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A Database for TSSs of Human MicroRNAs Nature Precedings
Malay Bhattacharyya; Sanghamitra Bandyopadhyay.
MicroRNAs (miRNAs) are small endogeneous non-coding RNAs of about 22nt length. These short RNAs regulate the expression of mRNAs by hybridizing with their 3'-UTRs or by translational repression. They have been shown to take crucial roles in many biological processes. Many of the current studies are focused over how mature miRNAs regulate mRNAs, even though there is very limited knowledge about their transcriptional loci. Primary miRNAs (pri-miRs) are first transcribed from the DNA, followed by the formation of precursor miRNA (pre-miR) by endonucleases activity, which finally produces mature miRNAs. Unfortunately, the identification of the loci of pri-miRs, and the associated information about transcription start sites (TSSs) and promoters is...
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Genetics & Genomics; Molecular Cell Biology; Bioinformatics.
Ano: 2012 URL: http://precedings.nature.com/documents/6832/version/1
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A database of orthologous exons in primates for comparative analysis of RNA-seq data Nature Precedings
Ran Blekhman.
RNA-seq technology facilitates the study of gene expression at the level of individual exons and transcripts. Moreover, RNA-seq enables unbiased comparative analysis of expression levels across species. Such analyses typically start by mapping sequenced reads to the appropriate reference genome before comparing expression levels across species. However, this comparison requires prior knowledge of orthology at the exon level. With this in mind, I constructed a database of orthologous exons across three primate species (human, chimpanzee, and rhesus macaque). The database facilitates cross-species comparative analysis of exon- and transcript-level regulation. A web application allowing for an easy database query: http://giladlab.uchicago.edu/orthoExon/
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Genetics & Genomics; Bioinformatics; Evolutionary Biology.
Ano: 2012 URL: http://precedings.nature.com/documents/7054/version/1
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A definição da agenda de pesquisa em ciência, tecnologia e inovação no Brasil: o caso da Embrapa e da Fiocruz Repositório Alice
BASSI, N. S. S.; SILVA, C. L. da; IEIS, F..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Planejamento estratégico; Política agrícola.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/945953
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“A Definition at Last, But What Does it All Mean?” Newspaper Coverage of Organic Food Production and its Effects on Milk Purchases AgEcon
Kiesel, Kristin.
This paper estimates the effects of media coverage of organic food production on food purchases. Information from several data sources links national and local newspaper coverage to fluid milk purchases. An analysis of weekly store-level scanner data in a differences-in-differences approach results in a 5% increase in organic milk sales relative to conventional milk sales. Increases in intensity of news coverage increase this relative difference in sales. Differentiating effects by media context further suggests that product category specific coverage increases sales more than general coverage. Critical coverage does not result in significant effects on organic milk sales.
Tipo: Article Palavras-chave: Consumer behavior; Information media effects; Organic food; Scanner data; Agricultural and Food Policy; Production Economics; Public Economics.
Ano: 2012 URL: http://purl.umn.edu/122316
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A Derived Demand Function for Freight Transportation: An Update of the 1980 Friedlaender Spady Analysis AgEcon
McCullough, Gerard J.; Hadash, Ishay.
Please send requests for this paper directly to the author.
Tipo: Working Paper Palavras-chave: Demand and Price Analysis; Financial Economics.
Ano: 2012 URL: http://purl.umn.edu/123249
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A desigualdade verde. Infoteca-e
ALVAREZ, I. A..
2012
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Coeficiente de Gini.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941841
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A discussion paper on challenges and proposals for advanced treatments for potabilization of wastewater in the food industry. Repositório Alice
LUIZ, D. B.; JOSÉ, H. J.; MOREIRA, R. F. P. M..
There are many studies and reviews on advanced processes to treat secondary wastewater from industries which also address the challenges and limitations to water reuse and the hygienic concerns especially in food industries. However, the challenges associated with treating a secondary wastewater to provide drinking water quality become clear when real wastewater is treated in batch and in pilot scale. The limitations are several, particularly in food industries. Hence, this review aims to present an overview and a discussion regarding the challenges and proposals related to the advanced treatment of food industry wastewater to provide drinking water quality, elucidating some experimental and theoretical questions surrounding such processes. Valuable...
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Tratamento da água; Qualidade da água; Waste treatment; Wastewater treatment; Food industry; Water quality; Water treatment.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/916163
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A distributed storage system for use in the Multiuser Bioinformatic's Laboratory of Embrapa. Repositório Alice
CINTRA, L..
The idea is to analyse the data to generate knowledge in biology, and to do that it is necessary a lot of storage space to data.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Métodos computacionais; Sistemas distribuídos; Sistema de armazenamento de dados; Distributed storage systems; Distributed file systems.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946522
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A diversidade de abóboras no Brasil e sua relação histórica com a cultura. Infoteca-e
BARBIERI, R. L..
2012
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Abobora; História; Brasil.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918029
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A dominância das capoeiras na paisagem agrícolas da Amazônia. Repositório Alice
SÁ, T. D. de A.; KATO, M. do S. A.; KATO, O. R..
bitstream/item/173055/1/EDUCAcaO-AMBIENTAL-vol-3-2012p156.pdf
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Amazônia; Capoeira.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/987152
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A Educação ambiental como instrumento para a melhoria da gestão dos resíduos sólidos nas organizações públicas e privadas: contexto, legislação e ações estratégicas. Infoteca-e
GÓES, A. C. P.; GUEDES, M. C..
Este trabalho parte de um problema do presente, o alto consumo de bens materiais e seus desperdícios nas organizações públicas e privadas, e se propõe a oferecer diretrizes em educação ambiental para administrar e diminuir a produção de resíduos sólidos comuns, como papel, plástico, vidro e metal. Na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), no Estado do Amapá, desenvolve-se um programa de gestão ambiental, cuja ênfase no gerenciamento desses resíduos está em fase de implementação, com a construção de uma área para processamento do lixo produzido diariamente. Dessa forma, o objetivo geral deste documento é apresentar uma pequena abordagem sobre a evolução da questão ambiental, sugerindo ações para a redução do consumo de materiais diversos nas...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Impacto ambiental; Resíduos sólidos; Educação ambiental; Ecologia humana.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/929016
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A Embrapa Agroindústria de Alimentos e a Rio+20: contribuição para o desenvolvimento sustentável e desafios futuros. Infoteca-e
NASCIMENTO, D. T. do..
Desenvolvimento Sustentável e a Rio+20; Segurança alimentar e qualidade dos alimentos; A Embrapa e a agroindústria de alimentos; Contribuições da Embrapa Agroindústria de Alimentos para o meio ambiente; Tecnologias, produtos e projetos; Ações internas de gestão ambiental; Considerações finais e desafios futuros.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Desenvolvimento sustentável; Segurança alimentar; Embrapa Agroindústria de Alimentos.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/931826
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A Embrapa e a consultoria tecnológica. Infoteca-e
HOFFMANN, A..
A Embrapa presta serviços de consultoria? Esta é uma atividade que, sob determinadas circunstâncias, pode fazer parte do trabalho da Embrapa. A consultoria é uma atividade em crescimento, também na vitivinicultura e na fruticultura de clima temperado, nas quais se notam consultores percorrendo as propriedades e as vinícolas. Segundo um dicionário, consultoria é "uma atividade profissional de diagnóstico e formulação de soluções acerca de um assunto ou especialidade". Ou seja, é uma forma de intervenção bastante específica, quando um estabelecimento precisa de um suporte de informação capaz de resolver problemas.
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Embrapa Uva e Vinho; Consultoria; Tecnologia; Pesquisa; Agricultura.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/926130
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A energia da floresta. Infoteca-e
SILVA, H. D. da.
2012
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Carvão vegetal.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/911727
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A exploração da pimenta-do-reino como alternativa de sustentabilidade socioeconômica e ambiental no estado do Pará. Repositório Alice
FILGUEIRAS, G. C.; HOMMA, A. K. O.; SANTOS, M. A. S. dos; MOTA JUNIOR, K. J. A. da; SILVA, S. C..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pimenta-do-reino; Sustentabilidade; Meio ambiente; Pará.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/957450
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A farm level assessment of a novel drought tolerant forage:Tedera (Bituminaria bituminosa C.H.Stirt var. albomarginata). AgEcon
Finlayson, John D.; Real, Daniel; Nordblom, Thomas L.; Revell, Clinton; Ewing, Michael A.; Kingwell, Ross S..
Tedera (Bituminaria bituminosa C.H.Stirt var. albomarginata) is a drought tolerant perennial legume originating in the Canary Islands. This study evaluates the potential role and value of tedera in dryland mixed crop and sheep production systems in southern Australia. Regional variants of the bio-economic model MIDAS are used to assess tedera in farming systems at two locations. The analysis considers the quantity and quality of feed produced by tedera, the ability of other forages to complement or substitute for tedera and its impact on meat versus wool-producing sheep flocks. The results indicate that tedera offers the potential to increase farm profits by up to 26% and be grown on ~28% of a low rainfall mixed enterprise farm. On a high rainfall mixed...
Tipo: Presentation Palavras-chave: Tedera; Drought tolerant; Forage; Legume; Mediterranean-type climate; Autumn feed gap; Bio-economic modelling; Whole farm modelling; Technology evaluation; MIDAS; Model of dryland agricultural system.; Crop Production/Industries.
Ano: 2012 URL: http://purl.umn.edu/124297
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A floricultura no Distrito Federal: perspectivas para o setor. Infoteca-e
ALONSO, A. M.; SILVA, J. C. S..
2012
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Floricultura; Cadeia produtiva; Cerrado; Plantas ornamentais; Distrito Federal.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/968132
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A Forest Management Map of European Forests Ecology and Society
Hengeveld, Geerten M.; ALTERRA - Wageningen UR; Geerten.Hengeveld@wur.nl; Nabuurs, Gert-Jan; European Forest Institute; gert-jan.nabuurs@efi.int; Didion, Markus; ALTERRA - Wageningen UR; Markus.didion@wur.nl; van den Wyngaert, Isabel; ALTERRA - Wageningen UR; isabel.vandenwyngaert@wur.nl; Clerkx, A.P.P.M. (Sandra); ALTERRA - Wageningen UR; Sandra.Clerkx@wur.nl; Schelhaas, Mart-Jan; ALTERRA - Wageningen UR; martjan.schelhaas@wur.nl.
Forest management to a large extent determines the possible services that the forest can provide. Different objectives in forest management determine the rotation length and valuation of different stages in forest succession. We present a method of mapping potential forest management at 1-km resolution to inform policy, land use modeling, and forest resource projections. The presented method calculates the suitability of a location to different forest management alternatives based on biotic, abiotic, socioeconomic, and political factors. A sensitivity analysis of the resulting map to the data sources used was performed. This showed that the results are very sensitive to some data sources. The potential use of the map and the sensitivity to the availability...
Tipo: Peer-Reviewed Reports Palavras-chave: Europe; Forest management approach; Land use mapping.
Ano: 2012
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A framework for a European network for a systematic environmental impact assessment of genetically modified organisms (GMO) Organic Eprints
Graef, Frieder; Römbke, Jörg; Binimelis, Rosa; Myhr, Anne Ingeborg; Hilbeck, Angelika; Breckling, Boder; Dalgaard, Tommy; Stachow, Ulrich; Catacora-Vargas, Georgina; Bohn, Thomas; Quist, David; Darvas, Béla; Dudel, Gert; Oehen, Bernadette; Meyer, Hartmut; Henle, Klaus; Wynne, Brian; Metzger, Marc J.; Knäbe, Silvio; Settele, Josef; Székács, András; Wurbs, Angelika; Bernard, Jeannette; Murphy-Bokern, Donal; Buiatti, Marcello; Giovannetti, Manuela; Debeljak, Marko; Andersen, Erling; Paetz, Andreas; Dzeroski, Saso; Tappeser, Beatrix; van Gestel, Cornelis A.M.; Wosniok, Werner; Séralini, Gilles-Eric; Aslaksen, Iulie; Pesch, Roland; Maly, Stanislav; Werner, Armin.
The assessment of the impacts of growing genetically modified (GM) crops remains a major political and scientific challenge in Europe. Concerns have been raised by the evidence of adverse and unexpected environmental effects and differing opinions on the outcomes of environmental risk assessments (ERA). The current regulatory system is hampered by insufficiently developed methods for GM crop safety testing and introduction studies. Improvement to the regulatory system needs to address the lack of well designed GM crop monitoring frameworks, professional and financial conflicts of interest within the ERA research and testing community, weaknesses in consideration of stakeholder interests and specific regional conditions, and the lack of comprehensive...
Tipo: Journal paper Palavras-chave: Biodiversity and ecosystem services.
Ano: 2012 URL: http://orgprints.org/23020/1/Graef-etal-2012-BioRisk-Vol7-p73-97.pdf
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A gentle introduction to Stata Buscador Latinoamericano
Alan C. Acock; Acock, Alan C., 1944-.
Tipo: Text Palavras-chave: ESTADISTICA; CIENCIAS SOCIALES; PROGRAMAS DE ORDENADOR.
Ano: 2012 URL: http://www.flacso.org.ec/biblio/shared/biblio_view.php?bibid=140172&tab=opac&oai:flacso.org.ec:140172
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