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Bayesian random regression threshold models for genetic evaluation of pregnancy probability in Red Sindhi heifers. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. T. de; BONAFÉ, C. M.; SIVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; OLIVEIRA, H. R. de; MENEZES, G. R. de O.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S..
We proposed a Bayesian random regression threshold model for genetic evaluation of pregnancy probability (PP) in Red Sindhi heifers over different months. Since this breed was recently introduced in Brazil, the age of 14 months usually preconized for Nellore cattle may not reflect the reality of the fertility indicator. In this context, the pregnancy success was evaluated at other ages aiming to understand its genetic variability pattern over time. A total of 4828 phenotyped heifers belong to 657 contemporary groups were used for the analysis. The estimated connectedness was equal to 99.75% considering 6189 individuals in the final pedigree. The random regression threshold models were implemented by combining second, third and fourth order Legendre...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Heifer pregnancy; Legendre polynomials; Prenhez; Novilho; Bos indicus; Gado nelore; Zebu; Pedigree; Genetic heterogeneity.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077375
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Genome prediction accuracy of common bean via Bayesian models. Repositório Alice
BARILI, L. D.; VALE, N. M. do; SILVA, F. R. e; CARNEIRO, J. E. de S.; OLIVEIRA, H. R. de; VIANELLO, R. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; NASCIMENTO, M..
We aimed to apply genomic information based on SNP (single nucleotide polymorphism) markers for the genetic evaluation of the traits ?stay-green? (SG), plant architecture (PA), grain aspect (GA) and grain yield (GY) in common bean through Bayesian models. These models were compared in terms of prediction accuracy and ability for heritability estimation for each one of the mentioned traits. A total of 80 cultivars were genotyped for 377 SNP markers, whose effects were estimated by five different Bayesian models: Bayes A (BA), B (BB), C (BC), LASSO (BL) e Ridge regression (BRR). Although, prediction accuracies calculated by means of cross-validation have been similar within each trait, the BB model stood out for the trait SG, whereas the BRR was indicated...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Validação cruzada; Cross-validation; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Marcador Molecular; Beans; Genetic markers; Marker-assisted selection.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095835
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Modelos de limiar em regressão aleatória para avaliação genética da probabilidade de prenhez na raça Sindi. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. T. de; MENEZES, G. R. de O.; SILVA, F. F. e; OLIVEIRA, H. R. de; VENTURA, H. T..
Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para probabilidade de prenhez na raça Sindi em diferentes idades (15, 19, 23, 27, 31, 35, 39 e 43 meses, respectivamente denotadas por PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 e PP_43) via modelos de limiar em regressão aleatória. Foram utilizados polinômios ortogonais de Legendre de segunda, terceira e quarta ordem, considerando a homogeneidade e heterogeneidade de variância residual. Os componentes de covariância foram estimados via abordagem Bayesiana por meio do software THRGIBBS3F90. Foram incluídos os efeitos sistemáticos de criador, fazenda do criador, ano de nascimento, estação de nascimento e como covariável (linear) o peso da vaca na idade em que ela concebeu. Além desses efeitos, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Correlação genética; Inferência bayesiana; Modelo threshold; Prenhez precoce; Bayesian inference; Early pregnancy; Threshold model; Gado Sindi; Genetic correlation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077394
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