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Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Repositório Alice
ALVES, G. S. C.; TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; BREITLER, J-C.; JOËT, T.; GATINEAU, F.; ANDRADE, A. C.; BERTRAND, B.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H..
Despite the importance of the DREB1D gene (also known as CBF4) in plant responses to water deficit and cold stress, studies analysing its regulation by transgenic approaches are lacking. In the current work, a functional study of three CcDREB1D promoter haplotypes (named HP15, HP16 and HP17) isolated from drought-tolerant and droughtsensitive clones of Coffea canephora was carried out in plants of C. arabica stably transformed by Agrobacterium tumefaciens by analysing their ability to regulate the expression of the uidA reporter gene in response to water deficit mimicked by polyethylene glycol (−2.0 MPa) and low relative humidity treatments.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffe; Water deficit; Genetic transformation; Haplotypes; Reporter gene.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084513
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Influence of abiotic stresses in phenotypic expression of transgenic plants of Coffea Arabica under action CcDREB1D promoter. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DECHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; DINIZ, L. E. C.; PAIVA, L. V; BREITLER, J-C.; ANDRADE, A. C.; MARRACINI, P.; ETIENNE, HERVE.
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DREB; Abiotic stress; Biotic stress.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066290
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RNA-Seq em Coffea arabica: genes candidatos em condições de estresse abiótico. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C..
A crescente pesquisa na área de expressão gênica em busca de genes candidatos associados às respostas aos estresses abióticos têm possibilitado estudar o transcriptoma e identificar genes responsivos a esses estresses. O principal objetivo deste trabalho foi obter uma visão geral dos genes ativos em folhas de café arábica variedade Caturra quando submetido a vários estresses abióticos e analisar estes genes identificados in silico por meio da técnica de RT-qPCR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequenciamento por síntese (SBS); Experimento RT-qPCR; Gene; Cafeeiro; Coffea arabica.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084690
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Transcriptome analysis in Coffea arabica, under several abiotic stresses, reveals differentially expressed genes in leaves. Repositório Alice
TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C..
In recent years, Coffea ssp. has become subject of increasing research in gene expression analysis, in the quest to find genetic factors associated to abiotic stress responses with special attention to transcription factors such as the DREB family. This focus was due to their involvement in the regulation of many stress-related genes that play an important role in cascading a response to an environmental stimuli. RNA-seq analysis, creates the possibility to s study the transcriptome and to identify differentially expressed genes upon an abiotic stress or any important agronomic trait. The main objectives of this work were to obtain an overview of the transcriptionally active genes in Arabica coffee leaves when subjected to several abiotic stresses and to...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DREB family; Coffea arabica; Abiotic stress; Genetic factors.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084646
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