts.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000945
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Identificação de genes das famílias protéicas CBL e CIPK a partir de análises in silico da base de dados do genoma café. Repositório Alice
CARMO, J. R.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Base de dados; Genoma café.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188552
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Tipos de marcadores e genômica de plantas. Repositório Alice
CARNEIRO, N. P.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V..
Plant breeding relies on genetic variation and selection to gradually improve plants for traits that are of interest to the grower and the consumer. This variability has been in part assessed through an efficient use of the available germplasm. Although breeding efforts have continuously produced improved varieties throughout the years, recent developments in the field of biotechnology and molecular biology can now be employed to facilitate and speed up cultivar development. These methods are mainly DNA-based techniques and basically use the hybridization of cloned probes to detect genomic sequences that are polymorphic for internal restriction sites, such as in restriction fragment length polymorphisms, or on the amplification of DNA fragments using the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento de plantas; Biologia molecular; Genetica molecular.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/489101
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Processo para a obtenção de plantas transgênicas de algodão utilizando o gene ahas que confere tolerãncia ao herbicida Imazapyr. Repositório Alice
CARVALHEIRA, S. B. R.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189036
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Effect of dicamba and AgNO3 on friable calli prodution in maize (Zea mays). Repositório Alice
CARVALHO, C. H. S.; BORDALO, P. N.; ABREU, N. L.; PAIVA, E..
1993
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Biotecnologia; Biologia molecular; Producao; Zea mays; Maize; Biotechnology; Production; Dicamba.
Ano: 1993 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/482782
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Estudo sobre a viabilidade da produção de linhagens de milho por meio de cultura de anteras. Repositório Alice
CARVALHO, C.H.S.; ANGELO, P.C. da S.; MAGNAVACA, R.; GAMA, E.E.G.e..
Este trabalho foi conduzido com os objetivos de estabelecer protocolos para o cultivo de anteras de milho, in vitro, visando a producao de linhagens; e avaliar a possibilidade da incorporacao dessa tecnica em um programa de melhoramento. Foram testados 37 genotipos de milho. A metodologia utilizada inclui a determinacao do estadio de desenvolvimento dos microsporos, mediante coloracao com carmim propionico; um teste de viabilidade de microsporos, pela reacao da fluorescencia enzimaticamente induzida; o pre-tratamento de pendoes a 8,0 C; o plaqueamento das anteras, em posicao lateral, sobre tres tipos de meio; e a incubacao das placas no escuro ou sob fotoperiodo de 16 horas, a 26 +/- 1C. Para a regeneracao de plantas, os calos foram transferidos para um...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Milho in vitro; Anteras; Cultivo; Producao; Linhagens; Biologia molecular; Biotecnologia; Zea mays; Maize; Molecular biology; Biotechnology; Plant in vitro; Production; Anther.
Ano: 1995 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/475980
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Caracterização de isolados de Claviceps spp., obtidos de Sorghum bicolor e gramíneas forrageiras, no Brasil. Repositório Alice
CHAVES, Z.M.; GOMES, E. A.; MARRIEL, I. E.; CASELA, C.R.; FERREIRA, A.S.; PFENNING, L.H..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sorgo; Doença; Biologia molecular; Claviceps spp; Sphacelia sp.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/488107
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Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. Repositório Alice
CINTRA, L. C.; CINTRA, L..
Recently news technologies in molecular biology enormously improved the sequencing data production, making it possible to generate billions of short reads totalizing gibabases of data per experiment. Prices for sequencing are decreasing rapidly and experiments that were impossible in the past because of costs are now being executed. Computational methodologies that were successfully used to solve the genome assembler problem with data obtained by the shotgun strategy, are now inefficient. Efforts are under way to develop new programs. At this moment, a stabilized condition for producing quality assembles is to use paired-end reads to virtually increase the length of reads, but there is a lot of controversy in other points. The works described in literature...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Genomas de eucariotos; Biologia molecular; Bioinformática; Genome; Eukaryotic cells; Molecular biology; Bioinformatics.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908741
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Construção de biblioteca de cDNA e clonagem do gene da enzima Ä6-desaturase de ácidos graxos poliinsaturados ômega-3 da microalga marinha Thalassiosira fluviatilis. Repositório Alice
CITADIN, C.T.; ALMEIDA, E. R. P.; DERNER, R. B.; MARTINS, N. F.; MONTE, D. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Thalassiosira fluviatilis; Microalga marinha; Biblioteca de cDNA; Clonagem; Gene da enzima Ä6-desaturase.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187636
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Engenharia genética: conceitos básicos, ferramentas e aplicações. Infoteca-e
CORDEIRO, M. C. R..
ABSTRACT: Basic concepts and methodologies concerning genetic engineering are presented in this review and is directed to people or professionales not familiarized to it. Moreover, it can be a document to clarity what is genetic engineering, the importance of its contributions to modern agriculture, medicine or livestock research and to support discussions on genetic research ethics. Covers information on structure of nucleic acids, types, functions and main processes such us DNA duplication, transcription and traduction. Important methodologies are covered about DNA/RNA extraction, electrophoresis, PCR, nucleic acid libraries production, cloning, sequencing, gene characterization in connection to main historical events of genetic engineering. It...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Engenharia genética; Biotecnologia; Marcador genético; DNA; RNA; Ácido nucléico; Gene; Biologia molecular; Clonagem; Transgênico; Genetic engineering; Biotechnology; Genetic markers; Nucleic acids; Genes; Molecular biology; Cloning; Transgenic.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/568132
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Diagnóstico molecular para o nematóide Rotylenchulus reniformis. Infoteca-e
CORDEIRO, M. C. R.; GOULART, A. M. C.; COSTA, A. M.; SHARMA, R. D..
2008
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biologia molecular; Nematóide; Rotylenchulus reniformis; Molecular biology; Nematoda.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/571879
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Similaridade genética da cultivares de mandioca (Manihot esculenta) por meio de marcadores RAPD. Repositório Alice
COSTA, M. R.; CARDOSO, E. R.; OHAZE, M. M. M..
O objetivo deste trabalho foi analisar a divergência genética entre 27 acessos de mandioca provenientes do banco ativo de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental. Foram utilizados 12 primers, onde todos apresentaram polimorfismo. Foram analisadas 73 bandas polimórficas de um total de 211 bandas amplificadas. A análise de divergência genética foi realizada a partir do programa NTSYS-pc, 2.02, utilizando o coeficiente de Jaccard. Na análise do dendograma, foram observados dois grupos principais. No primeiro grupo, que se subdividiu em dois subgrupos, com coeficiente de similaridade, variando de 8% a 78%, incluem-se 20 materiais, oriundos de diferentes localidades. O segundo grupo dividiu-se em dois subgrupos, com similaridade genética, variando de 9% a 38%....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mandioca; Cultivar; Diversidade genética; Biologia molecular; Marcadores moleculares; RAPD; Banco Ativo de Germoplasma; Belém; Pará; Amazônia; Brasil.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/406846
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Biologia molecular aplicada aos recursos genéticos. Repositório Alice
COSTA, M. R. T. da R.; BONFIM, K.; NASCIMENTO, S. V. do..
Este trabalho tem como objetivo descrever algumas das metodologias de biologia molecular utilizadas no Laboratório de Genética da Embrapa Amazônia Oriental (LABGEN) e Laboratório de Fitopatologia, visando à identificação, classificação e conservação de recursos genéticos, levando-se em consideração as peculiaridades observadas. É uma abordagem prática, sendo que os protocolos apresentados são passíveis de alteração pelo usuário, conforme as particularidades do seu trabalho e necessitam do máximo de critério para a execução.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DNA; Biologia molecular; Genética.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/922492
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Construção e análise de uma biblioteca subtrativa de cDNAs de plantas Coffea arabica inoculada com o nematóide da galha Meloidogyne paranaensis. Repositório Alice
COSTA, P. M.; BARROS, E. V. S. A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; MARTINS, N. F.; PAES, N. S.; MEHTA, A.; GROSSI-DE-SÁ, M. F..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Coffea arabica; Biblioteca subtrativa de cDNAs; Inoculação; Nematóide da galha; Meloidogyne paranaensis.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188527
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