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BlueStar STING platform for analysis of protein structure / function relationship: designing agrochemicals to fit new protein targets for bacterial, fungal and insect control. Repositório Alice
NESHICH, G..
Blue Star STING suite of programs for comprehensive analysis of structure, function and stability of proteins and their complexes, has matured over a decade of development. We will present the in silico process for identification of the catalytic site amino acids by means of selecting a range for values for a set of the STING_DB parameters - protein structure descriptors.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Biologia molecular; Estrutura de proteínas; Processo in silico; Bioinformatics; Protein structure.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/949444
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T25: Multiple Structures - Selected Parameter (MSSP) 2D Plot. Repositório Alice
NESHICH, G..
The Multiple Structures - Single Parameter 2D module allows a user to compare, in a simple yet intuitive 2D plot, any one of the 150 different sequence, structure, function and stability parameters / descriptors, stored in STING_DB, for any protein structure deposited in the PDB. The 2D plot shows (for a selected parameter / descriptor) the numerical values in the Y-axis and the sequence residue numbers for structurally aligned proteins, in the X-axis. The MSSP module is a part of the improved Blue Star STING protein structure analysis computer interface and DB (which contains per-residue-reported descriptors (available for display both numerically and graphically) for either the public protein data base (the PDB)) or local files. The MSSP allows a user to...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sting; Estrutura de proteínas; Protein structure.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876488
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