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COMPARACIÓN ENTRE EL POTENCIAL DE LAS REGIONES VARIABLES DEL 16s RDNA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE Lactobacillus spp. (LACTOBACILLIACEAE) Acta biol.Colomb.
GONZÁLEZ GARCÍA,LAURA N; VANEGAS LÓPEZ,MARÍA C; RIAÑO PACHÓN,DIEGO M.
El 16s rDNA es utilizado para la identificación bacteriana dada su tasa de variación entre especies. Algunas de las regiones variables de la subunidad ribosomal son más informativas que otras por lo cual en este estudio se evalúa el potencial de identificación aportado por cada región y combinaciones entre ellas. Se extrajeron las regiones variables V1 a la V8 del 16s rDNA de diferentes cepas y especies de Lactobacillus y se analizaron mediante los paquetes de STAP (ss-RNA Taxonomy Assigning Pipeline) y RDP (Ribosomal Database Project) multiclassifier. Adicionalmente se evaluaron árboles filogenéticos de máxima verosimilitud. Nuestros resultados muestran que la mayoría de regiones variables logran dar una correcta clasificación hasta género, sin embargo no...
Tipo: Journal article Palavras-chave: 16s rDNA; Estructura secundaria; Inferencia filogenética; Lactobacillus; Regiones variables.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2013000200012
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