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A Simple and Inexpensive Technique for Estimating Leaf Surface Area of Muskmelon (Cucumis melo L.) Taiwan Agricultural Research Institute
吳惠卿; 陳烈夫; 魏夢麗; 呂秀英; Hui-Chin Wu; Lit-Fu Chan; Meng-Li Wei; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]Leaf area is a valuable index in identifying muskmelon (Cucumis melo L.) growth and development. A simple technique was developed for estimating leaf surface area (A) of muskmelon with measurements of leaf length from the sinus base to the apex of leaf along midrib (L) and/or maximum leaf width (W) without the use of any expensive instruments. Leaves for three muskmelon varieties, Chioumih, Zhufen and Tianhun were collected from different levels of the canopy of plants during the growing season in 2007 at Taiwan Agricultural Research Institute, Wufeng, Taichung, Taiwan. Each leaf was measured for L, W and A. Data analysis were performed by regression technique. Results showed that differences in leaf shape among these varieties affected the...
Palavras-chave: Surface leaf area Nondestructive estimation Linear regression model Leaf shape Prediction accuracy 葉面積; 非破壞性估算; 線性回歸模式; 葉形; 預測準確度 [[classification]]1.
Ano: 2010
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Effects of Nitrate and Ammonium Nitrogen Sources on the Seedling Growth and Root Phosphoenolpyruvate Carboxylase Activity of Different Crop Species Taiwan Agricultural Research Institute
D.J. Liu; C.S. Wang; M.L. Wei; 劉大江; 王強生; 魏夢麗.
[[abstract]]Seven crop species, including maize, sorghum, rice, wheat, barley, peanut and soybean, were grown hydroponically with either nitrate or ammonium N at a concentration of 150 ppm. Rates of seedling growth were determined to study the effect of N sources on the performances of carbon metabolism. As ammonium N could enhance the activity of PEP carboxylase in the roots of many crops, attempts had been made to clarify the characteristics of this enzyme in order to provide basis for further studies. Experimental results showed that crops grew better in nitrate N than in ammonium N medium. However, shoots of rice and wheat gained more fresh weight when treated with ammonium N which was different from the results on maize, sorghum and peanut, indicating...
Palavras-chave: [[classification]]6.
Ano: 1987
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上帝和宇宙玩骰子?-談統計在生物資訊上所扮演的角色 Taiwan Agricultural Research Institute
呂秀英; 呂椿棠; 魏夢麗.
Palavras-chave: 生物質訊; 統計; [[classification]]6.
Ano: 2003
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不同種植期對水芋乾物質與氮素累積性狀之影響 Taiwan Agricultural Research Institute
陳烈夫; 呂椿棠; 魏夢麗; 呂秀英; Lit-Fu Chan;Chun-Tang Lu;Meng-Li Wei;Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]為瞭解水田檳榔心芋的田間產量表現,本試驗於1995及1996年分別於1、5 及9月種植水芋,調查植株各部位在生育全期的乾物質與氮素累積量及累積速率的變化差異,以探討不同種植期對乾物質與氮素累積性狀之影響,並推知水芋葉片葉柄累積光合產物之最主要時期。由於不同種植期間環境氣候的變化不同,明顯造成水芋植株乾物質生產及氮素同化分配的不同。移植後第3~5個月間為水芋植株地上部器官累積乾物質與氮素的重要時期,由於1月種植期在此期間的溫度及日射量較高,故地上部葉片及葉柄的乾物質與氮素累積速率最快,能累積最高的乾物質與氮素量,以因應之後球莖膨大充實所需,致使成熟期可獲致最高的球莖產量。9月種植期則因為地上部生長旺盛期間逢低溫及低日射量,乾物質與氮素累積速率甚為緩慢,氮素供源嚴重不足,而且在進入球莖快速膨大期以後地上部乾物重及氮素含量仍持續上升,表示在球莖快速膨大期葉片及葉柄仍然也還是氮素積儲器官,故導致成熟期之產量降低。5月種植期乾物質與氮素累積的生長特性,與1月種植期的表現頗為相似,惟地上部生長旺盛期之累積速率較低,故成熟期之球莖產量較1月種植期為低。但是,種植期不會影響水芋地上部生長旺盛期地上部氮素與乾物質的相對累積效率。水芋地上部營養器官分配至葉片及葉柄的乾物質分配比例與氮素累積分配比例,亦不因種植期及生長階段而異,水芋植株地上部營養器官的乾物質量約有三分之一分配於葉片,三分之二分配於葉柄,而氮素累積分配比例大致上都是以約十分之六分配於葉片,而十分之四分配於葉柄,此顯示氮素含量有優先集中於葉片的趨勢,與乾物質的表現不相同。
Palavras-chave: 芋 種植期 乾物質累積 氮素累積 地上部生長旺盛期 Taro; Planting seasons; Dry matter accumulation; Nitrogen accumulation; Vigorous top-growth stage [[classification]]1.
Ano: 1999
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不同粒重水稻品種葉片形態與氮素代謝性狀差異比較 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 張富洲; 劉大江; M.L. Wei; F.C. Chang; D.J. Liu.
[[abstract]]本試驗以大粒型品種Pegonil、中粒型品種臺農67號與兩個粒重較高之臺農67號近同源系為主要材料,比較其間葉片形態性狀、氮素代謝酵素活性及維管束性狀的差異,藉以探討影響具不同粒重水稻種源光合及氮素代謝能力之機制。與大粒型品種比較,中粒型品種葉長自上位葉至下位葉顯著增加,葉寬減幅極小,田間透光度較佳,且下位葉比葉重較高,有利於光合作用表現。大粒品種葉片氮素濃度雖然較高,在穀粒充實期間葉綠素及可溶性蛋白質濃度降低的幅度與速率却高於中粒品種,亦即受老化影響,生理活性快速衰退。自抽穗期以後,glutamine synthetase活性逐漸降低,近成熟期時之活性以臺農67號為高,而Pegonil之proteinase活性則超過臺農67號三倍以上,顯示中粒型品種具有較高的氮素同化能力;glutamate dehydrogenase活性在穀粒充實期間的變化不大,推測對氮素代謝的影響較小。兩個回交系統的含氮化合物濃度及氮素代謝作用表現不受粒重影響,較趨近中粒親本臺農67號。造成品種間氮素代謝差異的主因,可能為穀粒對氮素需求的積儲強度。臺農67號葉脈數與葉脈頻度較Pegonil為高,篩管面積則較小,尚難據以判定輸導能力之強弱,但臺農67號篩管面積與維管束面積比值顯著較高,而兩個回交系統之維管束面積亦顯示雜種優勢,為具有利用價值之生理性狀,有必要對此變異性再加研究。 A medium-grain variety, Tainung 67 , a large-grain variety, Pegonil, and two each of their BC5 and BC6 offsprings with caryopsis weight about 28.5mg were used to study...
Palavras-chave: [[classification]]6.
Ano: 1989
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二期作水稻光合成物質的生產、分配及與產量間的關係 Taiwan Agricultural Research Institute
楊藹華; 梁文實; 魏夢麗; 劉大江; A.H. Yang; W.S. Liang; M.L. Wei; D.J. Liu.
[[abstract]]於70 年二期作在羅東、臺中與屏東共栽培4 個水稻品種,自抽穗期至成熟期間,每十天取樣一次,分析植株不同器官內乾物質、全氮及非構造性碳水化合物(TNC )含量變化。以瞭解二期作水稻穀粒充實期間光合成物質的生產能力及分配,對其增產之可能性加以評估,並於不同地區間進行比較。 水稻穀粒充實期間,葉片內的氮濃度明顯下降,莖稈的降低幅度較小,穗部則無顯著變化。葉片TNC 濃度的變異頗不規則,莖稈部位極顯著的下降,表示有多量碳水化合物向穗部轉移。三個地區的稉稻全株乾物質生產量均在6-8g 之間,臺中秈10號則高達12g ,但與產量的關係並非完全一致,可能與乾物質的分配效率有關。非構造性碳水化合物的淨生產則與產量有密切之關係,臺中地區的兩個秈稻品種,每株可增加14-18g 的TNC ,產量為29-33g ,其他兩個稉稻品種則分別為6-11g 之TNC 與16-20g 的穀產量。 羅東地區臺南5 號產量最低的原因為一穗穎花數太少,臺中地區秈稻高產則歸因於穗數或一穗穎花數較多。收穫指數介於0.52-0.67 之問,且產量越高,收穫指數亦高;氮收穫指數(harvest N index )也有相同的表現,即產量高時,穗部含氮量佔全株含氮量的比值增高,但二者間之因果關係則未能明瞭。非構造性碳水化合物收穫指數(harvest TNC index )高達0.91 - 0.97 ,以羅東臺南5 號最低,表示部分葉片所生產的TNC 儲存於莖稈,未能充份轉運至穗部;而較高產水稻品種殘留營養器官內之TNC 僅為3-4 %,可能無法充份供應穗部需要,亦即光合成能力成為產量限制因子。 就乾物質之生產、分佈及TNC...
Palavras-chave: [[classification]]6.
Ano: 1983
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去葉處理與栽植密度對大粒型水稻品種產量表現的影響 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 劉大江; M.L. Wei; D.J. Liu.
[[abstract]]為探討藉密植栽培增加大粒型水稻單位面積穗數以提高產量的可能性,及於抽穗期與抽穗後一週去除50 %葉片,以明瞭穀粒充實期間光合成物質的供需平衡關係,本試驗採用大粒型水稻品種Pegonil 與中粒型品種臺農67 號為材料,於抽穗後定期測定乾物質之累積與分佈,分析植株各器官全氮與非構造性碳水化合物(TNC)濃度的變化,並解析與產量表現間的關係。在第二期作的栽培環境下,臺農67 號較Pegonil 品種高產40%,穎花數與穗數為導致差異的主要產量構成因素。於抽穗期去除50%葉片,對成熟期Pegonil 穗重並無影響,但使臺農67 號穗重減輕32%,抽穗後一週去葉使兩品種穗重分別降低14%與32%;去除部份葉片使穗部氮濃度降低,但對葉片與莖稈氮濃度的影響甚小,亦即氮素再轉移至穗部之量甚微,此一現象與同一時期莖稈TNC 濃度大幅下降,顯示可能因光合成物質供應不足而降低根部活性,致使氮素供應不敷穀粒充實之需。密植栽培(行株距30 × 7.5 cm)較一般栽培(行株距30 × 15cm)可提高Pegonil 產量42%,唯仍較臺農67 號低產20%;密植使單株穗數減少,但大幅增加單位面積穗數,且不影響其他產量構成要素的表現,顯示改良栽培方法以提高大粒型水稻產量的可行性。高族群密度亦使穀粒氮濃度下降,在植株氮素供需與光合成物質的影響方面,可能與去葉處理具有相似的作用機制。本試驗中大粒型品種在抽穗後3 週內,單穗乾物質、全氮與TNC 的累積速率均顯著超過臺農67 號,為可資利用之優良生理特性,但穀粒充實期較短,穗內穎花累積TNC 之均一性差距頗大,易導致產量效率(yield efficiency)之降低。 Studies were conducted to examine the possibility...
Palavras-chave: [[classification]]6.
Ano: 1986
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受稻熱病菌誘導之水稻表現序列標誌(EST)的比較分析 Taiwan Agricultural Research Institute
呂秀英; 邱怡嘉; 陳政道; 魏夢麗; 呂椿棠; Hsiu-Ying Lu; Yi-Chia Chiu; Cheng-Tao Chen; Meng-Li Wei; Chun-Tang Lu.
[[abstract]]Rice blast is caused by fungus pathogen Magnaporthe grisea, which is a major destructive disease in rice production worldwide. Expressed sequence tag (EST) is the fragment of cDNA sequence. Direct study of EST is therefore helpful to obtain the gene expression information. In order to investigate the differences of gene expression patterns of rice among varieties, tissues and developmental stages after rice-blast infection, we made a comparative analysis of rice ESTs induced by M. grisea from 14 cDNA libraries in NCBI-dbEST database. For each individual library, EST functional annotation, classification and representation statistics were performed. Clustering analysis and correspondence analysis were also used to detect the differences in gene...
Palavras-chave: 水稻 稻熱病 表現序列標幟 功能註解及分類 基因表現量統計 集群分析 對應分析 Rice; Rice blast; Expressed sequence tag; Functional annotation and classification; Statistics of gene representation; Clustering analysis; Correspondence analysis [[classification]]6.
Ano: 2007
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基因轉殖作物共存模式與隔離距離 Taiwan Agricultural Research Institute
陳烈夫; 丁孟宜; 吳明哲; 吳惠卿; 魏夢麗; 呂秀英.
Palavras-chave: 基因轉殖作物; 隔離距離; 基因流佈; 共存模式; [[classification]]1.
Ano: 2008
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官能品評資料分析之SAS程式應用及例釋 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 呂椿棠; 呂秀英.
Palavras-chave: 官能品評; [[classification]]6.
Ano: 2004
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期作間水芋全生育期光合成物質生產之比較 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 陳烈夫; 呂椿棠; 呂秀英; Meng-Li wei;Lit-Fu Chan;Chun-Tang Lu;Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]本試驗於1995及1996年分別於本省最適(1月)及較不適宜(7月)之栽種季節下種值水田檳榔心芋,自移植起每月各取樣一次,直到移植後第8個月收穫止,測定水芋生育全期植株各部位的乾物重、全氮與非構造性碳水化合物 (TNC) 濃度及含量的變化情形,以明瞭期作間產量差異的原因,並探討造成水芋產量降低的主要限制因子。水芋植株各部位在全生育期間皆以葉片的氮素濃度最高,而TNC濃度以球莖為最高,葉柄也具有貯存碳水化合物的功能。l月種植期在地上部生長旺盛期的溫度及日射量較高,故行光合作用的地上部營養器官能提供預貯光合成產物的能力強,同時於球莖快速膨大期轉移至球莖積儲之氮素轉流量較高,地上部可有較多的預貯TNC以供球莖充實,若不考慮呼吸作用之消耗,地上部營養器官TNC最高可貢獻13~19%之球莖TNC,因此收穫產量較高。而7月種植期產量降低的主要原因,為地上部生長旺盛期間的氣溫降低且日射量減少,導致光合成產量不足,同時其轉運分配至球莖的效率低且時間短,故乾物質及碳水化合物不足以提供移植後第6個月以後的球莖快速充實膨大所需,直到收穫止,其球莖乾重、氮素及TNC佔有全株之比例都未有明顯增加。
Palavras-chave: 芋 種植期 乾物質 氮素 非構造性碳水化合物 Taro; Planting season; Dry matter; Nitrogen; Total nonstructural carbohydrates [[classification]]6.
Ano: 1999
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栽培密度對玉米生育及產量之影響Ⅱ.子粒充實期 Taiwan Agricultural Research Institute
姜義展; 魏夢麗; 陳烈夫; 劉大江; Yih-Jan Jiang; Meng-Li Wei; Lit-Fu Chan; Dah-Jiang Liu.
[[abstract]]本試驗採用玉米品種臺農一號為材料,以吐絲期具不同營養生長量但吐絲後具有相似生育環境之處理,探討子粒充實期間植株產量生理性狀表現。於1991及1992年秋作進行田間試驗,行距約為75cm,株距分為11與22cm兩種處理,第一年試驗於吐絲期將部份小區株距自11cm間拔為22cm,第二年於雄穗分化始期與吐絲期進行相同處理,又於吐絲期將部份小區株距自22cm間拔至44cm,分析子粒充實期間不同器官之乾物質與氮素累積性狀,解析對產量的影響。密植栽培降低植株在吐絲期之營養生長量;吐絲後如維持相同株距,則吐絲期營養生長量較低之處理,植株在子粒充實前期(吐絲後0~24日)及後期(48~65日)的單株乾物質生產量較高,但分配至子粒之比率則較低。子粒充實前期所生產的光合物質平均分配於子粒及果穗其他部位,器官間可能有競爭現象,以疏植區最為明顯。吐絲期營養生長量較低之植株於充實中期,及吐絲期營養生長量較高之植株於充實後期,其全株光合物質產量不足以供應子粒充實之需。在氮素累積性狀方面,吐絲期氮素累積量較低者,於子粒充實前期與中期(吐絲後24~48日)有較高的氮素同化能力。多數處理於子粒充實全期之全株氮素累積速率低於子粒氮素累積速率,以充實中期的差異最為顯著;但吐絲期營養生長量與氮素累積量最低之處理,可同化較多量氮素,反而表現較佳之供需平衡關係。玉米植株氮素利用效率因密植而升高,主要受氮素吸收效率影響。如吐絲期營養生長與氮素累積量不同,而吐絲後維持相同之行株距,其氮素利用效率與多數組成因子之表現並無顯著差異,顯示臺農一號玉米品種之氮素利用對栽培密度呈現較為穩定的反應。吐絲期乾物質與氮素累積量較低之處理,植株在吐絲後具有較高的光合物質與氮素同化作用能力,對子粒產量具有明顯的補償及緩衝作用。
Palavras-chave: 玉米 栽培密度 子粒充實 乾物質累積 氮素累積 氮素利用 Zea mays; Plant spacing; Kernel-filling; Dry matter accumulation; N accumulation; N use efficiency [[classification]]6.
Ano: 1995
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栽培密度對玉米生育及產量之影響Ⅰ.營養生長期 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 陳烈夫; 姜義展; 劉大江; Meng-Li Wei; Lit-Fu Chan; Yih-Jan Jiang; Dah-Jiang Liu.
[[abstract]]玉米吐絲前的營養生長可能影響子粒產量表現,本試驗以玉米品種臺農一號為材料,調查營養生長期間植株物質與氮素的累積與分配性狀,同時探討栽培密度的作用,以對其產量生理有進一步的瞭解。於1991及1992年秋作進行試驗,行距均為75cm,1991年採用株距11、22及44cm三種處理,1992年採用11與22cm兩種株距,又於雄穗分化始期將部份植株株距自11cm間拔為22cm;在播種至吐絲期間連續取樣,分析不同器官之乾物質與氮素累積性狀。自第十二葉齡以後,栽培密度對臺農一號單株乾物質及氮素累積能力的影響方較明顯,葉片乾物質與氮素含量佔全株總量的比值快速下降,而莖稈乾物質與氮素含量佔全株總量的比值相對快速升高。玉米植株在第十二葉期至吐絲期約一個月生育期間,具有極旺盛的同化作用,植株所累積的乾物質量佔吐絲期總乾物量的80~92%,所累積的氮素量佔吐絲期總含氮量的69~85%,於密度處理間比較,則以最密植處理之比值較低。玉米植株自播種至吐絲期,生長速率持續上升,尤以吐絲前約二週之速率最高,乾物質累積速率最高可達389 kg/ha.day,氮素累積速率最高達6.4kg/ha.day,隨株距之增加而顯著降低。在營養生長全期,乾物質累積速率與氮素累積速率的比值有逐漸上升的趨勢,但在栽培密度處理間則多無顯著差異,顯示以單位氮素為基準的乾物質累積速率,在不同生育階段雖然有異,但在本試驗栽培密度條件下,並不受環境因子的環境。
Palavras-chave: 玉米 栽培密度 營養生長 乾物質累積 氮素累積 Zea mays; Plant spacing; Vegetative growth; Dry matter accumulation; N accumulation [[classification]]6.
Ano: 1995
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植酸酵素基因轉殖之馬鈴薯植株生長和產量評估 Taiwan Agricultural Research Institute
陳烈夫; 曾文彬; 魏夢麗; 呂秀英; Lit-Fu Chan; Wen-Pin Tseng; Meng-Li Wei; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]馬鈴薯 (Solanum tuberosum L.) 是世界上最重要的非禾穀類糧食作物。基因轉殖馬鈴薯2-1品系,是由克尼伯 (Kennebec) 品種轉殖植酸酵素基因 (phytase gene) 所產生的基因轉殖作物。根據在農業試驗所隔離試驗田進行的2004-2005年秋作試驗結果顯示,植酸酵素基因轉殖馬鈴薯在各生長期的主莖長、側枝數及地上部乾重等生長介量雖較克尼伯為低但未達統計上5%顯著水準差異;單株薯球總鮮重雖稍低但亦無顯著差異。植酸酵素基因轉殖馬鈴薯2-1品系可能不適合自行留種連續栽種,其第二年(2005年)連續栽種之產量表現,小於120 g的薯球數量明顯減少。轉殖馬鈴薯在第四週時的出土率,也顯著低於非轉殖馬鈴薯。
Palavras-chave: 馬鈴薯 基因轉殖作物 植酸酵素基因 薯球產量 出土率 Potato; Genetically modified crops; Phytase gene; Tuber yield; Emergence rate [[classification]]1.
Ano: 2007
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水稻抗白葉枯病基因之密碼子使用偏性 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 鍾依涵; 呂椿棠; 呂秀英; Meng-Li Wei; Yi-Han Chung; Chun-Tang Lu; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]密碼子使用偏性分析對水稻白葉枯病抗病基因 (Xa) 之抗性分子機制之瞭解 相當重要,因此本研究自NCBI (National Center for Biotechnology Information) 公 共資料庫下載已完全定序的Xa 基因 (Xa1, xa5, xa13, Xa13, Xa21, Xa26 及Xa27) 及 其家族之17 個編碼區序列 (coding domain sequence, CDS) 進行密碼子使用偏性分 析。首先進行各Xa 基因之同義密碼子相對使用度 (relative synonymous codon usage, RSCU) 的集群分析和對應分析,可將Xa 基因之CDS 明顯區分成4 群。進而再分 別計算各群基因之同義密碼子相對使用頻率 (relative frequency of synonymous codon, RFSC) 以篩選出高頻密碼子,結果發現蛋白質序列具有多白胺酸重複 (leucine-rich repeat, LRR) 區域結構且CDS 長度大於1000 bp 的Xa1、Xa21 及Xa26, 其大多數胺基酸並無密碼子使用偏好性,僅少數胺基酸偏好以A 或U 結尾的同義 密碼子;而不具LRR 區域蛋白質結構且CDS 長度較短的xa5、xa13、Xa13 及Xa27, 則幾乎所有胺基酸都偏好以C 或G 結尾的同義密碼子。Xa1、Xa21、Xa26 及Xa27 的表現蛋白質皆含豐富之白胺酸 (leucine, Leu),但Xa1、Xa21 及Xa26 的Leu 並 無偏好任何密碼子,亦即其表現蛋白質的Leu 可選擇任意同義密碼子轉譯,而Xa27 的Leu 則高度偏好使用CUC。由此顯見,同樣對白葉枯病菌產生抗性的不同Xa...
Palavras-chave: Xa基因 同義密碼子相對使用度 同義密碼子相對使用頻率 集群分析 對應分析 Xa genes; Relative synonymous codon usage; Relative frequency of synonymous codon; Cluster analysis; Correspondence analysis [[classification]]6.
Ano: 2009
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水稻抗白葉枯病基因同義密碼子使用偏性之影響因素探討 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 鍾依涵; 呂椿棠; 呂秀英; Meng-Li Wei; Yi-Han Chung; Chun-Tang Lu; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]同樣對白葉枯病菌產生抗性的不同Xa 基因間,呈現出密碼子使用偏性的多樣性。因此,本研究進行Xa 基因同義密碼子使用偏性之影響因素探討,以進而暸解形成密碼子使用的演化機制。研究材料係取自NCBI (National Center for Biotechnology Information) 之GenBank 資料庫下載已完全定序的Xa 基因 (Xa1, xa5, xa13, Xa13, Xa21, Xa26 及Xa27) 及其家族之17 個編碼區序列 (coding domain sequence, CDS),透過計算這些Xa 基因的CDS 長度及各種同義密碼子使用偏性指標,如同義密碼子相對使用度 (relative synonymous codon usage, RSCU)、密碼子適應指標 (codon adaption index, CAI)、有效密碼子數 (effective number of codons,ENC)、同義密碼子第三位置出現G 或C 核苷酸之頻率 (GC3) 以及同義密碼子第一、二位置出現G 或C 核苷酸之平均頻率 (GC12),並分析其間之關係,以闡明同義密碼子使用偏性之主要影響因素。結果發現Xa 基因之CDS 長度及基因表達程度與同義密碼子使用偏性有極顯著關係,即Xa 基因長度較短者可有較高的基因表達程度、以及較高的同義密碼子使用偏性,如xa5、xa13、Xa13 及Xa27 基因。 Xa 基因序列之GC3 組成限制,也影響密碼子的使用。而GC3 突變偏性又受到GC12之影響,造成Xa 基因之同義密碼子使用偏性。
Palavras-chave: 同義密碼子使用偏性 基因表達程度 GC含量 突變偏性 分子演化 Synonymous codon usage bias; Gene expression level; GC3 content; Mutation bias; Molecular evo lution; Bacterial leaf blight; Xanthomonas oryzae [[classification]]6.
Ano: 2010
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水稻抗白葉枯病基因表現蛋白質之多白胺酸重復(LRR)的分布及胺基酸組成 Taiwan Agricultural Research Institute
林奕承; 呂椿棠; 魏夢麗; 呂秀英; Yi-Chen Lin; Chun-Tang Lu; Meng-Li Wei; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]目前已知多白胺酸重複 (leucine-rich repeat, LRR) 為生物體抗病基因蛋白質序列 上的特有序列,因此本研究針對水稻所有已定序之Xa基因,自NCBI (National Center for Biotechnology Information) 及KOME (Knowledge-based Oryza Molecular Biological Encyclopedia) 公共資料庫內擷取出它們已知的CDS (coding domain sequence) 與全 長cDNA 序列,將其轉譯的蛋白質序列利用Pfam 蛋白質家族資料庫尋找出各LRR 片段,發現僅在Xa1、Xa21 及Xa26 基因之表現蛋白質結構中發現LRR 存在。進而 利用生物資訊與統計方法,進行不同Xa 基因蛋白質之LRR 序列的分布及胺基酸組成 之比較分析。結果顯示,Xa1 之LRR 在蛋白質序列中鬆散分布於NB-ARC (nucleotidebinding adaptor shared by APAF-1, R proteins, and CED-4) 區域序列之後,而Xa21 及 Xa26 之LRR 則密集分布在NB-ARC 或P-kinase (protein-kinase) 區域序列之前。Xa1 的蛋白質序列中靠近NB-ARC 區域序列的前一、二個LRR 似乎較遠離其他LRR,但 Xa21 和Xa26 的蛋白質之LRR 區域結構並未有如此現象。三個Xa 基因表現蛋白質之 LRR 序列的胺基酸組成皆以親水性胺基酸為最多且其中以白胺酸 (leucine) 出現頻 率最高,其次為不帶電荷之絲胺酸 (serine)。Xa1 蛋白質之LRR 在某些胺基酸的出現 頻率相異於Xa21...
Palavras-chave: 水稻 Xa基因 白葉枯病 多白胺酸重複 胺基酸組成及屬性 Rice; Xa genes; Bacterial blight; Xanthomonas oryzae pv. oryzae; Leucine-rich repeat; Amino acids [[classification]]6.
Ano: 2009
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水稻病蟲害診斷與防治資訊系統 Taiwan Agricultural Research Institute
呂秀英; 黃守宏; 張義璋; 鄭清煥; 魏夢麗; 李竺玲; 呂椿棠.
Palavras-chave: 水稻病蟲害防治; 知識庫; 徵狀診斷規則表; 台灣稻作資訊系統; [[classification]]10.
Ano: 2010
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水稻白葉枯病抗性基因之蛋白質胺基酸的多變數分析 Taiwan Agricultural Research Institute
魏夢麗; 鍾依涵; 呂椿棠; 呂秀英; Meng-Li Wei; Yi-Han Chung; Chun-Tang Lu; Hsiu-Ying Lu.
[[abstract]]蛋白質中的胺基酸組成隱藏甚多訊息,但其組成特性會因不同物種或物種內不同基 因而異,故蛋白質的胺基酸組成分析成為生物資訊研究的重要課題之一。胺基酸組成特 性是由多個物種或基因 (觀測值) 與20 種胺基酸之頻率 (變數) 所構成的資料矩陣來決 定,這種多維資料形式所含之訊息,最適合利用多變數分析 (multivariate analysis) 之統 計技術來解析。為促進水稻白葉枯病抗病基因 (Xa) 蛋白質序列的結構研究,有必要針 對所有已完全定序的Xa 基因進行蛋白質之胺基酸組成分析。基此,本研究以NCBI 公 共資料庫內已知序列的Xa1、xa5、xa13、Xa13、Xa21、Xa26 及Xa27 等基因共17 條蛋 白質序列為供試材料,綜合運用集群分析 (cluster analysis) 及對應分析 (correspondence analysis),來檢測不同Xa 基因之蛋白質胺基酸組成的變異形式。結果顯示,根據胺基酸 組成比例,可將Xa 基因及其家族分成六群,各群基因之蛋白質序列中各有偏好的胺基 酸。Xa1、Xa21、Xa26 及Xa27 基因之蛋白質序列中皆以白胺酸 (leucine) 出現頻率最高; xa13、Xa13 及Xa27 的丙胺酸 (alanine) 出現較多但絲胺酸 (serine) 較少;xa13 及Xa13 也有較多的纈胺酸 (valine);xa5 出現麩胺酸 (glutamic acid) 和酥胺酸 (threonine) 的頻 率遠高於其他基因;所有Xa 基因皆含有高比例的疏水性胺基酸。本研究揭示出多變數 分析之統計技術,可有效檢測出Xa 基因間蛋白質之胺基酸組成的變異形式。
Palavras-chave: 水稻 Xa基因 蛋白質結構 胺基酸組成及屬性 集群分析 對應分析 Rice (Oryza sativa L.); Xa genes; Protein structure; Composition and attribution of amino acids; Cluster analysis; Correspondence analysis [[classification]]6.
Ano: 2008
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水稻粒形量化分析-I、形狀參數之決定 Taiwan Agricultural Research Institute
呂秀英; 魏夢麗; 呂椿棠; 陳烈夫; Hsiu-Ying Lu; Meng-Li Wei; Chun-Tang Lu; Lit-Fu Chan.
[[abstract]]隨著市售稻米品牌愈來愈多,為求能夠快速且準確地區分出穀粒樣品間的形狀差異,進行自動化篩選,達到品質管制之目的,於是影像分析系統之應用漸受重視。該項技術在軟體設計方面之發展,首先要確立有效的形狀指標。傳統上以長寬比例將稻米區分為三類(長、中及短粒形),但此對影像測量系統而言,則過於簡單而不足以充分地辨識稻米之粒形變異。有關稻米穀粒的形態量化分析研究仍相當闕如,故本研究以40個稉稻品種(系)之稻穀及糙米為試驗材料,利用可測的長(L)、寬(W)、厚(D)、面積(A)及圓周(P)等幾何特徵,估算7種二維(2D)或三維(3D)之形狀參數(S1~S7),並探討這些形狀參數之間的關係,以從中找出最能代表水稻粒形的量化指標。結果得知,稻穀或糙米的分析結果一致,若採用2D法則建議利用長、寬及面積所建立之形狀參數S2(=L/A)、S5(=4A/πLW)、S6(=W/L),就能有效地將稻穀及糙米之粒形予以量化;若考慮3D法,則可再搭配形狀參數S7(=(L+W)/2D)。
Palavras-chave: 稉稻 粒形 幾何特徵 形狀參數 影像分析系統 Japonica rice; Grain shape; Geometric features; Shape parameters; Image analysis system [[classification]]6.
Ano: 2003
Registros recuperados: 31
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