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Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites PAB
Menezes,Ivandilson Pessoa Pinto de; Hoffmann,Lúcia Vieira; Alves,Milena Ferreira; Morello,Camilo de Lelis; Barroso,Paulo Augusto Vianna.
O objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirsutum; Diversidade genética; Marcadores RAPD; Marcadores SSR.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001000012
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In situ and genetic characterization of Gossypium barbadense populations from the states of Pará and Amapá, Brazil PAB
Almeida,Vanessa Cavalcante de; Hoffmann,Lúcia Vieira; Yokomizo,Gilberto Ken It; Costa,Joaquim Nunes da; Giband,Marc; Barroso,Paulo Augusto Vianna.
The objective of this work was to characterize the populations of Gossypium barbadense in the states of Amapá and Pará, Brazil. In situ characterization was conducted through interviews with the owners of the plants and environmental observations. Leaf or petal tissue as well as seed samples were collected for genetic characterization by single sequence repeats markers and for storage in germplasm banks, respectively. The plants were maintained in dooryards and used mainly for medical purposes. The genetic analysis showed no heterozygous plants at the loci tested (f = 1), indicating that reproduction occurs mainly through selfing. The total genetic diversity was high (He = 0.39); and a high level of differentiation was observed between cotton plants from...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cotton; Genetic diversity; Germplasm; SSR markers.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000700011
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Inheritance of resistance to cotton blue disease PAB
Pupim Junior,Osmério; Schuster,Ivan; Pinto,Ronald Barth; Pires,Ely; Belot,Jean-Louis; Silvie,Pierre; Chitarra,Luiz Gonzaga; Hoffmann,Lúcia Vieira; Barroso,Paulo.
The objective of this work was to determine the inheritance of cotton blue disease resistance by cotton plants. Populations derived from the CD 401 and Delta Opal resistant varieties were evaluated, through a greenhouse test with artificial inoculation by viruliferous aphids. Cotton blue disease resistance is conditioned by one dominant gene, both in CD 401 and Delta Opal varieties.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirsutum; Aphis gossypii; Genetic resistance; Luteoviruses.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000500015
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Inibição da colonização por Bradyrhizobium elkanii mas não por Glomus intraradices em soja pelo ativador de defesa vegetal BTH Scientia Agricola
Hoffmann,Lúcia Vieira; Cardoso,Elke Jurandy Bran Nogueira.
O produto BTH controla doenças através da ativação dos mecanismos de resistência de plantas, cujo modo de ação tem sido caracterizado através da identificação de genes ou enzimas ativados durante esta reação. Os mesmos genes e enzimas podem ser ativados como parte da reação das plantas à colonização por microssimbiontes mutualistas. Então, a aplicação de BTH pode inibir também essas simbioses. Um experimento foi conduzido para verificar se BTH tem efeito sobre a colonização de raízes de soja pelos microssimbiontes Glomus intraradices e Bradyrhizobium elkanii. Plantas controle ou inoculadas com o fungo micorrízico ou rizóbio foram tratadas com 20 mL de BTH 25 mg L-1 por meio da aplicação em sementes, via radicular ou via foliar. As plantas que receberam...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Micorriza; Rizóbio; Resistência sistêmica adquirida.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000400022
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Optimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton PAB
Pereira,Guilherme da Silva; Cazé,Ana Luíza Ramos; Silva,Michelle Garcia da; Almeida,Vanessa Cavalcante; Magalhães,Fernanda Oliveira da Cunha; Silva Filho,João Luís da; Barroso,Paulo Augusto Vianna; Hoffmann,Lúcia Vieira.
Abstract: The objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirsutum; Cultivar discrimination; Intraspecific polymorphism; Microsatellite.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000700571
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SSR markers to detect gene flow from upland to mocó cotton Rev. Ciênc. Agron.
Dantas,Ana Carolina Assis; Barroso,Paulo Augusto Vianna; Hoffmann,Lúcia Vieira; Alves,Milena Ferreira; Andrade,Francisco Pereira de.
Mocó cotton was the most important crop in Northeastern Brazil. Local varieties had been developed before governmental breeding programs, which should be identified and preserved as a genetic resource. The aim of this work was to select SSR markers which can be used to monitor gene flow from herbaceous to mocó cotton plants, using non transgenic upland cotton as a pollen source. Unique mocó cotton feral populations were identified in the state of Rio Grande do Norte, and mother plants and their seeds were collected. Allele frequencies were studied among fifteen plants from these populations using 64 SSR primer pairs. Ten SSR markers, with alleles exclusive to mocó or upland genotypes, were selected to monitor gene flow by paternity analysis (BNL3627; 2960;...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biosafety; Molecular markers; Genetic resources.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902012000100020
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