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Brazilian microbiome project: revealing the unexplored microbial diversity - challenges and prospects. Repositório Alice
PYLRO, V. S.; ROESCH, L. F. W.; ORTEGA, J. M.; AMARAL, A. M. do; TÓTOLA, M. R.; HIRSCH, P. R.; ROSADO, A. S.; GÓES-NETO, A.; SILVA, A. L. da C.; ROSA, C. A.; MORAIS, D. K.; ANDREOTE, F. D.; DUARTE, G. F.; MELO, I. S. de; SELDIN, L.; LAMBAIS, M. R.; HUNGRIA, M.; PEIXOTO, R. S.; KRUGER, R. H.; TSAI, S. M.; AZEVEDO, V..
The Brazilian Microbiome Project (BMP) aims to assemble a Brazilian Metagenomic Consortium/Database. At present, many metagenomic projects underway in Brazil are widely known. Our goal in this initiative is to co-ordinate and standardize these together with new projects to come. It is estimated that Brazil hosts approximately 20 % of the entire world's macroorganism biological diversity. It is 1 of the 17 countries that share nearly 70 % of the world's catalogued animal and plant species, and is recognized as one of the most megadiverse countries. At the end of 2012, Brazil has joined GBIF (Global Biodiversity Information Facility), as associated member, to improve the access to the Brazilian biodiversity data in a free and open way. This was an important...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade microbiana; Biodiversidade; Microrganismo; Biodiversity.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000621
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Comparison of DNA extraction protocols for microbial communities from soil treated with biochar. Repositório Alice
LEITE, D. C. A.; BALIEIRO, F. C.; C. A. PIRES; MADARI, B. E.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. C.; PEIXOTO, R. S..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biochar; Extração de DNA; PCR-DGGE; Comunidades microbianas; Índice de pureza do DNA.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007986
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Effect of sugarcane burning or green harvest methods on the brazilian cerrado soil bacterial community structure. Repositório Alice
RACHID, C. T. C. C.; SANTOS, A. L.; PICCOLO, M. C.; BALIEIRO, F. C.; COUTINHO, H. L. C.; PEIXOTO, R. S.; TIEDJE, J. M.; ROSADO, A. S..
2013
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cerrado; Sugarcane; Bacterial Community.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981944
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Impacto de diferentes níveis de palhada de cana-de-açúcar sobre comunidade fúngica total de latossolo do cerrado. Repositório Alice
PIRES, C. A.; LEITE, D. C. A.; COSTA, C. T. R. C.; ANGELINI, G. A. R.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S.; COUTINHO, H. L. C.; ZANATTA, J.; SALTON, J.; BALIEIRO, F. C..
O Brasil atualmente é o líder na produção de cana-de-açúcar, com aproximadamente 5,5 milhões de hectares plantados e produção de 423 milhões de toneladas de colmos na safra 2005/2006. Os resíduos da indústria sucroalcooleira também constituem fontes alternativas de matéria orgânica, nutrientes e energia para o agronegócio nacional, dentre eles a palhada que fica sobre solo após a colheita mecanizada. O presente trabalho buscou avaliar o impacto da retirada total e parcial da palhada de cana-de-açúcar na estrutura da comunidade microbiana total do solo. As coletas foram feitas na Fazenda Cristal, do Grupo Unialco (Dourados AS Álcool e Açúcar), no município de Dourados, MS. Os tratamentos do experimento correspondem a três níveis de palhada remanescente após...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Latossolo; Cerrado; Cana-de-açucar.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/920016
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Integrated crop-livestock-forest system presents a different soil microbial structure in comparison to other land uses. Repositório Alice
LEITE, D. C. A.; BALIEIRO, F. de C.; LEITE, L. F. C.; MADARI, B. E.; RIBEIRO, A. de F.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S..
Soil organic matter (SOM) conservation is essential for environmental services maintenance, especially in tropical agroecosytems where this component is essential for soil fertility, structure and biological activity. Soil microorganisms are the main driver of nutrient cycling, since key processes, such as C and N mineralization, N immobilization, xenobiotics decomposition, denitrification and others are mediated by them. However when the agroecosystems are manipulated, these active components of soils are impacted, changing the carbon and nutrient dynamics. Therefore, the monitoring of the microbial communities is a good tool to indicate changes in soil dynamics. Our objective was to characterize the soil microbial communities under different land uses by...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Uso da terra; Microbiologia do solo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022253
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Intercropped silviculture systems, a key to achieving soil fungal community management in eucalyptus plantations. Repositório Alice
RACHID, C. T. C. C.; BALIEIRO, F. C.; FONSECA, E. S.; PEIXOTO, R. S.; CHAER, G. M.; TIEDJE, J. M.; ROSADO, A. S..
Fungi are ubiquitous and important contributors to soil nutrient cycling, playing a vital role in C, N and P turnover, with many fungi having direct beneficial relationships with plants. However, the factors that modulate the soil fungal community are poorly understood. We studied the degree to which the composition of tree species affected the soil fungal community structure and diversity by pyrosequencing the 28S rRNA gene in soil DNA. We were also interested in whether intercropping (mixed plantation of two plant species) could be used to select fungal species. More than 50,000 high quality sequences were analyzed from three treatments: monoculture of Eucalyptus; monoculture of Acacia mangium; and a mixed plantation with both species sampled 2 and 3...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Eucalipto; Silvicultura.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1019687
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Intercropped silviculture systems, a key to achieving soil fungal community management in eucalyptus plantations. Repositório Alice
RACHID, C. T. C. C.; BALIEIRO, F. de C.; FONSECA, E. S.; PEIXOTO, R. S.; CHAER, G. M.; TIEDJ, J. M.; ROSADO, A. S..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soil management; Acacia mangium; Fungi diversity.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010390
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Sugarcane trash levels in soil affects the fungi but not bacteria in a short-term field experiment. Repositório Alice
RACHID, C. T. C. C.; PIRES, C. A.; LEITE, D. C. A.; COUTINHO, H. L. C.; PEIXOTO, R. S.; ROSADO, A. S.; SALTON, J.; ZANATTA, J. A.; MERCANTE, F. M.; ANGELINI, G. A. R.; BALIEIRO, F. de C..
The sugarcane in Brazil is passing through a management transition that is leading to the abolition of pre-harvest burning. Without burning, large amounts of sugarcane trash is generated, and there is a discussion regarding the utilization of this biomass in the industry versus keeping it in the field to improve soil quality. To study the effects of the trash removal on soil quality, we established an experimental sugarcane plantation with different levels of trash over the soil (0%, 50% and 100% of the original trash deposition) and analyzed the structure of the bacterial and fungal community as the bioindicators of impacts. The soil DNA was extracted, and the microbial community was screened by denaturing gradient gel electrophoresis in two different...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Palhada de cana-de-açúcar; Qualidade do solo; Microbiologia do solo; Estrutura da comunidade de fungos.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052739
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