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Aide à la décision pour la conservation des populations de saumon atlantique (Salmo salar L.) ArchiMer
Brun, Melanie.
The sustainable management of natural living resources is a major issue in a context of increasing scarcity due to human impact and of pervasive uncertainty. Improving existing tools and developing new ones to advise decision makers on the potential evolution of natural living resources, according to various management and environmental scenarios, is requested. This PhD aims at contributing to the development of a methodology for decision making for natural living resources management, while taking into account major sources of uncertainty. This is achieved through the study case of the Atlantic salmon (Salmo salar L.) population of the Nivelle River (France). This population is subjected to a long term monitoring program and the species has been...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31012/29416.pdf
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Définition d’un indice composition pour le phytoplancton en Manche- Atlantique, à partir des données du micro-phytoplancton du REPHY et des réseaux régionaux, et des mesures complémentaires de la flore phytoplanctonique acquises avec des techniques novatrices. Action 3 – Livrable 1. Propositions pour un indice de composition du phytoplancton, basé sur les résultats des méthodes microscopie, pigments et diversité génétique. Rapport final, février 2016 ArchiMer
Hernandez Farinas, Tania; Brun, Melanie; Siano, Raffaele; Delmas, Daniel.
This deliverable is composed of two reports which propose indice of phytoplankton composition, based respectively on the results of pigment and genetic diversity methods, and the results of microscopy method. Proposals based on the results of pigment and genetic diversity methods. The present work is a continuation of several studies carried out in the past (Siano and Delmas, 2013, 2015) on investigating an indicator of phytoplankton diversity using two methods complementary to optical microscopy: the genetic diversity analyzed with metabarcoding (exhaustive analysis of the diversity and relative abundance of OTUs, i.e. groups of sequences identified by their genetic resemblance) and the pigmentary diversity (analysis of the diversity and abundance of...
Tipo: Text Palavras-chave: Metabarcoding; OTUs; Pigments; Picophytoplancton; Indice composition; Niche ecologique; Mamiellophyceae; Chlorophylle b; Rade de Brest; Bretagne sud; Panache de la Gironde; Denombrements du micro-phytoplancton; Abondance totale; Monotonicite; Linearite; Pressions; Facade Manche-Atlantique; Metabarcoding; OTUs; Pigments; Picophytoplankton; Composition indice; Ecological niche; Mamiellophyceae; Chlorophyll b; Brest Bay; Southern Britain; Gironde plume; Micro-phytoplankton counts; Total abundance; Monotonicity; Linearity; Pressure; Channel-Atlantic coast.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00363/47421/47426.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-Analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin dans le cadre du REPHY. Résultats exercice 2016 ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie; Chomerat, Nicolas.
La détermination des espèces phytoplanctoniques et l’estimation de leur abondance dans le cadre du Réseau d’observation et de surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie, mis en œuvre par l’Ifremer (REPHY) s’appuie en 2016 sur 25 analystes, répartis dans 9 laboratoires sur 12 sites. Neuf d’entre eux ont été inscrits à titre individuel en 2016 pour participer à l'exercice d’inter-comparaison international (IPI)  organisé tous les ans par le Marine Institute Phytoplankton unit de Galway (Ireland). Les échantillons envoyés aux analystes concernés ont été utilisés pour évaluer aussi les compétences des analystes non-inscrits à l’IPI, mais réalisant également des analyses de phytoplancton dans ces mêmes laboratoires pour le REPHY. Au total, 23 analystes...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00388/49923/50497.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin. Rapport d'évaluation des analystes du phytoplancton dans le cadre du réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et de l'hydrologie (REPHY) mis en œuvre par l'Ifremer. Exercice 2018 ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie.
The determination of phytoplankton species and the estimation of their abundance in the context of the Phytoplankton and Hydrology Monitoring and Surveillance Network, implemented by Ifremer (REPHY), are based in 2018 on 25 analysts spread over 12 sites. Proficiency testing by inter-laboratory or inter-analyst comparison is used to evaluate the performance of laboratories or analysts on specific skills. An International Phytoplankton Inter-comparison (IPI) is organized annually by the Marine Institute Phytoplankton unit of Galway (Ireland), to evaluate marine phytoplankton identification and enumeration performance. The IPI is implementing its inter-comparison exercises through the Marine Institute Ireland in cooperation with the Intergovernmental...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Comparaison Inter-Laboratoire; CIL; Comparaison Inter-Analyste; CIA; Essai d’aptitude; Phytoplankton; Inter-Laboratory Comparison; ILC; Inter-Analyst Comparison; IAC; Aptitude Test; International Phytoplankton Inter-comparison; IPI.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00592/70415/68505.pdf
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Essai d'aptitude par comparaison Inter-analystes pour l'évaluation des performances en identification et dénombrement du phytoplancton marin. Rapport d'évaluation des compétences des analystes du phytoplancton dans le cadre du réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et de l'hydrologie (REPHY) mis en oeuvre par l'Ifremer ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie; Chomerat, Nicolas.
The determination of phytoplankton species and the estimation of their abundance in the context of the Phytoplankton and Hydrology Monitoring and Surveillance Network, implemented by Ifremer (REPHY), is based in 2017 on 21 analysts spread over 12 sites. Proficiency testing by inter-laboratory or inter-analyst comparison is used to evaluate the performance of laboratories or analysts on specific skills. An International Phytoplankton Inter-comparison (IPI) is organized annually by the Marine Institute Phytoplankton unit of Galway (Ireland), to evaluate marine phytoplankton identification and enumeration performance. The IPI is implementing its inter-comparison exercises through the Marine Institute Ireland in cooperation with the Intergovernmental...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Comparaison Inter-Laboratoire; CIL; Comparaison Inter-Analyste; CIA; Essai d’aptitude; Phytoplankton; Inter-Laboratory Comparison; CIL; Inter-Analyst Comparison; CIA; Aptitude Test; International Phytoplankton Inter-comparison; IPI.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00436/54797/56255.pdf
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Essai inter-analystes Ifremer pour l’évaluation de la qualité des connaissances en taxinomie et dénombrement du phytoplancton marin – Rapport d'évaluation des analystest du phytoplancton marin dans le cadre du REPHY ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Brun, Melanie.
Les essais d'aptitude par comparaison inter-laboratoires ou inter-analystes sont utilisés pour évaluer les performances des laboratoires ou analystes sur des compétences spécifiques. Un exercice d’inter-comparaison international est organisé tous les ans par le Marine Institute Phytoplankton unit de Galway (Ireland), sous couvert du NMBAQC-BEQUALM, pour évaluer les performances en identification et en dénombrement du phytoplancton marin. La détermination des espèces phytoplanctoniques et l’estimation de leur abondance dans le cadre du Réseau d’observation et de surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie, mis en oeuvre par l’Ifremer (REPHY) s’appuie sur 28 analystes, répartis dans 11 laboratoires. Onze d’entre eux ont été inscrits à titre individuel...
Tipo: Text Palavras-chave: Essai d’aptitude; Comparaison Inter-Laboratoires; ICN; Essai Inter-Analystes; EIA; Phytoplancton.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00340/45158/44553.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018 ArchiMer
Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf
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Evaluation du descripteur 8 « Contaminants dans le milieu » en France Métropolitaine. ArchiMer
Mauffret, Aourell; Chiffoleau, Jean-francois; Burgeot, Thierry; Wessel, Nathalie; Brun, Melanie.
Good Environmental Status (GES) for descriptor 8 of MSFD is reached when concentrations of contaminants are at levels not giving rise to pollution effects. According to the decision 2017/848/CE, descriptor 8 is defined by four criteria: concentration in the relevant matrices (sediment, biota) (D8C1), effects of chronic contamination to the marine organisms (D8C2), duration and spatial extent of acute pollution events (D8C3), effects of acute contamination to the marine organisms (D8C4). The GES for descriptor 8 is assessed at the level of four marine subregions (SRM), including: Channel – North Sea (MMN), Celtics Seas (MC), Bay of Biscay (GdG) and the Occidental Mediterranean Sea (MO). In order to achieve GES, each indicator of descriptor 8 should respect...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57294/59374.pdf
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OBSLAG 2016 - volet eutrophisation. Etat DCE des lagunes méditerranéennes (eau et phytoplancton, période 2011-2016). Développement d’indicateurs de tendance et de variabilité ArchiMer
Derolez, Valerie; Gimard, Antonin; Munaron, Dominique; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Fortune, Martine; Poirrier, Samuel; Mortreux, Serge; Guillou, Jean-louis; Brun, Melanie; Provost, Charlotte; Hatey, Elise; Bec, Béatrice; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2016 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2011-2016 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne sont...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49744/50277.pdf
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OBSLAG 2018 - volet eutrophisation. Lagunes méditerranéennes (période 2013-2018). Etat DCE de la colonne d'eau et du phytoplancton, tendance et variabilité des indicateurs ArchiMer
Derolez, Valerie; Bec, Béatrice; Munaron, Dominique; Foucault, Elodie; Fiandrino, Annie; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Hatey, Elise; Connes, Coralie; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Fortune, Martine; Mortreux, Serge; Serais, Ophelie; Crottier, Anais; Malet, Nathalie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2018 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival en 2018 du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2013-2018 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Eutrophisation; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00507/61862/65959.pdf
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Substances prioritaires DCE : Cohérence et applicabilité des seuils mollusques existants en milieu marin : DCE (NQE, VGE) et OSPAR (EAC, BAC) ArchiMer
Amouroux, Isabelle; Brun, Melanie.
L’évaluation de la qualité chimique du milieu marin s’appuie, depuis près de 40 ans en France, sur la recherche des substances dans des espèces sentinelles et intégratrices : les mollusques (moules, huîtres). La  bioaccumulation au sein de ces organismes permet de quantifier des contaminants chimiques présents à l’état de trace dans le milieu environnant. De façon à développer une surveillance plus appropriée au milieu marin, un travail de détermination de valeurs guides environnementales (VGE) sur les mollusques, alternatives aux Normes de Qualité Environnementales (NQE) fixées par la DCE dans l’eau, est engagé par Ifremer depuis 2015 en collaboration avec l’ONEMA / AFB. Les NQE eau sont dérivés en VGE mollusques en utilisant des facteurs de conversion :...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques moules seuils; Valeurs Guides Environnementales (VGE) milieu marin; Substances prioritaires; ROCCH.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55242/56725.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne sur la période 2012-2017 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Genauzeau, Sylvie; Morin, Dimitri; Schmitt, Anne; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Michel, Valérie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2012 et 2017 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du bassin Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en oeuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physicochimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, azote inorganique dissous pour les masses d’eau côtières et les masses d’eau de transition peu turbides, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans l’annexe 1 de ce rapport. Sont également incluses dans ce...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00463/57484/59622.pdf
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Synthèse bibliographique relative à la notion d'indicateur dans le contexte de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) ArchiMer
Brun, Melanie; Soudant, Dominique.
Stakeholders of the Marine Strategy Framework Directive (MSFD) need scientific and technical support to assess ecological status of marine waters and to adopt management actions to achieve the objective of the directive, i.e. “to achieve or to maintain good environmental status in the [European] marine environment by the year 2020 at the latest”. This support involves especially the development of indicators. Studies about the concept of indicator exist, in particular since the implementation of legislations such as the Water Framework Directive (WFD) in Europe. Indeed, they provide a significant source of reports and scientific papers, representing essential information for the implementation of the MSFD. However, the generic nature of the concept of...
Tipo: Text Palavras-chave: Indicateur; Indice; DCSMM; Qualités attendues; Processus de développement; Indicator; Index; MSFD; Expected qualities; Development procedure.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00247/35858/34379.pdf
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Valorisation des données issues du contrôle de surveillance du compartiment benthique suivi dans le cadre de la Directive Cadre sur l'Eau (2000/60/CE) : campagnes 2007 et 2010 – Élément de qualité biologique « invertébrés benthiques de substrats meubles » – Masses d'eau côtières - Façades Manche et Atlantique ArchiMer
Garcia, Aurelie; Brun, Melanie; Soudant, Dominique; Pothier, Anaelle; Gauthier, Emilie; Desroy, Nicolas.
This report deals with the ecological status assessment of the English Channel and the Atlantic coastal water bodies, with respect to the benthic invertebrate biological quality element and defined from samples collected in 2007 and 2010.
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l'Eau; Benthos; Réseau de surveillance; Manche; Océan Atlantique; Zones côtières.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38404/36729.pdf
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