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Análise de quatro protocolos de extração de DNA em Acmella uliginosa. Repositório Alice
SÁ, G. H. de; COSTA, M. F.; GOMES, M. F. da C.; BRITO, M. V. de; SOUSA, C. C. de; GOMES, S. O.; VIANA, J. P. G.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S..
Realizou-se a avaliação de quatro protocolos de extração de DNA descritos por Ferreira e Grataplaglia (1995), Romano e Brasileiro (1998), Khanuja et al. (1999), baseados no detergente CTAB, e o protocolo descrito por Dellaporta et al. (1983), baseado no método de SDS, com modificações referentes à quantidade de tecido foliar, proporcionais à quantidade de reagentes. No presente trabalho objetivou-se a identificação do protocolo que proporcione DNA em quantidade e qualidade adequados a futuros experimentos envolvendo técnicas moleculares para a espécie Acmella uliginosa, conhecida popularmente como agrião. Observou-se que os protocolos que se mostraram mais eficientes foram os descritos por Romano e Brasileiro (1998) e Dellaporta et al. (1983).
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Agrião; Protocolo de extração; Técnica molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953399
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Avaliação de métodos de extração de DNA genômico em Ocimum basilicum. Repositório Alice
BRITO, M. V. de; GOMES, M. F. da C.; SÁ, G. H. de; COSTA, M. F.; VIANA, J. P. G.; SOUSA, C. C. de; GOMES, S. O.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S..
A espécie Ocimum basilicum popularmente conhecida como manjericão ou alfavaca, é encontrada em regiões tropicais e subtropicais da África, Ásia e América do Sul. Essa espécie é economicamente importante devido à produção de grande quantidade de óleos essenciais. Tendo em vista sua importância econômica, fazem-se necessários estudos moleculares para fins de caracterização, filogenia e conservação de germoplasma. O objetivo deste estudo foi avaliar quatro protocolos de extração de DNA em Ocimum basilicum. Realizou-se extrações de DNA de acordo com quatro protocolos descritos na literatura, com modificações na quantidade de tecido foliar. Apenas três, dos quatro protocolos avaliados resultaram em DNA e dentre estes, dois podem ser ditos como os mais...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Alfavaca; DNA; Manjericão.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951756
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Avaliação de protocolos de extração de DNA genômico total em Cymbopogon winterianu. Repositório Alice
SANTOS, J. de A.; ARAUJO, L. A.; SOUSA, C. C. de; LIMA, F. da C. D. de; ARAUJO, E. de S.; GOMES, S. O.; VIANA, J. P. G.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S..
Realizou-se extrações de DNA em Cymbopogon winterianus, onde avaliou-se os protocolos descritos por Doyle e Doyle (1987), Clark et al. (1989), Ferreira e Grattapaglia (1995) e Romano e Brasileiro (1998), todos baseados no detergente Brometo de Cetiltrimetilamônio (CTAB), com modificações relativas à quantidade de tecido foliar, onde padronizou-se para a quantidade de 40 mg por amostra. O objetivo do presente trabalho foi estabelecer um protocolo de extração de DNA para C. winterianus, possibilitando a obtenção de um DNA de alta qualidade, em boa quantidade, de forma rápida, eficiente e menos onerosa. Os resultados mais eficientes foram obtidos por meio do protocolo descrito por Doyle e Doyle (1987); porém, o método de Clark et al. (1989) pode ser uma boa...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cymbopogon winterianus; DNA; Extração; Protocolo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953085
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Comparação de cinco métodos para extração de DNA a partir de folhas de Phyllanthus niruri. Repositório Alice
LIMA, F. da C. D. de; ARAUJO, L. A.; SOUSA, C. C. de; SANTOS, J. de A.; ARAUJO, E. de S.; GOMES, S. O.; VIANA, J. P. G.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S..
Realizou-se a avaliação de protocolos de extração de DNA genômico vegetal em Phyllanthus niruri para identificar o protocolo que proporciona um resultado mais adequado em relação à quantidade e à qualidade do DNA obtido. Comparou-se cinco protocolos: Romano (1998), Doyle & Doyle (1987), Grattapaglia et al. (1995) e Clark et al. (1989), todos baseados no método CTAB e o protocolo descrito por Dellaporta (1983), baseado no método SDS. Para uma melhor comparação entre os protocolos analisados foram feitas padronizações nas quantidades dos reagentes e de tecido foliar. Através do presente estudo pode-se observar que o protocolo que gerou um DNA mais adequado para futuros estudos moleculares foi o descrito por Dellaporta (1983). Verificou-se um alto nível...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DNA; Extração; Phyllanthus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951344
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Comparação de seis métodos de extração de DNA genômico em babaçu. Repositório Alice
VIANA, J. P. G.; GOMES, S. O.; LOPES, A. C. de A.; GOMES, R. L. F.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. dos S..
O babaçu (Orbignya phalerata Mart.) é uma das palmeiras mais importantes do Brasil. Estudar a variabilidade disponível em populações desta espécie é necessário a fim de se estabelecer estratégias de conservação. O estudo da variabilidade genética pode ser feita por meio de marcadores moleculares e muitas destas preparações exigem DNA de qualidade e em quantidades adequadas. Este estudo objetivou avaliar seis métodos de extração de DNA em babaçu. As extrações de DNA foram realizadas de acordo com os protocolos originais. A qualidade e concentração de ácidos nucléicos foram reveladas por espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose. Com base nos dados obtidos por espectrofotometria foi possível observar que na aplicação de alguns métodos obteve-se...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Germoplasma; Recurso genético; Variabilidade genética.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953003
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Comparison of eight methods of genomic DNA extraction from babassu. Repositório Alice
VIANA, J. P. G.; BORGES, A. N. C.; LOPES, A. C. A.; GOMES, R. L. F.; LIMA, P. S. da C.; VALENTE, S. E. S..
Babassu (Orbignya phalerata Martius) is one of the most important palms in Brazil because of the largest morphological variation, wide geographic distribution, and high socio-economic importance. The diversity present in babassu germplasm should be protected against loss to ensure their use with high productivity.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Recurso genético; Germoplasma; Orbignya phalerata.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032404
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Genomic diversity is similar between Atlantic Forest restorations and natural remnants for the native tree Casearia sylvestris Sw. Repositório Alice
VIANA, J. P. G.; SIQUEIRA, M. V. B. M.; ARAUJO, F. L.; GRANDO, C.; SUJII, P. S.; SILVESTRE, E. de A.; NOVELLO, M.; PINHEIRO, J. B.; CAVALLARI, M. M.; BRANCALION, P. H. S.; RODRIGUES, R. R.; SOUZA, A. P. de; CATCHEN, J.; ZUCCHI, M. I..
The primary focus of tropical forest restoration has been the recovery of forest structure and tree taxonomic diversity, with limited attention given to genetic conservation. Populations reintroduced through restoration plantings may have low genetic diversity and be genetically structured due to founder effects and genetic drift, which limit the potential of restoration to recover ecologically resilient plant communities. Here, we studied the genetic diversity, genetic structure and differentiation using single nucleotide polymorphisms (SNP) markers between restored and natural populations of the native tree Casearia sylvestris in the Atlantic Forest of Brazil. We sampled leaves from approximately 24 adult individuals in each of the study sites: two...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: SNP; Single nucleotide polymorphisms; Floresta Tropical; Casearia Sylvestris; Tropical forests.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101157
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Utilização de marcadores microssatélites em estudo de diversidade genética em Mikania laevigata Sch. Bip. ex Baker Repositório Alice
FIGUEIRA, G. M.; CAMPOS, J. B. de; VIANA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; BELINI, C. M. B.; AZEVEDO, V. C. R.; VIEIRA, R. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise molecular; Diversidade genética; Locos SSR.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002082
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