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Angiospermes des côtes françaises Manche-Atlantique. Propositions pour un indicateur DCE et premières estimations de la qualité ArchiMer
Auby, Isabelle; Oger-jeanneret, Helene; Sauriau, Pierre-guy; Hily, Christian; Barille, Laurent.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14358/11646.pdf
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Approche multirésidus pour le suivi des pesticides dans différents compartiments (eau, sédiment, huîtres) de l’environnement aquatique du bassin d’Arcachon ArchiMer
Murcia, Fréderic; Le Menach, Karyn; Pardon, P.; Augagneur, S.; Armstrong, N.; Tapie, Nathalie; Auby, Isabelle; Budzinski, Helene.
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00259/37069/35581.pdf
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Assessment and interpretation of temporal or spactial differences in shellfish productivity of typical French ecosystems ArchiMer
Mazurie, Joseph; Soletchnik, Patrick; Ropert, Michel; Fleury, Pierre-gildas; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Bacher, Cedric.
Monitoring of Crassostrea gigas performances, from two year-classes, during 12 years, in various French shellfish farming areas have revealed great inter-annual and inter-sites differences in reproduction, growth, mortality or quality of oysters (meat content, Polydora infestation...). The presentation attempts to highlight how a comparative analysis of existing temporal or spatial data on molluscs, water quality, geography or meteorogoly may help to better understand and manage shellfish ecosystems. The range of hydrobiological conditions (food availability, turbidity, temperature...) recorded at national, pluriannual scale, in relation to shellfish performances, enlarges the base of such relationship. However, undirect causative factors, either natural...
Tipo: Text Palavras-chave: Climatic modulation; Hydro geography; Reproduction; Growth; Spatial differences; Water quality; Mortality; Shellfish productivity.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3318.pdf
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Bassin Adour-Garonne : hydrologie et phytoplancton – Résultats 2013-2018 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2013 et 2018), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00516/62735/67113.pdf
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Bilans depuis 1999 et évolution de la stratégie du REPAMO ArchiMer
Thebault, Anne; Martin, Anne-genevieve; Pichot, Yves; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; Le Coguic, Yvette; Tige, Gilbert; Hirata, Toshio; Mazurie, Joseph; Le Saux, Jean-claude; Masson, Nadine; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Le Roux, Frédérique; Cochennec, Nathalie; Renault, Tristan; Berthe, Franck; Grizel, Henri.
The main objectives of the Mollusc Pathology Network (REPAMO) are to prevent introductions or outbreaks of infectious agents, prevent spread within a farm and especially from one farm to another, to study ways of decreasing the impact of infectious agent and to monitor the development of these pathogens in order to guarantee the health status of oysters exchanged with our commercial partners. On the whole, REPAMO's activities have not changed and include: - monitoring the development of diseases that have to be reported to authorities and carrying out analyses to classify zones: bonamiosis and marteiliosis; - baseline monitoring of farmed and wild populations of bivalve molluscs; - studying cases of abnormal mortality events; - controlling mollusc...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques; Réseau surveillance; Pathologie; REPAMO.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3265.pdf
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Biomass and species composition of macrophytes in Arcachon Bay and Prevost lagoon, with a compilation of data of primary production in Arcachon Bay ArchiMer
Auby, Isabelle; Bachelet, Guy; Labourg, Pierre Jean.
Tipo: Text
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00259/37008/35505.pdf
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Can pesticides, copper and seasonal water temperature explain the seagrass Zostera noltei decline in the Arcachon bay? ArchiMer
Gamain, Perrine; Feurtet-mazel, Agnes; Maury-brachet, Regine; Auby, Isabelle; Pierron, Fabien; Belles, Angel; Budzinski, Helene; Daffe, Guillemine; Gonzalez, Patrice.
Dwarf eelgrasses (Zostera noltei) populations have decreased since 2005 in Arcachon Bay (southwest France). Various stressors have been pointed out, however the role of xenobiotics like pesticides or copper (Cu) and of parameters like water temperature warming have not yet been explored. To determine their impact, Z. noltei individuals were collected in a pollution-free site and transferred to the laboratory in seawater microcosms. This dwarf eelgrass was exposed to a pesticide cocktail and copper, alone or simultaneously, at temperatures (10 °C, 20 °C, 28 °C) representative of different seasons. After a two-week contamination, leaf growth, leaf bioaccumulation of Cu, and differential expression of target genes were studied. Eelgrasses bioaccumulated Cu...
Tipo: Text Palavras-chave: Zostera noltei; Arcachon Bay; Pesticides; Copper; Cellular impacts.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00407/51831/58536.pdf
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Caractérisation de la qualité biologique des Masses d'Eau Côtières. Cartographie des herbiers à Zostera noltei et Zostera marina du Lac d'Hossegor. MEC FRFC09 - année 2013 ArchiMer
Trut, Gilles; Rigouin, Loic; Auby, Isabelle; Ganthy, Florian; Oger-jeanneret, Helene; Gouilleux, Benoit.
Le présent rapport concerne l’actualisation 2013 du suivi surfacique des herbiers du Lac d’Hossegor (emprise maximale colonisée par les deux espèces), qui doit être effectuée une fois par plan de gestion (soit tous les 6 ans). En 2008, une carte des herbiers a été réalisée par l’Ifremer (Trut et al., 2009). Quelques années auparavant (2004), une cartographie avait été établie par le syndicat mixte de rivière Bourret-Boudigau, qui nous a transmis ces données. La fiabilité de cette première carte au 1/85 000 est cependant difficile à estimer, du fait qu’elle n’est pas assortie de métadonnées. Nous avons établi, à partir d’une analyse spatiale SIG, une première tendance d’évolution de l’emprise maximale des herbiers, en comparant trois séries de données...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00193/30437/28844.pdf
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Caractérisation de la qualité biologique des Masses d'Eau Côtières : Cartographie des herbiers à Zostera noltii et Zostera marina du Lac d'Hossegor. MEC FRFC09 ArchiMer
Trut, Gilles; Dalloyau, Sebastien; Auby, Isabelle.
Ce rapport présente la carte des herbiers de zostères intertidales et subtidales du Lac d'Hossegor, établie en 2009.
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00181/29215/27626.pdf
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Caractérisation de la qualité biologique des Masses d'Eau Côtières : Cartographie des herbiers de Zostera noltii et Zostera marina du Bassin d'Arcachon ArchiMer
Dalloyau, Sebastien; Trut, Gilles; Plus, Martin; Auby, Isabelle; Emery, Eric.
Le suivi surfacique des herbiers de zostères du Bassin d'Arcachon (a été entrepris en 2007 (pour Zostera noltii) et 2008 (pour Zostera marina). Pour Zostera noltii, cette cartographie a été réalisée par photo-interprétation d’une mosaïque d’images de résolution 1 mètre. Ces clichés IGN, orthorectifiés et georéferencés ont été acquis en août et septembre 2007. Un important travail de validation terrain a permis d'attribuer des indices de fiabilité aux cartographies obtenues. Pour Zostera marina, la méthode a consisté à coupler une information de présence/absence déterminée par superposition de signaux issus d’un sonar latéral et d’un sondeur acoustique à des observations terrain obtenues par une caméra vidéo tractée sous marine reliée à un système de...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27833/26039.pdf
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Carbon sequestration loss following Zostera noltei decline in the Arcachon Bay (France) ArchiMer
Ribaudo, Cristina; Plus, Martin; Ganthy, Florian; Auby, Isabelle.
The worldwide decline of seagrass meadows may result in the loss of relevant ecosystem services such as the carbon sequestration within marine ecosystems. In this paper, net primary production (NPP) of Zostera noltei meadows was assessed in the Arcachon Bay (SW France) with the aim of understanding the impact of meadows decline on C sequestration capacity at a basin scale. Net growth rates obtained by means of a year-long leaf-marking experiment (2005-2006) were coupled to interannual biomass measurements (1983-2010) to obtain a direct estimate of NPP. Concurrently, an indirect estimate was obtained through a mathematical model which embedded natural factors variation (temperature, light and nutrients). Z. noltei seasonal growth and leaf morphometry...
Tipo: Text Palavras-chave: Seagrass; Meadow regression; Macrotidal lagoon; Growth model; Nutrient leaf resorption.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00309/42061/41357.pdf
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Cartographie des Herbiers de Zostères. Guide technique ArchiMer
Bajjouk, Touria; Cordier, Celine; Auby, Isabelle; Liabot, Pierre-olivier; Kerninon, Fanny; Le Bouffant, Naig; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene.
Les phanérogames marines sont devenues ces dernières années des "espèces phares". Habitat à forte valeur écologique et patrimoniale, les herbiers bénéficient de mesures de gestion et de protection à différentes échelles : locale, nationale et internationale. Il y a donc un contexte favorable pour que les connaissances sur les herbiers progressent et que leur dynamique spatio-temporelle soit surveillée à une échelle globale. Depuis quelques années, et en lien avec les exigences des directives européennes, les phanérogames marines ont servi de support pour le développement et la valorisation des outils et techniques de télédétection pour la planification d'une gestion et d’une stratégie de surveillance efficace. En France, les méthodes pour évaluer les...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00514/62528/66891.pdf
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Chemical monitoring of sediments and molluscs in the Adour-Garonne district ArchiMer
Gouriou, Laure; Trut, Gilles; Rigouin, Loic; Lamouroux, Mélina; Oger-jeanneret, Helene; Auby, Isabelle.
ROCCH is the French monitoring network for the chemical contamination in coastal and transition water bodies. This network meets two objectives: assessing levels and trends of the chemical contamination of the French coastline and answering both environmental objectives of the Water Framework Directive (WFD) and obligations of marine regional conventions (OSPAR and Barcelona). For this purpose, bivalve mollusks are used as quantitative biological indicators for their properties to concentrate and accumulate pollutants in their soft tissues with a relationship to the ambient level; this characteristic makes the measurement of chemical contaminants technically simpler than in the water column. Furthermore, chemical monitoring in sediment is also performed....
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00471/58224/60730.pdf
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Classement des masses d’eau du littoral Manche-Atlantique sur la base de l’indicateur DCE «Angiospermes» (2012-2016) ArchiMer
Auby, Isabelle; Oger-jeanneret, Helene; Trut, Gilles; Ganthy, Florian; Rigouin, Loic; De Casamajor, Marie-noelle; Sanchez, Florence; Lissardy, Muriel; Fortune, Mireille; Manach, Soazig; Bizzozero, Lucie; Rollet, Claire; Lejolivet, Aurore; Desroy, Nicolas; Foveau, Aurelie; Le Mao, Patrick; Sauriau, P.g.; Aubert, A.; Cajeri, P.; Curti, C.; Duvard, A.; Latry, L.; Lachaussee, N.; Pineau, P.; Plumejeaud-perreau, C.; Aubin, S.; Droual, G.; Fournier, J.; Garcia, A; Guillaudeau, J.; Hubert, C.; Humbert, S.; Janson, A.l.; Masse, C.; Panizza, A.c.; Grall, J.; Maguer, M.; Hily, C.; Hacquebart, P.; Joncourt, Y.; Baffreau, A.; Timsit, O..
Certaines masses d’eau s’avérant parfois déclassées par cet élément de qualité, le groupe de travail DCE « Eaux Littorales » a sollicité de la part des scientifiques une réflexion sur les raisons de ce mauvais classement et les éventuelles actions de restauration ou d'amélioration de connaissances relatives aux herbiers de ces zones. L’objectif de cette expertise, soutenue par l’Agence Française pour la Biodiversité, et réalisée en collaboration avec les acteurs concernés par l’indicateur « angiospermes » sur les façades Manche-Atlantique, est d’identifier les pressions potentiellement responsables de cette situation (Tableau 1) en prenant également en compte l’effet des différentes métriques de l’indicateur sur les résultats obtenus.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00427/53868/54918.pdf
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Coastal phytoplankton community dynamics and coexistence driven by intragroup density-dependence, light and hydrodynamics ArchiMer
Barraquand, F.; Picoche, C.; Maurer, Daniele; Carassou, L.; Auby, Isabelle.
Phytoplanktonic communities maintain a high diversity in a seemingly homogeneous environment, competing for the same set of resources. Many theories have been proposed to explain this coexistence despite likely competition, such as contrasted responses to temporal environmental variation. However, theory has developed at a faster pace than empirical evaluation using field data, which requires inferring drivers of community dynamics from observational time series. Here, we combine autoregressive models with a data set spanning more than 20 years of phytoplankton counts every two weeks, together with nutrients and physical variables. By comparing models dominated by nutrients or physical variables (hydrodynamics and climate), we first explore which abiotic...
Tipo: Text Palavras-chave: Competition; Diatoms; Dinoflagellates; Hydrodynamics; Interactions; MAR; Mutualism; Network; Population dynamics; Seasonality; Time series.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57257/59285.pdf
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Comparaison des capacités photosynthétiques des zostères naines de deux étangs méditerranéens : Lagune de Thau et étang du Vaccarès. ArchiMer
Auby, Isabelle; Levavasseur, Guy; Plus, Martin; Deslous Paoli, Jean-marc; Grillas, Patrick.
Zostera noltii colonise en Méditerranée des baies abritées et des lagunes présentant des conditions abiotiques (e.g. atténuation lumineuse et salinité) très variées. Les zostères constituent des herbiers étendus et stables à Thau (Gerbal et Verlaque, 1995) qui est une lagune profonde et bien connectée à la mer (salinité peu variable). Dans le Vaccarès, moins bien connecté à la mer, cette espèce a présenté un développement important entre 1984 et 1996, alors que la salinité (moyenne annuelle) variait entre 30,1 et 4,8 (Grillas et Auby, 1996). L'objectif de ce travail était de préciser dans quelle mesure les conditions suboptimales (Tableau 1) auxquelles sont soumises les zostères du Vaccarès affecte leur production. Les capacités photosynthétiques...
Tipo: Text
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26287/24370.pdf
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Compte rendu des travaux d’accompagnement de l’opération Resur 2 menée par le Comité Régional Conchylicole d’Arcachon ArchiMer
Gouillieux, Benoit; Plus, Martin; Auby, Isabelle; Tchaleu, Gwenaelle; Lapegue, Sylvie.
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14386/11678.pdf
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Contribution à l’étude de l’origine de la chlorophylle dans le bassin d’Arcachon ArchiMer
Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Rigouin, Loic; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ganthy, Florian; Gouriou, Laure; Auby, Isabelle; Oger-jeanneret, Helene; Savoye, Nicolas; Lienart, Camilla; Jude, Florence; Del Amo, Yolanda; Beaugard, Laureen.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00387/49806/50380.pdf
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Contribution à l'étude des herbiers de Zostera noltii du Bassin d'Arcachon : Dynamique, production et dégradation, macrofaune associée ArchiMer
Auby, Isabelle.
This study aimed to characterize the ecology of the seagrass Zostera noltii in the Bassin d'Arcachon. These seagrasses, which belong to the family of Potamogetonaceae occupy in the Bay for about three quarters of the area of ​​intertidal areas. Despite their large size and ecological importance, this grass never had previously be studied. This thesis deals with eelgrass populations (distribution, growth, production and recycling) and the macrofauna associated with them (spatial and temporal variation of the nature and structure of animal populations). In addition to this descriptive approach, this work has also helped to quantify the participation of seagrass beds on the balance sheet of the organic matter in the Arcachon basin.
Tipo: Text
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15556/12945.pdf
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Cyanobactéries dans le Lac d’Hossegor en 2013 ArchiMer
Rumebe, Myriam; Auby, Isabelle; Chomerat, Nicolas; Amzil, Zouher; Costa, Magali; Arrue, François.
Cette note concerne une efflorescence de cyanobactéries du genre Planktothrix dans le Lac marin d'Hossegor, en janvier 2013. La provenance de ces microalgues a été identifiée et leur innocuité démontrée grâce aux résultats d'analyses des phycotoxines.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27834/26040.pdf
Registros recuperados: 143
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