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Análise in silico da expressão gênica de citocromo p450 relacionada ao metabolismo de diterpenos em Coffea. Repositório Alice
IVAMOTO, S. T.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; ALVES, L. C.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Diterpenos; Cafestol; Caveol; Cyt P450.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880428
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Identificação e caracterização de microssatélites provenientes de sequências expressas do projeto brasileiro de genoma café. Repositório Alice
PENA, G. F.; CAIXETA, E. T.; FERREIRA, J. L.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
Dentre os marcadores genéticos disponíveis, os microssatélites ou SSRs (Simple Sequence Repeats) têm sido os escolhidos para diferentes estudos genéticos por apresentarem características que agregam simplicidade técnica, grande poder de resolução e alto nível de polimorfismo. Com a disponibilidade das seqüências ESTs (Expressed Sequence Tags), geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café, surgiu a oportunidade de desenvolver esses marcadores, de forma direta e eficiente, por meio de análise eletrônica. Visando o desenvolvimento futuro de marcadores SSRs para café, nesse trabalho foram identificados e caracterizados microssatélites nas seqüências expressas do genoma do cafeeiro. A mineração dos dados foi realizada utilizando-se todas as combinações de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SSR; EST-SSR; Marcador molecular; Coffea.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903733
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Genetic characterization of an elite coffee germplasm assessed by gSSR and EST-SSR markers. Repositório Alice
MISSIO, R. F.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; PENA, G. F.; ZAMBOLIM, L.; DIAS, L. A. S.; SAKIYAMA, N. S..
Coffee is one of the main agrifood commodities traded worldwide. In 2009, coffee accounted for 6.1% of the value of Brazilian agricultural production, generating a revenue of US$6 billion. Despite the importance of coffee production in Brazil, it is supported by a narrow genetic base, with few accessions. Molecular differentiation and diversity of a coffee breeding program were assessed with gSSR and EST-SSR markers. The study comprised 24 coffee accessions according to their genetic origin: arabica accessions (six traditional genotypes of C. arabica), resistant arabica (six leaf rust-resistant C. arabica genotypes with introgression of Híbrido de Timor), robusta (five C. canephora genotypes), Híbrido de Timor (three C. arabica x C. canephora), triploids...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microsatellite marker; Coffea; Discriminant analysis; Genetic diversity.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903366
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Triple plagiotropic branch in coffee: a new promising mutant? Repositório Alice
SAKIYAMA, N. S.; PICOLI, E. A. de T.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L.; MARTINEZ, H. E. P.; PEREIRA, A. A..
Coffee tree is a shrub with dimorphic branches. The orthotropic stem grows vertically with two near-horizontal plagiotropic branches, per node, in opposite phyllotaxy. The consecutive nodes of the orthotropic stem are organized in parastichies. We report here mutant plants of Coffea arabica with triple plagiotropic branch, resulted from the whorled phyllotaxy of the orthotropic stem. In mutant plants three plagiotropic branches in the same node are separated by angles of approximately 120o, while in normal plants two plagiotropic branches in the same node are separated by angles of approximately 180o. In mutant plants the angles of the parastichies increase approximately 50o clockwise between consecutive nodes, while in normal plants the angles increase...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Orthotropic; Mutante; Progenie; Reprodução; Coffea; Mutants; Breeding; Dimorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081921
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Análise in silico e in vivo da via de isoprenóides em café. Repositório Alice
TISKI, I.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; MARRACCINI, P. R.; VIEIRA, L. G. E..
Os diterpenos cafestol e caveol, presentes na fração lipídica em grãos de café, originam-se da via de síntese de isoprenóides. Estes compostos são sintetizados em todos os organismos, sendo abundantes em plantas com cerca de 10 mil componentes relatados. Apesar da diversidade de funções e estruturas todos os isoprenóides derivam de cinco comuns átomos de carbono, o isopentenil difosfato (IPP) e do isômero dimetilalil difosfato (DMAPP). Em vegetais superiores, duas vias localizadas em compartimentos intracelulares separados estão envolvidas na biossíntese de IPP e DMAPP. No citosol, IPP é derivado da via do ácido mevalônico (MVA) e no plastídeo, IPP é formado pela via do metileritritol fosfato (MEP ou não mevalonato). Com a disponibilidade das seqüências...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Coffee; Café; Análise; Analysis; In silico; In vivo; MEP; MVA..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906049
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O cultivo intercalar da seringueira com plantas de valor econômico. Repositório Alice
PINHEIRO, E..
1982
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Consorciação de cultura; Seringueira; Cacau; Guaraná; Café; Pimenta-do-reino; Patchuli; Citronela; Capim limão; Hevea brasiliensis; Theobroma cacao; Coffea; Piper nigrum; Pogostemon cablin; Cymbopogon.
Ano: 1982 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/394698
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Banco de sementes de café em criopreservação: experiência inédita no Brasil. Repositório Alice
EIRA, M. T. S. da; REIS, R. B.; RIBEIRO, F. N. S..
A conservação de sementes de café por longos períodos é dificultada pelo comportamento intermediário no armazenamento. No entanto, estudos recentes relatam que a partir da combinação de um grau crítico de umidade das sementes para cada temperatura de armazenamento, pode-se prolongar o período de conservação. Com o objetivo de estabelecer um Banco de Germoplasma de Coffea spp, através de técnicas de criopreservação, estudos vêm sendo desenvolvidos na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, em Brasília, DF. O protocolo de conservação consta da desidratação parcial das sementes, até cerca de 20% de água, embalagem em sacos trifoliados de papel-alumínio-polietileno, selados hermeticamente e imersão direta no nitrogênio líquido. Após a criopreservação as...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Armazenamento; Germinação; Viabilidade; Banco de germoplasma; Criopreservação; Coffea.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/909568
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Análise de genes expressos durante estádios finais da maturação de frutos de café. Repositório Alice
BUDZINSKI, I. G. F.; CAÇÃO, S. M. B.; CARNEIRO, C. E. A.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E..
A maturação uniforme dos frutos do cafeeiro relaciona-se diretamente com a qualidade da bebida. Diferentes floradas em um mesmo cafeeiro propiciam frutos em estádios desiguais de maturação podendo resultar em uma maior dificuldade na colheita, maior gasto com mão de obra e queda na qualidade do produto. Em frutos climatéricos, o processo final da maturação é desencadeado por um grande acúmulo de etileno, seguido por mudança bioquímicas e fisiológicas que promovem principalmente a desestabilização da parede celular dos frutos, composta principalmente por compostos pécticos. As pectinas são degradadas devido à solubilização e despolimerização da parede celular vegetal em decorrência da ação de enzimas como: pectinametilesterase, poligalacturonase,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Maturação; Poligalacturonase; Pectinametilesterase; Expansina; Genoma; Coffea.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/909458
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Genetic diversity and structure of Hemileia vastatrix populations on Coffea spp. Repositório Alice
CABRAL, P. G. C.; MACIEL-ZAMBOLIM, E.; OLIVEIRA, S. A. S. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L..
Coffee leaf rust is the most limiting disease for coffee cultivation in Brazil. Despite its importance, relatively little is known about the genetic diversity of Hemileia vastatrix, the rust causal agent. In this work, the DNA from 112 monopustule isolates from different geographic locations and coffee genotypes were analysed by amplified fragment length polymorphisms (AFLP). The objectives were to assess the influence of the host and geographic origin on the diversity and population differentiation in H. vastatrix. The fungal population showed a low level of genotypic diversity. Gene diversity (h) was 0027 and the hypothesis of random mating in the total population was rejected, but evidence for recombination was found for two subpopulations (São Paulo...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Café; Variação genética; Coffea.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1041410
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Coffea expansin gene family and expansin expression during fruit maturation. Repositório Alice
BUDZINSKI, I. G. F.; LEITE, T. F.; TAKAHASHI, E. K.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E..
Expansins (EXP) are plant cell-wall loosing proteins involved in cell enlargement and developmental process such as organogenesis, seeds germination, cell wall dissolution and fruit ripening. Two families of EXP are known, α-expansin (EXPA), involved in the control of cell wall extension, and β-expansins (EXPB), the major allergens of grass pollen that also have cell wall-loosening activity. With the objective to study the role of EXP in coffee fruit maturation we selected EXP homologous sequences on the Brazilian Coffee Genome Project database. Full-length contigs were classified according the EXP family. Northern blots of pulp from fruits at the latest stages of maturation (22-32 weeks after flowering) showed increased transcription of...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Oganogenesis.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885761
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Propagação vegetativa do cafeeiro (Coffea arabica L.) por meio de enraizamento de estacas. Repositório Alice
BERGO, C. L.; MENDES, A. N. G..
Buscando-se uma metodologia que permita a regeneração de plantas de Coffea arabica L. a partir do enraizamento de estacas, foi conduzido um experimento no Departamento de Agricultura da Universidade federal de Lavras (UFLA) - Lavras, MG, em casa-de-vegetação,com sistema automático de irrigação por microaspersão. Utilizaram-se cafeeiros das cultivares Catuaí Vermelho e e Acaiá na ausência e presença do zinco em adubação foliar, imergindo ou não suas estacas e em águua corrente para posterior tratamento com antioxidante e regulador de crescimento. A cultivar Conillon foi utilizada adicionalmente sem tratamento algum. Acredita-se que o menor percentual de pegamento das estacas de C. Arabica seja por problemas de oxidação por fenóis,, ocasionados pelos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Catuaí vermelho; Conillon; Acaiá; Lavras (MG); Minas Gerais; Café; Coffea arabica L; Propagação vegetativa; Comportamento de variedade; Enraizamento de estaca; Regulador de crescimento; Auxina AIB; Coffea; Vegetative propagation; Rooting; Plant growth substances; Auxins; Indole butyric acid; Propagación vegetativa; Enraizamiento; Sustancias de crecimiento vegetal; Auxinas; Ácido indol butírico.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/492544
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Análise proteômica do estresse hídrico em cafeeiro. Repositório Alice
RAMOS, H. J. O.; CHAVES, D. F. S.; PEREIRA, L. F. P.; CRUZ, L. M.; FUNGARO, M. H.; CUNHA, M. H. da; OSAKU, C.; PETZL-ERLER, M. L.; AYUB, R. A.; PERALTA, R. M.; MARUR, C. J.; SOUZA, E. M.; VIEIRA, L. G. E.; PEDROSA, F. O..
Déficit hídrico é um dos fatores ambientais mais importantes para a diminuição da produtividade do cafeeiro, tanto no Brasil quanto em outros países produtores. O estabelecimento de estratégias para obtenção de cultivares tolerantes ao estresse hídrico depende da compreensão das respostas biológicas ao nível genético, molecular e bioquímico. Para estudar a resposta ao estresse hídrico no gênero Coffea, foi estabelecida uma rede de pesquisa em proteômica (PROTEOPAR ? Programa Proteoma do Paraná) constituída de oito laboratórios. Quatro genótipos de Coffea, com diferentes respostas fisiológicas à seca, foram analisados: C. canephora (Clone 14, tolerante e Clone 109A, sensível) e C. arabica (BA10, tolerante e Geisha, sensível). Proteínas foram extraídas de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Seca; Proteoma; PROTEOPAR.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906068
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In silico identification of coffee genome expressed sequences potentially associated with resistance to diseases. Repositório Alice
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; HUFNAGEL, B.; THIEBAUT, F.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
Sequences potentially associated with coffee resistance to diseases were identified by in silico analyses using the database of the Brazilian Coffee Genome Project (BCGP). Keywords corresponding to plant resistance mechanisms to pathogens identified in the literature were used as baits for data mining. Expressed sequence tags (ESTs) related to each of these keywords were identified with tools available in the BCGP bioinformatics platform. A total of 11,300 ESTs were mined. These ESTs were clustered and formed 979 EST-contigs with similarities to chitinases, kinases, cytochrome P450 and nucleotide binding site-leucine rich repeat (NBS-LRR) proteins, as well as with proteins related to disease resistance, pathogenesis, hypersensitivity response (HR) and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Data mining; ESTs; Genomics; Bioinformatics.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880494
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Difference between isolates from brown eye spot and black spot lesions in coffee plants. Repositório Alice
BOTELHO, D. M. dos s.; RESENDE, M. L. V. de; RESENDE J. C. de; RIBEIRO JUNIOR, P. M.; ANDRADE, C. C. L. de; ALVES, E.; AMARAL D. C..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diferença entre isolados de dois tipos de sintomas de cercosporiose do cafeeiro (mancha de olho pardo e cercospora negra) em relação à morfologia conidial, ao crescimento micelial, à produção de cercosporina e à reprodutibilidade dos sintomas em folhas de cafeeiro coletadas em três municípios de Minas Gerais, Brasil. Observou-se diferença entre os isolados para as variáveis estudadas, mas sem relação com o tipo de sintoma. As diferenças encontradas não foram associadas à origem do isolado. Os sintomas caracterizados como cercospora negra foram associados a diferentes condições do hospedeiro durante o processo de infecção.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Produção de cercosporina; Morfologia conidial; Crescimento micelial; Reprodutibilidade dos sintomas; Cercosporiose do cafeeiro; Mancha de olho; Cercospora negra; Coffea Arábica; Café; Doença; Coffea; Disease control.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117581
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Genetic diversity and structure of Hemileia vastatrix populations on Coffea spp. Repositório Alice
CABRAL, P. G. C.; MACIEL-ZAMBOLIM, E.; OLIVEIRA, S. A. S. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L..
Coffee leaf rust is the most limiting disease for coffee cultivation in Brazil. Despite its importance, relatively little is known about the genetic diversity of Hemileia vastatrix, the rust causal agent. In this work, the DNA from 112 monopustule isolates from different geographic locations and coffee genotypes were analysed by amplified fragment length polymorphisms (AFLP). The objectives were to assess the influence of the host and geographic origin on the diversity and population differentiation in H. vastatrix. The fungal population showed a low level of genotypic diversity. Gene diversity (h) was 0027 and the hypothesis of random mating in the total population was rejected, but evidence for recombination was found for two subpopulations (São Paulo...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Café; Variação genética; Coffea.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027450
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Influência do ambiente na diversidade de fungos associados a Hypothenemus hampei (Ferrari) (Coleoptera, Scolytidae) e frutos de Coffea canephora. Repositório Alice
GAMA, F. de C.; TEIXEIRA, C. A. D.; GARCIA, A.; COSTA, J. N. M.; LIMA, D. K. S..
Hypothenemus hampei, é uma importante praga do café no Brasil e no mundo. A maioria dos trabalhos referentes à associação entre este inseto e fungos teve como alvo a parte aérea de plantas de Coffea canephora. Estudos de campo foram realizados em plantios de C. canephora, em Ouro Preto do Oeste, Rondônia, para levantar a micota associada à broca e frutos de café. Brocas e galerias foram obtidas a partir da dissecção de frutos de C. canephora brocados e não brocados. Os resultados mostraram que existe uma grande diversidade de fungos associados aos insetos. Nas brocas do solo foram encontrados 110 isolados (10 gêneros) e na parte aérea 91 isolados (10 gêneros). Em relação aos frutos brocados (galerias) foram registrados 5 gêneros no solo e 2 na parte aérea...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Micota; Coffea; Interações insetos-fungos; Mycobiota; Insect-fungus interactions.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/710594
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Germinação in vitro de grãos de pólen de cafeeiro Acauã para estimativa de viabilidade. Repositório Alice
ANGELO, P. C. da S..
O estudo dos grãos de pólen ou micrósporos é interessante sob vários aspectos científicos, desde a ciência básica até a biotecnologia. A fase progâmica é quando os gametas masculinos competem para realizar fecundações. Estudos sobre esta competição e sobre a duração da fase progâmica em café foram publicados há alguns anos. O presente trabalho teve como objetivos testar condições para a germinação in vitro de grãos de pólen de cafeeiro Acauã e utilizar as melhores condições para comparar a viabilidade em diferentes estádios de desenvolvimento da flor e alterações na viabilidade dos grãos, nos dias seguintes à coleta. As flores e anteras foram examinadas sob microscópio estereoscópico para seleção de anteras íntegras, pré e pós-deiscência. Foram testados...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gametogênese; Cultivo in vitro; Coffea; Gametogenesis; In vitro culture.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032625
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Coffee water use in agroforestry system with rubber trees. Repositório Alice
RIGHI, C. A.; LUNZ, A. M. P.; BERNARDES, M. S.; PEREIRA, C. R.; TERAMOTO, E. R.; FAVARIN, J. L..
Water uptake and use by plants are essentially energy processes that can be largely modified by percentage of soil cover, plant type; foliage area and its distribution; phenological stage and several environmental factors. Coffee trees (Coffea arabica - cv. Obatã IAC 1669-20) in Agrforestry System (AFS) spaced 3.4x0.9m apart, were planted inside and along rows of 12- year-old rubber trees (Hevea spp.) in Piracicaba-SP, Brazil (22 42'30" S, 47 38'00" W - altitude: 546m). Sap flow of one-year-old coffee plants exposed to 35; 45; 80; 95 and 100% of total solar radiation was estimated by the heat balance technique (Dynamax Inc.). Coffee plants under shade showed greater water loss per unit of incident irradiance. On the other hand, plants in monocrop (full...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sistema Agroflorestal (SAF); Coffee; Rubber tree; Árbol del caucho; Agrossilvicultura; Cultivo intercalado; Café; Coffea arabica cv Obatã; Seringueira; Hevea sp; Radiação solar; Transpiração vegetal; Absorção de água; Agroforestry; Intercropping; Coffea; Hevea brasiliensis; Solar radiation; Transpiration; Water uptake; Agroforestería; Cultivo intercalar; Radiación solar; Transpiración; Absorción de agua.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/511362
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Transcriptional activity, chromosomal distribution and expression effects of transposable elements in Coffea genomes. Repositório Alice
LOPES, F. R.; JJINGO, D.; SILVA C. R. M. da; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; TEIXEIRA, J. B.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; PEREIRA, L. F. P.; VANZELA, A. L. L.; WANG, L.; JORDAN, I. K.; CARARETO, C. M. A..
bitstream/item/179989/1/journal.pone.0078931.PDF
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plant genomes; Coffee; Coffea.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981148
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Avaliação da produção de ramos ortotrópicos em genótipos de cafeeiro Catucaí Amarelo e Siriema clonados in vitro. Repositório Alice
BUENO, I. F.; CARLI, J. R. de; FERNANDES, B.; ANGELO, P. C. da S.; CARVALHO, C. H. S. de.
Recentemente, o enraizamento de estacas tem sido aplicado também à propagação vegetativa de cafeeiros arábica. Os objetivos do trabalho foram estimar o número de brotações e segmentos nodais produzidos por plantas de cafeeiro de um genótipo Catucaí e de nove genótipos de Siriema clonados in vitro e avaliar a influência do genótipo e da idade das plantas sobre estas variáveis. As plantas foram levadas a campo nos anos de 2008 e 2009 e são mantidas a pleno sol com tratos culturais convencionais e o esqueletamento ocorreu seis meses antes da coleta dos dados. As variáveis analisadas foram o número de ramos ortotrópicos por planta (ramos por planta), o número de segmentos nodais em ramos ortotrópicos por planta (segmentos nodais por planta) e o número médio de...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estaquia; Stem cuttings; Rerodução assexuada; Clonagem; Coffea; Vegetative propagation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032628
Registros recuperados: 105
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