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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/171242/1/Resumo50CBFito-0637.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: E guineensis; E oleifera; NBS-LRRs; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085646
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Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. Repositório Alice
VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
A seca é uma das principais limitações climáticas à produção do cafeeiro. A importância dessa limitação deve aumentar, em função das mudanças reconhecidas no clima global e, também, porque a cafeicultura vem sendo expandida para regiões marginais onde a baixa pluviosidade e temperaturas desfavoráveis se constituem grandes limitações à produção do café. A seca induz diversas respostas fisiológicas e moleculares nas plantas, incluindo alterações da expressão gênica, visando atingir ajuste osmótico, a indução de reparadores de sistemas moleculares e a expressão de diversas proteínas protetoras. Existem diversas formas de se avaliar a expressão gênica em plantas submetidas ao estresse hídrico. Uma técnica amplamente utilizada nos últimos anos, para a análise...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Expressão gênica; Gene candidato; Seca; Coffea canephora; Candidate genes; Drought; Gene expression.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903864
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Construction and characterization of a BAC library from the Coffea arabica genotype Timor Hybrid CIFC 832/2. Repositório Alice
CACAO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; DINIZ, L. E. C.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; ANDRADE, A. C.; CARPENTIERI PIPOLO, V.; PEREIRA, L. F. P..
bitstream/item/179851/1/Cacao2013-Article-ConstructionAndCharacterizatio.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética de planta; Marcador; Coffee; Genetic; Café; Genética.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/968360
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Controlled irrigation and nitrogen, phosphorous and potassium fertilization affect the biochemical composition and quality of Arabica coffee beans. Repositório Alice
VINECKY, F.; DAVRIEUX, F.; MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; LAVAGNINI, G.; LEROY, T.; BONNOT, F.; ROCHA, O. C.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
Controlled irrigation during the dry period associated with adequate nitrogen (N), phosphorous (P) and potassium (K) fertilization led to the accumulation of biochemical compounds in coffee beans considered as positive precursors of beverage quality. Adult plants of coffee (Coffea arabica ?Rubi?) were cultivated using different water regimes (WR) and fertilization conditions under the dry climate of the Brazilian Cerrado. Coffee-bean physical characteristics were evaluated as well as biochemical composition by near-infrared analysis. The K treatment mostly affected bean biochemistry, lipid and chlorogenic acid (CGA) contents, which increased with increasing amounts of fertilizer. Caffeine contents increased with higher amounts of N, but no significant...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sistema de irrigação; Fertilidade do Solo; Fertilizante Nitrogenado; Fertilizante Potássico; Fertilizante Fosfatado; Coffea Arabica.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065059
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Controlled irrigation and nitrogen, phosphorous and potassium fertilization affect the biochemical composition and quality of Arabica coffee beans. Repositório Alice
VINECKY, F.; DAVRIEUX, F.; MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; LAVAGNINI, G.; LEROY, T.; BONNOT, F.; ROCHA, O. C.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCNINI, P.; ANDRADE, A. C..
Controlled irrigation during the dry period associated with adequate nitrogen (N), phosphorous (P) and potassium (K) fertilization led to the accumulation of biochemical compounds in coffee beans considered as positive pre-cursors of beverage quality. Adult plants of coffee (Coffea arabica?Rubi?) were cultivated using different water regimes (WR) and fertilization conditions under the dry climate of the Brazilian Cerrado. Coffee-bean physical characteristics were evaluated as well as biochemical composition by near-infrared analysis. The K treatment mostly affected bean biochemistry, lipid and chlorogenic acid (CGA) contents, which increased with increasing amounts of fertilizer. Caffeine contents increased with higher amounts of N, but no significant...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Controlled irrigation; Caffeine.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066248
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Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Repositório Alice
ALVES, G. S. C.; TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; BREITLER, J-C.; JOËT, T.; GATINEAU, F.; ANDRADE, A. C.; BERTRAND, B.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H..
Despite the importance of the DREB1D gene (also known as CBF4) in plant responses to water deficit and cold stress, studies analysing its regulation by transgenic approaches are lacking. In the current work, a functional study of three CcDREB1D promoter haplotypes (named HP15, HP16 and HP17) isolated from drought-tolerant and droughtsensitive clones of Coffea canephora was carried out in plants of C. arabica stably transformed by Agrobacterium tumefaciens by analysing their ability to regulate the expression of the uidA reporter gene in response to water deficit mimicked by polyethylene glycol (−2.0 MPa) and low relative humidity treatments.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffe; Water deficit; Genetic transformation; Haplotypes; Reporter gene.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084513
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Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. Repositório Alice
GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de.
bitstream/item/184260/1/EnPI-2018-8.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Transcritoma; NGS; Pré-tratamento biológico; Macrofungos; Jatropha Curcas.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097269
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Expression analysis ofdrebsubfamily genes in leaves and roots of Coffea canephora Conilon subjected to Drought. Repositório Alice
REICHEL, T.; ALVES, G. S. C.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Temperature variations.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066329
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Functional analysis of different promoter haplotypes of the coffee (Coffea Canephora) CcDREB1D gene through genetic transformation of Nicotiana tabacum. Repositório Alice
AQUINO, S. O.; CARNEIRO, FERNANDA A; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Conilon; DREB genes.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066317
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076414
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074046
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Influence of abiotic stresses in phenotypic expression of transgenic plants of Coffea Arabica under action CcDREB1D promoter. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DECHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; DINIZ, L. E. C.; PAIVA, L. V; BREITLER, J-C.; ANDRADE, A. C.; MARRACINI, P.; ETIENNE, HERVE.
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DREB; Abiotic stress; Biotic stress.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066290
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Molecular responses of coffee plants to drought stress. Repositório Alice
MARRACCINI, P.; VIEIRA, N. G.; DUARTE, K. E.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F. A.; COSTA, T. S.; SUJII, P. S.; VINECKY, F.; ALEKCEVETCH, J. C.; ALVES, G. S. C.; LEROY, T.; BELLIS, F. de; FERRÃO, M. A. G.; DAMATTA, F. M.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C..
With the aim to investigate the molecular mechanisms underlying drought tolerance in coffee plants of C. canephora and C. arabica, qPCR experiments identified more than 80 candidate genes (CGs) presenting differential gene expression between drought-tolerant and drought-susceptible clones/cultivars cultivated under different (with or without) irrigation conditions.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tolerância à seca; Café; Water stress; Coffea; Drought tolerance.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979069
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Prospecção de promotores tecido-específico em Café. Infoteca-e
ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; CAÇÃO, S. B.; EIRA, M. T. S.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; PEREIRA, L. F. P.; DA SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, M..
2008
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Café; Coffea; Prospecção; Genoma; Organismo geneticamente modificado.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/191191
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RBCS1 expression in coffee: coffea orthologs, coffea arabica homeologs, and expression variability between genotypes and under drought stress. Repositório Alice
MARRACCINI, P.; FREIRE, L. P.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; ELBELT, S.; RAMOS, H. J. O.; MONTAGNON, C.; VIEIRA, L. G. E.; LEROY, T.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C..
Background: In higher plants, the inhibition of photosynthetic capacity under drought is attributable to stomatal and non-stomatal (i.e., photochemical and biochemical) effects. In particular, a disruption of photosynthetic metabolism and Rubisco regulation can be observed. Several studies reported reduced expression of the RBCS genes, which encode the Rubisco small subunit, under water stress. Results: Expression of the RBCS1 gene was analysed in the allopolyploid context of C. arabica, which originates from a natural cross between the C. canephora and C. eugenioides species. Our study revealed the existence of two homeologous RBCS1 genes in C. arabica: one carried by the C. canephora sub-genome (called CaCc) and the other carried by the C. eugenioides...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Café; Expressão gênica; Sequência genética; Genética molecular; Coffea arabica; Coffea canephora; Gene expression; Molecular genetics.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905604
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RNA-Seq em Coffea arabica: genes candidatos em condições de estresse abiótico. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C..
A crescente pesquisa na área de expressão gênica em busca de genes candidatos associados às respostas aos estresses abióticos têm possibilitado estudar o transcriptoma e identificar genes responsivos a esses estresses. O principal objetivo deste trabalho foi obter uma visão geral dos genes ativos em folhas de café arábica variedade Caturra quando submetido a vários estresses abióticos e analisar estes genes identificados in silico por meio da técnica de RT-qPCR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequenciamento por síntese (SBS); Experimento RT-qPCR; Gene; Cafeeiro; Coffea arabica.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084690
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Transcriptome analysis in Coffea arabica, under several abiotic stresses, reveals differentially expressed genes in leaves. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C..
In recent years, Coffea ssp. has become subject of increasing research in gene expression analysis, in the quest to find genetic factors associated to abiotic stress responses with special attention to transcription factors such as the DREB family. This focus was due to their involvement in the regulation of many stress-related genes that play an important role in cascading a response to an environmental stimuli. RNA-seq analysis, creates the possibility to s study the transcriptome and to identify differentially expressed genes upon an abiotic stress or any important agronomic trait. The main objectives of this work were to obtain an overview of the transcriptionally active genes in Arabica coffee leaves when subjected to several abiotic stresses and to...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DREB family; Coffea arabica; Abiotic stress; Genetic factors.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084646
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