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Ajuste de ondas genômicas no sinal de intensidade de dados de genotipagem para a identificação de CNVs. Repositório Alice
PEREIRA, F. C. P.; GONÇALVES, A. R.; REGITANO, L. C. A.; GIACHETTO, P. F..
O presente trabalho teve como objetivo avaliar uma metodologia de ajuste da intensidade do sinal para ondas genômicas, na identificação de CNVs em bovinos da raça Canchim, genotipados com um chip de SNPs de alta densidade.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Polimorfismo de nucleotídeo único; Variações no número de cópias; Copy number variation; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/975703
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Copy number variation discovery in canchim cattle using data from SNP genotyping arrays. Repositório Alice
GONÇALVES, A. R.; PEREIRA, F. C. de P.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F..
Data from cattle genotyping using SNP arrays for genome-wide association studies, is widely available at Embrapa. The objective os this study was to use an open source tool, CNstream, for CNV identification from cattle genotyping using Illumina SNP arrays.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência genômica; Gado; Bioinformática; Nucleotide sequences; Single nucleotide polymorphism; Cattle; Bioinformatics.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946491
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Development of a pipeline for CNV detection and analysis using data from SNP arrays. Repositório Alice
PEREIRA, F. C. de P.; HERAI, R. H.; GONÇALVES, A. R.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F..
The objective of this study was to develop a bioinformatics pipeline for CNV identification and analysis from data generated by high density SNP chips genotyping from Illumina platform, which has been extensively used to genotyping cattle at Embrapa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado; Bioinformática; Single nucleotide polymorphism; Cattle; Bioinformatics.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946496
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Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de gentipagem de SNPs com chips de alta densidade. Repositório Alice
GONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F..
O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da plataforma Illumina. Foram utilizados dados de 400 animais (bovinos Canchim), participantes de um programa de melhoramento da Embrapa Pecuária Sudeste, genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem de bovinos; Polimorfismo de base única; Chips de SNP; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/954567
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Implantação e manejo de florestas em pequenas propriedades no Estado do Paraná: um modelo para a conservação ambiental, com inclusão social e viabilidade econômica. Infoteca-e
SCHAITZA, E. G.; SHANG, M.; OLIVEIRA, E. B. de; LIMBERGER, E.; SANTOS, L. M. F. dos; SHIMIZU, J. Y.; GOBOR, D.; SIQUEROLO, E. F.; MAXIMIANO, G. A.; AGUIAR, A. V. de; SOUSA, L. P. de; BIANCO, A. de J.; SANTOS, E. S. dos; PASSARELLI, I.; FREITAS, J. C. de; DOMINGUES, R.; GONÇALVES, A. R.; GARBELINI, W. A.; SANTOS, J. F. dos; MORIS, A. C.; SABOT, A. L.; SANTOS, A. S. dos..
2008
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Implantação; Manejo; Conservação ambiental; Inclusão social; Viabilidade econômica; Sustentabilidade.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/315298
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