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Altered expression of the caffeine synthase gene in a naturally caffeine-free mutant of Coffea arabica. Repositório Alice
MALUF, M. P.; SILVA, C. C. da; OLIVEIRA, M. de P. A. de; TAVARES, A. G.; SILVAROLLA, M. B.; GUERREIRO FILHO, O..
In this work, we studied the biosynthesis of caffeine by examining the expression of genes involved in this biosynthetic pathway in coffee fruits containing normal or low levels of this substance. The amplification of gene-specific transcripts during fruit development revealed that low-caffeine fruits had a lower expression of the theobromine synthase and caffeine synthase genes and also contained an extra transcript of the caffeine synthase gene. This extra transcript contained only part of exon 1 and all of exon 3. The sequence of the mutant caffeine synthase gene revealed the substitution of isoleucine for valine in the enzyme active site that probably interfered with enzymatic activity. These findings indicate that the absence of caffeine in these...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffee; Cup quality; Differential expression; Naturally decaffeinated.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880373
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Análise de expressão gênica da interação entre cafeeiros silvestres de Coffea arabica E Meloidogyne paranaensis. Repositório Alice
FATOBENE, B. J. dos R.; RENCI, P. F.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; GUERREIRO FILHO. O.; SILVAROLLA, M. B.; GONÇALVES, W..
Fontes de resistência ao nematoide das galhas Meloidogyne paranaensis foram encontradas em cafeeiros silvestres de Coffea arabica. Esses cafeeiros resistentes representam importante fonte de variabilidade genética para o desenvolvimento de novas cultivares resistentes, dada a maior facilidade de hibridação com as cultivares comerciais da espécie e a consequente transferência dos genes de resistência, assim como, à recuperação mais rápida dos caracteres agronômicos do parental recorrente, contribuindo para abreviação do tempo e dos recursos investidos no melhoramento convencional da espécie. Com o objetivo de obter informações sobre a interação molecular entre cafeeiros silvestres de C. arabica e M. paranaensis foi realizada análise dos perfis de expressão...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético do cafeeiro; Nematoide da galha; Resistência genética; Café; Root-knot nematodes; Genetic resistance.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1040344
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Assisted-selection of naturally caffeine-free coffee cultivars?characterization of SNPs from a methyltransferase gene. Repositório Alice
FAVORETTO, P.; SILVA, C. C. da; TAVARES, A. G.; GIATTI, G.; MORAES, P. F.; LOBATO, M. T. V.; SILVAROLLA, M. B.; OLIVEIRO FILHO, G.; MALUF, M. P..
Breeding of caffeine-free coffee cultivars require tools for an early selection of progenies bearing this later trait. Genes from caffeine synthesis and degradation represent major targets for the development of molecular markers for assisted selection. In this study, we characterized SNPs identified on the caffeine synthase gene from AC1 mutant, a naturally caffeine-free arabica coffee plant. Molecular analysis of normal and mutant sequences indicates the occurrence of SNPs in protein domains, potentially associated with caffeine synthesis in coffee. Progenies F2, F1BC1 and BC from crosses of AC mutants and elite cultivars were evaluated regarding caffeine content in grains and genomic segregation profile of selected SNPs. Genotyping analysis allowed the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caffeine content; Caffeine synthase; Coffee; Molecular markers; Marker-assisted selection.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113244
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Bancos de germoplasma de café no Brasil. Infoteca-e
EIRA, M. T. S.; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O.; SILVAROLLA, M. B.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A.; FERRÃO, R. G.; SERA, T.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CARVALHO, C. H.; PADILHA, L.; SOUZA, F. de F..
2007
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Café; Bancos de germoplasma; Brasil.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189629
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Bancos de germoplasma de café no Brasil: base do melhoramento para produtividade e qualidade. Repositório Alice
EIRA, M. T. S. da; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O.; SILVAROLLA, M. B.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRÃO, R. G.; SERA, T.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CARVALHO, C. H. S. de; PADILHA, L.; SOUZA, F. de F..
O melhoramento genético do café visa o desenvolvimento de cultivares que atendam as novas exigências do mercado consumidor. Isto é alcançado com a introdução de novas características mediante hibridações dentro ou entre espécies, aumentando, assim, a variabilidade genética do material a ser trabalhado. A utilização de materiais genéticos com características agronômicas desejáveis, tais como resistência a pragas e doenças, tolerância a seca, solos pobres em nutrientes, a baixos/altos teores de compostos químicos e melhor qualidade de bebida, entre outras, é de fundamental importância para o sucesso do agronegócio café. Este fato ressalta a grande importância da preservação dos acessos nos bancos de germoplasma, a fim de evitar a perda desses genes valiosos.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Café; Coffee; Germoplasma; Genes; Armazenamento; Banco de germoplasma; Criopreservação; Melhoramento vegetal; Brasil; Germoplasm; Genebank; Storage; Cryopreservation; Vegetal improvement..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906096
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Contribuiçoes atuais para a melhoria da qualidade do café arábica. Repositório Alice
SALVA, T. J. G.; RIBEIRO, J. S.; PEZZOPANE, J. R. M.; PEREIRA, S. P.; SILVAROLLA, M. B..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Café; Qualidade; Melhoria.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/575824
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Genetic diversity of a Coffea germplasm collection assessed by RAPD markers. Repositório Alice
SILVESTRINI, M.; MALUF, M. P.; SILVAROLLA, M. B.; GUERREIRO-FILHO, O.; MEDINA-FILHO, H. P.; VANINI, M. M. T.; OLIVEIRA, A. S.; GAPARI-PEZZOPANE, C. de; FAZUOLI, L. C..
Genetic diversity and relationships within and among nine species of Coffea, one species of Psilanthus and the Piata? hybrid from the Coffee Germplasm Collection of Instituto Agronômico de Campinas (IAC), Brazil were assessed using RAPD markers. Genetic diversity and relationships were evaluated by proportion of polymorphic loci (P), Shannon?s genetic index (H0 and G0 ST) and clustering analysis. The overall RAPD variation among all accessions was mostly partitioned between rather than within species. However, C. canephora and C. liberica showed a high genetic diversity within the species (H0 sp = 0.414 and H0 sp = 0.380, espectively) and this was highly structured (high G0 ST). Genetic diversity from C. congensis and C. arabica was also structured, but...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Keywords Coffea; Genetic variability; Molecular markers; Plant collections.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880531
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Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica. Repositório Alice
GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P..
RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção-assistida; Melhoramento molecular; Sequenciamento de RNA; Expressão gênica; Plantas sem cafeína; Assisted-selection; Sequenciamento de transcriptoma; RNAseq; Molecular breeding; Gene expression.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114189
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