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Accuracy of genome-wide imputation in Braford and Hereford beef cattle. Repositório Alice
PICCOLI, M. L.; BRACCINI, J. B.; CARDOSO, F. F.; SARGOLZAEI, M.; LARMER, S. G.; SCHENKEL, F. S..
Article 157.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bovino.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008091
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Accuracy of genotype imputation with different low density panels in Braford and Hereford cattle. Repositório Alice
PICCOLI, M. L.; BRACINNI NETO, J.; CARDOSO, F. F.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL, F. S..
The main objective of this research was to test alternative low density SNP panels to impute Illumina 50K SNP panel genotypes in Braford and Hereford cattle. Genotypes from 3,768 Hereford, Braford and Nellore animals were used for testing imputation from low density SNP panels (3K, 6K, 8K, 15K and 20K) to the Illumina 50K SNP panel, under four different scenarios: including or not Nellore genotypes in the reference population in combination with the use or not of pedigree information. There were no significant differences in imputation accuracy among these four scenarios within each panel. However, significant differences between panels were found. The best accuracy was given by a customized 15K SNP panel, with an overall genotype concordance rate of...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção genômica; Gado de corte.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/995739
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Genomic predictions for economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle using true and imputed genotypes. Repositório Alice
PICCOLI, M. L.; BRITO, L. F.; BRACCINI, J.; CARDOSO, F. F.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL, F. S..
Genomic selection (GS) has played an important role in cattle breeding programs. However, genotyping prices are still a challenge for implementation of GS in beef cattle and there is still a lack of information about the use of low-density Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) chip panels for genomic predictions in breeds such as Brazilian Braford and Hereford. Therefore, this study investigated the effect of using imputed genotypes in the accuracy of genomic predictions for twenty economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle. Various scenarios composed by different percentages of animals with imputed genotypes and different sizes of the training population were compared.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genotipagem; Gado de corte; Seleção genótipa.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1073847
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Genomic selection for tick resistance in Braford and Hereford cattle using single-step methodology. Repositório Alice
CARDOSO, F. F.; GULIAS-GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M.; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; YOKOO, M. J. I..
Resumo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção genômica.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/940293
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Genomic selection for tick resistance in Braford and Hereford cattle using single-step methodology. Repositório Alice
CARDOSO, F. F.; GULIAS-GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M.; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; YOKOO, M. J.; CAETANO, A. R.; MISZTAL, I.; AGUILAR, I..
The Rhipicephalus microplus tick is one of the main sources of losses in tropical cattle production, causing decreased performance, hide devaluation, and increased costs with treatments and transmission of infectious agents. The aim of this work was to evaluate the utility of genomic evaluation of Braford and Hereford cattle for genetic resistance to ticks.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Rhipicephalus microplus; Boophilus microplus; Beef cattle.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946764
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Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares. Infoteca-e
CARDOSO, F. F.; GOMES, C. C. G.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B. da; REGITANO, L. C. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..
O problema do carrapato bovino. A alternativa da seleção genômica. Resultados experimentais. Procedimentos para aplicação prática. Considerações finais.
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Carrapato bovino; Rhipicephalus; Boophilus microplus.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/945515
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Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares. Infoteca-e
CARDOSO, F. F.; GULIAS GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..
O problema do carrapato bovino; A alternativa da seleção genômica; Resultados experimentais; Procedimentos para aplicação prática; Considerações finais.
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Boophilus microplus; Gado de corte.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/950709
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