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Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource Braz. J. Plant Physiol.
Vieira,Luiz Gonzaga Esteves; Andrade,Alan Carvalho; Colombo,Carlos Augusto; Moraes,Ana Heloneida de Araújo; Metha,Ângela; Oliveira,Angélica Carvalho de; Labate,Carlos Alberto; Marino,Celso Luis; Monteiro-Vitorello,Claúdia de Barros; Monte,Damares de Castro; Giglioti,Éder; Kimura,Edna Teruko; Romano,Eduardo; Kuramae,Eiko Eurya; Lemos,Eliana Gertrudes Macedo; Almeida,Elionor Rita Pereira de; Jorge,Érika C.; Albuquerque,Érika V. S.; Silva,Felipe Rodrigues da; Vinecky,Felipe; Sawazaki,Haiko Enok; Dorry,Hamza Fahmi A.; Carrer,Helaine; Abreu,Ilka Nacif; Batista,João A. N.; Teixeira,João Batista; Kitajima,João Paulo; Xavier,Karem Guimarães; Lima,Liziane Maria de; Camargo,Luis Eduardo Aranha de; Pereira,Luiz Filipe Protasio; Coutinho,Luiz Lehmann; Lemos,Manoel Victor Franco; Romano,Marcelo Ribeiro; Machado,Marcos Antonio; Costa,Marcos Mota do Carmo; Sá,Maria Fátima Grossi de; Goldman,Maria Helena S.; Ferro,Maria Inês T.; Tinoco,Maria Laine Penha; Oliveira,Mariana C.; Van Sluys,Marie-Anne; Shimizu,Milton Massao; Maluf,Mirian Perez; Eira,Mirian Therezinha Souza da; Guerreiro Filho,Oliveiro; Arruda,Paulo; Mazzafera,Paulo; Mariani,Pilar Drummond Sampaio Correa; Oliveira,Regina L.B.C. de; Harakava,Ricardo; Balbao,Silvia Filippi; Tsai,Siu Mui; Mauro,Sonia Marli Zingaretti di; Santos,Suzana Neiva; Siqueira,Walter José; Costa,Gustavo Gilson Lacerda; Formighieri,Eduardo Fernandes; Carazzolle,Marcelo Falsarella; Pereira,Gonçalo Amarante Guimarães.
Coffee is one of the most valuable agricultural commodities and ranks second on international trade exchanges. The genus Coffea belongs to the Rubiaceae family which includes other important plants. The genus contains about 100 species but commercial production is based only on two species, Coffea arabica and Coffea canephora that represent about 70 % and 30 % of the total coffee market, respectively. The Brazilian Coffee Genome Project was designed with the objective of making modern genomics resources available to the coffee scientific community, working on different aspects of the coffee production chain. We have single-pass sequenced a total of 214,964 randomly picked clones from 37 cDNA libraries of C. arabica, C. canephora and C. racemosa,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coffea; CDNA; EST; Transcriptome.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1677-04202006000100008
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Expressão eficiente do gene reporter beta-glucuronidase nos tecidos vasculares de batata (Solanum tuberosum L.) utilizando de um promotor específico (BRA3) de Agrobacterium rhizogenes Horticultura Brasileira
Torres,Antonio Carlos; Ferreira,Adriana T.; Widholzer,Carlos F. N.; Romano,Eduardo; Peters,José A..
Promotores tecido-específico controlam a transcrição de genes em diferentes tecidos vegetais bem como em diferentes estádios de desenvolvimento da planta, levando à indução de distintos níveis de atividade transiente e/ou estável do gene. Tais promotores podem ser empregados para a expressão seletiva de genes de interesse. O promotor rol A de Agrobacterium rhizogenes, por exemplo, é floema-específico, sugerindo que possa ser empregado em estratégias de defesa de plantas que são infectadas por vírus com replicação restrita ao floema. A expressão do gene marcador da ß-glucuronidase (gus) dirigido pelo promotor rol A (pBRA3) foi observada em plantas transgênicas de batata (cvs. Macaca e Baronesa). Entrenós e secções de folhas foram submetidos ao cocultivo com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Agrobacterium tumefaciens; Solanum tuberosum; Transformação genética; Expressão do gene gus.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362003000200011
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Expression analysis in response to drought stress in soybean: shedding light on the regulation of metabolic pathway genes Genet. Mol. Biol.
Guimarães-Dias,Fábia; Neves-Borges,Anna Cristina; Viana,Antonio Americo Barbosa; Mesquita,Rosilene Oliveira; Romano,Eduardo; Grossi-de-Sá,Maria de Fátima; Nepomuceno,Alexandre Lima; Loureiro,Marcelo Ehlers; Alves-Ferreira,Márcio.
Metabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Drought resistance; QPCR; Metabolic pathway; Bioinformatics.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000200004
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Expression pattern of drought stress marker genes in soybean roots under two water deficit systems Genet. Mol. Biol.
Neves-Borges,Anna Cristina; Guimarães-Dias,Fábia; Cruz,Fernanda; Mesquita,Rosilene Oliveira; Nepomuceno,Alexandre Lima; Romano,Eduardo; Loureiro,Marcelo Ehlers; Grossi-de-Sá,Maria de Fátima; Alves-Ferreira,Márcio.
The study of tolerance mechanisms for drought stress in soybean is fundamental to the understanding and development of tolerant varieties. Using in silico analysis, four marker genes involved in the classical ABA-dependent and ABA-independent pathways of drought response were identified in the Glycine max genome in the present work. The expression profiles of the marker genes ERD1-like, GmaxRD20A-like, GmaxRD22-like and GmaxRD29B-like were investigated by qPCR in root samples of drought sensitive and tolerant soybean cultivars (BR 16 and Embrapa 48, respectively), submitted to water deficit conditions in hydroponic and pot-based systems. Among the four putative soybean homologs to Arabidopsis genes investigated herein, only GmaxRD29B-like was not regulated...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Water deficit; Drought adaptation; Marker genes; Glycine max.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000200003
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Extreme resistance to two Brazilian strains of Potato virus Y (PVY) in transgenic potato, cv. Achat, expressing the PVYº coat protein Horticultura Brasileira
Romano,Eduardo; Ferreira,Adriana T.; Dusi,André N.; Proite,Karina; Buso,Jose A.; Ávila,Antonio C.; Nishijima,Marta L.; Nascimento,Adriana S.; Bravo-Almonacid,Fernando; Mentaberry,Alejandro; Monte,Damares; Campos,Magnólia A.; Melo,Paulo Eduardo; Cattony,Monica K.; Torres,Antonio C..
The coat protein (CP) gene of the potato virus Y strain "o" (PVY O) was introduced into potato, cultivar Achat, via Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation. Sixty three putative transgenic lines were challenged against the Brazilian strains PVY-OBR and PVY-NBR. An extremely resistant phenotype, against the two strains, was observed in one line, denominated 1P. No symptoms or positive ELISA results were observed in 16 challenged plants from this line. Another clone, named as 63P, showed a lower level of resistance. Southern blot analysis showed five copies of the CP gene in the extremely resistant line and at least three copies in the other resistant line. The stability of the integrated transgenes in the extreme resistant line was examined during...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum tuberosum; GMO.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362001000200004
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Transformação genética da batata cultivar Achat via Agrobacterium tumefaciens Horticultura Brasileira
Torres,Antonio Carlos; Ferreira,Adriana Teixeira; Romano,Eduardo; Cattony,Mônica Kangussú; Nascimento,Adriana Souza.
Explantes de segmentos nodais de batata (Solanum tuberosum L.) cultivar Achat provenientes da cultura in vitro foram transformados, via Agrobacterium tumefaciens, estirpe LBA4404, contendo o vetor binário pBI121 com os genes npt II e o gus-intron. A regeneração de potenciais transformantes foi feita em meio seletivo contendo 50 mg.L-1 de canamicina. Foram obtidas plantas expressando resistência à canamicina e atividade da b-glucuronidase. Pela análise molecular nas plantas gus+, via PCR, constatou-se a amplificação dos genes npt II. A hibridização por Southern blotting demonstrou a inserção de pelo menos uma cópia do gene introduzido.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum tuberosum; Regeneração; Plantas transgênicas.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362000000100009
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