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Connectivities with shellfish farms and channel rivers are associated with mortality risk in oysters ArchiMer
Gangnery, Aline; Normand, Julien; Duval, Cyrielle; Cugier, Philippe; Grangeré, Karine; Petton, Bruno; Petton, Sebastien; Orvain, Francis; Pernet, Fabrice.
Oyster diseases have major consequences on fisheries and aquaculture. In France, young Pacific oysters Crassostrea gigas are severely hit by the ostreid herpesvirus, whereas adults suffer mortalities presumably caused by pathogenic bacteria. Here we investigated the origin and spread of mortalities that affect both young and adult oysters, and we identified and compared their risk factors. Mortality was monitored in 2 age classes of oysters deployed in early spring at 39 sites spread over a 37 km2 surface area inside and outside of shellfish farms. Environmental data obtained from numerical modelling were used to investigate risk factors. Mortality of young oysters associated with ostreid herpesvirus occurred in the oyster farming area. Hydrodynamic...
Tipo: Text Palavras-chave: Aquaculture; Bivalve; Disease; Epidemiology and health; Ecological modelling; Hydrodynamic connectivity.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/69983/67896.pdf
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Development and validation of a sediment dynamics model within a coastal operational oceanographic system ArchiMer
Cayocca, Florence; Verney, Romaric; Petton, Sebastien; Caillaud, Matthieu; Dussauze, Morgan; Dumas, Franck; Le Roux, Jean-francois; Pineau-guillou, Lucia; Le Hir, Pierre.
The rising interest in environmental and ecosystem dynamics have lead coastal oceanographers to not only investigate the “traditional” physical parameters describing the ocean state and its dynamics (e.g. temperature, salinity, currents, water levels in coastal areas), but to also account for the dynamics of parameters describing its biogeochemical components. To that end, MARS3D regional and coastal modelling system has been coupled to ecosystem modules (ECO-MARS3D, ECO3M) as well as sediment dynamics modules (MARS3D-SEDIM): sediment, nutrient and primary production contents can be considered as the lower level environment and ecosystem descriptors of the “biogeochemical” ocean. Early investments into physical and biological analysis at the regional scale...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00194/30572/29015.pdf
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Devenir des apports terrigènes autour du Grand Nouméa (Décembre 2016 - Avril 2017) ArchiMer
Desclaux, Terence; Hubert, Clarisse; Le Tesson, Eric; Lemonnier, Hugues; Petton, Sebastien; Royer, Florence; Soulard, Benoit; Schohn, Thomas; Le Gendre, Romain.
Dans l’objectif de mieux caractériser le devenir en mer des apports terrigènes autour de la ville de Nouméa, Nouvelle-Calédonie, notamment suite au passage de dépressions et cyclones tropicaux, différents réseaux d’observation routiniers (GOPS, Météo-France, DAVAR) ont été complétés par l’installation d’instruments au niveau des exutoires marins de la Dumbéa et la Coulée, et par la réalisation répétée de profils hydrologiques (CTD) sur la zone côtière d’intérêt. L’objectif de ce rapport est de restituer et commenter les observations collectées. Le contexte météo-océanique et les observations réalisées sont d’abord exposés sur l’ensemble de la période étudiée, qui court du 1er décembre 2016 au 30 avril 2017. Les conséquences du passage du cyclone Cook sur...
Tipo: Text Palavras-chave: Apports terrigènes; Lagon; Campagne de mesure; Panache; Rivière; Cyclone; Dépression tropicale; Grand Nouméa; Nouvelle-Calédonie; Physico chimie.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00471/58315/60865.pdf
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Étude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest ArchiMer
Chapelle, Annie; Le Bec, Claude; Amzil, Zouher; Dreanno, Catherine; Guillou, Laure; Klouch, Khadidja; Labry, Claire; Le Gac, Mickael; Pineau-guillou, Lucia; Siano, Raffaele; Abernot, Chantal; Andrieux, Francoise; Caradec, Florian; Destombe, Christophe; Dia, A.; Doner, Anne; Duval, Julia; Gouriou, Jeremie; Lazure, Pascal; Le Brun, Luc; Le Gal, Dominique; Malestroit, Pascale; Petton, Sebastien; Plus, Martin; Quere, Julien; Savar, Veronique; Schmitt, Sophie; Terre, A.; Youenou, Agnes.
Suite à l’événement de grande ampleur d’efflorescence d’Alexandrium minutum et des toxicités associées en Rade de Brest en 2012, un projet a été élaboré avec la Région Bretagne dans le cadre du développement du port de Brest. L’Ifremer a organisé un échantillonnage dans l’estuaire de la rivière de Daoulas, zone la plus touchée en 2012, au cours des printemps-été 2013 et 2014. Un suivi de la présence d’A. minutum dans les sédiments a également été réalisé en hiver 2014. De ces suivis, des mesures réalisées au laboratoire à ce jour, des simulations du modèle Prévimer ainsi que des résultats du réseau Rephy et Velyger, il ressort que: * La rade de Brest peut aujourd’hui être considérée comme une zone à risque pour Alexandrium minutum. En effet, depuis 2012...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00254/36487/35029.pdf
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Influence of environmental and anthropogenic factors on the composition, concentration and spatial distribution of microplastics: A case study of the Bay of Brest (Brittany, France) ArchiMer
Frere, L.; Paul-pont, I.; Rinnert, Emmanuel; Petton, Sebastien; Jaffre, J; Bihannic, Isabelle; Soudant, P.; Lambert, C.; Huvet, Arnaud.
The concentration and spatial distribution of microplastics in the Bay of Brest (Brittany, France) was investigated in two surveys. Surface water and sediment were sampled at nine locations in areas characterized by contrasting anthropic pressures, riverine influences or water mixing. Microplastics were categorized by their polymer type and size class. Microplastic contamination in surface water and sediment was dominated by polyethylene fragments (PE, 53–67%) followed by polypropylene (PP, 16–30%) and polystyrene (PS, 16–17%) microparticles. The presence of buoyant microplastics (PE, PP and PS) in sediment suggests the existence of physical and/or biological processes leading to vertical transfer of lightweight microplastics in the bay. In sediment (upper...
Tipo: Text Palavras-chave: Microplastic; Coastal ecosystem; Surface water; Sediment; Raman spectroscopy; Hydrodynamic; Dispersal particle modelling.
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00379/48994/51083.pdf
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Modeling reproductive traits of an invasive bivalve species under contrasting climate scenarios from 1960 to 2100 ArchiMer
Gourault, Melaine; Petton, Sebastien; Thomas, Yoann; Pecquerie, Laure; Marques, Goncalo M.; Cassou, Christophe; Fleury, Elodie; Paulet, Yves-marie; Pouvreau, Stephane.
Identifying the drivers that control the reproductive success of a population is vital to forecasting the consequences of climate change in terms of distribution shift and population dynamics. In the present study, we aimed to improve our understanding of the environmental conditions that allowed the colonization of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, in the Bay of Brest since its introduction in the 1960s. We also aimed to evaluate the potential consequences of future climate change on its reproductive success and further expansion. Three reproductive traits were defined to study the success of the reproduction: the spawning occurrence, synchronicity among individuals and individual fecundity. We simulated these traits by applying an individual-based...
Tipo: Text Palavras-chave: DEB model; IPCC scenarios; Reproductive traits; Crassostrea gigas; Bay of Brest.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55188/56794.pdf
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Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2017 ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Lapegue, Sylvie.
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85 000 tonnes ces dernières années. Véritable espèce ingénieur, l’huître creuse, installée en France depuis plus de 50 ans, joue aussi un rôle essentiel sur le plan écologique dans les écosystèmes qui l’abritent. Pourtant, depuis plusieurs années, cette filière subie une baisse de production et les bancs naturels, garants de la diversité génétique, sont mis en danger. Ces phénomènes sont la conséquence directe de l’épizootie causée par OsHV-1 (sous sa forme µVar) affectant les naissains et des mortalités d’adultes associées à la bactérie Vibrio aestuarianus. Ces épisodes de...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Génétique; Ecologie; Réseau National.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56030/57556.pdf
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Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2013 ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Bellec, Gwenael; Talarmain, Eric; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Langlade, Aime; Bouget, Jean-francois; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Palvadeau, Hubert; Bedier, Edouard; Robert, Stephane; Pepin, Jean-francois; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Bucas, Karenn; Barbot, Stephane; Guillemot, Anne; Nonnotte, Lidwine; Duros, Wenceslas; Bonnat, Armel; Tarot, Stephane; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise.
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31091/29499.pdf
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Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2014 ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Haurie, Axel; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Palvadeau, Hubert; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Fouillaron, Pierre; Bouget, Jean-francois; Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise.
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Naissain; Recrutement; Captage; Larves; Cycle de reproduction; Changement climatique; Pacific oyster; Spat; Recruitment; Spat collecting; Larvae; Reproductive cycle; Climate change.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/38990/37561.pdf
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PREVIMER: Downscaling from MyOcean regional scale to coastal scale ArchiMer
Pineau-guillou, Lucia; Dumas, Franck; Petton, Sebastien; Garreau, Pierre; Herbert, Gaelle; Charria, Guillaume; Le Traon, Pierre-yves; Debreu, Laurent.
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00214/32496/30976.pdf
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Qualification zoo-sanitaire du naissain de captage 2013 de l'huître creuse Crassostrea gigas (QUALIF) - Détection précoce des maladies en épreuve thermique de laboratoire ArchiMer
Petton, Bruno; Riobe, Marion; Koechlin, Hugo; Queau, Isabelle; Mingant, Christian; Ratiskol, Dominique; Le Grand, Jacqueline; Petton, Sebastien; Thomas, Yoann; Alunno-bruscia, Marianne; Pouvreau, Stephane; Pernet, Fabrice; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Mille, Dominique; Geay, A.; Bouquet, A.-l.; Cochet, Helene.
Depuis 2008, des mortalités massives d’huîtres creuses âgées de moins d’un an sont relevées sur le littoral français dès que la température de l’eau de mer atteint le seuil de 16°C. Ces mortalités de naissains sont associées à la détection du virus OsHV-1 μVar. Des travaux de qualification zoo-sanitaire menés depuis 2010 ont montré qu’un lot de naissains issus du captage naturel sur deux était infecté par le virus bien avant l’apparition des mortalités dans le milieu naturel, mais qu’a contrario les naissains d’écloserie expertisés présentaient un moindre risque de contamination. Dans le contexte de crise sanitaire chronique, l’objectif de notre étude était d’ obtenir une information qualitative relative au statut zoo-sanitaire OsHV -1 μ V ar des...
Tipo: Text Palavras-chave: Huitre creuse; OsHV - 1μVar; Epreuve thermique.; Maladie; Naissain; Pacific oyster; Spat; Disease; Thermal challenge; OsHV-1 μVar.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00276/38682/37180.pdf
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Qualification zoo-sanitaire du naissain de captage 2014 de l'huître creuse Crassostrea gigas (QUALIF) - Détection précoce des maladies en épreuve thermique de laboratoire ArchiMer
Petton, Bruno; Le Grand, Jacqueline; Riobe, Marion; Mingant, Christian; Ratiskol, Dominique; Petton, Sebastien; Alunno-bruscia, Marianne.
Depuis 2008, des mortalités massives d’huîtres creuses âgées de moins d’un an sont relevées sur le littoral français dès que la température de l’eau de mer atteint le seuil de 16°C. Ces mortalités de naissains sont associées à la détection du virus OsHV-1 μVar. Depuis 2010, des travaux de qualification zoo-sanitaire ont montré qu’environ un lot de naissains de captage sur deux était infecté par le virus avant l’apparition des mortalités dans le milieu naturel. En 2014, dans le cadre de la première action QUALIF, les résultats de la qualification zoo-sanitaire des naissains du captage de l’année 2013 à l’échelle nationale ont mis en évidence le caractère infectieux des maladies développées par ces naissains porteurs latents d’OsHV-1 μVar. L’objectif 2015 du...
Tipo: Text Palavras-chave: Huitre creuse; Naissain; Maladie; OsHV-1 μVar; Epreuve thermique.; Pacific oyster; Seed; Disease; OsHV-1 μVar; Thermal challenge..
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00335/44587/44305.pdf
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Une application dynamique sous système d'information géographique pour la planification spatiale des activités aquacoles en Normandie ArchiMer
Gangnery, Aline; Le Gendre, Romain; Picoche, Coralie; Petton, Sebastien; Bacher, Cedric; Alunno-bruscia, Marianne; You, Junyong; Hageberg, Anne; Strand, Oivind.
La conchyliculture représente une activité importante en Normandie et doit faire face à de sérieuses difficultés (mortalités, diminution de la qualité des produits). Un enjeu actuel concerne la réorganisation des zones d’élevage existantes afin d’optimiser les performances. A contrario, la pisciculture marine est très peu présente dans cette région et il existe un réel enjeu de développement économique. Dans ce contexte, les décideurs (services de l’Etat) et les professionnels ont besoin d’identifier des sites propices à la réalisation de ces activités qui soient également compatibles avec les nombreux autres usages du littoral. Au sein du projet SISQUONOR, un démonstrateur sous Système d’Information Géographique, nommé AkvaVis et développé originellement...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00307/41773/40988.pdf
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