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Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. Repositório Alice
CINTRA, L. C.; CINTRA, L..
Recently news technologies in molecular biology enormously improved the sequencing data production, making it possible to generate billions of short reads totalizing gibabases of data per experiment. Prices for sequencing are decreasing rapidly and experiments that were impossible in the past because of costs are now being executed. Computational methodologies that were successfully used to solve the genome assembler problem with data obtained by the shotgun strategy, are now inefficient. Efforts are under way to develop new programs. At this moment, a stabilized condition for producing quality assembles is to use paired-end reads to virtually increase the length of reads, but there is a lot of controversy in other points. The works described in literature...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Genomas de eucariotos; Biologia molecular; Bioinformática; Genome; Eukaryotic cells; Molecular biology; Bioinformatics.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908741
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Construção de baculovirus recombinante ocluso positivo contendo o inibidor alpha-amilase BIII de centeio. Repositório Alice
SISSON, D.; SIHLER. W.; DIAS, S. C.; SOUZA, M. L..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Baculovirus; Anthonomus grandis; Alpha-amilase; Gene BIII; Centeio.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188540
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Construçâo de baculovirus recombinantes contendo o gene da renina. Repositório Alice
MENDES, D. N.; NEVES, F. A. R.; SIMEONI, L. A.; SIHLER, W.; SOUZA, M. L..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Baculovirus recombinantes; Gene da renina.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187261
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Construção de biblioteca de cDNA e clonagem do gene da enzima Ä6-desaturase de ácidos graxos poliinsaturados ômega-3 da microalga marinha Thalassiosira fluviatilis. Repositório Alice
CITADIN, C.T.; ALMEIDA, E. R. P.; DERNER, R. B.; MARTINS, N. F.; MONTE, D. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Thalassiosira fluviatilis; Microalga marinha; Biblioteca de cDNA; Clonagem; Gene da enzima Ä6-desaturase.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187636
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Construção de macroarranjos de DNA, a partir do unigene café, para a identificação de genes de interesse agronômico. Repositório Alice
VINECKY, F.; BRITO, K. M.; VIEIRA, N. G.; FERREIRA, D. L. A.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Café; Unigene; Macroarranjos de DNA; Construção.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188500
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Construção de vetores binários com os genes Tar1 e cpti e transformação de Nicotiniana tabacum visando resistência a nematóides fitoparasitas. Repositório Alice
PASCOAL, A. V.; BERTIOLI, D.; MONTE, D. C..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189175
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Construção de vetores para transformação genética de algodoeiro visando resistência à insetos-praga. Repositório Alice
LOURENÇO, I. T.; FRAGOSO, R. R.; ROCHA, T. L.; ELPÍDIO, W.; GROSSI-DE-SÁ, M. F..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Algodão; Construção de vetores; Transformação genética; Resistência à insetos-praga.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188525
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Construção e análise de uma biblioteca subtrativa de cDNAs de plantas Coffea arabica inoculada com o nematóide da galha Meloidogyne paranaensis. Repositório Alice
COSTA, P. M.; BARROS, E. V. S. A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; MARTINS, N. F.; PAES, N. S.; MEHTA, A.; GROSSI-DE-SÁ, M. F..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Coffea arabica; Biblioteca subtrativa de cDNAs; Inoculação; Nematóide da galha; Meloidogyne paranaensis.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188527
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Contribuição à filogenia de abelhas Melipona com uso de sequências parciais da região ITS1 do nrDNA. Repositório Alice
BOMFIM, I. G. A.; FREITAS, B. M.; VENTURIERI, G. C.; JORGE, D. M. de M.; LOBO, M. D. P.; TORRES, D. C.; GRANGEIRO, T. B..
O objetivo deste estudo foi investigar, por meio de dados moleculares de sequências de DNA, as relações filogenéticasde abelhas indígenas sem ferrão do táxon Melipona nativas do Brasil. Procurou-se, assim, fornecersubsídios para facilitar uma futura revisão taxonômica sobre esse grupo de abelhas. Sequências parciais daregião do espaçador transcrito interno I (ITS1) do DNA ribossômico nuclear (nrDNA) foram obtidas de espécimesde M. flavolineata, M. mondury e M. fasciculata, coletados em estados do Norte, Nordeste e Sudestedo Brasil. O alinhamento múltiplo das sequências geradas em conjunto com outras 25 do gênero Melipona,depositadas no GenBank ou publicadas em artigos científicos por outros autores, apresentou 141 caracteresalinhados, com uma distância...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Sequenciamento automático; Reconstrução filogenética; Abelhas sem ferrão; Meliponicultura; Molecular biology; Automated sequencing; Phylogenetic reconstruction; Stingless bees.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017063
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Descrição de seqüências homólogas ao gene homeótico Agamous em Brachiaria brizantha. Repositório Alice
GUIMARÃES, L. A.; SILVEIRA, E. D.; DUSI, D. M. A; CARNEIRO, V. T. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Brachiaria brizantha; Gene homeótico Agamous; Seqüências homólogas.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188531
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Desenvolvimento de protocolo para transformação genéticade plantas utilizando fragmentos de DNA. Repositório Alice
VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189020
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Desenvolvimento de sistema para obtenção de plantas de feijão resistentes ao vírus do mosaico dourado do feijoeiro. Repositório Alice
JUNGMANN, L. C.; ALBINO, M. M. C.; DIAS, B. B. A.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; FARIA, J. C.; ARAGÃO, F. J. L..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189022
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Desenvolvimento de um método rápido, eficiente e de baixo custo para extração de DNA de artrópodos. Repositório Alice
MEGA, N. O.; REVERS, L. F..
Aqui, é apresentado um método rápido e eficiente para obtenção de DNA de boa qualidade a partir de pequenas amostras de tecidos de artrópodos, gerando pequenas quantidades de resíduos perigosos. Comparamos a eficiência do método com outro protocolo caseiro utilizando fenol e com dois kits comerciais. A qualidade do DNA obtido foi verificada em espectrofotômetro e avaliada por um ensaio de AFLP. Foi obtido DNA pouco fragmentado a partir de todas as amostras, mas as melhores leituras foram obtidas para o DNA extraído com o novo método. O ensaio de AFLP indicou que os DNAs obtidos estavam adequados para uso em técnicas de biologia molecular sensíveis a contaminantes. Porém, os protocolos caseiros foram mais eficientes em extrair DNA do que kits comerciais,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: AFLP; Extração genética; Biologia molecular; Artropoda; Inseto; DNA; Genética.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/904233
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Desenvolvimento e análise de polimorfismo de microssatélites tetra e pentanucleotídeos em três espécies de Eucalyptus. Repositório Alice
SANSALONI, C. P.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Eucalyptus; Polimorfismo; Microssatélites tetra; Pentanucleotídeos.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188535
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Detecting levels of autozygosity in two pure lines of pigs using genomic and pedigree data. Repositório Alice
ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; CARDOSO, F. F.; FREITAS, L.; OTAVIANO, A.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Avicultura; Biologia molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1013818
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Diagnóstico molecular para o nematóide Rotylenchulus reniformis. Infoteca-e
CORDEIRO, M. C. R.; GOULART, A. M. C.; COSTA, A. M.; SHARMA, R. D..
2008
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biologia molecular; Nematóide; Rotylenchulus reniformis; Molecular biology; Nematoda.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/571879
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DIVERGÊNCIA GENÉTICA ENTRE DOZE GENÓTIPOS DE ABACAXIZEIRO (Ananas comosus L, Merril.) ESTIMADA POR ANÁLISE DE MARCADORES RAPD Rev. Bras. Frutic.
PEREIRA,CÍCERO DONIZETE; KERR,WARWICK ESTEVAM.
Por meio de estudos moleculares, este trabalho determinou a distância genética entre 12 genótipos de A. comosus por marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), utilizando 11 "primers" decâmeros da OPERON Technologies Inc. Dos 12 genótipos , 1 foi proveniente da Jamaica, 2 do Estado do Acre (Quinari e RBR-1), 2 do Estado do Maranhão (Turiaçu e São Domingos), 3 do Estado do Piauí (Cefas, Floriano-1 e Floriano-2), 2 do Estado da Bahia (Monte Alegre-1 e Monte Alegre-2) e 2 de Minas Gerais (Pérola e Smouth Cayenne). Pela análise de "cluster", utilizando o método de UPGMA, foi constatada uma grande divergência entre os genótipos de A. comosus estudados com a separação destes em dois grupos a uma distância genética de 31,1%.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biologia molecular; Caracterização molecular.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452001000200027
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Diversidade genética de populações de Cotesia flavipes (Hymenoptera: Braconidae) no Brasil. Repositório Alice
SMANIOTTO, G.; BERTO, R. M.; NAVA, D. E..
bitstream/item/165789/1/Dori-livro-siconbiol-2017-completo.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Controle biológico; DNA genômico.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078446
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Dormancy-related transcript accumulation of the dehydrin gene family in apple buds. Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; FALAVIGNA, V. S.; PORTO, D. D.; MARGIS-PINHEIRO, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão genética; RT-qPCR; Fruticultura; Maçã; Dormência; Genética; Biologia molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/978972
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Efeito da 5-azacitidina na regeneração e transformação genética de eucalipto (Eucalyptus grandis x E. urophylla). Repositório Alice
SARTORETTO, L. M.; ESMERALDO, M. V.; DEUS, S. 0.; BRASILEIRO, A. C. M..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189024
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