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A novel cloning strategy for isolating, genotyping and phenotyping genetic variants of geminiviruses Inra
Urbino, C.; Thébaud, G.; Granier, M.; Blanc, S.; Peterschmitt, M..
Viruses of the genus Begomovirus (Geminiviridae) are emerging economically importantplant viruses with a circular, single-stranded DNA genome. Previous studies have shown thatgeminiviruses and RNA viruses exhibit similar mutation frequencies, although geminivirusesare replicated by host DNA polymerases and RNA viruses by their own virus-encoded error-prone RNA-dependent RNA-polymerase. However, the phenotypic effects of naturallyoccurring mutations have never been extensively investigated in geminiviruses, particularlybecause, to be infectious, cloned viral genomes usually require sub-cloning as complete orpartial tandem repeats into a binary vector from Agrobacterium tumefaciens.Using Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), we show here that infectivity...
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: GEMINIVIRUS; TOMATO YELLOW LEAF CURL VIRUS; TYLCV.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009b88c5e4&uri=/notices/prodinra1/2010/05/
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A worldwide survey of tomato yellow leaf curl viruses Inra
Czosnek, H.; Laterrot, H..
The name tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) has been given to several whitefly-transmitted geminiviruses affecting tomato cultures in many tropical and subtropical regions. Hybridization tests with two DNA probes derived from a cloned isolate of TYLCV from Israel (TYLCV-ISR) were used to assess the affinities of viruses in naturally infected tomato plants with yellow leaf curl or leaf curl symptoms from 25 countries. Probe A which included most of the intergenic region was expected to detect only isolates closely related to TYLCV-ISR, especially after high stringency washes. In contrast probe B, which included the full-length genome, was expected to detect a wide range of whitefly-transmitted geminiviruses. Tomato samples from six countries in the...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VIRUS DE L'ENROULEMENT JAUNE DE LA TOMATE; GEMINIVIRUS; BEMISIA TABACI; VIRUS DES VEGETAUX; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; VECTEUR DE MALADIE; DISTRIBUTION GEOGRAPHIQUE.
Ano: 1997 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9700027877065437&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Banques de séquences pour la taxinomie des phytovirus : l'analyse factorielle des correspondances appliquée à la classification des géminivirus IRD
Desbois, D.; Fauquet, Claude; Fargette, Denis; Vidal, G..
Cet article présente un exemple d'utilisation des banques de données moléculaires, comme source d'information, et de l'analyse factorielle des correspondances, comme technique d'analyse, pour la recherche taxinomique, ceci dans un pays en développement. L'application de cette technique statistique multivariée à la classification des virus de plantes permet de dégager des critères taxinomiques cohérents basés sur la composition en acides aminés, dinucléotides et codons de la protéine capsidaire. Ces critères aboutissent à une typologie pertinente du groupe des géminivirus, issue d'un algorithme ascendant de classification hiérarchique. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: ANALYSE MULTIVARIABLE; ANALYSE DE CORRESPONDANCE; CLASSIFICATION HIERARCHIQUE; TAXONOMIE; PHYTOVIRUS; BANQUE DE DONNEES; GEMINIVIRUS.
Ano: 1992 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41386
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Contribution à l'étude de l'enroulement du gombo (Okra leaf curl virus) IRD
N'Guessan, Koffi Placide.
Le comportement de deux variétés de gombo, Clemson spineless et ORS 520, vis-à-vis de l'enroulement du gombo et des populations d'aleurodes vecteurs a été testé dans quatre localités. Clemson spineless s'est révélée être une variété sensible et ORS 520 une variété résistante. Présente dans les quatre localités, la contamination et les populations d'aleurodes vecteurs sont plus importantes dans les localités situées au nord et au centre, alors que dans le sud elles sont plutôt faibles. Les cinétiques de contamination et des populations d'aleurodes vecteurs montrent des périodes de faible et de forte pression d'inoculum, qui seraient probablement en relation avec certains facteurs du milieu. Les essais de transmission de l'enroulement du gombo par la graine...
Tipo: Text Palavras-chave: INSECTE NUISIBLE; VECTEUR; DYNAMIQUE DE POPULATION; AGENT PATHOGENE; ECOTOPE; TRANSMISSION; INOCULATION; VARIETE RESISTANTE; VARIETE SENSIBLE; ENROULEMENT DU GOMBO; GEMINIVIRUS; INOCULUM.
Ano: 1987 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:24681
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Detection of geminiviruses from tropical countries by a double monoclonal antibody ELISA using antibodies to African cassava mosaic virus IRD
Givord, Louise; Fargette, Denis; Kounounguissa, B.; Thouvenel, Jean-Claude; Walter, B.; Van Regenmortel, M.H.V..
Tipo: Text Palavras-chave: PATHOLOGIE VEGETALE; VIROLOGIE; ANTICORPS; PHYTOVIRUS; TEST BIOLOGIQUE; DIAGNOSTIC; TECHNIQUE DE LABORATOIRE; GEMINIVIRUS; VIRUS ACMV; IMMUNOESSAI.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010010703
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Detection of geminiviruses from tropical countries by a double monoclonal antibody elisa using antibodies to african cassava mosaic virus Inra
Givord, L.; Fargette, D.; Kounounguissa, B.; Thouvenel, J.C.; Walter, B.; van Regenmortel, M.H.V..
Des anticorps monoclonaux (AcMc) dirigés contre le virus de la mosaïque africaine du manioc («ACMV») (isolat du Nigéria) et utilisés dans un test DAS-ELISA («double antibody sandwich-ELISA») permettent de distinguer (à l’intérieur du sous-groupe III des geminivirus), les geminivirus originaires dAfrique (ACMV souche Ouest et Est ; virus de l’enroulement jaunissant de la tomate : «TYLCV» ; virus de l’enroulement du gombo) de ceux provenant des autres continents du monde (virus de la mosaïque de l’euphorbe ; virus indien de la mosaïque du manioc ; TYLCV de l’Inde). L’un de ces AcMc réagit avec les 7 geminivirus testés. Néanmoins, la détection du TYLCV (isolat du Sénégal) nécessite un tampon d’extraction spécifique, contenant un agent réducteur. Un test de...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ACMV; GEMINIVIRUS; AFRICAN CASSAVA MOSAIC VIRUS; VIROSE; MOSAIQUE; TECHNIQUE ELISA; ANTICORPS MONOCLONAL; TEST.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400016675040752&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Diagnostic d'infection à geminivirus à l'aide d'anticorps monoclonaux dirigés contre le virus de la mosaïque africaine du manioc IRD
Givord, Louise; Fargette, Denis; Kounounguissa, B.; Thouvenel, Jean-Claude; Van Regenmortel, M.H.V..
Tipo: Text Palavras-chave: PATHOLOGIE VEGETALE; PHYTOVIRUS; TEST BIOLOGIQUE; DIAGNOSTIC; ANTICORPS; VIRUS ACMV; GEMINIVIRUS; TECHNIQUE DE LABORATOIRE; IMMUNOESSAI.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010010705
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Epidémiologie de la mosaïque africaine du manioc en Côte d'Ivoire IRD
Fargette, Denis.
La mosaïque africaine du manioc est une maladie du manioc d'origine virale transmise par l'aleurode #Bemisia tabaci$ Genn. On s'intéresse aux interactions entre l'agent pathogène, le vecteur et la plante hôte. On met en évidence le rôle majeur de #Manihot esculenta$ comme source d'infection. On fait ressortir plusieurs caractéristiques du développement de la maladie dans l'espace et dans le temps (gradients de contamination, fluctuation de la pression d'inoculum) que l'on met en relation avec les mouvements et la taille des populations de vecteurs ainsi qu'avec les conditions climatiques. On évalue l'impact de la maladie sur la production en liaison avec le mode et la date de contamination et l'on étudie les possibilités de lutte offertes par la mise en...
Tipo: Text Palavras-chave: PHYTOVIRUS; PLANTE HOTE; LUTTE; PREVENTION SANITAIRE; DYNAMIQUE DE POPULATION; EPIDEMIOLOGIE; PIEGEAGE; RESISTANCE DE L'HOTE; VMAM; GEMINIVIRUS; TEST ELISA; ALEURODE.
Ano: 1987 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:24691
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Epidémiologie de la mosaïque africaine du manioc en Côte d'Ivoire IRD
Fargette, Denis.
Tipo: Text Palavras-chave: PHYTOVIRUS; PLANTE HOTE; EPIDEMIOLOGIE; LUTTE; PREVENTION SANITAIRE; PIEGEAGE; DYNAMIQUE DE POPULATION; RESISTANCE DE L'HOTE; VMAM; GEMINIVIRUS; TEST ELISA.
Ano: 1985 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:24690
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Influence des cultures associées sur l'épidémiologie de la mosaïque africaine du manioc IRD
Servajean, Elisabeth.
L'influence de l'insertion de rangs de maïs, dans une culture de manioc, sur l'épidémiologie de la Mosaïque africaine du manioc a été étudiée. L'agent pathogène est le virus de la Mosaïque africaine du manioc (ACMV). Sur culture issue de boutures saines, il est transmis par #Bemisia tabaci$ Gennadius selon le mode persistant. Le but est de renforcer, par certaines méthodes culturales, les chances de succès d'une stratégie de lutte basée sur la plantation de matériel sain. Deux densités de maïs et trois dates de semis ont été testées durant les quatre premiers mois de culture en zone de forte pression d'inoculum. La contamination a augmenté de manière significative à faible densité de maïs, en relation avec un niveau de population élevé d'insectes vecteurs....
Tipo: Text Palavras-chave: MANIOC; MAIS; CULTURE ASSOCIEE; CONTAMINATION; INSECTE; VECTEUR; VIRUS; PRATIQUE CULTURALE; BRISE VENT; MOSAIQUE AFRICAINE DU MANIOC; GEMINIVIRUS; DATE DE SEMIS.
Ano: 1986 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:26419
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Propriétés et variations géographiques de particules de geminivirus extraites de maniocs malades IRD
Harrison, B.D..
Tipo: Text Palavras-chave: PATHOLOGIE VEGETALE; VIRUS; PLANTE HOTE; VECTEUR; GENETIQUE; SEROLOGIE; DIAGNOSTIC; MOSAIQUE AFRICAINE DU MANIOC; GEMINIVIRUS; TEST ELISA.
Ano: 1988 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:25566
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