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A crise paradigmática nas ciências de identificação de plantas e a valorização da etnobotânica. Repositório Alice
GOMES, G. C.; MEDEIROS, C. A. B.; GOMES, J. C. C.; BARBIERI, R. L..
2017
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sistemática vegetal; Conhecimento tradicional; Filogenia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1068793
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Análise de sequências de DNA cloroplástico de espécies do gênero Capsicum. Infoteca-e
BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. de S.; BIANCHETTI, L. de B.; FERREIRA, M. E..
2002
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Analise de sequencias; DNA cloropastico; Capsicum; Filogenia; Pimenta; Evolucao; CAPS.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/176888
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Análise e comparação filogenética de expansinas presentes em Urochloa decumbens cv Basilick. Repositório Alice
ONO, R. Y.; CHIARI, L.; PEREIRA, M..
O objetivo deste trabalho foi analisar 4 expansinas de Urochloa decumbens, verificando a similaridade e a homologia delas com as de outras plantas.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Transcriptoma; Bioinformática; Filogenia.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1012029
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Análise filogenética de espécies de potyvirus provenientes de Cucurbitáceas no estado do Pará. Repositório Alice
PONTE, N. H. T. da; BOARI, A. de J..
bitstream/item/172287/1/Anais-XVPIBIC-2017-02.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vírus; Filogenia.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087292
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Análise filogenética do gênero Oryza com ênfase nas espécies brasileiras. Repositório Alice
RODRIGUES, L. L.; SOUZA, R. R.; ABREU, A. G.; RANGEL, P. H. N..
Esse trabalho teve o objetivo de inferir as relações filogenéticas das espécies brasileiras do gênero Oryza, analisando sequências do gene cloroplastidial maturase K (matK). O matK é um gene de cerca de 1500 pares de bases (pb), que já foi utilizado em estudos de filogenia do gênero Oryza.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Filogenia; Recursos genético.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027843
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Análise in silico de aquaporinas potencialmente envolvidas com o estresse hídrico nas interações café- e citros-Xylella fastidiosa. Repositório Alice
RABELO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; REIS, A. M. dos.
No Brasil, um dos importantes problemas enfrentados por produtores de café e citros envolve os danos causados pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria causa o entupimento dos vasos do xilema e impede a passagem de água e nutrientes, o que causa uma condição biológica de estresse hídrico. Os genomas de citros e café têm sido investigados funcionalmente e várias seqüências expressas (ESTs) foram identificadas a partir de diversas condições biológicas. Bibliotecas de EST utilizando folhas e ramos infectados com X. fastidiosa foram construídas em citros e café, respectivamente. A análise in silico das ESTs nesses tecidos revelou genes comuns expressos em ambas as culturas. Alguns destes genes codificam para proteínas relacionados com a resposta de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: EST; Filogenia; Aguaporina; Drought-induced protein Di19-like protein DIP; Fiber protein Fb2.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906023
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Análisis filogenético del género sacciolepis: poaceae, panicoideae, paniceae) con caracteres morfológicos Darwiniana
De Gennaro,Diego; Scataglini,M. Amalia.
Sacciolepis (Poaceae, Panicoideae, Paniceae) es un género pantropical constituido por 23 especies, distribuidas mayormente en África, con algunos taxones en América, Asia y Australia. Los objetivos de este trabajo son poner a prueba el origen monofilético de Sacciolepis y explorar las relaciones filogenéticas intragenéricas. Se analizaron 31 taxones y 80 caracteres morfológicos y anatómicos, incluyendo caracteres continuos, bajo el criterio de máxima parsimonia. Se corroboró la monofilia del género y se discutieron sus caracteres diagnósticos. Este trabajo es el primer análisis filogenético de Sacciolepis.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caracteres continuos; Caracteres morfológicos; Filogenia; Poaceae; Sacciolepis.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0011-67932012000100004
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Anatomía de raíz de la tribu Cranichideae (Orchidaceae), con énfasis en la importancia filogenética del velamen Colegio de Postgraduados
Figueroa Batalla, Coyolxauhqui.
El velamen es una rizodermis especializada formada por células muertas con engrosamientos en la pared secundaria; se encuentra en muchas orquídeas y otras monocotiledóneas. Se considera que esta estructura podría tener valor taxonómico, aunque no se han realizado estudios al respecto en la tribu Cranichideae. En este trabajo se examinó la estructura anatómica de la raíz de 26 especies/19 géneros de cinco linajes (subtribus) de la tribu Cranichideae mediante microscopía de luz y microscopía electrónica de barrido. Se evaluó la importancia taxonómica y filogenética del velamen en el marco de una filogenia generada a partir de secuencias de ADN nuclear y de cloroplasto así como caracteres morfológicos/anatómicos de raíz. Se registró por primera vez...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Anatomía de raíz; Cranichideae; Filogenia; NrITS; Orchidaceae; Plastidio trnK-matK; Secuencias de ADN; Tilosomas; Velamen; Maestría; Botánica; DNA sequences; Orchidaceae; Phylogeny; Plastid trnK-matK; Root anatomy; Tilosomes.
Ano: 2007 URL: http://hdl.handle.net/10521/1467
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Biogeografia e genética populacional de rizóbios isolados de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.). Repositório Alice
OLIVEIRA, I. S. R. de; SILVA, M. S. R. de A. da; FARIA, S. M. de; JESUS, E. da C..
bitstream/item/178775/1/Biogeografia-e-genetica-populacional-de-rizobios.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação biológica do nitrogênio; Rizóbio; Filogenia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092609
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Caracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose. Repositório Alice
SILVA, K. N.; SOUZA, J. M.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; SILVA, M. S.; ORILIO, A. F.; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; VERZIGNASSI, J. R.; FRAGOSO, R. da R.; DESSAUNE, S. N.; RESENDE, R. O..
Em área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estilosante; Diversidade viral; Graminea; Genoma; Filogenia.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066082
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Caracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA. Repositório Alice
TOLEDO, B.F.B. de; MARCONDES, J.; LEMOS, E.G. de M..
O objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do "Basic Local Alignment Search Tool" (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bradyrhizobium; Rhizobium; Filogenia; Phylogeny.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/125856
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CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR E CONTROLE DE FUNGOS DA FAMÍLIA Botryosphaeriaceae ASSOCIADOS À FRUTEIRAS TROPICAIS Repositório Alice
COUTINHO, I. B. de L..
A família Botryosphaeriaceae (Ascomycota, Botryosphaeriales) é composta por complexos de espécies crípticas endofíticas e patogênicas capazes de provocar sintomas de cancros e morte descendente de ramos a diversos hospedeiros, sobretudo plantas lenhosas, dentre as fruteiras tropicais se destacam. Objetivou-se com o presente estudo realizar a caracterização biológica, molecular e o controle de isolados fúngicos família Botryosphaeriaceae associados a fruteiras tropicais no Nordeste brasileiro. Dentre as técnicas utilizadas estão: o sequenciamento gênico combinado das regiões do espaçador interno transcristo (ITS) do DNA ribossômico, fator de elongação 1-alfa (TEF-1?) e ?-tubulina (?t) para a determinação das relações filogenéticas entre os isolados, dados...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Anacardiáceas; Taxonomia; Filogenia; Lasiodiplodia Theobromae; Taxonomy; Phylogeny.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101452
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Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. Repositório Alice
VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The cachara (Pseudoplatystoma reticulatum) is a Neotropical freshwater catfish from family Pimelodidae (Siluriformes) native to Brazil. The species is of relative economic importance for local aquaculture production and basic biological information is under development to help boost efforts to domesticate and raise the species in commercial systems. The complete cachara mitochondrial genome was obtained by assembling Illumina RNA-seq data from pooled samples. The full mitogenome was found to be 16,576 bp in length, showing the same basic structure, order, and genetic organization observed in other Pimelodidae, with 13 protein-coding genes, 2 rNA genes, 22 trNAs, and a control region. Observed base composition was 24.63% T, 28.47% C, 31.45% A, and 15.44% G....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cachara; Peixe-gato; Mitogenome; Aquicultura; Filogenia; Melhoramento genético animal; Peixe de água doce; RNA; Pseudoplatystoma reticulatum; Mitochondrial genome; Siluriformes; Phylogeny; Catfish; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074198
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Descripción morfológica del esqueñeto axial de filotinos (Rodentia: Sigmodontinae): Aspectos morfofuncionales y filogenéticos Mastozool. neotrop.
Carrizo,Luz. V; Díaz,M. Mónica.
Los estudios de taxonomía y filogenia en roedores filotinos en particular, y en sigmodontinos en general, se han enfocado en el análisis de las características externas, craneales y dentarias, otorgándole menor importancia al esqueleto postcraneal. Es por esto que se planteó un estudio descriptivo y comparativo de los elementos óseos del esqueleto axial de los representantes de la tribu Phyllotini sobre la base de 140 ejemplares pertenecientes a 10 géneros y 26 especies. Los objetivos del estudio fueron contribuir al conocimiento de la anatomía postcraneal de los filotinos, determinar los morfotipos de las estructuras vertebrales e identificar patrones morfológicos con un probable significado funcional y filogenético. Nuestros resultados indican que el...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Anatomía; Filogenia; Morfología funcional; Phyllotini; Vértebras.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832013000100002
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Detecção molecular de Colletotrichum siamense em mudas de palma de óleo. Repositório Alice
QUADROS, A. F. F.; BOARI, A. de J.; CARVALHO, T. P.; GOMES JUNIOR, R. A..
A palma de óleo é uma das culturas mais importantes no mundo, encontrando-se em franca expansão no estado do Pará. Muitos fungos têm sido encontrados causando doenças nesta cultura. Durante o monitoramento das plantas do Banco Ativo de Germoplasma de palma de óleo da Embrapa Amazônia Oriental, utilizado no programa de melhoramento, foi observada a presença de mudas com sintomas de necrose foliar onde se observou a presença de conídios característicos do gênero Colletotrichum. Assim, o trabalho teve como objetivo identificar a espécie do fungo por meio de PCR, seguido do sequenciamento multilocus do DNA. Para isso, tecidos de folhas das mudas de palma de óleo que apresentavam sintomas de doenças foram plaqueados em ágar-água. Posteriormente, o fungo foi...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Palma de óleo; Antracnose; Muda; Elaeis guineenses; Filogenia.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022662
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Diagnóstico molecular e análise filogenética de isolados brasileiros de Trypanosoma vivax baseado na reação da polimerase em cadeia - PCR. Infoteca-e
MADRUGA, C. R.; ARAÚJO, F. R. de; SOARES, C. O.; MELO, E. S. de P.; ALMEIDA, D. A.; ALMEIDA JÚNIOR, N. F. de; XAVIER, M. A. S.; OSÓRIO, A. L. A.; GÓES-CAVALCANTE, G.; RAMOS, C. A. do N..
2003
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Trypanosoma vivax; Filogenia; Diagnóstico; Reação da polimerase em cadeia; Brasil; Phylogeny; Diagnosis; Polymerase chain reaction; Brazil.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/325753
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Diversidad de los recursos genéticos mexicanos del hongo funcional ganoderma (Fungi, Ganodermataceae), conocido como reishi en los mercados internacionales, y su relevancia para el desarrollo regional. Colegio de Postgraduados
Tello Salgado, Isaac.
Actualmente se estudia la capacidad funcional a nivel molecular de los hongos basidiomicetos como modificadores de la respuesta biológica, dada la efectividad de los productos examinados de activar al sistema inmunológico, sin embargo, el origen geográfico de estos recursos, principalmente son asiáticos y europeos. Ganoderma es reconocido por su eficiente actividad en el tratamiento de varias enfermedades, principalmente las anticancerígenas y antitumorales, crece de manera silvestre en el área central de México, una de las más importantes, debido a la convergencia de las regiones Neártica y Neotropical, lo cual da como resultado un amplia diversidad de recursos genéticos. En la presente investigación se aislaron 66 cepas del género Ganoderma producto de...
Palavras-chave: Caracterización; Cultivo; Filogenia; Ganoderma; Recurso Genético; Characterization; Cultivation; Phylogeny; Genetic resource; Doctorado; EDAR; Estrategias para el Desarrollo Agrícola Regional.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/372
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Diversidade de bactérias diazotróficas endofíticas dos gêneros Herbaspirillum e Burkholderia na cultura do arroz inundado. Repositório Alice
RODRIGUES, L.S.; BALDANI, V.L.D.; REIS, V.M.; BALDANI, J.I..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de bactérias diazotróficas endofíticas, dos gêneros Herbaspirillum e Burkholderia, em duas variedades de arroz, consideradas de alta (IR 42) e baixa (IAC 4440) eficiência de fixação biológica de nitrogênio. Foram realizados dois experimentos em casa de vegetação, em vasos com dois tipos de solos, provenientes dos Estados de Goiás e do Rio de Janeiro. Foi feita a contagem do número de bactérias e o isolamento em diferentes partes e estágios de desenvolvimento das plantas, mediante o uso de meios de cultivo JNFb e JMV. Os isolados bacterianos foram caracterizados a partir de aspectos morfológicos das colônias, com o crescimento em meios de cultivo, e de testes fisiológicos (uso de fontes de carbono e...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio; Filogenia; Interação planta-bactéria; Biological nitrogen fixation; Phylogeny; Plant-bacteria interaction.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/118447
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