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Genotipagem de amostras de Corynebacterium pseudotuberculosis originadas de casos de linfadenite caseosa no Distrito Federal UnB - FAB
Arruda, Lorena Fernandes.
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2006.
Tipo: Dissertation Palavras-chave: Genotipagem; Ovino; Bioquímica; Distrito Federal (Brasil).
Ano: 2006 URL: http://hdl.handle.net/10482/5070
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Genetic variability of Brazilian rice landraces determined by SSR markers. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; MENDES, C. dos A.; GUIMARÃES, E. P.; BRUNES, T. O.; FONSECA, J. R.; BRONDANI, R. V.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de variedades locais de arroz (Oryza sativa), coletadas em pequenas propriedades rurais. Doze marcadores microssatélites (SSR) caracterizaram 417 variedades locais, coletadas em 1986, 1987 e 2003, no Estado de Goiás. O número de variedades locais com tipo de grão longo e fino aumentou no intervalo de tempo avaliado, provavelmente em razão da demanda de mercado. Conforme os dados moleculares, houve aumento na variabilidade genética e, por meio da análise fatorial de correspondência, observou-se que a maior parte dos acessos foi agrupada de acordo com o ano de coleta. A incorporação de cultivares modernas de arroz às áreas de cultivo das variedades locais e a seleção realizada pelos pequenos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Variabilidade genética; Microsatélite; Genotipagem; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento; Genótipo; Rice; Microsatellite repeats; Genetic resources; Genotype.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/428289
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Biopsia Embrionária Manual. Infoteca-e
CAMARGO, L. S. de A.; QUINTAO, C. C. R.; FREITAS, C. de; OLIVEIRA, C. S..
Este documento mostra um protocolo otimizado para biópsia manual, sem auxílio de micromanipuladores, em embriões fertilizados in vitro em estádio de blastocisto. Com a utilização deste protocolo obteve-se taxa de gestação e de nascimentos semelhantes à de embriões não biopsiados, demonstrando a viabilidade da biópsia embrionária em nossas condições experimentais e a possibilidade de sua aplicação em um sistema comercial, sugerindo seu uso para genotipagem objetivando a SGE (seleção genômica embrionária).
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genotipagem; Seleção genômica embrionária; SGE; Protocolo; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101180
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Protocolo para identificação de híbridos de amendoim forrageiro utilizando marcador molecular microssatélite. Infoteca-e
CAMPOS, T. de; AZÊVEDO, H. S. F. da S.; OLIVEIRA, J. C. de; FERREIRA FILHO, J. A.; YOMURA, R. B. T.; SILVA, L. M. da.
A pecuária na Amazônia representa uma cadeia produtiva importante para pequenos, médios e grandes produtores, uma vez que mais de 80% das áreas desmatadas são ocupadas por pastagens e cerca da metade delas encontra-se degradada ou em vias de degradação. A utilização de pastagens consorciadas pode ser uma alternativa de recuperação, manutenção da produtividade por um período maior e redução do tempo dos animais no pasto. Essa tecnologia tem sido amplamente defendida e utilizada pelos pecuaristas. A utilização do amendoim forrageiro em consórcio com gramíneas em pastagens tem mostrado resultados bastante significativos em relação ao aumento na rentabilidade e melhoria das condições do pasto. No entanto, ainda há baixa oferta de cultivares no mercado. No...
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Arachis pintoi; Forage peanut; Cacahuete forrajero; Marcador microssatélite; Genotipagem; Melhoramento genético vegetal; Leguminosa forrageira; Marcador molecular; Híbrido; Plant breeding; Forage legumes; Genetic markers; Hybrids; Genotyping; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Marcadores genéticos; Híbridos; Genotipificación.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064915
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Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. Repositório Alice
CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C..
A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços na genômica do cafeeiro, como o sequenciamento do genoma de C. canephora, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o chip de genotipagem de DNA para C. canephora (26K Axiom SNP array), visando uma plataforma de genotipagem confiável e de alto rendimento, a ser utilizada nos programas de melhoramento da espécie. A construção do chip foi feita utilizando-se dados gerados a partir do resequenciamento genômico de pools formados por indivíduos dos diferentes grupos de diversidade encontrados na espécie e por indivíduos de C. canephora Conilon,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; SNP array; Coffea canephora; DNA; Gene; Melhoramento genético; Genoma.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084718
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avanços no programa de melhoramento genético de batata da embrapa na fenotipagem para os estresses abióticos. Repositório Alice
CASTRO, C. M.; PEREIRA, A. da S.; REISSER JUNIOR, C.; BRITO, G. G. de; ROHR, A.; KNEIB, R.; PINHEIRO, N. L..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Solanum tuberosum; Tolerância à seca; Tolerância ao calor; Mapeamento associativo; Genotipagem.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1051496
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Identificação de novos acessos de Coffea Arábica introduzidos na coleção da Etiópia do IAPAR. Repositório Alice
FERREIRA, R. V.; ANDRADE, G. A.; CHARMETANT, P.; LEROY, T.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P..
Marcadores microssatélites foram utilizados na discriminação de novos acessos de Coffea arabica que foram introduzidos na coleção da Etiópia do IAPAR, provenientes de uma coleção similar na República de Camarões. Inicialmente 46 acessos de Camarões foram repassados para a Embrapa CPAC (Embrapa Cerrados ? Planaltina - DF), onde ficaram em quarentena. Em seguida, estes acessos foram transferidos para o IAPAR, porém durante os processos de quarentena e transferênc ia, alguns dos acessos foram misturados. Visando identificar corretamente os acessos e também validar os SSRs previamente identificados, todos os 46 acessos foram analisados em géis de poliacrilamida. Os 8 locos microssatélites utilizados geraram um total de 19 alelos, com uma média de 2,3 alelos...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cafeeiro; Marcador microssatélite; Genotipagem; Coffee tree; Microsatellite markers; Café; Genotyping.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1040035
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Genomic variant hotspots in nelore cattle revealed by missing genotypes. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; SILVA, J. M. da; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B..
In order to investigate whether or not the ?missing? genotypes actually reveal genomic variant hotspots, we examined BovineHD missing genotypes from a total of 1,709 Nelore DNA samples and used sequence data from eight of them to identify putative polymorphisms flanking the assayed SNPs.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado de corte; Single nucleotide polymorphism; Genotyping; Cattle.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033991
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Desenvolvimento de ferramenta molecular para a análise e certificação racial de bovinos da raça Pantaneira. Repositório Alice
GODOY, A. P. de J.; LIMA, T. P. C.; JULIANO, R. S.; OLIVEIRA, M. V. M.; EGITO, A. A. do.
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Bovino; Raça; Dna; Genetica animal.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066866
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Genotypic profile of Pantanal creole sheep regarding susceptibility or resistance to scrapie. Repositório Alice
GONÇALVES, A. N. D.; SOARES, C. O.; SANCHES, S. C.; REIS, F. A.; ROSINHA, G. M. S..
The objective of this work was to determine the genotypic profile specific to scrapie in codons 136, 154, and 171 of the PRNP gene of the Pantanal creole sheep. Genomic DNA was extracted from blood samples collected from 66 sheep, and the regions of interest on the DNA strand were amplified by PCR. Five haplotypes were identified: ARR, alanine, arginine, arginine; ARQ, alanine, arginine, glutamine; AHQ, alanine, histidine, glutamine; ARH, alanine, arginine, histidine; and VRQ, valine, arginine, glutamine. The most common genotypes were ARQ/ARQ (27%) and ARR/ARQ (24%). The genotypic profile of the Pantanal creole sheep shows low to moderate susceptibility.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Encefalopatia espongiforme transmissivel; Gene PRNP; Genotipagem; Polimorfismo de nucleotídeo único; Single nucleotide polymorphisms; Transmissible spongiform encephalopathies; Genotyping; Prion diseases.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1050554
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Padronização da técnica de high resolution melting para detecção de um SNP no gene da calmodulina em galinhas. Repositório Alice
KOWACIC, R. da C.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Temperatura de dissociação; Gallus gallus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032233
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Genotipagem por sequenciamento e dosagem alélica em Panicum maximum. Repositório Alice
LARA, L. A. de C.; CAVALCANTE, D. N. C.; DÉO, T. G.; SANTOS, M. F.; CHIARI, L.; JANK, L.; VILELA, M. de M.; ZENG, Z. B.; GARCIA, A. A. F..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pastagem tropical; Seleção genômica; Genotipagem; Panicum maximum.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066378
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Utilização de ferramentas genômicas na caracterização e seleção genética para maciez da carne em bovinos nelore mocho. Infoteca-e
MAGNABOSCO, C. de U.; CASTRO, L. M. de; LOPES, F. B.; EIFERT, E. da C.; OLIVEIRA COSTA, M. F. DE; MAMEDE, M. M. S.; REGITANO, L. C. de A.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; PRADO, C. S.; ROSA, G. J. de M.; SAINZ, R. D..
2016
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genotipagem; Qualidade; Shear force; Genotypes; Quantitative trait loci; Bovines; Cattle; Meat; Bovino; Gado; Carne.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052500
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Frequência alélica e genotípica do SNP ligado ao fenótipo slick hair no gene do receptor da prolactina (PRLR) em bovinos da raça Caracu. Repositório Alice
NASCIMENTO, J. C.; SEIBERLICK, O. S. G.; CARVALHO, B. O.; PEREIRA, H. P.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B..
Resumo: Em ambientes tropicais e subtropicais, a expressão de características produtivas em bovinos é dificultada pelos efeitos ambientais como o estresse térmico, agravado pelo aquecimento global. Regiões genômicas associadas à tolerância ao calor foram recentemente descritas e polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) relacionados a essa variação foram identificados. Uma mutação no gene do receptor de prolactina, no SNP 39136666 foi relacionada à presença de um tipo diferente de pelagem denominada ?slick hair? em animais da raça Carora e Caracu, que está associado com a maior tolerância ao calor. Foram genotipados neste trabalho, 61 animais da raça Cararu Caldeano, utilizando a técnica tetra-primers ARMSPCR. A frequência alélica e genotípica foi...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Caracu caldeano; Tetra-primer; ARNS-PCR.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1112049
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Genomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production. Repositório Alice
OLIVEIRA, A. A. de; PASTINA, M. M.; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; NODA, R. W.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de; DAMASCENO, C. M. B.; MARGARIDO, G. R. A..
The increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Bioenergia; Biomassa.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096210
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Genomic selection methods applied to high biomass sorghum for the production of second generation ethanol. Repositório Alice
OLIVEIRA, A. A.; PASTINA, M. M.; SOUZA, V. F.; PARRELLA, R. A. C.; NODA, R. W.; MAGALHAES, J. V.; SCHAFFERT, R. E.; DAMASCENO, C. M. B.; MARGARIDO, G. R. A..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Bioenergia; Etanol.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1028788
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Aplicabilidade da técnica PCR-RAPD para a determinação do perfil genotipico de variedades de romã (Punica granatum). Repositório Alice
OLIVEIRA, E. M. M.; LIMA, I. S. de.; CARNEIRO, B. T.; NOGUEIRA, R. I.; FREITAS-SILVA, O..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Romã; Genotipagem; RAPD.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/935878
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Variabilidade genética entre acessos de Astrocaryum Vulgare Mart. selecionados para frutos e teor de óleo com base em marcadores SSR. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. do S. P. de; SILVA, I. C. da; OLIVEIRA, N. P. de..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Recursos genéticos; Tucumã-do-Pará; Tucumã; Genotipagem; Heterozigosidades.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059233
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Divergência genética entre genótipos de tucumã-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.) desejáveis para frutos por meio de marcadores moleculares. Repositório Alice
OLIVEIRA, N. P. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de; MOURA, E. F..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Palmeira; Amazônia; Genotipagem; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880777
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Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. Repositório Alice
PEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F..
O objetivo desse estudo foi construir um pipeline de bioinformática para a identificação e análise de CNVs a partir dos dados gerados pelos chips de genotipagem de SNPs da plataforma Illumina, o qual tem sido largamente utilizado na genotipagem de rebanhos bovinos da Embrapa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Polimorfismo de base única; Genotipagem; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/954566
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