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Alocação de indivíduos baseado em genótipos multilocus em grupos genéticos de búfalos criados no Brasil. Repositório Alice
ALBUQUERQUE, M. S. M.; PAIVA, S. R.; EGITO, A. A.; MARQUES, J. R. F.; CASTRO, S. T. R.; MARIANTE, A. S..
2007
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Animal genetic resources; Bubalus bubalis; Diversidade Genética; Genetic Diversity; Genética; Recursos genéticos animais.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/959651
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Análise bibliométrica da aplicação dos marcadores SNP para os estudos da conservação dos recursos genéticos: Capra hircus. Repositório Alice
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; SILVA, G. R. da; DINIZ, F. M.; ARAUJO, A. M. de..
Esse estudo teve como objetivo analisar a produção científica mundial acerca do uso de marcadores SNPs em Capra hircus (caprinos) a fim de verificar o estado da arte sob aspecto da genética evolutiva e da conservação de diversidade da espécie. Conclui-se que as pesquisas com caprinos usando os marcadores SNPs tendem a concentrar-se na Ásia e estarem voltados a temas referentes aos aspectos produtivos (com destaque para leite) e reprodutivos, provavelmente pela grande importância da espécie no mercado mundial.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genômica evolutiva; Caprino; Base de Dados; Marcador Genético; Genética Animal; Recurso Genético; Goats; Genetic markers; Animal genetic resources.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102285
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Análise da estrutura populacional de ovinos deslanados do núcleo de conservação. Repositório Alice
TINO, C. R. S.; CAVANI, L.; FONSECA, R.; SILVA, K. de M..
Resumo: Este estudo analisou a estrutura populacional de ovinos deslanados do núcleo de conservação do estado do Ceará, Brasil. Os parâmetros populacionais foram estimados com base nos dados genealógicos de indivíduos das raças Santa Inês (SI), Somalis (SO) e Morada Nova (MN), nascidos entre os anos de 2001 e 2014. Os parâmetros estimados foram: número de gerações completas equivalentes (GCE), intervalo entre gerações (IEG), número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), coeficiente de endogamia (F) e índice de contribuição genética (ICG). O GCE médio foi de 1,82, 2,78 e 1,52 para SI, SO e MN, respectivamente. O IEG foi próximo entre as raças, 3,67 anos em média. O Nf para SI, SO e MN foi igual a 225, 194 e...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fundadores; Diversidade genética; Raça Santa Inês; Raça nativa; Raça Somalis; Raça Morada Nova; Região Nordeste; Brasil; Founders; Brazilian Northeast; Ovino; Melhoramento Genético Animal; Genética Animal; Conservação; Endogamia; Sheep; Population genetics; Conservation programs; Animal genetic resources; Breeding and Genetic Improvement; Inbreeding.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120340
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Animal GRIN database user manual for the management of genetic resources. Repositório Alice
WILSON, C. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; MANAHAN, T. J.; CAJUEIRO, E. V. de M.; MARIANTE, A. da S.; BLACKBURN, H..
Introduction to Animal GRIN; Navigating the Database; Setting Up the Database (Super Users); Create Taxonomy Structure; Set Up Location Structure; Form Descriptions (All Users); Form Descriptions (Super Users); Entering Shipments; E-R Diagram for Incoming Orders; Entering Requests; Reports.
Tipo: Livro científico (ALICE) Palavras-chave: Gestão; Recurso genético; Produção animal; Segurança alimentar; Agricultural management; Management systems; Animal genetic resources; Food security.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052284
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Application of microsatellite markers for breeding and genetic conservation of herds of Pantaneiro sheep Electron. J. Biotechnol.
Crispim,Bruno do Amaral; Seno,Leonardo de Oliveira; Egito,Andréa Alves do; Vargas Junior,Fernando Miranda de; Grisolia,Alexéia Barufatti.
Background The aim of the present study was to assess the genetic diversity of Pantaneiro sheep, using microsatellite markers, in order to assist maintenance and management plans, enhance mating systems and reduce the inbreeding rate. A total of 127 animals were genotyped at eight microsatellite loci. They belonged to populations from the Experimental Farm of the Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD) (Dourados/MS/Brazil) and Embrapa Pantanal (Corumbá/MS/Brazil). Results The population of Pantaneiro sheep from the UFGD exhibited a high mean number of alleles (11.13) and allelic richness (10.66). The polymorphic information content was highly informative in the locus studied, resulting in a mean value of 0.71. Observed heterozygosity was lower than...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Animal genetic resources; Genetic diversity; Kinship; Locally adapted breed; STR.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582014000600010
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Avaliações fenotípicas da raça bovina Curraleiro Pé-Duro do Semiárido do Brasil. Repositório Alice
CARVALHO, G. M. C.; FÉ DA SILVA, L. R.; ALMEIDA, M. J. O.; LIMA NETO, A. F.; BEFFA, L. M..
O objetivo do presente trabalho foi avaliar algumas características qualitativas e quantitativas relacionadas com a pelagem, morfometria, desenvolvimento ponderal, carcaça e carne de bovinos Curraleiro Pé-Duro (CPD, Bos taurus taurus). Os dados analisados foram coletados nos animais do núcleo de conservação in situ da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) localizado na unidade experimental no Estado do Piauí, Brasil. Os dados foram analisados pelo método dos quadrados mínimos (Proc GLM) contidos no pacote estatístico SAS. Os modelos variaram conforme as análises, assim como o nível de significância dos efeitos ambientais incluídos e de suas interações. Os pesos médios, entre machos e fêmeas, para peso ao nascer (PN), desmama (P210), ano...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus adaptado aos trópicos; Raças crioulas; Recursos genéticos animais; Tropically adapted Bos taurus; Creole breeds; Animal genetic resources.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/955942
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BGCON - Banco de Germoplasma de Caprinos e Ovinos Naturalizados: uma alternativa para inventariar a infra-estrutura dos recursos genéticos existentes. Infoteca-e
SANTOS, D. O.; RÊGO, J. P. A. do; VILLELA, L. C. V.; SILVA, F. L. R. da; FACO, O..
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Conservação genética; Caprino; Ovino; Recurso genético; Banco de germoplasma; Melhoramento Genético Animal; Goats; Sheep; Animal genetic resources; Gene banks; Brazil.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/526505
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Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Abstract: The articular osteochondrosis (OC) is a disturbance of endochondral ossification occurring in humans and livestock animals. In pigs, OC is one of the major causes of leg weakness, leading to economic losses and reducing the animal welfare. The aim of this study was to evaluate the differential gene expression related to OC latens in femoral articular cartilage in swine. Thus, samples of MS115 5-months-old gilts, normal (control group) and affected with OC latens (affected group), were collected and submitted to histopathological and gene expression analysis. A total of 1,734 genes was differentially expressed (DE) between the two groups. Several biological processes (BP) were enriched including those already known as involved with OC, such as...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Desenvolvimento ósseo; Características do fêmur; Osteocondrose articular; Problemas de locomoção; Locomotor problems; RNA-Seq; Melhoramento Genético Animal; Suíno; Gene; Osso; Fêmur; Animal genetic resources; Swine; Osteochondrosis; Gene expression; Lameness; Leg weakness.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093227
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Bovine breeds identification by trichological analysis. Repositório Alice
FELIX, G. A.; FIORAVANTI, M. C. S.; CASSADRO, M.; TORMEN, N.; QUADROS, J.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do; MOURA, M. I. de; PIOVEZAN, U..
This study aimed to identify bovine breeds through trichological morphology and morphometry and to validate this technique by comparing it with genetic characterization. Animals from Caracu, Curraleiro Pé-Duro, Nelore, and Bovino Pantaneiro breeds were studied. Morphological and morphometric analyses of the guard hairs were performed. The cuticular pattern was observed on the shaft and the medulla pattern on the shield of the samples. The cattle genetic characterization was accomplished using microsatellite markers. Statistical analyses were performed using R version 3.2.4 software. Pearson?s correlation test showed a high positive and significant correlation between the matrices generated by trichological and genetic analyses (r = 0,996 and p < 0.001)....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Breed marker; Genetic characterization; Guard hair; Raça; Bovino; Genética Animal; Animal genetic resources; Cattle breeding.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117973
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Bovine breeds identification by trichological analysis. Repositório Alice
FELIX, G. A.; FIORAVANTI, M. C. S.; CASSADRO, M.; TORMEN, N.; QUADROS, J.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do; MOURA, M. I. de; PIOVEZAN, U..
This study aimed to identify bovine breeds through trichological morphology and morphometry and to validate this technique by comparing it with genetic characterization. Animals from Caracu, Curraleiro Pé-Duro, Nelore, and Bovino Pantaneiro breeds were studied. Morphological and morphometric analyses of the guard hairs were performed. The cuticular pattern was observed on the shaft and the medulla pattern on the shield of the samples. The cattle genetic characterization was accomplished using microsatellite markers. Statistical analyses were performed using R version 3.2.4 software. Pearson?s correlation test showed a high positive and significant correlation between the matrices generated by trichological and genetic analyses (r = 0,996 and p < 0.001)....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Breed marker; Genetic characterization; Guard hair; Non-invasive; Animal genetic resources.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117691
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Desenvolvimento ponderal e diversidade fenotípica entre cruzamentos de ovinos Dorper com raças locais Repositório Alice
CARNEIRO, P.L.S.; MALHADO, C.H.M.; JÚNIOR, A.A.O. de S.; SILVA, A.G.S. da; SANTOS, F.N. dos; SANTOS, P.F.; PAIVA, S.R..
O objetivo deste trabalho foi comparar o desenvolvimento ponderal, por meio de curva de crescimento e pesos ajustados e avaliar a diversidade entre ovinos cruzados Dorper com as raças locais, com base em características de carcaça e morfológicas. Foram realizadas pesagens dos animais cruzados em intervalos de aproximadamente 15 dias e avaliados os efeitos de sexo, ano e grupo genético. Na estimativa dos parâmetros das curvas, foi utilizado o modelo não-linear Logístico e, a fim de avaliar o grau de similaridade entre os animais dos grupos genéticos, foram utilizadas variáveis canônicas. O sexo dos animais não influenciou o peso. Houve efeito de ano e grupo genético sobre o desenvolvimento dos animais. Conforme o modelo Logístico para a curva de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ovis aries; Morada Nova; Rabo Largo; Santa Inês; Recursos genéticos animais; Animal genetic resources.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122772
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Detection and evaluation of selection signatures in sheep PAB
Paim,Tiago do Prado; Ianella,Patrícia; Paiva,Samuel Rezende; Caetano,Alexandre Rodrigues; Pimentel,Concepta Margaret McManus.
Abstract: The recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ovis aries; Analysis software; Animal genetic resources; Genetic improvement; Genomics; Molecular genetics; SNP markers.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2018000500527
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Distribution of goat breeds in brazil and their relationship with environmental controls. Repositório Alice
McMANUS, C.; HERMUCHE, P.; PAIVA, S. R.; DALTRO, D.; Evelyn München ALFONZO, E. M.; FACO, O..
Abstract: The localization of all flocks of purebred goats in Brazil was spatialized in ARCGIS along with climatic (THI, precipitation, topography, relative humidity) and physical environmental controls (altitude, pasture type). Data were analysed using analysis of variance, logisitic regression and cluster analyses. Distance matrices were constructed using longitude/latitude and those from environmental controls and these were correlated using Mantel test. Midpoint for most breeds was in Bahia State, but in Pernambuco for locally adapted breeds. The Anglonubian was the commercial breed with the northernmost midpoint. Toggenburg, Saanen and Apline breeds had the southernmost midpoint. There was little difference between environmental controls for locally...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Correlação de Mantel; Precipitação; Regressão logistica; Caprino; Raça; Pastagem; Temperatura; Recurso genético; Goats; Pastures; Temperature; Breeds (animals); Animal genetic resources; Regression analysis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007019
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Diversidade genética de diferentes variedades da raça Morada Nova por meio de marcadores SNP. Repositório Alice
MUNIZ, M. M. M.; CAVALCANTI, L. C. G.; FAÇANHA, D. A. E.; FACO, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Raça Morada Nova; Manejo genético; Ovino; Recurso genético; Genética animal; Marcador genético; Sheep; Animal genetic resources; Genetic markers.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007882
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D-loop haplotype diversity in Brazilian horse breeds. Repositório Alice
IANELLA, P.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; PAIVA, S. R.; EGITO, A. A. do; ALMEIDA, L. D.; SERENO, F. T. P. S.; CARVALHO, L. F. R.; MARIANTE, A. da S.; MCMANUS, C. M..
bitstream/item/165902/1/1415-4757-gmb-1678-4685-GMB-2016-01661.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic characterization; Locally adapted breeds; Mitochondrial DNA; Equus caballus; Animal genetic resources.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078580
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D-loop haplotype diversity in Brazilian horse breeds Genet. Mol. Biol.
Ianella,Patrícia; Albuquerque,Maria do Socorro Maués; Paiva,Samuel Rezende; Egito,Andréa Alves do; Almeida,Leonardo Daniel; Sereno,Fabiana T. P. S.; Carvalho,Luiz Felipe Ramos; Mariante,Arthur da Silva; McManus,Concepta Margaret.
Abstract The first horses were brought to Brazil by the colonizers after 1534. Over the centuries, these animals evolved and adapted to local environmental conditions usually unsuitable for exotic breeds, thereby originating locally adapted Brazilian breeds. The present work represents the first description of maternal genetic diversity in these horse breeds based on D-loop sequences. A D-Loop HSV-I fragment of 252 bp, from 141 horses belonging to ten Brazilian breeds / genetic groups (locally adapted and specialized breeds) were analysed. Thirty-five different haplotypes belonging to 18 haplogroups were identified with 33 polymorphic sites. Haplotype diversity (varying from 0.20 to 0.96) and nucleotide diversity (varying from 0.0039 to 0.0239) was lower...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mitochondrial DNA; Genetic characterization; Equus caballus; Locally adapted breeds; Animal genetic resources.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000400604
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Estimativa de la edad y peso a la primera monta de novillas en el Pantanal brasileño. Repositório Alice
SERENO, J.R.B.; PELLEGRIN, A.O.; LARA, M.A.C.; ABREU, U.G.P. de; SERENO, F.T.P. de S.; CHALITA, L.V. de A.S..
Esto trabajo tuvo como objetivo estimar la edad y peso a la primera monta de novillas de las razas Nelore (N), Pantaneira (P) y Mestizas Pantaneira x Nelore (PxN). Se utilizó un total de 98 hembras, siendo 51, 24 y 23 pertenecientes a las razas N, P y PxN, respectivamente. El análisis estadístico de los datos no reveló diferencia significativa (P = 0,3595) para el peso a la primera monta entre las razas estudiadas. El análisis de varianza no reveló diferencia significativa (P = 0,307) entre las edades a la primera monta entre razas, mostrando 3,5, 3,4 y 3,2 años para las novillas P, N y ½PxN, respectivamente.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mejora genética animal; Razas mestizas; Recursos genéticos animales; Animal breeding; Crossbred race; Animal genetic resources.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/105915
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Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. Repositório Alice
TOLEDO, N. M. de.; McMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; CARNEIRO, P.; CAETANO, A. R.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; MORAES, J. C. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização genética; Diversidade genética; SNPs; Recurso genético; Genética animal; Ovino; Raça; Sheep; Animal genetic resources; Genetic diversity as resource.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007892
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Evolução demográfica do cavalo Pantaneiro nos municípios de Mato Grosso e Mato Grosso do Sul. Repositório Alice
SANTOS, S. A.; McMANUS, C.; PAULA, F. de.; COMASTRI FILHO, J. A.; PAIVA, S. R.; JULIANO, R. S.; MARQUES, M. C. de A..
O interesse pela criação do cavalo Pantaneiro tem crescido nas ultimas décadas devido ao seu valor inestimável como animal de lida do gado adaptado às condições inóspitas do Pantanal, bem como à seleção e melhoramento para conformação e funcionalidade, tornando-o um animal valorizado pelos criadores. Atualmente o cavalo também vem sendo utilizado para práticas esportivas e de lazer em diversas partes do Brasil e do mundo. Este estudo objetivou avaliar a evolução dos cavalos Pantaneiros registrados na Associação Brasileira de Criadores de Cavalo Pantaneiro (ABCCP) nos estados de Mato Grosso (MT) e Mato Grosso do Sul (MS). A população estudada incluiu todos os animais registrados pela ABCCP, desde sua criação, em 1972, até março de 2010. Os dados foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pelagem; População; Raças locais; Recursos genéticos animais; Animal genetic resources; Coat; Local breeds; Population.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/973569
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Ferramentas moleculares para a gestão, uso e conservação das raças Curraleiro Pé-Duro e Pantaneira. Repositório Alice
EGITO, A. A. do; JULIANO, R. S.; FIORAVANTI, M. C..
A diversidade genética animal, em termos globais, é de vital importância para a agricultura, a produção de alimentos, o desenvolvimento rural e o meio ambiente. Futuras adaptações às mudanças nas condições socioeconômicas e ambientais, incluindo as mudanças climáticas, somente serão viáveis se houver variabilidade genética suficiente que permita a adequação das populações existentes à estas flutuações. Um longo trabalho foi realizado pela FAO, a partir de 1990, para orientar o manejo sustentável dos Recursos Genéticos Animais (RGA) no mundo, buscando fomentar e orientar planos nacionais e regionais de conservação, documentação e caracterização dos RGAs existentes, reforçando a contribuição dos animais domésticos e de seus produtos, bem como a importância...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética molecular; Marcador molecular; Genética animal; Conservação de raça; Animal genetic resources; Genetic resources; Animal breeding.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1025674
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