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Effects of quantitative trait loci on iron content of bovine longissimus dorsi muscle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; REECY, J. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Fe; GWAS.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/997999
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Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake. Repositório Alice
TIZIOTO, P. L.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O.; ROCHA, M. I.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; ZERLOTINI NETO, A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
Residual feed intake (RFI), a measure of feed efficiency (FE), is defined as the difference between the observed and the predictable feed intake considering size and growth of the animal. It is extremely important to beef production systems due to its impact on the allocation of land areas to alternative agricultural production, animal methane emissions, food demand and cost of production. Global differential gene expression analysis between high and low RFI groups (HRFI and LRFI: less and more efficient, respectively) revealed 73 differentially expressed (DE) annotated genes in Longissimus thoracis (LT) muscle of Nelore steers. These genes are involved in the overrepresented pathways Metabolism of Xenobiotics by Cytochrome P450 and Butanoate and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association studies; Quantitative trait locus; Gado de corte; Gene expression; Feed conversion; Beef cattle; Nellore.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073482
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Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. N.; ALENCAR, M. M.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJÓ, G. L. D.; SILVA, L. O. C.; TORRES, R. A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
A genome wide-association study (GWAS) for Warner-Bratzler shear force (WBSF) measured at different times of meat aging was conducted using genotype data from the Illumina BovineHD BeadChip to identify QTLs in Nelore cattle (n=442).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Gado de corte; Genome; Beef cattle; Nellore.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/969364
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Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. de A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO. L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genome scan; Nellore; Meat tenderness.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/988848
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Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. Repositório Alice
TIZIOTO, P.; COUTINHO, L. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; ROSA, C. O.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. A..
Background: Efficiency of feed utilization is important for animal production because it can reduce greenhouse gas emissions and improve industry profitability. However, the genetic basis of feed utilization in livestock remains poorly understood. Recent developments in molecular genetics, such as platforms for genome-wide genotyping and sequencing, provide an opportunity to identify genes and pathways that influence production traits. It is known that transcriptional networks influence feed efficiency-related traits such as growth and energy balance. This study sought to identify differentially expressed genes in animals genetically divergent for Residual Feed Intake (RFI), using RNA sequencing methodology (RNA-seq) to obtain information from genome-wide...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transcriptoma; Sequenciamento genético; Bioinformática; Bos indicus; RFI; Feed efficiency; Zebu; Feed conversion; Transcriptomics; Bioinformatics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1034697
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Resolving the evolution of extant and extinct ruminants with hith-throughput phylogenomics. Repositório Alice
DECKER, J. E.; PIRES, J. C.; CONANT, G. C.; MCKAY, S. D.; HEATON, M. P.; CHEN, K.; COOPER, A.; VIKKI, J.; SEABURY, C. M.; CAETANO, A. R.; JOHNSON, G. D.; BRENNEMAN, R. A.; HANOTTE, O.; EGGERT, L. S.; WIENER, P.; KIM, J.-J.; KIM, K. S.; SONSTEGARD, T. S.; TASSELL, C. P. V.; NEIBERGS, H. L.; MCEWAN, J. C.; BRAUNING, R.; COUTINHO, L. L.; BABAR, M. E.; WILSON, G. A.; MCCLURE, M. C.; ROLF, M. M.; KIM, J. W.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F..
bitstream/item/178476/1/SP-19768-ID-31945.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pecoran; Ancient DNA; Ruminant; Ruminante; Domestication.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/577801
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Tissue tropism in host transcriptional response to members of the bovine respiratory disease complex. Repositório Alice
BEHURA, S. K.; TIZIOTO, P. C.; KIM, J.; GRUPIONI, N. V.; SEABURY, C. M.; SCHNABEL, R. D.; GERSHWIN, L. J.; VAN EEnenNAAM, A. L.; TOAF-FROSENSTEIN, R.; NEIBERGS, H. L.; REGITANO, L. C. de A.; TAYLOR, J. F..
Bovine respiratory disease (BRD) is the most common infectious disease of beef and dairy cattle and is characterized by a complex infectious etiology that includes a variety of viral and bacterial pathogens. We examined the global changes in mRNA abundance in healthy lung and lung lesions and in the lymphoid tissues bronchial lymph node, retropharyngeal lymph node, nasopharyngeal lymph node and pharyngeal tonsil collected at the peak of clinical disease from beef cattle experimentally challenged with either bovine respiratory syncytial virus, infectious bovine rhinotracheitis, bovine viral diarrhea virus, Mannheimia haemolytica or Mycoplasma bovis. We identified signatures of tissue-specific transcriptional responses indicative of tropism in the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: MRNA; Bovinos de corte; BRD; Doença Respiratória; Gado de Corte; Beef cattle; Bovine respiratory disease.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1106292
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