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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/938894
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923298
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923169
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/922956
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Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P..
Esse estudo teve como objetivo desenvolver e sequenciar bibliotecas de cDNA a partir de diferentes tecidos e genótipos de feijão e analisar em resposta aos tratamentos específicos os níveis diferenciais de expressão gênica. Foram avaliados os genótipos fenotipicamente divergentes BAT477, caracterizado como tolerante à seca, e Pérola, como suscetível.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039617
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Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.). Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..
Association analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Association analysis; Core collection; Genetic structure; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Germoplasma; Rice; Germplasm conservation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/862017
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Avaliação genotípica de linhagens e cultivares brasileiras e introduzidas da coleção nuclear de arroz da Embrapa por meio da caracterização agronômica e molecular. Repositório Alice
BUENO, L. G.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; OLIVEIRA, J. P..
Avaliar a diversidade genética de linhagens e cultivares brasileira e do exterior da CNAE, por meio de caracteres agronômicos e marcadores moleculares SSR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Caracterização agronômica; Caracterização molecular; SSR; Arroz; Oryza sativa; Germoplasma.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866754
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Biochemical and metabolic profiles of Trichoderma strains isolated from common bean crops in the Brazilian Cerrado, and potential antagonism against Sclerotinia sclerotiorum. Repositório Alice
LOPES, F. A. C.; STEINDORFF, A. S.; GERALDINE, A. M.; BRANDÃO, R. S.; MONTEIRO, V. N.; LOBO JUNIOR, M.; COELHO, A. S. G.; ULHOA, C. J.; SILVA, R. N..
Some species of Trichoderma have successfully been used in the commercial biological control of fungal pathogens, e.g., Sclerotinia sclerotiorum, an economically important pathogen of common beans (Phaseolus vulgaris L.). The objectives of the present study were (1) to provide molecular characterization of Trichoderma strains isolated from the Brazilian Cerrado; (2) to assess the metabolic profile of each strain by means of Biolog FF Microplates; and (3) to evaluate the ability of each strain to antagonize S. sclerotiorum via the production of cell wall-degrading enzymes (CWDEs), volatile antibiotics, and dual-culture tests. Among 21 isolates, we identified 42.86 % as Trichoderma asperellum, 33.33 % as Trichoderma harzianum, 14.29 % as Trichoderma...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Cerrado; Sclerotinia sclerotiorum; Trichoderma; Fungo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/933549
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Climatic oscillations in the production of Eucalyptus benthamii x E. dunnii shoots in mini-clonal hedge. Repositório Alice
PIRES, P. P.; WENDLING, I.; SOUZA, A. M. de; COELHO, A. S. G..
Detailed knowledge on the factors influencing the production of minicuttings, especially focusing on management and environmental optimization is important. Therefore, this study aimed at evaluating the influence of temperature, relative humidity and PAR (photosynthetically active radiation) and their oscillations in mini-clonal hedges of three E. benthamii x E. dunnii hybrid clones regarding survival, vigor and productive capacity of ministumps. A mini-clonal hedge with a semi-hydroponic system was formed, with five replicates of five ministumps per clone, submitted to 41 successive collections of minicuttings during one year. A multiple linear regression model for minicutting production was adjusted according to maximum, average and minimum climatic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Minicutting; Miniestaquia; Eucalipto; Clone; Eucalyptus; Cloning (plants); Photosynthetically active radiation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1106351
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Comparative linkage mapping of Oryza glumaepatulaand Oryza sativa interspecific crosses based on microsatellite and expressed sequence tag markers. Repositório Alice
RANGEL, P. N.; BRONDANI, R. P. V.; COELHO, A. S. G.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..
Molecular linkage maps representing the rice genome have been an important tool for breeding programs because they allow the elucidation of polygenic traits and are an efficient tool for monitoring wild introgressions in interspecific crosses. Common markers among rice genetic maps are important in defining the homology of chromosomes and the synteny between genomic target regions. We used 148 markers (expressed sequence tags, microsatellites and single nucleotide polymorphisms) to construct a molecular linkage map based on co-dominant markers for an interspecific backcross population using a wild rice ( Oryza glumaepatula) from Brazil and performed a comparative analysis with other interspecific maps. The comparative analysis revealed a Spearman...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Molecular markers; Oryza glumaepatula; Microsatellite.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/215913
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Comparative proteomics in the genus Paracoccidioides. Repositório Alice
PIGOSSO, L. L.; PARENTE, A. F. A.; COELHO, A. S. G.; SILVA, L. P. da; BORGES, C. L.; BAILÃO, A. M.; SOARES, C. M. de A..
bitstream/item/179974/1/1-s2.0-S1087184513001291-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phylogenetic species; Comparative proteomic profiles; Paracoccidioides.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/979961
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Construção de mapa genético de Eucalyptus utilizando microssatélites. Repositório Alice
CHEDIAK, G. L. de C.; COELHO, A. S. G.; BRONDANI, R. P. V..
O objetivo principal deste trabalho é a construção de mapas genéticos baseados em locos microssatélites e identificação de regiões genômicas associadas a características físico-químicas da madeira utilizando um cruzamento entre a espécies E. grandis e um híbrido E. Urophylla x E. Globulus.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eucalipto; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular; Microssatélite; Conpeex.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/217546
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Development of microsatellite markers in Annona crasiflora Mart., a brazilian cerrado fruit tree species Repositório Alice
PEREIRA, M. F.; BANDEIRA, L. F.; BLANCO, A. J. V.; CIAMPI, A. Y.; COELHO, A. S. G..
bitstream/item/177842/1/SP-19615-ID-30902.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade Genética; Annona Crassiflora; Araticum; Cerrado.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190628
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Efetividade da seleção recorrente genotípica no melhoramento do arroz irrigado. Repositório Alice
MORAIS JUNIOR, O. P. de; BRESEGHELLO, F.; DUARTE, J. B.; MORAIS, O. P. de; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; RANGEL, P. H. N..
Nosso objetivo foi avaliar a efetividade deste método em atingir progresso genético, mantendo a variabilidade genética e aumentando o potencial da população para a extração de linhagens superiores quanto à produtividade, altura de planta e duração do ciclo até a floração. A população de arroz irrigado utilizada neste trabalho foi a CNA12S, a qual tem ampla base genética e já foi submetida a três ciclos de seleção recorrente.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ganho genético; Tamanho efetivo; Arroz irrigado; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Seleção recorrente.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078675
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Identificação de genitores para resistência à Magnaporthe oryzae em arroz utilizando-se a análise AMMI. Repositório Alice
CRISPIM, B. C. F.; RÉSIO, L.; BUENO, L. G.; COELHO, A. S. G.; MELLO, R. N. de.
Com o objetivo de identificar genitores para resistência à Magnaporthe oryzae entre fontes de resistência e linhagens elites, 47 genótipos foram avaliados para resistência utilizando-se 11 isolados coletados na safra 2008/2009.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Brusone; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/924076
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In-depth genome characterization of a Brazilian common bean core collection using DArTseq high-density SNP genotyping. Repositório Alice
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; ALMEIDA FILHO, J. E.; MÜLLER, B. S. F.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; LANNA, A. C.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; MORAES, A. da C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
Background: Common bean is a legume of social and nutritional importance as a food crop, cultivated worldwide especially in developing countries, accounting for an important source of income for small farmers. The availability of the complete sequences of the two common bean genomes has dramatically accelerated and has enabled new experimental strategies to be applied for genetic research. DArTseq has been widely used as a method of SNP genotyping allowing comprehensive genome coverage with genetic applications in common bean breeding programs. Results: Using this technology, 6286 SNPs (1 SNP/86.5 Kbp) were genotyped in genic (43.3%) and non-genic regions (56. 7%). Genetic subdivision associated to the common bean gene pools (K = 2) and related to grain...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversity arrays technology; Diversity analysis; Loci under selection; Core collection; Feijão; Phaseolus vulgaris; Genética vegetal; Linkage disequilibrium; Genotyping; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076278
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Microarray analysis of eucalyptus gene expression. Repositório Alice
PASQUALI, G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; BASTOLLA, F. M.; VOM ENDT, D.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. M.; GRATTAPAGLIA, D..
bitstream/item/200788/1/Pasquali-XXXV-Reuniao-Anual-da-SBBq.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eucalyptus genome; Eucalipto; Genoma.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187590
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Relevance of additive and non-additive genetic relatedness for genomic prediction in rice population under recurrent selection breeding Repositório Alice
MORAIS JÚNIOR, O. P.; DUARTE, J. B.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; AGUIAR, J. T.; NEVES, P. C. F.; MORAIS, O. P..
In genomic recurrent selection programs of self-pollinated crops, additive genetic effects (breeding values) are effectively relevant for selection of superior progenies as new parents. However, considering additive and nonadditive genetic effects can improve the prediction of genome-enhanced breeding values (GEBV) of progenies, for quantitative traits. In this study, we assessed the magnitude of additive and nonadditive genetic variances for eight key traits in a rice population under recurrent selection, using marker-based relationship matrices. We then assessed the goodness-to-fit, bias, stability and accuracy of prediction for breeding values and total (additive plus nonadditive) genetic values, in five genomic best linear unbiased prediction (GBLUP)...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Quantitative traits; Genetic architecture; Predictive accuracy; GBLUP models; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Seleção recorrente; Rice; Plant breeding; Variance components.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086472
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Transcriptoma para seca revela novos genes para o germoplasma do feijão comum mesoamericano. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; ABREU, F. R. M.; MELO, A. T. de O.; COELHO, A. S. G.; RODRIGUES, F. A.; MAMIDI, S.; ALENCAR, S. A. de; LANNA, A. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; BORBA, T. C. de O.; VIANELLO, R. P..
Este estudo foi realizado com o objetivo de promover uma ampla caracterização de genes do feijoeiro comum relacionados à seca.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; RNA-seq; Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência a seca; Beans.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078772
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