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Descriptive analysis of haplotypes in a population of Canchim beef cattle. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A..
The aim in this study was to descriptively analyze haplotypes from a Canchim beef cattle population.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação; Gado; Cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946423
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Descriptive analysis of haplotypes in a population of Canchim beef cattle. Repositório Alice
MOKRY, F. B.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A..
The aim in this study was to descriptively analyze haplotypes from a Canchim beef cattle population.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação; Gado; Cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/967077
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Expressão gênica diferencial em bovinos nelore, angus x nelore e senepol x nelore infestados com carrapato rhipicephalus (boophilus) microplus. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, M. C. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. R. B; ALENCAR, M. M.; GIGLIOTI, R.; REGITANO, L. C. A..
Os bovinos apresentam vários mecanismos de proteção ao carrapato, que ocorrem durante por todo o estágio parasitário de aproximadamente 3 semanas. No entanto, tem sido verificado que animais resistentes geralmente apresentam a maior rejeição às larvas, em quantidade absoluta, nas primeiras 24 horas após a infestação. Isso ocorre provavelmente devido ao impedimento de fixação das larvas pelas reações iniciadas no hospedeiro. Dessa maneira, o objetivo deste trabalho foi verificar a expressão gênica diferencial em bovinos após 24 horas da infestação artificial com carrapato R. microplus. Foram utilizadas 7 fêmeas de cada grupo genético: cruzadas Senepol x Nelore, Angus x Nelore, e Nelore, nascidas, na Embrapa Pecuária Sudeste. Os animais livres de carrapatos...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Carrapato; Microarranjos; Expressão gênica diferencia; Bovinos..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885898
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Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A..
Entre os principais problemas da pecuária brasileira está o parasitismo pelo carrapato bovino, Rhipicephalus microplus, acarretando prejuízos de mais de dois bilhões de dólares por ano. A compreensão dos mecanismos envolvidos na resistência genética aos carrapatos é importante porque pode auxiliar a identificação de genes ou marcadores para essa característica. O objetivo deste trabalho foi identificar genes e vias regulatórias envolvidos na discriminação de grupos de bovinos resistentes e sensíveis submetidos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Infestação artificial de carrapato; Bovinos infestados com carrapatos; Mecanismos de resistência a carrapatos; Vias regulatórias; Expressão gênica..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885900
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Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A..
Entre os principais problemas da pecuária brasileira está o parasitismo pelo carrapato bovino, Rhipicephalus microplus, acarretando prejuízos de mais de dois bilhões de dólares por ano. A compreensão dos mecanismos envolvidos na resistência genética aos carrapatos é importante porque pode auxiliar a identificação de genes ou marcadores para essa característica. O objetivo deste trabalho foi identificar genes e vias regulatórias envolvidos na discriminação de grupos de bovinos resistentes e sensíveis submetidos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Infestação artificial de carrapato; Bovinos infestados com carrapatos; Mecanismos de resistência a carrapatos; Vias regulatórias; Expressão gênica; Rhipicephalus microplus; Genes.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/875224
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Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. N.; ALENCAR, M. M.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJÓ, G. L. D.; SILVA, L. O. C.; TORRES, R. A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
A genome wide-association study (GWAS) for Warner-Bratzler shear force (WBSF) measured at different times of meat aging was conducted using genotype data from the Illumina BovineHD BeadChip to identify QTLs in Nelore cattle (n=442).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Gado de corte; Genome; Beef cattle; Nellore.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/969364
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Genome-wide association for growth traits in Canchim beef cattle. Repositório Alice
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; TORRES JÚNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A.; MUNARI, D. P..
Abstract. Studies are being conducted on the applicability of genomic data to improve the accuracy of the selection process in livestock, and genome-wide association studies (GWAS) provide valuable information to enhance the understanding on the genetics of complex traits. The aim of this study was to identify genomic regions and genes that play roles in birth weight (BW), weaning weight adjusted for 210 days of age (WW), and long-yearling weight adjusted for 420 days of age (LYW) in Canchim cattle. GWAS were performed by means of the Generalized Quasi-Likelihood Score (GQLS) method using genotypes from the BovineHD BeadChip and estimated breeding values for BW, WW, and LYW. Data consisted of 285 animals from the Canchim breed and 114 from the MA genetic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association study; Gado de corte; Beef cattle.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003481
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Genome-wide association study of weight gain in feedlot Nellore cattle: comparison of single nucleotide polymorphism and haplotype blocks approaches. Repositório Alice
SOMAVILLA, A. L.; MOTA, M. D. S.; ROSA, A. do N.; COUTINHO,; ALENCAR, M. M.; TULLIO, R. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Beef cattle; Bos indicus; Growth; QTL; SNP.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972657
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Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. Repositório Alice
VERONESI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; GROSSI, D. A.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. de A..
Canchim is a synthetic beef cattle developed in Brazil which have good growth potential and tropical adaptation but suboptimal fat deposition. There are genomic regions associated with fat deposition already described, among them the centromeric region of BTA14. The scope of this work was to identify genomic regions associated with backfat thickness in Canchim (5/8 Charolais + 3/8 zebu) and MA (offspring of Charolais bulls and 1/2 Canchim + 1/2 Zebu cows) populations and to validate the association of haplotypes of the BTA14 with backfat thickness in this population. Thirty animals with extreme phenotypes were genotyped with the 54 K SNP chip, revealing 100 signifi cant SNPs contained in chromosomes 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 14, 15, 17, 18,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Canchim; Genômica; Beef cattle; Genomics.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876696
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Initial analysis of copy number variations in canchim beef cattle with extreme phenotypes for ribeye area. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. P.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V.; NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; MEIRELLES, S. L. C.; LIMA, A. O.; REGITANO, L. C. A..
Genomic structural variation, in the form of large-scale insertions and deletions, as well as inversions and translocations, are referred to as copy number variations (CNVs). Compared to single nucleotide polymorphisms (SNPs), CNVs have potentially greater effects on gene structure, dosage and regulation, being an important source of phenotypic variation. In humans, CNVs are widespread in the genome and have been shown to be associated with complex traits. In livestock species, the characterization of this genetic variation is an important step toward linking genes or genomic regions with phenotypic traits of economic importance. Studies in cattle have revealed some CNVs associated with differences in host parasite resistance and breed-specific differences...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Variação genética; Polimorfismo de nucleotídeo único; Bioinformática; Copy number variations; Genetic variation; Single nucleotide polymorphisms; Bioinformatics.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974748
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Initial analysis of copy number variations in canchim beef cattle with extreme phenotypes for ribeye area. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. P.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V.; NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; MEIRELLES, S. L. C.; LIMA, A. O.; REGITANO, L. C. A..
Genomic structural variation, in the form of large-scale insertions and deletions, as well as inversions and translocations, are referred to as copy number variations (CNVs). Compared to single nucleotide polymorphisms (SNPs), CNVs have potentially greater effects on gene structure, dosage and regulation, being an important source of phenotypic variation. In humans, CNVs are widespread in the genome and have been shown to be associated with complex traits. In livestock species, the characterization of this genetic variation is an important step toward linking genes or genomic regions with phenotypic traits of economic importance. Studies in cattle have revealed some CNVs associated with differences in host parasite resistance and breed-specific differences...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Variação genética; Polimorfismo de nucleotídeo único; Bioinformática; Copy number variations; Genetic variation; Single nucleotide polymorphisms; Bioinformatics.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/980708
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