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Bilan des essais et optimisation du suivi mutualisé « réseaux trophiques et contaminants » sur les campagnes halieutiques DCF 2014- 2015 ArchiMer
Mialet, Benoit; Banaru, Daniela; Baudrier, Jerome; Bustamante, Paco; Chekri, Rachida; Cresson, Pierre; Harmelin, Mireille; Le Loc'H, François; Mauffret, Aourell; Marchand, Philippe; Petit, Laetitia; Prieur, Solene; Saibi-yedjer, Lynda; Serre, Sandrine; Spitz, Jerome; Timmerman, Charles-andre; Vouriot, Pauline; Wessel, Nathalie.
Ce document s’adresse à un public large, familier ou non avec les problématiques couvertes par la Directive Cadre “Stratégie pour le Milieu Marin” (DCSMM). Ce public inclut donc le personnel intervenant sur la mise en oeuvre de la DCSMM, les scientifiques, et toute personne concernée par la surveillance de l’état de santé du milieu marin. L’objectif du document est de valoriser les travaux menés lors des essais du Programme de Surveillance de la DCSMM. Ces essais ont consisté à tester des protocoles visant à utiliser les campagnes océanographiques bentho-démersales et pélagiques existantes pour collecter les données indispensables à la construction et au renseignement d’indicateurs du Bon État Écologique. Cette collecte de données implique la participation...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00373/48447/48712.pdf
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Campagne dédiée à l'évaluation des effets biologiques induits pas la contamination chimique en Baies de Loire et Vilaine. SELILOIRE 2017 ArchiMer
Mauffret, Aourell; Wessel, Nathalie; Akcha, Farida; Munschy, Catherine; Chouvelon, Tiphaine; Couteau, Jérôme; Briaudeau, Tifanie; Izagirre, Urtzi; Aminot, Yann; Pollono, Charles; Moisan, Karine; Olivier, Nathalie; Bely, Nadege; Crochet, Sylvette; Thomas, Bastien; Sireau, Teddy; Menard, Dominique; Burgeot, Thierry.
Le dispositif « SELI » est mis en place depuis 2016 pour acquérir des données sur les effets biologiques intégrateurs de la contamination chimique chez des organismes marins (poissons et bivalves) et ainsi renseigner le critère 2 du descripteur 8 de la DCSMM (Le niveau de concentration des contaminants ne provoque pas d’effets dus à la pollution). Des soles ont été prélevées en août et septembre 2017 et des moules en février 2018, dans le cadre du suivi ROCCH MV. Les biomarqueurs suivis chez ces organismes couvrent plusieurs mécanismes d’actions toxiques (reprotoxicité, génotoxicité, neurotoxicité) et incluent des mesures de la santé générale de l'organisme. Les contaminants suivis sont des éléments traces métalliques et des contaminants organiques...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73215/72410.pdf
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Etude de la contamination chimique chez quatre espèces de poisson en Méditerranée. Rapport final des actions 2017-2018 du dispositif de suivi CONTAMED ArchiMer
Mille, Tiphaine; Mauffret, Aourell; Baudrier, Jerome; Wessel, Nathalie; Bouchoucha, Marc.
Le dispositif de suivi CONTAMED vise à suivre les niveaux de contamination de plusieurs maillons de réseaux trophiques méditerranéens et à approfondir la compréhension des processus de bioaccumulation et de transfert des contaminants métalliques et organiques. CONTAMED se décompose en 3 protocoles ; les actions 2017-2018 correspondent à la réalisation des protocoles 1 et 3. Le protocole 1 est le suivi de la contamination en mercure dans le muscle des 2 espèces communes de rougets le long de la façade méditerranéenne française avec pour objectif supplémentaire cette année de mieux appréhender les variations saisonnières de la contamination en mercure dans le but de définir la période d’échantillonnage optimale et donc de stabiliser le protocole du réseau de...
Tipo: Text Palavras-chave: Contaminants chimiques Réseaux trophiques; Méditerranée Surveillance DCSMM.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00458/56962/58860.pdf
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Evaluation du descripteur 8 « Contaminants dans le milieu » en France Métropolitaine. ArchiMer
Mauffret, Aourell; Chiffoleau, Jean-francois; Burgeot, Thierry; Wessel, Nathalie; Brun, Melanie.
Good Environmental Status (GES) for descriptor 8 of MSFD is reached when concentrations of contaminants are at levels not giving rise to pollution effects. According to the decision 2017/848/CE, descriptor 8 is defined by four criteria: concentration in the relevant matrices (sediment, biota) (D8C1), effects of chronic contamination to the marine organisms (D8C2), duration and spatial extent of acute pollution events (D8C3), effects of acute contamination to the marine organisms (D8C4). The GES for descriptor 8 is assessed at the level of four marine subregions (SRM), including: Channel – North Sea (MMN), Celtics Seas (MC), Bay of Biscay (GdG) and the Occidental Mediterranean Sea (MO). In order to achieve GES, each indicator of descriptor 8 should respect...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57294/59374.pdf
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Legacy and emerging organohalogen compounds in deep-sea pelagic organisms from the Bay of Biscay (Northeast Atlantic) ArchiMer
Munschy, Catherine; Chouvelon, Tiphaine; Bely, Nadege; Moisan, Karine; Pollono, Charles; Mauffret, Aourell; Spitz, Jérôme.
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00610/72170/70942.pdf
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Recent innovation in microbial source tracking using bacterial real-time PCR markers in shellfish ArchiMer
Mauffret, Aourell; Mieszkin, Sophie; Morizur, Mael; Alfiansah, Yustian Rovi; Lozach, Solen; Gourmelon, Michele.
We assessed the capacity of real-time PCR markers to identify the origin of contamination in shellfish. Oyster, cockles or clams were either contaminated with fecal materials and host-associated markers designed from Bacteroidales or Catellicoccus marimammalium 16S RNA genes were extracted from their intravalvular liquid, digestive tissues or shellfish flesh. Extraction of bacterial DNA from the oyster intravalvular liquid with FastDNA spin kit for soil enabled the selected markers to be quantified in 100% of artificially contaminated samples, and the source of contamination to be identified in 13 out of 38 naturally contaminated batches from European Class B and Class C areas. However, this protocol did not enable the origin of the contamination to be...
Tipo: Text Palavras-chave: Microbial source tracking; Shellfish; Bacteroidales; Real-time PCR; Intravalvular liquid; Digestive tissues.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00137/24776/25188.pdf
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Relevance of Bacteroidales and F-Specific RNA Bacteriophages for Efficient Fecal Contamination Tracking at the Level of a Catchment in France ArchiMer
Mauffret, Aourell; Caprais, Marie-paule; Gourmelon, Michele.
The relevance of three host-associated Bacteroidales markers (HF183, Rum2Bac, and Pig2Bac) and four F-specific RNA bacteriophage genogroups (FRNAPH I to IV) as microbial source tracking markers was assessed at the level of a catchment (Daoulas, France). They were monitored together with fecal indicators (Escherichia coli and enterococci) and chemophysical parameters (rainfall, temperature, salinity, pH, and turbidity) by monthly sampling over 2 years (n = 240 water samples) and one specific sampling following an accidental pig manure spillage (n = 5 samples). During the 2-year regular monitoring, levels of E. coil, enterococci, total F-specific RNA bacteriophages, and the general Bacteroidales marker AllBac were strongly correlated with one another and...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00089/20009/17680.pdf
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Report on the approaches implemented in the Mediterranean countries for GES descriptor 8. Proposition of a road map for a better harmonization ArchiMer
Mauffret, Aourell; Bajt, Oliver; Bellas, Juan; Chalkiadaki, Olga; Dassenakis, Manos; Giannoudi, Louisa; Giubilato, Elisa; Hatzianestis, Ioannis; Marcomini, Antonio; Paramana, Theodora; Tsangaris, Catherine; Tronczynski, Jacek; Zeri, Christina.
Based on the data gap analysis performed in the first step of MEDCIS, the Medcis team on contaminant proposed a road map associated with a time-schedule in order to improve harmonization in Mediterranean region for 2024 GES assessment. Partner countries shared information on monitored substances and biological effects, thresholds used, matrix/matrices used for the monitoring of each substance/family of substances, the limit of quantification (LQ) of each chemical measurement, and the proportion of censored data
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73249/72463.pdf
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