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Aclimatação de Inóculo para determinação de PME. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; VILLANOVA, D. F. Q.; LIMA, J. C. F.; OTENIO, M. H.; CARNEIRO, J. da C..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Aclimatação; Bioenergia; Biogás.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1062281
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Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; LOBO, F. P..
Este estudo detectou diversos genes virais sabidamente relacionados à modulação do sistema imune dos hospedeiros sob evidência de seleção positiva.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção positiva; Alphaherpesvirinae.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/954557
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de novo assembly and transcriptome analysis of sugarcane leaves from contrasting varieties submited to prolonged water stress. Repositório Alice
BELESINI, A. A.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. da S.; CARVALHO, F. M. de S.; CARLIN, S. R.; CAZETTA, J. O.; FERRO, M. I. T.; PINHEIRO, D. G..
Sugarcane is an important crop, major source of sugar and alcohol, accounting for two-thirds of the world's sugar production. In Brazil, the sugarcane culture has expanded to areas with prolonged drought seasons, which is constraining its production. In order to identify genes and molecular process related to sugarcane drought tolerance, we performed de novo assembly and transcriptome analysis of two sugarcane genotypes, one tolerant and other sensitive to water stress, submitted to three water deficit condition (30, 60 and 90 days). The de novo assembly of leaves transcriptome was performed using short reads from Illumina RNA-Seq platform, which produced more than 1 billion reads, which were assembled into 177,509 and 185,153 transcripts sequences for the...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Cana-de-açúcar; Tolerância à seca; Transcriptoma; Bioinformatics; Sugarcane; Drought tolerance; Water stress; Transcriptomics.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038946
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De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. Repositório Alice
BELESINI, A. A.; CARVALHO, F. M. S.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. S.; CARLIN, S. D.; CAZETTA, J. O.; PINHEIRO, D. G.; FERRO, M. I. T..
ABSTRACT. Sugarcane production is strongly influenced by drought, which is a limiting factor for agricultural productivity in the world. In this study, the gene expression profiles obtained by de novo assembly of the leaf transcriptome of two sugarcane cultivars that differ in their physiological response to water deficit were evaluated by the RNA-Seq method: drought-tolerant cultivar (SP81-3250) and drought-sensitive cultivar (RB855453). For this purpose, plants were grown in a greenhouse for 60 days and were then submitted to three treatments: control (-0.01 to -0.015 MPa), moderate water deficit (-0.05 to -0.055 MPa), and severe water deficit (-0.075 to -0.08 MPa). The plants were evaluated 30, 60, and 90 days after the beginning of treatment....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão genética; Cana de açúcar; Deficiência hídrica; Sugarcane; Drought; Gene expression; Saccharum; Water stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082783
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First report of Papaya ringspot virus-type W infecting fevillea species (cucurbitaceae) in South America. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; LIMA, M. F.; FONSECA, M. E. de N.; BOITEUX, L. S..
2016
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Nhandirobas; Fervillea cordifolia L; F tribata L.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065826
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Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P..
This study comprises the first genomic search for positively selected genes on HSV-1 genome.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção positiva; Homologia; Sequence homology.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946654
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Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B..
In several eukaryotic organisms, the nuclear genome has several partial copies of the mitochondrial DNA (mtDNA). These copies are called NUMTs (NUclear MiTochondrial DNA) and they have been known since 1967 when the first evidence of them were reported in the mouse nuclear genome. Despite almost fifty years have passed, the reason of their very existence remains controversial. However, their presence has been confirmed in an increasing number of genomes. The NUMts could be only another DNA idiosyncrasy, but they actually represent a serious issue for important application such as genome bar coding. There are many open questions about them.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DNA mitocondrial; Genoma nuclear; Genoma; Genome; Nuclear genome; Mitochondrial DNA.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035016
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Serendipitomics: a new virus found on an RNA-seq library. Repositório Alice
CASTRO, G. M. de; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. de N. F.; LOBO, F.; RECH, E.; SILVA, F. R. da..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genômica; Genomics; Papaya ringspot virus; Nucleotide sequences.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008424
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