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A lima bean core collection based on molecular markers Scientia Agricola
Gomes,Regina Lucia Ferreira; Costa,Marcones Ferreira; Alves-Pereira,Alessandro; Bajay,Miklos Maximiliano; Viana,João Paulo Gomes; Valente,Sérgio Emílio dos Santos; Lopes,Ângela Celis de Almeida; Zucchi,Maria Imaculada; Pinheiro,José Baldin.
ABSTRACT Some germplasm collections have a high number of accessions, which makes it difficult to explore the genetic variability present in the germplasm bank due to the redundancy and the difficulty of detailed analysis of all conserved accessions. Therefore, our study aimed to analyze the genetic diversity of 153 lima bean (Phaseolus lunatus) accessions for the purpose of constructing a core collection. Eleven SSRs were used for this purpose. The 153 lima bean accessions can be represented by low redundancy using a minimum of 34 accessions, thus representing 22 % of the size of the entire germplasm bank. The core collection had a higher Shannon diversity index and expected heterozygosity (1.906 and 0.811, respectively) than those presented by the entire...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Germplasm; Genetic diversity; Genetic structure; Microsatellite markers.
Ano: 2020 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162020000201100
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A note on the distribution of genetic diversity of Anglo-Nubian goats in central-northern farms of Piauí, Brazil R. Bras. Zootec.
Silvestre,Ellida de Aguiar; Costa,Márcio da Silva; Silva,Pollyana Oliveira da; Bajay,Miklos Maximiliano; Pinheiro,José Baldin; Zucchi,Maria Imaculada; Campelo,José Elivalto Guimarães; Britto,Fábio Barros.
The objective of this study was to characterize the genetic variability of Anglo-Nubian goats using microsatellite markers. The study was conducted using herds from four municipalities of Central-Northern Piauí (Teresina, José de Freitas, Campo Maior, and Angical), where technical information is scarce. Seven markers suggested by FAO were used (ILSTS11, McM527, INRA23, ETH10, OarfCB304, OarfCB48, and MAF209). The samples were genotyped using a 7% polyacrylamide gel. The average number of alleles per locus was 4.0, with observed and expected heterozygosity of 0.38 and 0.55, respectively. Few deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed for each population. Only two loci deviated significantly in two localities. The coefficient of gene...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Endogamy; Genetic structure; Microsatellite; Molecular markers.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982015000400155
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Adaptabilidade e estabilidade de linhagens experimentais de soja selecionadas para caracteres agronômicos através de método uni-multivariado Bragantia
Maia,Maria Clideana Cabral; Vello,Natal Antonio; Rocha,Maurisrael de Moura; Pinheiro,José Baldin; Silva Júnior,Nelson Fonseca da.
Esta pesquisa visou estudar a interação entre genótipos e ambientes (G x E), a adaptabilidade e estabilidade fenotípica, com o uso do modelo biométrico AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis), para avaliação da produtividade de grãos de linhagens experimentais (F10 e F11) de soja. O material envolveu três populações obtidas a partir de um dialelo parcial 4 x 4 com quatro genitores resistentes a insetos (IAC-100, Crokett, Lamar e D72-9601-1) e quatro cultivares adaptadas (BR-6, IAS-5, Davis, OCEPAR-4). Em F2 foram empregados três procedimentos distintos de seleção de plantas individuais: PCI, população formada a partir de plantas F2 obtidas com controle total de insetos; PRIM e PRIS formadas a partir de plantas F2 selecionadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Interação genótipo-ambiente; Modelo AMMI; Produtividade de grãos.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052006000200004
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Adaptabilidade e estabilidade fenotípica em soja avaliada pelo método de Toler Bragantia
Morais,Lizz Kezzy de; Moura,Mara Fernandes; Vencovsky,Roland; Pinheiro,José Baldin.
O objetivo deste trabalho foi avaliar 69 genótipos de soja com diferentes ciclos de maturação em diferentes ambientes nos Estados de Mato Grosso e Mato Grosso do Sul utilizando o método de regressão não-linear proposto por TOLER (1990). O método propõe enquadrar os genótipos em cinco grupos, conforme o padrão de resposta A, B, C, D e E. Verificou-se que nas estimativas de qualidade ambiental houve diferenças em seus valores, permitindo inferir sobre os piores e melhores ambientes, Pedra Preta foi detectado como ambiente de melhor qualidade, com a maior estimativa, o que contribui para o aumento da média geral de ambientes. Ao classificar os genótipos com base na produtividade e no padrão de resposta verificou-se que genótipos com padrão de resposta...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Regressão não-linear; Interação genótipo x ambiente; Estabilidade; Adaptabilidade.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052008000200003
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Caracterização genética de mulungu (Erythrina velutina Willd.) em áreas de baixa ocorrência Rev. Ciênc. Agron.
Gonçalves,Luciana Oliveira; Pinheiro,José Baldin; Zucchi,Maria Imaculada; Silva-Mann,Renata.
A Erythrina velutina Willd., popularmente conhecida como mulungu, apresenta propriedades farmacológicas e se encontra em estado de raridade em regiões do Estado de Sergipe. Devido ao interesse econômico, torna-se fundamental gerar informações para definir planos de conservação e exploração sustentável. Este trabalho teve como objetivo caracterizar os indivíduos de Erythrina velutina por meio de marcadores ISSRs. Para isto foram estudados 40 indivíduos do Estado de Sergipe pertencentes a três localidades (Município de Pinhão - Caatinga; Município de Santana do São Francisco e São Cristóvão - Mata Atlântica). Ao total, foram avaliados e obtidos 149 locos a partir de 11 primers ISSR. O número mínimo de locos para estudo de diversidade em E. velutina foi de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genética vegetal; Mulungu.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902014000200009
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Divergência genética em germoplasma de alho Ciência Rural
Viana,João Paulo Gomes; Pires,Carolline de Jesús; Pinheiro,José Baldin; Valente,Sérgio Emílio dos Santos; Lopes,Ângela Célis de Almeida; Gomes,Regina Lucia Ferreira.
RESUMO: O alho é uma das hortaliças mais importantes no mercado brasileiro e mundial. No Piauí, mais especificamente na microrregião de Picos, o alho semi-nobre foi cultivado em larga escala e supria a demanda de vários municípios do estado. Devido à entrada do alho nobre no mercado brasileiro, houve redução na produção de alho semi-nobre que pode ter levado à perda de diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética em doze variedades de alho, sendo quatro de origem piauiense e oito da Coleção de Germoplasma de Alho da Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - Universidade de São Paulo (ESALQ/USP). Para isso, caracterizou-se o germoplasma com base nos descritores propostos pelo International Plant Genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allium sativum; Caracterização agromorfológica; Microssatélites..
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782016000200203
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Emprego da análise AMMI na avaliação da estabilidade produtiva em soja PAB
Oliveira,Adriano Borges de; Duarte,João Batista; Pinheiro,José Baldin.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da interação de genótipos com ambientes (GxA) na produtividade de grãos de um conjunto de linhagens de soja (Glycine max L.). Foram utilizados dados de 11 experimentos (ambientes) realizados no Estado de Goiás. Em cada experimento foram avaliados 18 genótipos, sendo quatro cultivares comerciais como testemunhas. O método de análise da interação foi o procedimento AMMI (modelo de efeitos principais aditivos e interação multiplicativa). O padrão significativo das interações GxA foi captado apenas pelo primeiro eixo principal AMMI, o qual explicou 36% da soma de quadrados GxA original, sugerindo contaminação da matriz de interações clássica por ruídos que prejudicam a qualidade das predições de respostas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Progênie; Interação genótipo-ambiente; Adaptação; Biplot.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003000300004
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Genetic diversity among Brazilian soybean cultivars based on SSR loci and pedigree data BABT
Priolli,Regina Helena Geribello; Pinheiro,José Baldin; Zucchi,Maria Imaculada; Bajay,Miklos Maximiliano; Vello,Natal Antonio.
In this study, simple sequence repeats (SSR) loci and pedigree data were used to investigate the genetic relationship in a group of 168 Brazilian soybean cultivars. Eighteen SSR loci produced an average of 5.06 alleles and a mean gene diversity of 0.58 for the cultivars studied. Genetic distance (GD) was determined using the modified Roger's Wright distance, and a final dendrogram was in agreement with the cultivar pedigree. A distance matrix based on the coefficient of parentage scores was also generated for the cultivars, which ranged from 0 to 1, with a mean of 0.18, whereas SSR-based genetic similarity (1- GD) ranged from 0.01 to 0.90, with a mean of 0.25. Mantel's Z test showed that the similarity matrices generated from both the data sets were low,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coefficient of parentage; Glycine max (L.) Merr.; Microsatellite markers.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000300004
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Genetic diversity in soybean germplasm identified by SSR and EST-SSR markers PAB
Mulato,Bruno Mello; Möller,Milene; Zucchi,Maria Imaculada; Quecini,Vera; Pinheiro,José Baldin.
The objectives of this work were to investigate the genetic variation in 79 soybean (Glycine max) accessions from different regions of the world, to cluster the accessions based on their similarity, and to test the correlation between the two types of markers used. Simple sequence repeat markers present in genomic (SSR) and in expressed regions (EST-SSR) were used. Thirty SSR primer-pairs were selected (20 genomic and 10 EST-SSR) based on their distribution on the 20 genetic linkage groups of soybean, on their trinucleotide repetition unit and on their polymorphism information content. All analyzed loci were polymorphic, and 259 alleles were found. The number of alleles per locus varied from 2-21, with an average of 8.63. The accessions exhibit a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Molecular marker; Plant breeding; Plant germplasm; Polymorphism information content.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000300007
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Genetic parameters and selection strategies for soybean genotypes resistant to the stink bug-complex Genet. Mol. Biol.
Godoi,Cláudio Roberto Cardoso de; Pinheiro,José Baldin.
Soybean genotypes resistant to stink bugs are derived from complex breeding processes obtained through indirect selection. The aim of the present work was to estimate genetic parameters for guiding selection strategies towards resistant genotypes, based on those traits associated with responses to pod-attacking stink bugs, such as the grain filling period (GFP), leaf retention (LR), percentage index of pod damage (PIPD) and percentage of spotted seeds (PSS). We assessed the parental lines IAC-100 (resistant) and FT-Estrela (susceptible), the progenies F2 and F4, 30 progenies F2:3, 30 progenies BC1F2:3 and 30 progenies BC2F2:3, besides the cultivars BRS Celeste and MGBR-46 (Conquista). Three field experiments, using randomized complete block design with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Insect resistance; Stink bugs; Heritability.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000200020
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Genetic structure and a selected core set of brazilian soybean cultivars Genet. Mol. Biol.
Priolli,Regina Helena Geribello; Wysmierski,Philip Traldi; Cunha,Camila Pinto da; Pinheiro,José Baldin; Vello,Natal Antonio.
Soybean is one of the most valuable and profitable oil crop species and a thorough knowledge of the genetic structure of this crop is necessary for developing the best breeding strategies. In this study, a representative collection of soybean cultivars recommended for farming in all Brazilian regions was genotyped using 27 simple sequence repeat (SSR) loci. A total of 130 alleles were detected, with an average allelic number of 4.81 per locus. These alleles determined the core set that best represented this soybean germplasm. The Bayesian analysis revealed the presence of two clusters or subgroups within the whole collection (435 soybean cultivars) and the core set (31 entries). Cultivars of similar origin (ancestral) were clustered into the same groups in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Core collection; Genetic base; Glycine max (L.) Merrill; Bayesian method; SSR markers.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000300013
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Genetic structure and gene flow in Eugenia dysenterica DC in the Brazilian Cerrado utilizing SSR markers Genet. Mol. Biol.
Zucchi,Maria Imaculada; Brondani,Rosana Pereira Vianello; Pinheiro,José Baldin; Chaves,Lázaro José; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Vencovsky,Roland.
The ''cagaita tree'' (Eugenia dysenterica) is a plant found widespread in the Brazilian Cerrado. Its fruit is used for popular consumption and for industrial purposes. This study opens a new perspective for the generation of population genetic data and parameters estimates for devising sound collection and conservation procedures for Eugenia dysenterica. A battery of 356 primer pairs developed for Eucalyptus spp. was tested on the ''cagaita tree''. Only 10 primer pairs were found to be transferable between the two species. Using a polyacrilamide gel, an average of 10.4 alleles per locus was detected, in a sample of 116 individuals from 10 natural ''cagaita tree'' populations. Seven polymorphic loci allowed estimation of genetic parameters, including...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SSR; Myrtaceae; Cerrado; Tropical tree; Genetic diversity and transferability.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000400008
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Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations PAB
Zucchi,Maria Imaculada; Pinheiro,José Baldin; Chaves,Lázaro José; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Couto,Mansuêmia Alves; Morais,Lizz Kezzy de; Vencovsky,Roland.
This study was carried out to assess the genetic variability of ten "cagaita" tree (Eugenia dysenterica) populations in Southeastern Goiás. Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecular variance (AMOVA). A phiST value of 0.2703 was obtained, showing that 27.03% and 72.97% of the genetic variability is present among and within populations, respectively. The Pearson correlation coefficient (r) among the genetic distances matrix (1 - Jaccard similarity index) and the geographic distances were estimated, and a strong positive correlation was detected. Results suggest that these populations are differentiating through a stochastic process, with restricted...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Myrtaceae; Cerrado; Tropical species; Genetic diversity.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005001000005
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Marcadores RAPD para detecção de resistência à ferrugem-asiática-da-soja PAB
Costa,Marcelo Marchi; Unêda-Trevisoli,Sandra Helena; Pinheiro,José Baldin; Kiihl,Romeu Afonso de Souza; Calvo,Éberson Sanches; Di Mauro,Antonio Orlando.
Os objetivos deste trabalho foram confirmar a herança da resistência da PI 459025 (Rpp4) à ferrugem-asiática-da-soja e identificar marcadores moleculares do tipo RAPD, ligados a este gene de resistência, em populações de soja. Pelo cruzamento dos genitores contrastantes PI 459025 x Coodetec 208 obteve-se uma população, cujas populações das gerações F2 e F2:3 foram artificialmente infectadas e avaliadas quanto à reação ao fungo Phakopsora pachyrhizi, pelo tipo de lesão (RB - resistente e TAN - suscetível). Com os resultados da avaliação fenotípica, dois "bulks" foram obtidos com DNA de plantas homozigóticas resistentes e suscetíveis, respectivamente, pela análise de "bulks" segregantes. De 600 iniciadores RAPD aleatórios, foram identificados três com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; Seleção assistida.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001200013
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Parâmetros genéticos da resistência da soja ao nematóide de cisto Raça 1 Bragantia
Moura,Mara Fernandes; Vencovsky,Rolando; Silva,João Flávio Veloso; Morais,Lizz Kezzy de; Moura,Nara Fernades; Pinheiro,José Baldin.
O trabalho objetivou verificar o comportamento de Linhagens Endogâmicas Recombinantes (RIL's - Recombinant Imbred Lines), obtidas do cruzamento entre Hartwig (genitor resistente) e EMGOPA-316 (genitor suscetível) em relação à resistência ao nematóide de cisto da soja - NCS (raça 1) e a estimação de parâmetros genéticos e de progressos de seleção como implicação no melhoramento de plantas. Os parâmetros envolveram o índice de fêmeas (IF) obtido na avaliação de 176 linhagens F6 de soja quanto à resistência ao NCS. Avaliaram-se os genótipos quanto à resposta ao NCS em casa de vegetação e calcularam-se as médias dos IF dos genótipos avaliados. Posteriormente, foram realizadas a distribuição de freqüência e a análise de variância e, então, estimado o número de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Heterodera glycines; Resistência genética; Glycine max; Ganho de seleção.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052008000100014
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Seleção de linhagens experimentais de soja para características agronômicas e tolerância a insetos Bragantia
Maia,Maria Clideana Cabral; Vello,Natal Antonio; Rocha,Maurisrael de Moura; Fonseca Júnior,Nelson Silva da; Lavorante,Osmir José; Pinheiro,José Baldin; Dias,Carlos Tadeu dos Santos; Assis,Giselle Mariano Lessa de.
Esta pesquisa visou avaliar linhagens experimentais de soja, com a finalidade de identificar genótipos que reúnam características de alta produtividade e tolerância a insetos. O material foi composto por três populações obtidas de um dialelo parcial 4 x 4 envolvendo quatro genitores tolerantes a insetos e quatro cultivares de elevada produtividade. Foram conduzidos 24 experimentos no delineamento aleatório, em blocos com duas repetições subdivididas em conjuntos experimentais com testemunhas comuns, combinando as três populações e oito ambientes. Com base na produtividade de grãos, concluiu-se que: existe variabilidade genética remanescente entre as linhagens nas três populações; o manejo diferenciado com controle intensivo de insetos e controle ecológico...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; População segregante e análise univariada.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000100010
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