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Apports futurs de la bioinformatique IRD
Rivals, E..
Tipo: Text Palavras-chave: BIOLOGIE; INFORMATIQUE SCIENTIFIQUE; GENOME; PROTEINE; MODELE MATHEMATIQUE; METHODE D'ANALYSE; ETUDE COMPARATIVE; EXPRESSION DES GENES; BIOINFORMATIQUE; ANALYSE DE SEQUENCE.
Ano: 2001 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010028487
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Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés Inra
Hergalant, S.; Aigle, B.; Leblond, P.; Mari, J.F..
Nous décrivons un processus de fouille de données en bioinformatique. Il se traduit par la spéciation de modèles de Markov cachés du second-ordre, leur apprentissage et leur utilisation pour permettre une segmentation de grandes séquences d'ADN en différentes classes qui traduisent chacune un état organisationnel et structural des motifs d'ADN locaux sous-jacents. Nous ne supposons aucune connaissance a priori sur les séquences que nous étudions. Dans le domaine informatique, ce travail est dédié à la définition d'observations structurées (les k-d-k-mers) permettant la localisation en contexte d'irrégularités, ainsi qu'à la description d'une méthode de classifcation utilisant plusieurs classifieurs. Dans le domaine biologique, cet article décrit une...
Tipo: Book Chapter Palavras-chave: FOUILLE DONNEE; MODELE MARKOV CACHE; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; BIOINFORMATIQUE; K-MER; CLASSIFICATION HMM2.
Ano: 2005 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007596043c3&uri=/notices/prodinra1/2011/01/
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Utilisation par l’informatique et traitement statistique d’un fichier ampélographique Inra
Boursiquot, J.M.; Faber, M.P.; Blachier, O.; Truel, P..
L’ampélographie reste un problème d’actualité chez Vitis vinifera L. En effet, reconnaître et identifier une variété est souvent une opération délicate. Ceci est dû au grand nombre de cépages existants et à l’importance de la fluctuation présente au sein de chacun d’eux. Une aide à la reconnaissance est proposée en utilisant par des moyens informatiques un fichier ampélographique portant sur 5 226 clones (2 076 variétés). Ce fichier a été réalisé au Domaine de VASSAL (I.N.R.A., 34340 Marseillan-Plage). Les descriptions intéressent 75 caractères, ce qui représente 272 modalités. Après sauvegarde de ces données sur Mini 6, un programme en Pascal a été mis au point permettant de questionner ce fichier et d’obtenir ainsi des listes d’hypothèses pouvant...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: AMPELOGRAPHIE; PROGRAMME DE TRI; ANALYSE DES DONNEES; CARACTERES JUVENILES; VITIDACEAE; CEPAGE; CLONE; VARIETE; BIOINFORMATIQUE; METHODE STATISTIQUE; ANTHOCYANE.
Ano: 1987 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009c2d9d109&uri=/notices/prodinra1/2009/06/
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