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Production of DNA microarray and expression analysis of genes from Xylella fastidiosa in different culture media BABT
Travensolo,Regiane de Fátima; Costa,Maria Vitória Cecchette Gottardi; Carareto-Alves,Lucia Maria; Carrilho,Emanuel; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
DNA Microarray was developed to monitor the expression of many genes from Xylella fastidiosa, allowing the side by-side comparison of two situations in a single experiment. The experiments were performed using X. fastidiosa cells grown in two culture media: BCYE and XDM2. The primers were synthesized, spotted onto glass slides and the array was hybridized against fluorescently labeled cDNAs. The emitted signals were quantified, normalized and the data were statistically analyzed to verify the differentially expressed genes. According to the data, 104 genes were differentially expressed in XDM2 and 30 genes in BCYE media. The present study showed that DNA microarray technique efficiently differentiate the expressed genes under different conditions.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: DNA Microarray; Xylella fastidiosa; Expression; Transcriptome.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132009000300006
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Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira Rev. Bras. Frutic.
Zaccaro,Ronaldo Posella; Carareto-Alves,Lucia Maria; Travensolo,Regiane Fátima; Wickert,Ester; Lemos,Eliana Gertrudes Macedo.
O gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oligonucleotídeos iniciadores; Mangifera indica; Marcadores moleculares; RAPD-PCR.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452007000300029
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