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Agrupamento de acessos e cultivares de três espécies de Brachiaria por RAPD - DOI: 10.4025/actasciagron.v30i4.5298 Agronomy
Ambiel, Ana Claudia; UNOESTE; Guaberto, Luciana Machado; UNOESTE; Vanderlei, Talita Marques; UNOESTE; Machado Neto, Nelson Barbosa; UNOESTE.
O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais de três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), por meio de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 “primers” decâmeros foram selecionados de 120 “primers” avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizadas para a análise de variância molecular (Amova), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total estão contidas entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma, houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas...
Palavras-chave: 5.02.01.03-4 Genética e Melhoramento Florestal Brachiaria; Marcadores moleculares; Variabilidade genética; Dendrograma; Índice de fixação gênica. Brachiaria; Molecular markers; Genetic variability; Dendrogram; Genetic fixation index.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/5298
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Assessment of genetic diversity in Indian ash gourd (Benincasa hispida) accessions using RAPD markers National Institute of Agronomic Research
Pandey, S.; Kumar, S.; Rai, M.; Mishra, U.; Singh, M..
Thirty four (9 cultivars and 25 germplasm) genotypes of ash gourd (Benincasa hispida) have been studied to assess the molecular diversity using RAPD markers. A total of 25 RAPD markers produced 163 amplicons, of which 73 % were found polymorphic indicating a high degree of diversity. RAPD based dendrogram showed dissimilarity values from 0.64 to 0.943 also suggesting that the accessions represent a genetically diverse population. The accession IVAG-223 was clearly separated from rest of the accessions based on the RAPD primers. The dendogram revealed that the accessions from northeastern regions of India are different from the accessions of other parts of India, as they cluster together. On the basis of clustering, it was indicated that cultivars had a...
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: Genetic resources; Genetic diversity; Dendrogram; PCR amplification; Germplasm; Molecular diversity.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/193
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Caracteres epidemiológicos e uso da análise de agrupamento para resistência parcial à ferrugem da soja. Repositório Alice
SANTOS, J.A.; JULIATTI, F.C.; SANTOS, V.A.; POLIZEL, A.C.; JULIATTI, F.C.; HAMAWAKI, O.T..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência parcial de genótipos de soja ao fungo Phakopsora pachyrhizi. Calcularam-se o número médio de pústulas, a severidade e a área abaixo da curva de progresso da doença. Foram encontradas diferenças significativas entre os genótipos quanto ao número médio de pústulas e severidade, aos 12 dias após a inoculação. A análise de agrupamento permitiu a discriminação de genótipos parcialmente resistentes. Os genótipos G4, G41 e G42, referentes aos parentais Cristalina e IAC 100, foram detectados como os de maior resistência parcial à ferrugem da soja
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Glycine max; Phakopsora pachyrhizi; Análise multivariada; Dendrograma; Severidade; Multivariate analysis; Dendrogram; Rust severity.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/124455
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Characterization of sour (Prunus cerasus L.) and sweet cherry (Prunus avium L.) varieties with five isozyme systems IPB - Escola Superior Agrária
Morales Corts, Remedios; Rodrigues, Luciano; Ortiz, Jesús María; Pérez Sánches, Rodrigo.
Extracts from young leaves of nine sweet cherry (Prunus avium L.) and eight sour cherry (Prunus cerasus L.) varieties, located in the germplasm collection of the 'Direção Regional de Agricultura da Beira Interior' (Fundão, Portugal), were analysed for five isozyme systems in order to characterise these varieties and detect problems of synonymies and homonymies that frequently present. The sweet and sour cherry varieties analyzed showed low isoenzymatic polymorphism, being PGM and PGI the systems with the highest discrimination power. These systems presented seven and five different zymogrames, respectively. IDH showed four patterns. SKDH and 6-PGD grouped the varieties only into two patterns. The evident and discriminant restrictions of this type of...
Tipo: Article Palavras-chave: Dendrogram; Polymorphism; Starch gel electrophoresis; Zymogram..
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/10198/5930
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Genetic diversity among native varieties and commercial cultivars of Solanum tuberosum ssp. tuberosum L. present in Chile Electron. J. Biotechnol.
Solano,Jaime; Mathias,Monica; Esnault,Florence; Brabant,Philippe.
Background: The object of this work was to determine the genetic and allelic diversity of Solanum species present in Chile, assessing allelic distribution among native varieties and commercial cultivars of Solanum tuberosum ssp. tuberosum L., using microsatellite markers. Results: A high level of allelic richness was found in the potatoes studied. The seven microsatellite markers used presented a total of 64 allelic variants among native varieties and commercial cultivars of Solanum tuberosum ssp. tuberosum. The SSR loci generated an average of 9.16 alleles/locus. The group with the highest PIC was that of native varieties collected in the Chiloe archipelago. The high PIC values found indicate that the native varieties from Chiloe have a low level of...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Dendrogram; Germplasm; SSR markers.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582013000600008
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The clustergram: A graph for visualizing hierarchical and nonhierarchical cluster analyses AgEcon
Schonlau, Matthias.
In hierarchical cluster analysis, dendrograms are used to visualize how clusters are formed. I propose an alternative graph called a “clustergram” to examine how cluster members are assigned to clusters as the number of clusters increases. This graph is useful in exploratory analysis for nonhierarchical clustering algorithms such as k-means and for hierarchical cluster algorithms when the number of observations is large enough to make dendrograms impractical. I present the Stata code and give two examples.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Dendrogram; Tree; Clustering; Nonhierarchical; Large data; Asbestos; Research Methods/ Statistical Methods.
Ano: 2002 URL: http://purl.umn.edu/116024
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Variabilidade genética do umbuzeiro no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP. Repositório Alice
SANTOS, C.A.F.; RODRIGUES, M.A.; ZUCCHI, M.I..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição da variabilidade genética do umbuzeiro (Spondias tuberosa), no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP, para subsidiar estratégias de prospecção e conservação da espécie. Foram analisados 68 indivíduos de umbuzeiro de 15 ecorregiões, pelo dendrograma UPGMA e pela dispersão em escala multidimensional (MDS), com o coeficiente de Jaccard de 141 bandas polimórficas de AFLP. A análise da variância molecular foi realizada pela decomposição total entre e dentro das regiões ecogeográficas. O dendrograma apresentou valor cofenético de 0,96, e o gráfico MDS apresentou 0,25 para a falta de ajustamento. A variabilidade genética do umbuzeiro foi estimada em 0,3138, o que indica grande variação entre os...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Spondias tuberosa; Análise multivariada; Análise de variância molecular; Dendrograma; Escala multidimensional; Multivariate analyses; Analysis of molecular variance; Dendrogram; Multidimensional scaling.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122147
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