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Análise de associação genômica ampla (GWAS) da produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via genotipagem por sequenciamento (GBS), marcadores SNPs polimórficos em 175 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico, identificando regiões genômicas que poderiam estar relacionadas a esse caráter.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento associativo; Genotipagem por sequenciamento; Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022477
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Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas. Repositório Alice
MENDES, C. dos A.; BORBA, T. C. de O.; BUENO, L. G.; CRUZEIRO, G. A. V.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi identificar, por meio da análise de mapeamento associativo, os marcadores moleculares relacionados à produtividade do arroz de terras altas e aos seus caracteres componentes. Foram usadas 113 linhagens e cultivares de arroz de terras altas, da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa, com reduzido vínculo genético entre si. Os seguintes caracteres componentes da produtividade foram avaliados: número de panículas por metro, número de grãos por panícula e peso de 100 grãos. Dos 115 marcadores utilizados, 25 (21,7%) associaram-se significativamente a um ou mais caracteres. Entre os 29 SSR ("simple sequence repeats") colocalizados em QTL ("quantitative trait loci") de produtividade de arroz, 12 foram associados aos caracteres avaliados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Desequilíbrio de ligação; Genômica funcional; Mapeamento associativo; Seleção assistida por marcadores; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético; Germoplasma; Marcador genético.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1001903
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Análise de QTLs para produtividade baseada em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
ADORNO, D. R.; PANTALIÃO, G. F.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho consiste na localização de genes e combinações alélicas associados à produtividade em arroz por meio da genotipagem de alta resolução por marcadores SNPs, obtidos por genotipagem por sequenciamento (GBS) e posterior análise de QTLs.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Genética; Variação genética; Recombinação.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039618
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Análise dos dados moleculares genotipados via GBS da populaçao RIL de arroz para uma posterior análise de QTL. Repositório Alice
SILVA, D. R. A.; BORBA, T. C. de O.; GARCIA, A. L. B.; PANTALIÃO, G. F.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho consiste na análise e filtragem dos dados de marcadores SNPs obtidos pela genotipagem por sequenciamento (GBS) provinda da população RIL (linhas puras recombinantes) em estudo, com o intuito de obter apenas marcadores SNPs polimórficos para uma posterior análise de QTL para produtividade em arroz.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: QTL; SNPs; Arroz; Oryza sativa; Protutividade; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022482
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Cruzamentos em dialelo de genótipos de arroz. Repositório Alice
RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho foi, por meio da análise dialélica, avaliar o potencial de acessos mais produtivos e de ampla base genética na obtenção de linhagens superiores.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Genótipo; Cruzamento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039479
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Estudo de associação genômica ampla para produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via GBS, o polimorfismo de marcadores SNPs em 283 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027737
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Identificação de loci relacionados à produtividade sob deficit hídrico utilizando uma abordagem GBS - GWAS. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via GBS, o polimorfismo de marcadores SNPs em 175 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob deficit hídrico, identificando regiões genômicas que podem estar relacionadas a esse caráter.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Deficiência hídrica; Arroz; Oryza sativa; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039439
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Identificação de SNPs associados à produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via Genotipagem por Sequenciamento (GBS), o polimorfismo de marcadores SNPs em 283 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984352
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Mapeamento associativo para produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via Genotipagem por Sequenciamento (GBS), o polimorfismo de marcadores SNPs em 283 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Melhoramento genético.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964164
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Mapeamento associativo para tolerância à seca em arroz por marcadores SNPs em alta densidade. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; GUIMARÃES, C. M.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via GBS, o polimorfismo de marcadores SNPs em 95 acessos componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular; Mapa.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941690
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Marker-assisted elimination of drought-susceptible accessions in upland rice breeding. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; PANTALIÃO, G. F.; ABREU, F. M.; SILVEIRA, R. D.; GARCIA, A. L. B.; NEVES, L. G.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; BRONDANI, C..
Breeding for water-deficit tolerance is fundamental to guarantee the sustainability of upland rice production, mainly due to the possibility of an increased frequency of drought episodes due to climate change. This work aimed to identify single nucleotide polymorphism (SNP) markers, derived from RNA sequencing (RNA-Seq), genome-wide association study (GWAS) and candidate genes from Arabidopsis, with potential for use in marker-assisted selection (MAS) for drought tolerance. RNA-Seq and GWAS were efficient in identifying useful SNP markers from the data obtained from three years of field experiments for 175 upland rice accessions, which were sequenced using 32 genes by Capture-Seq. Three genes were equally able to generate SNP markers that discriminated 95%...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Melhoramento genético vegetal; Resistência a seca; Rice; Genotyping by sequencing; Plant breeding; Genetic techniques and protocols; Single nucleotide polymorphism; Nucleotide sequences; Sequence analysis; Drought tolerance.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088846
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