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Análise filogenética do gene nodY/K revela coevolução e transferência horizontal entre Bradyrhizobium e leguminosas. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; MENNA, P.; HUNGRIA, M..
Plantas da família Leguminosae (Fabaceae) ocupam uma ampla variedade de biomas terrestres, com algumas delas estabelecendo simbiose com um grupo de bactérias coletivamente chamadas de rizóbios, cuja característica mais importante é a capacidade de fixar o nitrogênio atmosférico (N2). No caso do Brasil, bactérias do gênero Bradyrhizobium representam a grande maioria dos isolados de leguminosas tropicais nativas, além de apresentarem relevância como simbiontes de culturas de importância econômica, como é o caso da soja. Estudos taxonômicos com essas bactérias têm demonstrado uma elevada diversidade genética entre as estirpes e, nos últimos anos, várias espécies já foram descritas. Contudo, quando a filogenia dos genes envolvidos no processo de nodulação e...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene; Genes.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010714
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Análise polifásica aplicada à taxonomia e filogenia de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
MARTINS, T. B.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M..
Algumas leguminosas de importância econômica e social como o feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) estabelecem simbiose com bactérias chamadas coletivamente de rizóbios. O processo de fixação biológica de nitrogênio (FBN) é responsável por beneficiar a agricultura com elevada produtividade, além de reduzir o custo econômico para o produtor, pela substituição de fertilizantes nitrogenados. O objetivo do trabalho foi caracterizar seis estirpes (CNPSo 670, CNPSo 671, CNPSo 672, CNPSo 676, CNPSo 683 e CNPSo 659), as quais foram denominadas grupo PEL 4, provenientes de estudos de seleção de rizóbio simbiontes do feijoeiro com posição taxonômica pouco clara pela análise do gene ribossomal 16S (16S RNAr), com possibilidade de representar uma nova espécie. Para isso,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijoeiro; Feijão; Beans.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010720
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Atividades da coleção de culturas de microrganismos multifuncionais da Embrapa Soja. Repositório Alice
CHUEIRE, L. M. O.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; FERREIRA, E.; AQUINO, M.; SANTOS, H. C.; CUNHA, M. H..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918546
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Caracterização genética e morfofisiológica da "Coleção de culturas de microrganismos multifuncionais da Embrapa Soja". Repositório Alice
CHUEIRE, L. M. de O.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; FERREIRA, E.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M..
A degradação do meio ambiente gera uma grande preocupação com a sustentabilidade do planeta para os anos futuros. A principal maneira de reverter essa situação é através do aproveitamento da biodiversidade em prol de sistemas de baixa emissão de carbono, biorremediação, produção de medicamentos, vacinas entre outros. Dentre os vários ecossistemas, o solo apresenta importante destaque, pois apesar da alta diversidade procariótica que possui, ainda precisa ser mais explorado para que essas informações sejam utilizadas a favor do aumento de produtividade da agricultura. A criação e a manutenção de coleções de culturas são de extrema importância para o estudo nas áreas biológicas e agronômicas. Nesse sentido, o Laboratório de Biotecnologia do Solo da Embrapa...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Bacteriologia do solo; Nitrogen fixation; Nitrogen-fixing bacteria; Soil bacteria.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934640
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Diversidade de bactérias diazotróficas endofíticas de milho em cultivos convencional e agroecológico. Repositório Alice
FAGOTTI, D. S. L.; CEREZINI, P.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M.; NOGUEIRA, M. A..
Diferentes gêneros de bactérias diazotróficas, além de fixar N2 atmosférico, também promovem o crescimento de plantas pela produção de hormônios vegetais e disponibilização de outros nutrientes como o fósforo. O objetivo deste trabalho foi isolar e identificar bactérias diazotróficas endofíticas de milho (Zea mays L.) sob plantio direto e convencional, em sistema agroecológico e convencional. O isolamento foi realizado em meios de cultura livres de N (LGI, JNFb e JMV), totalizando 86 isolados. Por meio do sequenciamento do gene 16S DNAr foram identificadas bactérias dos gêneros Burkholderia spp., Agrobacterium spp., Enterobacter spp., Stenotrophomonas spp., Rhizobium spp., Pseudoxanthomonas sp., Microbacterium sp., Sphingomonas sp., Klebsiella spp.,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bactéria não patogênica; Isolamento; Fixação de nitrogênio; Crescimento; Milho; Nitrogen fixation; Nitrogen-fixing bacteria; Corn; Plant growth.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934629
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Diversidade e filogenia de estirpes de Rhizobium pela metodologia de MLSA. Repositório Alice
DALL'AGNOL, R. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
O nitrogênio (N) é um dos elementos mais requisitados pelas culturas, sendo um fator determinante na produtividade agrícola. Sabe-se que o grupo de bactérias conhecidas como rizóbios pode fixar o N2 atmosférico, suprindo total ou parcialmente a carência do mesmo no solo. Dessa forma, a caracterização molecular e filogenética de rizóbios nativos de solos brasileiros é importante para futuros estudos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade filogenética de cinco estirpes de Rhizobium, que apresentam fortes indicações de representarem novas espécies por estudos filogenéticos anteriores. Todas as estirpes foram crescidas em meio de cultura específico e submetidas à análise por MLSA (Multi-Locus Sequence Analysis) e BOX-PCR. Os resultados de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rizóbios.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934744
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Draft genome sequence of agrobacterium deltaense strain CNPSo 3391, isolated from a soybean nodule in Mozambique. Repositório Alice
SCHERER, A. J.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; CHIBEBA, A. M.; KYEI-BOAHEN, S.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/196489/1/2019-Am-J-Microb-Draft-Genome-Agrobac-Mozambique-Scherer-et-al.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja; Nódulo; Genoma; Soybeans; Genome.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108516
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Draft genome sequence of Bradyrhizobium elkanii strain SEMIA 938, used in commercial inoculants for Lupinus spp. in Brazil. Repositório Alice
HUNGRIA, M.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; NOGUEIRA, M. A..
bitstream/item/201483/1/aMicrobiology-Resource-Announcements-2019-Hungria-e00546-19.full.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Inoculante; Fixação de Nitrogênio; Genome; Nitrogen fixation; Bradyrhizobium elkanii; Lupinus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111798
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Emprego da metodologia de MLSA em avaliações de filogenia e taxonomia de rizóbios: estudo com Rhizobium spp. Microssimbionte de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M..
RESUMO: Estudos taxonômicos desempenham um papel relevante na valoração da diversidade microbiana do solo. A metodologia de MLSA (Multilocus Sequence Analysis) tem possibilitado incrementar o conhecimento da biodiversidade bacteriana do solo, bem como a descrição de novas espécies. Neste estudo, quatro genes housekeeping foram utilizados para estabelecer as relações filogenéticas entre 19 estirpes de Rhizobium spp. microssimbiontes do feijoeiro. Além de obter maior definição das relações filogenéticas, o MLSA indicou possíveis novas espécies de rizóbios ainda não descritas.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971105
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Estudo das relações filogenéticas de estirpes de rizóbios através da metodologia Multilocus Sequence Analysis (MLSA) com identificação de espécies novas. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Os microrganismos são muito utilizados hoje em dia, fazendo parte de diversos produtos do nosso cotidiano, variando de alimentos até produtos de tratamento ambiental. O estudo dos organismos vivos gerou uma necessidade de se identificar e classificar os animais e plantas em grupos relacionados, inferindo nomes a eles. Hoje, os parâmetros utilizados para elucidar a filogenia entre os microrganismos envolvem a análise de moléculas biológicas amplamente distribuídas entre eles em conjunto com a caracterização morfofisiológica dos indivíduos. Em análises biomoleculares conhecidas como Multilocus Sequence Analysis (MLSA), os cientistas têm utilizado sequencias concatenadas dos chamados genes housekeeping como marcadores filogenéticos, comparado também com dados...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rizóbios.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1044006
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Estudo filogenético da diversidade do gênero Bradyrhizobium por MLSA e utilização desta técnica para designar possíveis novas espécies. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, também chamadas popularmente de rizóbios, têm grande relevância agronômica, pois fornecem quantidades significativas de N para as plantas e colaboram para a recuperação de solos e ambientes degradados. Nos últimos anos, com o avanço das técnicas moleculares e das análises genéticas, diversos trabalhos têm demonstrado que essas bactérias apresentam uma elevada diversidade genética, resultando em reclassificações taxonômicas e na descrição de novas espécies. Apesar do gene ribossomal 16S (16S RNAr) ainda ser utilizado em análises filogenéticas de procariotos, sua alta conservação não é capaz de revelar diferenças entre espécies de diversos gêneros, incluindo Bradyrhizobium. Outras metodologias, como o MLSA...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de Nitrogênio; Bradyrhizobium; Nitrogen fixation.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010717
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Estudo polifásico para reclassificação de estirpes simbiontes de feijoeiro em uma nova espécie no gênero Rhizobium. Repositório Alice
RIBEIRO, R. A.; DALL'AGNOL, A.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M..
O Brasil tem se destacado mundialmente na produção de alimentos, tornando-se referência no sistema agrícola. O feijão (Phaseolus vulgaris L.) tem um importante destaque, e devido ao seu alto valor nutricional, é muito consumido na América latina e alguns países Africanos. Entretanto, o aumento de produtividade da cultura ainda é um desafio, e a inoculação das sementes com bactérias fixadoras de nitrogênio torna-se uma aliada junto aos produtores dessa leguminosa, os quais sofrem com os altos preços dos fertilizantes nitrogenados que acabam onerando a produção. No intuito de otimizar o processo simbiótico planta-bactéria, é necessário buscar estirpes cada vez mais adaptadas ao clima, ao solo e às cultivares e, desse modo, a taxonomia desses procariotos...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijoeiro.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010654
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Evidências polifásicas suportam a reclassificação de bradyrhizobium japonicum tipo Ia em uma nova espécie. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; MELO, I. S. de; HUNGRIA, M..
O gênero Bradyrhizobium compreende um grupo diverso de bactérias com capacidade de estabelecer simbiose com plantas da família Leguminosae. Espécies de B. japonicum são divididas em dois grupos bem definidos (tipo I e Ia) e fortes evidências sugerem que eles representam espécies distintas. Com o objetivo de apontar as diferença entre esses dois grupos, foram utilizadas quatro estirpes do tipo Ia em uma análise polifásica. O fingerprinting obtido por BOX-PCR demonstrou a grande semelhança dentro do grupo de B. japonicum tipo Ia, com valores acima de 85% de similaridade entre eles. Resultado análogo também foi constatado pela análise dos genes housekeeping concatenados. Dados de hibridização DNA-DNA mostram que o valor obtido entre a estirpe referência de B....
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Bacteria não patogênica; Bacteriologia do solo; Nitrogen fixation; Nitrogen-fixing bacteria; Soil bacteria.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934603
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Genome sequence of Bradyrhizobium embrapense strain CNPSo 2833T, isolated from a root nodule of Desmodium heterocarpon. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. O.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/167103/1/2017DelamutaetalBJM-Genome.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Simbiose; Genoma; Nodulação; Nitrogen fixation; Symbiosis; Genome; Nodulation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080233
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Genome sequence of Bradyrhizobium mercantei strain SEMIA 6399T, isolated from nodules of Deguelia costata in Brazil. Repositório Alice
RIBEIRO, R. A.; HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/167337/1/2017RibeiroetalGenomeAnnounc-Bmercantei.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Simbiose; Nitrogen fixation; Symbiosis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080447
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Genome sequence of Bradyrhizobium pachyrhizi strain PAC48T, a nitrogen-fixing symbiont of Pachyrhizus erosus (L.) Urb. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C..
Bradyrhizobium pachyrhizi PAC48T has been isolated from a jicama nodule in Costa Rica. The draft genome indicates high similarity with that of Bradyrhizobium elkanii. Several coding sequences (CDSs) of the stress response might help in survival in the tropics. PAC48T carries nodD1 and nodK, similar to Bradyrhizobium (Parasponia) ANU 289 and a particular nodD2 gene.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Jicama; Pachyrhizus tuberosus; Nitrogen fixation; Pachyrhizus erosus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038602
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Genome sequence of Bradyrhizobium stylosanthis Strain BR 446T, a Nitrogen-Fixing Symbiont of the legume Pasture stylosanthes guianensis. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Bradyrhizobium stylosanthis BR 446T is a nitrogen-fixing symbiont of the tropical legume pasture Stylosanthes guianensis. Its draft genome contains 8,801,717 bp and 8,239 coding sequences (CDSs). Several putative genes that might confer high competi- tiveness and saprophytic capacity under the stressful conditions of tropical soils were identified in the genome.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1063360
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Genome sequence of Bradyrhizobium tropiciagri Strain CNPSo 1112T , isolated from a root nodule of Neonotonia wightii. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
CNPSo 1112T is a nitrogen-fixing symbiont of perennial soybean, a tropical legume forage. Its draft genome indicates a large genome with a circular chromosome and 9,554 coding sequences (CDSs). Operons of nodulation, nitrogen fixation, and uptake hydrogenase were present in the symbiotic island, and the genome encompasses several CDSs of stress tolerance.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032022
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Genome sequence of Bradyrhizobium viridifuturi strain SEMIA 690T, a nitrogen-fixing symbiont of Centrosema pubescens. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; GOMES, D. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
SEMIA 690T is a nitrogen-fixing symbiont of Centrosema pubescens, and comprises the recently described species Bradyrhizobium viridifuturi. Its draft genome indicates that it belongs to the Bradyrhizobium elkanii superclade. SEMIA 690T carries two copies of the regulatory nodD gene, and the nod and nif operons resemble those of Bradyrhizobium diazoefficiens.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032024
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Genome Sequence of Paraburkholderia nodosa Strain CNPSo 1341, a N2-Fixing Symbiont of the Promiscuous Legume Phaseolus vulgaris. Repositório Alice
DALL'AGNOL, R. F.; COSTA, M. R.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Bradyrhizobium stylosanthis BR 446T is a nitrogen-fixing symbiont of the tropical legume pasture Stylosanthes guianensis . Its draft genome contains 8,801,717 bp and 8,239 coding sequences (CDSs). Several putative genes that might confer high competitiveness and saprophytic capacity under the stressful conditions of tropical soils were identified in the genome.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056822
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