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A new method to estimate genetic gain in annual crops Genet. Mol. Biol.
Breseghello,Flávio; Morais,Orlando Peixoto de; Rangel,Paulo Hideo Nakano.
The genetic gain obtained by breeding programs to improve quantitative traits may be estimated by using data from regional trials. A new statistical method for this estimate is proposed and includes four steps: a) joint analysis of regional trial data using a generalized linear model to obtain adjusted genotype means and covariance matrix of these means for the whole studied period; b) calculation of the arithmetic mean of the adjusted genotype means, exclusively for the group of genotypes evaluated each year; c) direct year comparison of the arithmetic means calculated, and d) estimation of mean genetic gain by regression. Using the generalized least squares method, a weighted estimate of mean genetic gain during the period is calculated. This method...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571998000400024
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz PAB
Bueno,Luíce Gomes; Vianello,Rosana Pereira; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Utumi,Marley Marico; Cordeiro,Antônio Carlos Centeno; Pereira,José Almeida; Franco,Daniel Fernandez; Moura Neto,Francisco; Mendonça,João Antônio; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Oliveira,Jaison Pereira de; Brondani,Claudio.
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; AMMI; Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Recursos genéticos; Variedades tradicionais.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000200010
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Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.) Genet. Mol. Biol.
Borba,Tereza Cristina de Oliveira; Brondani,Rosana Pereira Vianello; Breseghello,Flávio; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Mendonça,João Antônio; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Brondani,Claudio.
Association analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Association analysis; Core collection; Genetic structure.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000300023
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Avaliação dos danos de Oebalus spp. em genótipos de arroz irrigado PAB
Ferreira,Evane; Vieira,Noris Regina de Almeida; Rangel,Paulo Hideo Nakano.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a reação de genótipos de arroz irrigado ao dano causado por percevejos adultos (Oebalus spp., Hemiptera: Pentatomidae), confinados nas panículas, durante os períodos de desenvolvimento e maturação das espiguetas. Dez genótipos foram comparados pelas perdas quantitativas, qualitativas e totais provocadas por O. poecilus, no primeiro e segundo experimentos de campo, respectivamente. Paralelamente, cinco genótipos do primeiro experimento foram comparados quanto às perdas quantitativas causadas por O. ypsilongriseus. Ocorreu reação significativamente diferente entre os genótipos com relação às duas espécies de percevejo. O. poecilus causou uma perda geral média, nos dois experimentos, de 52,7%. A porcentagem média de perda...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Espigueta; Perda; Inseto.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2002000600004
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Características de tolerância à seca em genótipos de uma coleção nuclear de arroz de terras altas PAB
Terra,Thiago Gledson Rios; Leal,Tarcísio Castro Alves de Barros; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Oliveira,Aluízio Borém de.
Resumo:O objetivo deste trabalho foi avaliar características morfofisiológicas relacionadas à tolerância ao estresse hídrico em genótipos de uma coleção nuclear temática de arroz de terras altas, bem como identificar os materiais mais tolerantes. Foram avaliados 100 genótipos de arroz de terras altas em experimentos conduzidos com e sem estresse por deficiência hídrica. Os genótipos tenderam a aumentar o número de dias para o florescimento (FLO) e a diminuir a altura (ALT), na condição de estresse, mas manifestaram ampla variação de comportamento. A esterilidade das espiguetas (EST) foi a característica mais importante para a seleção, nas duas condições de cultivo, em razão de sua elevada correlação negativa com a produtividade. O número de perfilhos não...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Arroz de sequeiro; Estresse abiótico; Estresse hídrico; Índice de susceptibilidade; Variabilidade genética.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000900788
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Comparative linkage mapping of Oryza glumaepatula and Oryza sativa interspecific crosses based on microsatellite and expressed sequence tag markers Genet. Mol. Biol.
Rangel,Priscila Nascimento; Brondani,Rosana Pereira Vianello; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Brondani,Claudio.
Molecular linkage maps representing the rice genome have been an important tool for breeding programs because they allow the elucidation of polygenic traits and are an efficient tool for monitoring wild introgressions in interspecific crosses. Common markers among rice genetic maps are important in defining the homology of chromosomes and the synteny between genomic target regions. We used 148 markers (expressed sequence tags, microsatellites and single nucleotide polymorphisms) to construct a molecular linkage map based on co-dominant markers for an interspecific backcross population using a wild rice (Oryza glumaepatula) from Brazil and performed a comparative analysis with other interspecific maps. The comparative analysis revealed a Spearman...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Comparative linkage map; Molecular markers; Oryza glumaepatula; Rice.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000400019
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Construção de uma coleção nuclear de arroz para o Brasil PAB
Abadie,Tabare; Cordeiro,Celia Maria Torres; Fonseca,Jaime Roberto; Alves,Rosa de Belém das Neves; Burle,Marília Lobo; Brondani,Cláudio; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Castro,Emílio da Maia de; Silva,Heloísa Torres da; Freire,Marlene Silva; Zimmermann,Francisco José Pfeilsticker; Magalhães,José Ronaldo.
A coleção de germoplasma de arroz da Embrapa consiste aproximadamente de 10.000 acessos. O objetivo desse trabalho foi estabelecer a Coleção Nuclear (CN) dessa coleção utilizando as informações e dados disponíveis sobre seus acessos. A estratégia CN foi introduzida no manejo de recursos genéticos vegetais com o principal objetivo de ampliar e sistematizar o uso desses recursos. Uma CN deve ser selecionada procurando reter a variabilidade genética existente na coleção inteira (CI) com um mínimo de redundância. Os acessos da coleção de arroz foram classificados em três estratos: a) variedades tradicionais do Brasil (VT); b) linhagens/cultivares melhoradas do Brasil (LCM); e c) linhagens/cultivares introduzidas (LCI). As variedades tradicionais foram ainda...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; SIG; Diversidade genética; Recursos genéticos; Terras altas; Várzeas.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005000200005
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Determination of genetic variability of traditional varieties of Brazilian rice using microsatellite markers Genet. Mol. Biol.
Brondani,Claudio; Borba,Tereza Cristina Oliveira; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Brondani,Rosana Pereira Vianello.
The rice (Oryza sativa) breeding program of the Rice and Bean research center of the Brazilian agricultural company Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) is well established and provides new cultivars every year to attend the demand for improved high yielding varieties with tolerance to biotic and abiotic stresses. However, the elite genitors used to compose new populations for selection are closely related, contributing to the yield plateau reached in the last 20 years. To overcome this limit, it is necessary to broaden the genetic basis of the cultivars using diverse germplasm such as wild relatives or traditional varieties, with the latter being more practical because they are more easily crossed with elite germplasm to accelerate the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brazil; Genetic resources; Microsatellite markers; Oryza sativa.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000400017
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Development of herbicide-tolerant irrigated rice cultivars PAB
Rangel,Paulo Hideo Nakano; Moura Neto,Francisco Pereira; Fagundes,Paulo Ricardo Reis; Magalhães Junior,Ariano Martins de; Morais,Orlando Peixoto de; Schmidt,Andréa Branco; Mendonça,João Antônio; Santiago,Carlos Martins; Rangel,Priscila Nascimento; Cutrim,Veridiano dos Anjos; Ferreira,Márcio Elias.
The objective of this work was to develop new irrigated rice lines tolerant to imidazolinone herbicides. The backcross breeding procedure was used to transfer the imidazolinone tolerance allele from mutant 93AS3510 to the recurrent parents 'BRS 7 Taim' and 'BRS Pelota'. Individual herbicide-tolerant plants were selected in each generation, for three backcrossings (RC1 to RC3), followed by three selfing generations (RC3F1 to RC3F3). The best four RC3F3 lines for agronomic traits were genotyped with 44 microsatellite markers. The observed conversion index of the new imidazolinone-tolerant lines varied from 91.86 to 97.67%. Pairwise genetic distance analysis between these lines and 22 accessions from the Embrapa's Rice Germplasm Bank clustered the new lines...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Backcrossing; Clearfield rice; Microsatellites; Red rice.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000700010
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Ganho de produtividade pelo melhoramento genético do arroz irrigado no nordeste do Brasil PAB
Breseghello,Flávio; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Morais,Orlando Peixoto de.
Os ganhos genéticos para produtividade obtidos pelo programa de melhoramento do arroz irrigado por inundação na Região Nordeste do Brasil no período de 1984 a 1993 foram estimados visando avaliar a eficiência do programa e traçar novas estratégias. Esta estimativa foi feita a partir dos dados de 59 ensaios regionais de rendimento conduzidos pelas empresas de pesquisa agropecuária do Nordeste, em cooperação com a Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão (CNPAF), Goiânia, GO. O método estatístico utilizado baseia-se em médias ajustadas por modelo linear generalizado. O ganho genético médio estimado foi de 54,9 ± 14,4 kg/ha/ano (0,8%). Nos últimos três anos houve uma tendência de interrupção dos ganhos. A pequena magnitude dos ganhos para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ganho genético; Base genética; Programa de melhoramento.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X1999000300011
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Genetic variability of rice recurrent selection populations as affected by male sterility or manual recombination PAB
Pinheiro,Letícia da Silveira; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Vianello,Rosana Pereira; Brondani,Claudio.
The objective of this work was to determine the effect of male sterility or manual recombination on genetic variability of rice recurrent selection populations. The populations CNA-IRAT 4, with a gene for male sterility, and CNA 12, which was manually recombined, were evaluated. Genetic variability among selection cycles was estimated using14 simple sequence repeat (SSR) markers. A total of 926 plants were analyzed, including ten genitors and 180 individuals from each of the evaluated cycles (1, 2 and 5) of the population CNA-IRAT 4, and 16 genitors and 180 individuals from each of the cycles (1 and 2) of CNA 12. The analysis allowed the identification of alleles not present among the genitors for both populations, in all cycles, especially for the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Allele variation; Rice breeding; Molecular markers; Population improvement.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000600011
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Hot spots for diversity of Magnaporthe oryzae physiological races in irrigated rice fields in Brazil PAB
Dias Neto,Justino José; Santos,Gil Rodrigues dos; Anjos,Liamar Maria dos; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Ferreira,Marcio Elias.
The objective of this work was to evaluate the Magnaporthe oryzae pathotype diversity in new commercial irrigated rice fields in the Araguaia River Valley, state of Tocantins, Brazil. The causal agent of rice blast has heavily affected rice production in the region. Despite the efforts of breeding programs, blast resistance breakdown has been recorded shortly after the release of new resistant cultivars developed for the region. Among the causes of resistance breakage is the capacity of the fungus to rapidly develop new pathotypes. A sample of 479 M. oryzae monosporic isolates was obtained and tested using the international rice blast differential set. Isolate collections were made in small areas designed as trap nurseries and in scattered sites in their...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pyricularia; Pathogenicity; Pathotype; Race.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000300004
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Mapping of quantitative trait loci for thermosensitive genic male sterility in indica rice PAB
Alcochete,Antonio Alberto Neves de; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Ferreira,Marcio Elias.
The objective of this work was to select and use microsatellite markers, to map genomic regions associated with the genetic control of thermosensitive genic male sterility (TGMS) in rice. An F2 population, derived from the cross between fertile and TGMS indica lines, was used to construct a microsatellite-based genetic map of rice. The TGMS phenotype showed a continuous variation in the segregant population. A low level of segregation distortion was detected in the F2 (14.65%), whose cause was found to be zygotic selection. There was no evidence suggesting a cause-effect relationship between zygotic selection and the control of TGMS in this cross. A linkage map comprising 1,213.3 cM was constructed based on the segregation data of the F2 population....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Microsatellite; Hybrid rice; Genetic map.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005001200004
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Progressos do melhoramento genético do arroz de sequeiro no estado do Amapá PAB
Atroch,André Luiz; Morais,Orlando Peixoto de; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Castro,Emílio da Maia de.
Com o objetivo de avaliar os progressos apresentados pelas atividades de melhoramento de arroz (Oryza sativa L.) de sequeiro desenvolvidas no Estado do Amapá, são analisados dados de produção de grãos, floração média, altura de planta, classe de grãos, incidência de acamamento e doenças em sete ensaios comparativos avançados de rendimento e cinco ensaios comparativos preliminares de rendimento, conduzidos em áreas experimentais da Embrapa-Centro de Pesquisa Agroflorestal do Amapá (CPAF-AP), nos anos agrícolas 1990/91 a 1995/96. O ganho anual médio em produtividade, no período estudado, de 83,0 kg/ha, é significativo pelo teste t a 1% de probabilidade. Esse ganho representa, percentualmente, um incremento de 3,5% ao ano na produtividade. Das linhagens...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Linhagem; Ganho genético; Parâmetros genéticos.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X1999000900013
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Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines PAB
Rangel,Priscila Nascimento; Vianello,Rosana Pereira; Melo,Arthur Tavares Oliveira; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Mendonça,João Antônio; Brondani,Claudio.
The objective of this work was to evaluate the yield performance of two generations (BC2F2 and BC2F9) of introgression lines developed from the interspecific cross between Oryza sativa and O. glumaepatula, and to identify the SSR markers associated to yield. The wild accession RS‑16 (O. glumaepatula) was used as donor parent in the backcross with the high yielding cultivar Cica‑8 (O. sativa). A set of 114 BC2F1 introgression lines was genotyped with 141 polymorphic SSR loci distributed across the whole rice genome. Molecular analysis showed that in average 22% of the O. glumaepatula genome was introgressed into BC2F1 generation. Nine BC2F9 introgression lines had a significantly higher yield than the genitor Cica‑8, thus showing a positive genome...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: AB‑QTL; Breeding; Genetic pool; Molecular markers; Target genome region; Yield performance.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000300006
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